Diabrotica virgifera virgifera (western corn rootworm): 114334799
Help
Entry
114334799 CDS
T09922
Name
(RefSeq) sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1-like isoform X1
KO
K24469
sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1
Organism
dvv
Diabrotica virgifera virgifera (western corn rootworm)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dvv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
dvv04990
]
114334799
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
dvv04990
]
EGF-like domain-containing proteins
hEGF domain-containing proteins
114334799
BRITE hierarchy
Motif
Pfam:
Sushi
VWA
Pentaxin
HYR
Ephrin_rec_like
Laminin_G_3
EGF
VWA_2
hEGF
Laminin_G_2
DUF1194
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114334799
NCBI-ProteinID:
XP_028140692
EnsemblRapid:
LOC114334799
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(165365012..165569183)
Genome browser
AA seq
1992 aa
AA seq
DB search
MTSTIFILLIISLIANINCEIAEDTFNNYSAFLNFGRKRLFDGEKASSESESKSKIDVLG
DVLKTYTETIKNYTKLDIVFLIDGSSSVGENNFRSELKFVKKLLSDVIVDYNHTRVAVVT
FSSPNNIFKNIDQIGKISQNYNKCILLTRQLKRVRYRGGETFTLGALKKAKEIFDLSNRN
DSKKVIFLITDGYSNGGDPVPIAKQLKLNAVSIFTIGIQNGNYKELYDISSTPGQFYSYL
LDSFNEFESLARRALHSDLKHGDYIPLGYNFACNELCKEGDDCCDENAMCTCGTTTGHYA
CVCKTGYYGTGLKNNCFPCDPGTYSTGPNVCLPCPDPFHTTIPASYGLDSCVCKEGYKAT
GKRECKELKCVKATAPINGYYVKNRMCPNVIFSACGIRCEVGYTLKGTSVRLCQKNGTWS
GLEPKCEIKTCNQLDMPKGSKMECMQPDTKEIYDANRTNLPVDTICRFSCNEGHILTGSK
ERVCLPIARWSGLRTFCRPIKCKRLVPVNFGDVEPSSCKLGKQEFGKVCRVVCKEGFKRD
GPAVKRCLKERGNWDSKFEATTCKDITPPKITCPDNVVVNSLPGKKYGHVFWTKPNVTDN
SNLNVTVWMKPAISDIKTSKFEIGTTKITYFAQDAFQNRANCSFKVIIKDVEPPFFENCE
DPPIFLSTDIKGANVTWDEPTVFDNSQNITLNKSREFGFMNIGTTTITYIASDSSNNTST
CKLNITLEVSRCEPLPDPPNGRSQCFNQTDGIRCLITCDEGYSIPITQITEKGDTLFMCN
NVDPVWYSQDGFLFPECSVTEIPDEIQTGEITITEDGSCSDLQDIVTVKEEATYYLNTEF
CTDNCTLNTELECTNEIEKLEENDKKNLSKRDIASSVTKRPRRWKHKKRVNVKFRLKHKY
KNTTHPLKHRKFQLKSGRQASLHYKTKISCPLGFVQRVKRCVHCPKGTFHNETRGICQGC
PFGRYNEKVGQISCSFCPEHHSTGRIRSKKIQDCKEMCPPGTHARKKLQRMYRRFHNITI
EKTTLKPFCISCEIGYYQPNFGQLSCIPCPIGYTTTGINSTGIEQCIPTSVEICKSGICR
NGNCVAVNNFEYTCNCFDNYIGTYCEQTVHGCQSQPCYNGGMCSYNNTGYSCSCKEGYGG
KLCEDAIDTCNKPCLNNGLCYSEDNGNLLCLCPPEFIGEFCEIRVNTCEENYCENNAVCV
NKDGEFYCKCTDGFIGSRCHILPCDYRPCATTKVCVNIPEENATRESYSCACPEGYLGEN
CEERINYCINSPCFNNGTCINQLTNYTCTCSSLYFGNHCEFKRSTAYVLNFNQYSINNYV
KLKPFEEDLSEITTCLWIQTLDEVNYGTIVSYATRNDDNAFTLTDYTGLVLYVNNKYVVT
DIHLNDGTWHHLCITWTQLNGSYEVFVDGKLKKSGSNLSPGHNILGKGSFILGQDQDTFG
GEFSQSESFVGKLTYVDVWNRALTQEEVLRHFEECYGLFFGNLYAWPVMQDFIHGEVQIE
HSTFCKRCEAPKPLYNGYINVIKNIAYYSCYPGFTLNNLDYFNGRKCTKASRWEGHYDPY
CRRMYCGYPASIRNGYTIGNRYFYQDKIMFKCYEGYNMIGPPVLTCDQNGKWIPQKPRCI
GSQQCPAFRKPEYSNIMVISDQSYEEFKENQTKYEIGTQIEFECIDEYDLVGQDILSCLE
NATWDFSPPQCVQRTTTTTTTTTTTTTTTTTTTIAPTTTTTKTPTTTTPTSTIPTTITTT
PTTTTIPPTTTTTTPTTTTTTTSTTTTATTPRTTTSTTGVTTPTTTITIPTTTPTTISTS
VLTTRSAKSGCSLDQIPPAPANGYINLKSYNAIVSESSNVIEYKCSVGFKLVGDKVSTCI
IDGYWTEPNISCQPISCNSPPKFKNMAVDNNQATISRSYLYKHQLNFTCDEGYDKLGAHL
GIRCLSTGKWSRIQGKCLRKSCGKPEISDDTDIKGRSYLFGDKVTITCPSGSTYILICSK
TGSWDGERDQTC
NT seq
5979 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccagcactatttttatcttattaattataagtctgatagcaaatataaattgcgaa
atagccgaagatacatttaataattacagtgcatttttaaatttcggaagaaaacgatta
ttcgacggcgaaaaagcgagttcagaaagtgaatcgaaatcgaaaatagatgtattagga
gatgttttgaaaacttatacagagactattaagaactatacgaaattagatattgtgttt
ttgatagacgggtcgtcaagtgttggtgaaaataattttagaagtgagttaaagtttgtg
aaaaagttgttgagtgatgttatagtggattataatcacacaagggtagcagtggtcaca
tttagttctcccaataatattttcaagaatattgatcagattgggaaaatttcccaaaat
tataataagtgcattttactgacgagacaattgaagcgggtacgatatagaggaggagaa
acttttactttaggggcacttaaaaaggccaaggaaatatttgatttatctaatagaaac
gattccaagaaagtaatattccttataactgatggatattcaaatggtggcgatcctgtg
ccgatagcaaagcagctaaaactgaacgctgtctctatatttaccattgggatacagaat
gggaactacaaggaactatacgatatatcgtcgactcctggtcagttctatagttattta
cttgacagtttcaatgagtttgaaagtttggctaggagagccctacactcagacttgaaa
catggagactacatccctttaggatataattttgcttgtaatgaactatgcaaagaagga
gatgactgttgcgacgaaaatgctatgtgcacgtgtggtacaactactggccactacgca
tgtgtttgtaagaccggatactacggtactggtttaaaaaataattgttttccctgtgat
cctggtacatactcaactggaccgaatgtttgcttaccatgtcctgatccttttcacact
actatacctgcatcgtatggacttgatagttgtgtttgcaaggagggatacaaggctaca
ggaaagcgagaatgtaaggaattaaagtgcgtaaaagcaacagctcctattaatggatat
tacgtgaagaacagaatgtgtcctaatgtgatatttagcgcttgtggtattcgatgtgaa
gtaggatacactttaaaaggaaccagtgtaagattatgccaaaaaaatggtacctggagt
ggcttggaaccaaaatgtgaaattaagacctgcaatcaactggatatgcccaaaggcagt
aaaatggaatgtatgcagcctgacaccaaagaaatatatgacgctaatagaaccaatctg
ccagtcgatacaatatgcagattcagctgcaacgaaggtcacattctaactggttcaaag
gaaagggtatgcttacctatagcaagatggtccggtcttagaacattttgtagaccaatt
aaatgcaagagattagttcctgttaattttggagacgttgagccgtcttcttgtaaatta
ggcaaacaagaatttggtaaagtttgtcgagtggtctgcaaagaaggatttaaaagagat
ggacctgcagtaaagcgttgcttgaaagaaaggggaaactgggatagtaaattcgaggct
actacttgtaaagatattacacctccaaaaattacttgtcctgacaacgtagtggtaaac
tcattaccaggaaaaaaatatggccatgtattttggaccaaaccgaatgttacagataat
tcaaatctaaacgttactgtttggatgaaaccagcaatttcagatataaaaacatcgaaa
tttgaaataggtacaacgaagataacgtattttgcacaggacgctttccaaaatagagca
aactgctcttttaaagtaattattaaagacgttgaaccgcccttctttgaaaactgcgaa
gatcctccaatatttctatcaaccgatataaaaggagctaatgttacgtgggacgaacca
actgttttcgataattctcaaaatattacgttaaataagtctcgtgaatttggatttatg
aatattggtacgactacgattacctacatcgcatcagatagttcaaacaacaccagtaca
tgtaaactaaatataactcttgaagtgtcaagatgtgaacctcttccagacccaccaaat
ggacgaagccagtgttttaatcaaactgatggtattcgctgtttgattacttgtgacgag
ggttatagtatccctattacacaaataaccgaaaaaggtgacacactcttcatgtgtaac
aatgtggatccagtttggtacagccaagatggattcctctttccagaatgttcagtaacc
gaaattcctgacgaaatacagactggtgaaataaccataacagaagatggaagctgcagt
gatctacaagatatagtaacagtaaaggaagaagccacatattatctaaatacagaattt
tgtactgataattgcactctgaacacagaactagagtgtactaatgagatagaaaaactg
gaagagaatgacaaaaagaatctatcgaaaagagacattgcaagcagtgtaacaaagcgt
cctagacggtggaaacataaaaagagggttaatgtaaagtttcgtttgaaacataaatac
aaaaatactactcatccccttaaacatagaaaatttcaactaaaaagtggtcgacaagcg
tctctccattacaagacaaaaatttcctgtcctcttggttttgtacagagagttaaacga
tgtgtacactgtccaaaaggaacatttcacaatgaaacccgaggtatttgtcaaggttgt
ccatttggtcgatacaatgaaaaagtgggacagatttcctgttctttttgccctgaacac
cattctactggcaggattcggtcgaaaaaaattcaagattgtaaagagatgtgccctcca
ggtacacatgcgaggaaaaaactacagagaatgtacaggcgttttcacaatattactatt
gagaaaactactttgaaaccattttgtatatcatgtgaaataggttactaccaacccaac
tttggacagctatcttgtataccctgcccaatcgggtacactaccactggtataaattca
acaggtatcgaacaatgtataccaacttctgttgaaatatgtaaaagtggtatttgcaga
aatggaaattgcgtagctgtaaataattttgaatatacatgcaactgcttcgataattac
attggtacttattgcgagcaaactgtacacggatgccaatcccaaccatgttataatggc
ggaatgtgttcatacaataataccgggtactcttgctcgtgcaaggaaggatacggtgga
aaattatgtgaagatgccatcgatacttgcaataaaccttgtttaaataatggactctgc
tattccgaagataatgggaatctgttgtgtttgtgcccaccagaattcatcggagaattt
tgcgaaatacgagttaacacttgcgaggaaaactattgcgaaaataatgcggtatgtgtt
aacaaagacggagaattttattgcaaatgtacagacggatttataggctcaagatgtcat
atcttgccctgcgattatcgaccttgtgcaactaccaaagtatgtgttaacattcctgaa
gaaaacgcaaccagagagagttattcgtgcgcttgtccagaaggatatttgggcgaaaac
tgtgaggagaggataaattactgcataaactctccttgcttcaacaatggaacttgtatt
aaccaactgaccaattacacttgtacctgttcaagtttatatttcggaaatcattgtgag
tttaaaagaagcacggcgtatgtgctaaactttaatcaatatagtataaataattatgta
aaactgaaaccgtttgaggaggacttgtctgagataactacttgtctttggatacaaact
ttagatgaggttaattatggaaccatcgtatcctatgcaacaagaaacgatgacaatgcg
tttactttaactgattatacagggctagtattgtacgtaaataataaatatgtagtaact
gatattcatttgaatgacggaacgtggcaccatctctgcatcacctggacgcagttaaat
ggaagctatgaagtatttgtagatggaaaacttaagaaatctggcagtaatctttctcct
gggcataatatattaggtaagggaagttttatattgggtcaagatcaggacacgtttggt
ggagagtttagccaaagcgaatcattcgtaggaaaattaacatacgtagatgtttggaac
cgagctttaacacaagaagaggttttaagacatttcgaggaatgctatggcttatttttt
ggaaatttatatgcctggccagtcatgcaagatttcattcacggagaagtacagatagaa
cactcaacgttttgtaaacgctgcgaagctcctaaacccttatacaatggttacatcaat
gtgataaaaaacatcgcatactattcttgttatcctggctttactttaaataatctggac
tatttcaatggacgaaaatgtacaaaagcttctcgctgggaaggccattatgatccctat
tgcagaagaatgtactgtggatatccagcttctatcagaaacggttacactataggcaat
cgatatttttatcaagacaaaatcatgtttaaatgctacgaaggttataacatgattgga
cctccggttttaacctgcgaccaaaatggaaaatggattcctcaaaaaccgcgatgtata
ggttcgcaacaatgtccagcttttagaaaacctgagtatagcaatatcatggttatttct
gatcagagttatgaagaattcaaagaaaatcaaacaaaatatgagataggcacccaaata
gagtttgaatgtattgatgaatatgaccttgttggtcaggatatattgagctgtcttgaa
aatgcaacttgggatttctcgccacctcagtgtgttcaaagaacaactactacaaccaca
actactaccacgacaactaccactaccacaactaccactattgctccaacaacgacgaca
actaaaacaccaacaaccaccacacccacaagtaccatccccacaactattactaccacg
cccacaactacaactatcccacccacaactaccactaccactcctacaactacgactacc
actacctccaccacaactacagctaccacccccagaactacaacttctacaactggagtt
actactccaacaactacgattaccattccgacaactacaccaacgaccataagtacatca
gttttgacaactcgatcagccaaatctggatgttcattagatcaaattccaccagctcct
gctaatggatatattaatcttaaatcatataatgccattgtaagtgaatcttcaaatgtt
atcgaatataagtgtagcgtgggttttaagctggtcggtgataaagtttccacttgtatt
atagatggatactggacagaaccaaacataagttgtcagccaatcagttgtaactcacct
ccgaaatttaaaaatatggcagtcgataacaatcaagcaacaatcagcagatcctacttg
tataagcatcaattgaactttacttgtgacgaagggtatgataaattgggagcacatctt
ggtatccgatgtttatcaactgggaaatggtctcgaattcaaggaaaatgtctacgaaaa
tcttgtggaaaacctgaaatatctgatgatactgatataaaaggtagatcatatttgttc
ggggataaagtaacaataacgtgtccaagtggttccacatacatactgatctgtagcaaa
actggatcctgggatggcgagagagaccaaacttgttaa
DBGET
integrated database retrieval system