Dysgonomonas sp. HDW5A: G7050_15835
Help
Entry
G7050_15835 CDS
T06482
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
dys
Dysgonomonas sp. HDW5A
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dys00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
dys02000
]
G7050_15835
Transporters [BR:
dys02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
G7050_15835
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIK61227
LinkDB
All DBs
Position
3858566..3860779
Genome browser
AA seq
737 aa
AA seq
DB search
MKKEIISLTAFLSSISIFSEEIPDSLKQVNLSEIIVSATRVNGRAPIAFSNMSAVQIKEN
NAARNIPYILETMPSVVAFSEDGSGVGNTSLRIRGTDATRINVTLNGMPLNNPESQEVYW
VNIPDISNSLQSIQVQRGVGSSTNGSAAFGASISLKSQGAKPEAYGEASTAIGSYNTFTS
TIAAGSGILKNGLSFDARYSRVTGDGYIRNGSVNHRSAYAALSYYNDNQLFKLSYINGIQ
HTGITWEGINPEQMKIDRRYNPAGRFYDSAGNVHYYDNETDNYYSNIVQFTYSNALSEQL
SLNIGLNYNHGYGYYENYKMNQKFSKFGLTPQLVNDSLYKSSDIIRRKLMKNNFYTGNIT
LSYATDRLNLIGGVMLSSYAGDHYGELKWAKLNQNIPSNYEWYMNDANKKEFNIFTKGTY
RVTDAFSIFGDLQYRYIDYRMKGIDDDLEDITNNNYFSFFNPKGGVSYNFDAKNDIYASL
SFAQREPLRTDIKESYKGGSYQRIKPEQMLDYELGYRYASKEASFNANIYYMKYKDQMVQ
TGKLNDVGYKLMENVPDSYRLGLELIGAYQFAKWVRLDANVTISRNKIKDYTAYFDLYDN
QTDYNFVGQTSEHFKSTDISFSPNVISSGTVTVTPYKTLTLALIGKYVGKQYYDNTSNPE
NQLTNYFVSNFAASYTFKTQKIGEINLQFFVNNIFNKEYVANAWVSTDKFKDNTQLVYTG
LFPQATRNIMAKLGIRF
NT seq
2214 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaggaaataatatctcttacagcttttctctccagtatttctatcttttcagaa
gaaatacctgacagtctaaaacaagtgaatctcagcgagattattgtatcagccacacga
gttaatggacgtgctccaattgcattttcaaatatgagtgctgtacaaattaaagaaaat
aatgcagcaaggaatattccttatattctagaaaccatgccttcggtagttgctttttca
gaagatggttccggtgttggtaacacctctcttcgtataaggggaacagatgctactcgt
attaatgttactctaaatggtatgccattaaataaccctgaaagtcaggaagtatattgg
gtaaatatacctgacatatctaattctctacaaagtattcaagtgcaacggggtgtcgga
tcatcaacaaatggttctgcggcatttggagctagtatatcattaaaaagtcaaggagca
aaacctgaagcatacggtgaagcatcaacagctattggaagttataatacttttacttct
actattgcagcaggaagcggtattttaaagaatggactttcttttgatgccagatattct
cgtgtaacaggagatggatatatcagaaatggtagtgtaaaccacagatctgcatatgca
gcattatcttattataacgacaatcagttatttaaactgagctatatcaatggtattcag
catacagggataacatgggaaggtattaaccctgaacagatgaaaattgatcgcagatac
aatccggcaggtcgattctatgacagtgcgggaaatgtgcactattatgataacgaaact
gataattattattccaatatagtacagtttacatactcaaatgctttatcagaacaattg
tctttaaacattggattaaattacaatcatgggtatggctattacgagaattataaaatg
aatcagaaattttccaagtttggtttaaccccacaattggtaaacgattcattatataaa
tcttcagatattatcagacgtaaattaatgaagaacaacttttatacggggaatatcact
ttaagctatgctacagatcgattaaatcttattggaggagttatgctgtcttcctatgcc
ggagatcactatggcgagcttaaatgggctaaactcaatcaaaatataccgtctaattac
gaatggtatatgaacgatgcaaataaaaaagaatttaatatattcaccaaaggtacttac
agggttacagacgcattctctatttttggagatcttcaatatcgctatatcgattacaga
atgaaaggtattgatgatgatttagaagatataactaataataattactttagtttcttt
aatccgaaaggaggagtttcttataatttcgatgctaaaaacgatatttatgcttctctt
tcttttgctcaacgtgaacctcttcgcaccgatataaaggaatcatacaagggaggcagc
tatcagcgcattaaaccagaacagatgcttgattatgaattaggttatagatacgcttca
aaagaggcttccttcaatgcaaatatctattatatgaaatacaaggatcagatggtgcaa
acaggaaaactaaatgacgtaggatataagttgatggaaaatgtacctgacagttatcgt
ctgggattagagcttattggtgcatatcagtttgcaaaatgggtacgattagatgcaaat
gttactataagcagaaataagataaaagactatacagcttattttgatttatatgataat
caaacagattataattttgtcggtcagacctcagagcactttaaatctactgacatttca
ttctctcctaatgttataagcagtggtactgtaactgttactccctataaaactcttaca
ttagcacttattggtaaatatgtaggaaaacaatattatgacaatacttctaaccccgaa
aatcaattaacaaactattttgtgagtaactttgcagcaagttatacattcaaaactcaa
aaaataggagaaataaatcttcaattctttgtcaataatatatttaataaagaatatgta
gctaatgcttgggtatccaccgacaaatttaaagataatacacaattggtatacaccggt
ttatttccacaagcgacacgcaatataatggcaaaactaggtatcagattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
