Dickeya chrysanthemi: Dd1591_0392
Help
Entry
Dd1591_0392 CDS
T00930
Name
(GenBank) Ig family protein
Organism
dze
Dickeya chrysanthemi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
He_PIG
DUF4347
Cadherin_5
Cadherin_4
Big_9
Ig_SibA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACT05282
UniProt:
C6CI36
LinkDB
All DBs
Position
444285..450290
Genome browser
AA seq
2001 aa
AA seq
DB search
MLWRHLFGNRYLFSNKRSNPARSVELTADMPLGYALEARMLFDGAIAATVDQTNPAQNTT
TATTDMAVHADDSHAQNSTGQTDSSSRDSGTKDTATKDTSTDGEKVAVAGEAVQTHKEVV
FIDTSVADYQTLVNQVPAGTDVVLLDSSKDGLTQMAAWAQTHSGYDAIHIISHGSEGQVS
LGTLTLNTTTAASRSADLATLGSALTNDGDLLLYGCDVASNTGAEFLTKVADLTGADVAA
STDATGASTLGGDWTLEAVNKDGIIDSHGLLFSHYSYLLDTLTFGDTGHENEFSYGSSTF
TRVVNSATITFTSVDAFGNATYSGRDYLYNSDSPNNQTEVTLSVTGYTFDINSFKYYAES
QSSSEVAPTVTIIVTYANNSTATASFLATQDSEQIVSNFSFNNGQTTINDVISVTIKASN
GSSIPSFGMQDLVINDVRAITSQDSTSTLTAGAASEATTFSTTATSVGSATSLMDFTITD
TGASDGVATTVSALYANVSGSATSSELSQMTFLLSGPDATNVVGTYNSGTGRVTFSGLNV
SIADGGSETYTIKAYYNDNISSSDITDHHTVVLSINASNVTTGSGSSTFAGSQANVTSGS
GASIDVAATQLVYNQPPSTSVVSGINFTTQPVVYAVDARGNIDTDFNSSVTLSENGSGSL
TGTTQVTASNGIATFSGVKYTSASDADANFVLTAASGSLVSATSASINPDVVATRLVFST
QPVPTTIQNGQSTNFTTVPVVQAVDANGIVDQDYTTNIVLSVTDPNDSVVDGTINSLTVT
SGDNDGSATTVTLTPSGGIATYTGLIIQYTNSGSANTLALRATSGGLTAINSSSITSTTN
AAPVFSNLNGGATYTENGSAVVMDNNVTVADTELDALNSGQGNYNGASITIARNGGASSN
DTFGNSGLLGALTQGQNFTYNGTTVGSVTTNSGGTLTLTFNSNATSAMVDAVLQSLTYAN
SSDDPPASVTLNWTFNDGSLNSSGSNQAVLSITPVNDAPVISNTSVSKTFNEDSAQTFSA
SDFGFSDVDSGDTLQSITIVTAPTAGELFIDANSDGVRGVGDTLLGDGAVVSAANIGKLT
FRPAANANGAGYATFNWTVSDGTASSANMGTMTLNVTAVNDAPVISNTSVSKTFNEDSAQ
TFSAADFGFSDVDSGNTLQSITIVTGPSVGELFIDANSDGVRGGGDTLLGNGAVVSAADI
GKLTFRPTANANGAGYAAFTWKVSDGTALSGNTGTMTLNVTPVNDAPTLSNGVTVTLTST
TEDVTSSATTVSSLLSNAGYGDVDSGASSGIAITTTAGNGGWQYSTDSGANWFSIGTVSG
SSALLLSSTAQVRYVPDSANGETATLGFRAWDQTSGTATAGASKGLADTSTTGGSSAFST
NNAQASLVVTSVNDAPTVGSPVSLQSATKDTAFSFTVPGGTFVDVDSGDTLTLSATQSDG
SPLPTWLSFNPSTRTFSGTPGSNDVGNLTIRVTATDGSNASVSTTFGLTVNNSNLPPVVS
VPVADQAIAQNGGFSFTVPAGTFTDPDTGDTLTLSATQSDGSPLPTWLSFNPSTRTFSGT
PGSNDVGNLTIRVTATDGSNASVSTTFGLTVNNSNLPPVVSVPVADQAIAQNGGFSFTVP
AGTFTDPDTGDTLTLSATQSDGSALPGWLSFNPSTRTFSGTPGNGDVGNLTIRVTATDGS
NASVSTTFGLNVTNVNDAPVVSGSLAAQTVAQNGGFSFTVPAGTFTDPDSGDTLTLSATQ
ADGSALPGWLSFNPATRTFSGTPGNGDVGNLTIRVTATDGSNASVSTTFGLVVTGSTVDN
GDPEFRINGGTSVPPTATPVPVVTVAPAAPVTLGALFSSTSLGALNTGATADNATAASTI
FQAAQRAPQVNNGAPVSQIAGAFVQGVVSGSASLFDSSLGSFPSFNTGGALGGSSSLAGL
FSGISLPSLSPMAVFSGGSWRDINTNGANSSRLTTGLGAMQFAPDLEQQLQHLGDDTQQR
LAAMEQALNDIGQITRARQQG
NT seq
6006 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctatggcgtcatctgttcggtaaccgttacttattcagtaacaaacgcagtaacccg
gcccgttctgttgagctaactgccgatatgccgttggggtatgcgctggaagctcgcatg
ttgtttgatggggctattgccgccactgtggatcagaccaaccccgcccaaaacaccacg
actgccaccacggatatggcagtgcacgccgacgacagccacgcacagaacagcaccggt
cagactgattcatccagccgggacagcggcaccaaagacactgctactaaagacacctct
accgatggtgagaaggtggccgtcgcgggcgaagcggtacagacgcacaaagaggtcgtt
ttcatcgatacctcggtggcggattaccagacgttggtcaatcaggtgcctgccggaaca
gatgtggtattgctggacagcagcaaagatggcctgacccaaatggcggcatgggcgcaa
acccacagcggctatgacgcgattcatatcatcagtcatggtagtgaagggcaggtttca
ctggggacgctgacgttaaatacgacgacggcagcgtcacgctccgctgatttggcgacg
ctgggttcagccttgacgaatgatggggatctgttgctgtacgggtgtgatgtagcaagc
aatacaggggctgagtttcttactaaagtggccgacttaacaggcgctgatgtggccgcg
tcgactgatgccactggggcatcaacgcttggtggtgactggacgttagaggctgttaac
aaggatggcatcattgatagccatggtttgttgttcagccattatagttacctgctagat
acgctgacctttggtgataccggccatgaaaatgaatttagctacggatcgtccacattc
actcgtgtagtgaatagcgcgacgatcacctttacttctgtcgatgcctttggtaatgcg
acctattccggcagggactacctttataattctgatagccccaataatcagacggaggtg
acgctttcagttacaggttatacttttgatattaattcgttcaaatactatgcggagtcc
cagtcgagcagtgaagtcgcgcctaccgtcacgatcattgtgacatatgcgaataattca
acggctacggcatcatttcttgctacacaagatagcgagcaaatcgtttcaaacttctca
ttcaataatggccaaacgacgattaacgacgttatctcggtgacgattaaagccagtaat
ggctcatcgatcccttccttcggtatgcaggatctggtgatcaatgatgtcagagccatc
acgtcacaagactcgacctccacgctgaccgccggcgcagccagcgaggcgaccacgttt
tctaccacggcgacgtcggtgggcagcgcgacgtcactgatggatttcaccattaccgac
accggcgcatcggacggggtcgccacgaccgtcagcgcgttatacgctaacgtcagtgga
agcgcgacatcatcggaattaagccagatgaccttcctgctcagcggccccgatgccact
aacgtggtgggtacgtacaatagcggcactggcagagtcacgttttccgggcttaatgtg
tcgattgccgacggcggcagcgaaacctacaccatcaaagcctattacaacgacaacatc
agcagtagcgacatcaccgaccaccacacggtggtactgtccatcaatgccagcaacgtg
actaccgggtcgggcagttccacttttgccggcagtcaggccaacgtgacgagcggtagc
ggcgccagtattgatgtggcggcgacccaactggtttataaccagccgccgtccacctcc
gtggtcagcggcattaactttaccacccagccggtggtgtacgccgttgacgctcgcggc
aatatcgacaccgatttcaatagctcggtaacgctaagcgagaacggcagcggctcgctg
accggcaccactcaggtgaccgcctcaaacggtattgctacctttagcggtgtgaagtac
acctcggccagcgacgccgatgctaacttcgtgctgacggcggcgtccggtagcctagtc
agcgccacatctgcgtcgatcaatccggatgtggtggcgacgcggctggttttttccacc
caaccggtgccgactacgatccagaatggacaaagcaccaactttactaccgtaccggtc
gttcaggcggttgatgcgaatggcatagtggatcaggattacaccaccaatatcgtgctc
tcggtgactgaccctaacgacagtgtcgtcgatggtacgatcaatagcctgacggtcacc
tcgggcgataatgatggcagcgctacgacggtaacattaacgccgtctggcggtatcgcc
acctacaccggcctgattatccagtacaccaacagcggcagcgccaatacgctggcgctg
cgcgccacatcaggtggcctgacggcgatcaacagttcgtcgataacctcaaccaccaac
gctgcccccgtattcagcaacctgaacggcggcgcgacctataccgaaaatggcagcgcg
gtggtgatggataataatgtcaccgtcgccgataccgaactcgacgcgcttaacagcgga
cagggcaactataacggcgcatcgatcaccatcgcccgcaacggtggggccagcagtaac
gataccttcggcaatagcgggctgttgggggcgctgacgcaagggcaaaacttcacgtac
aacggtacgaccgtgggcagcgtcacgaccaattcgggcggtacgctgacgctgacgttt
aatagcaatgccacctcggcgatggtagatgccgtgctgcaatccctgacctatgccaac
agttctgacgatccaccggccagcgtcaccctgaactggacctttaacgacggctcgctc
aacagtagcggcagcaatcaggcggtactgagcatcacgccggtcaacgatgcgccggtc
atcagcaacacgtcggtcagcaaaaccttcaatgaggatagcgcgcagaccttcagcgcc
tcggatttcggtttcagcgatgtggatagcggcgacacgctgcaatccatcaccatcgtc
accgcaccgacggcgggcgagctgtttattgacgccaacagcgacggtgtgcgcggcgtc
ggcgatacattgcttggcgacggggcggtggtcagtgcggccaacatcggcaaattgacc
ttccgcccggcggcgaatgccaacggcgcgggttatgccaccttcaactggacggtcagc
gacggcacggcgtcgtccgcaaatatggggacgatgaccctcaacgtgacggcggtcaac
gacgcgccggtcatcagcaacacgtcggtcagtaaaaccttcaatgaggatagcgcgcag
actttcagcgccgctgattttggtttcagcgatgtggatagcggcaacacgctgcaatcc
atcaccatcgtcaccgggccgagcgtcggtgaattgtttattgacgccaacagcgacggt
gtacgtggcggcggcgataccttactgggcaacggggcggtggtcagcgcggccgatatc
ggcaaactgaccttccgcccgaccgcgaatgccaacggcgcgggctatgccgcctttacc
tggaaagtcagcgatggtacggcgttgtccggcaataccgggacgatgaccctcaatgta
acgccggttaacgatgcgccaacgttatccaacggcgtgacggtcaccctgacatcaacg
acggaagacgtgacgtcgtccgctactacggtatcgtcgttgctcagcaacgcgggctat
ggcgatgtggacagcggagcatccagcggcatcgctattaccacgacggcagggaacggc
ggctggcagtattccacggatagtggcgcgaactggttttctatcggaacggtatccggc
tcatcggcactgttgttgagctcgacggcacaggttcgctatgtgccggacagcgccaat
ggcgaaaccgcaacgctgggtttcagagcctgggatcaaaccagcggtactgccactgcg
ggtgccagcaagggcctggcggatacctcgactactggcggcagcagtgcgttctccacc
aataatgcacaagcatcgttggtggtaaccagcgtgaatgacgcccctaccgtggggagc
ccggtcagtctccaaagcgccaccaaagacacggcgttcagtttcaccgtacctggcggt
acttttgtcgatgtggatagtggcgacacgttgacgctgagcgctacccagtcggatggt
tcgccgctgccgacctggctgagttttaacccgtcaacccgcaccttctcgggtacgccg
ggcagcaacgatgtgggcaacctgaccatccgggtgacggcgaccgatggcagtaatgcg
tcggtcagcaccacctttgggctgacagtcaacaacagtaatcttcctccagtcgtttcc
gtaccggtggcggatcaggctattgcgcagaacggcggtttcagctttaccgtaccggcc
ggcacctttaccgacccggataccggcgacacgttgacgctgagcgctacccagtcggat
ggttcgccgctgccgacctggctgagttttaacccgtcaacccgcaccttctcgggtacg
ccgggcagcaacgatgtgggcaacctgaccatccgggtgacggcgaccgatggcagtaat
gcgtcggtcagcaccacctttgggctgacagtcaacaacagtaatcttcctccagtcgtt
tccgtaccggtggcggatcaggctattgcgcagaacggcggtttcagctttaccgtaccg
gccggcacctttaccgacccggataccggcgacacgctgacgctgagcgccacccagtcg
gatggctcggcgctgccgggctggctgagttttaacccgtcaacccgcaccttctcgggc
acgccgggcaacggcgatgtgggtaacctgaccatccgggtgacggcgaccgacggcagc
aacgcctcggtcagcaccaccttcgggttgaacgtcaccaacgttaatgatgcgccggtg
gtatccggttcgctggctgcgcagacggtggcgcagaacggcggtttcagctttaccgtc
ccggccggcacctttaccgacccagatagcggcgacacgctgacgctgagcgccacccag
gcggatggctcggcgctgccgggctggctaagttttaatccggctacccgcaccttctcg
ggcacgccgggcaacggcgacgtgggcaacctgaccatccgggtgacggcgaccgacggc
agcaacgcgtcggtcagcaccactttcgggctggtcgttaccggcagcactgtggataac
ggcgatccggaattcagaatcaatggcggcacgagtgtgccgccaacggctacgcccgtg
ccggttgtgacggtggcaccggcggcaccggtaaccttaggggcgttgttctcatctaca
tcgctcggtgcgctgaataccggcgccaccgcagataacgcaacggcggcgtcaaccatc
tttcaggctgcccaacgtgcgccacaagtcaataatggcgcaccggtcagccagatagcc
ggcgcttttgtgcagggtgtcgtttccggcagcgccagtctgtttgacagttcgctgggg
tcattccccagctttaacaccggcggtgcgttgggcggcagttcttcactggcggggctg
ttttcgggcatcagcttgccttctttgtcgccgatggcggtgttctccggcggcagttgg
cgcgacatcaacactaacggtgcgaattccagccggttaactaccggcctgggcgcgatg
caattcgccccagatctggaacagcagctacaacatcttggggatgatacacagcagcgg
ctggcggcgatggagcaggcgttgaatgatatcggccagatcacccgcgccagacaacaa
gggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
