Durio zibethinus (durian): 111306742
Help
Entry
111306742 CDS
T05242
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
dzi
Durio zibethinus (durian)
Pathway
dzi03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dzi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
111306742
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
dzi03019
]
111306742
Messenger RNA biogenesis [BR:
dzi03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
111306742
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111306742
NCBI-ProteinID:
XP_022760328
UniProt:
A0A6P6A5T8
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
459 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETNEDKLREYFGHYGEVLQTVVMRDKITGRPRGFGFVVFSDPSVL
DTVLQEKHTIDGRQVEAKRALSREEQQTSARSGNLNQGRNSGGVGNIRTKKIFVGGLPPT
LTEEGFRQYFEAYGHVTDVVIMYDQNTQRPRGFGFISFDTEDAVDRVLHKTFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGVSRNMSGGGGGGYQGYGSSGGNVSSYDGRMDSNRYMQAQSTGAGFP
PYGSSGYTPGYGYGPANNGVGYGSYGNYGGAGAGYGAPAGAGYGNPNAGYATGPPATPRS
SWGTQTPSGYGAMGYGNAAPWGAPSAGAGSGGPGSAATGQSPTGAAGYGSQGYGYGGYGG
NDGSYGNAGYGTVGVRSGGTPNSNAGAGGGDLQGSGGGYMGSGYGDANGSSGYGNASWRS
DSSQGSGNYGGTQANVPHGGQGGYSGGYGGAQGRQAQQQ
NT seq
1380 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcagggaaagttgttcattggagggatatcatgggaaacaaacgaagat
aagctaagggaatactttggccattacggcgaggttttacagactgttgttatgagagat
aagattacgggaagacctcgggggtttggattcgttgtcttttcagatccttctgttctt
gacactgttcttcaagaaaaacacaccatcgatggtagacaggttgaggcaaagagggcg
ttatcaagagaggagcagcaaacttctgctagatctggaaatcttaatcagggtagaaac
tctggaggcgttggaaatatcaggaccaagaagatttttgttggagggttgcctcctacc
ttaactgaagagggatttcgccaatactttgaggcttatggtcatgtaactgatgtggta
atcatgtatgatcagaatacccagcggcctcgcgggtttggttttatctcctttgacact
gaagatgctgttgatagggttttgcacaagacttttcatgatttaaatggcaagcaagtt
gaagtgaagcgggcccttcccaaagatgccaatcctggtggggttagccgaaatatgagt
ggtggtggtggtggaggttatcagggctatggttcttctggtgggaatgtcagttcttat
gatggtcgtatggactccaataggtacatgcaggcccagagtactggagctggctttcca
ccttatggctcatcaggatatacacctggttacggttatggtcctgctaataatggtgtt
ggttatggtagttatggcaattatggtggtgcaggtgctggttatggtgcccctgcaggt
gcaggttatgggaacccgaatgctggttatgcaactgggcctcctgctacccctagaagt
tcatggggtactcaaactccatctggttatggtgctatgggttatgggaatgctgctcct
tggggtgccccaagtgctggtgctggtagcggtggcccaggttcagcagctaccggccaa
tctcccactggagctgctgggtacgggagtcaaggttatggatatggtggatatggtgga
aatgatggatcttatgggaatgctgggtatgggactgttggagttcgttctggtggtact
ccaaatagtaatgctggtgctggtgggggagatctacaagggagcggcggtggttacatg
ggaagtggatatggtgatgcaaatggaagttcagggtatggaaatgcatcttggaggtcc
gattcatcacaaggttctggaaattatgggggcactcaggcaaatgttcctcatggtgga
caaggtggttacagtggtgggtacggtggtgctcagggtcgacaagcgcaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
