Escherichia coli ABU 83972: ECABU_c02850
Help
Entry
ECABU_c02850 CDS
T01995
Name
(GenBank) putative exopolygalacturonate lyase
KO
K22994
pectate disaccharide-lyase [EC:
4.2.2.9
]
Organism
eab
Escherichia coli ABU 83972
Pathway
eab00040
Pentose and glucuronate interconversions
eab01100
Metabolic pathways
eab01120
Microbial metabolism in diverse environments
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eab00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00040 Pentose and glucuronate interconversions
ECABU_c02850
Enzymes [BR:
eab01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.9 pectate disaccharide-lyase
ECABU_c02850
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PelX_N
Pel9A-like_beta_helix
PelX_Ig
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADN44891
LinkDB
All DBs
Position
287707..289941
Genome browser
AA seq
744 aa
AA seq
DB search
MNKHTLLLTVLFLNLICTPVFAQNWQVATFGQSTDLNFSSLIDSAKIGRNNAWLAGNNNF
LEAGKFYTLPTDFFIESRGGKIANSHDGMTVFYTIVPVTQTFRLEADLTLEQIGPEVNGK
SPAGQEGAGLFVRDIIGPQRQEPQSAGTEEYPQASNILMNAFITQNKKNDNLVQITSIVR
EGVIKTWGNEGITIKKQPIIENINFTQKRNIHMTIERLPEKFILTAFDTDRKENQSWQFS
DYSGFMNQLDNNSLAIGFFAARNAKLRVKNASFKPGKPLVDYKQLTSRQFSRVRHKAPEL
FLASPQSVVRNSTTLQFLANQAGIVSIDNDKQTKQVQAGELVQFPVTLQKKHNDFTVNFN
VDGNISKKAIRIEQVKSNLTDPYEIYVCSDCRQGARGSKNDPVDLQTAVKFVAPGGNIYL
NDGQYHGITLDRELSGIPGKYKTISAINPHKAIFINKTFNLDASYWHLKSVVFDGNVDNG
NNKPAYLRIAGSYNIIEHVIARNNDDTGISISAKDKNRFFWPAHNLVLNSDSYNNLDLSG
INADGFAAKLGVGPGNIFRGCIAHNNADDGWDLFNKIEDGPNASVTIENSVAYENGLPYN
KADILKGSIGNGFKLGGEGQPVNHKVINSIAINNNMDGFTDNFNTGSLIVRNNIAMNNAR
YNYILRTNPYKFPSSILFDNNYSIRDDWENKIKDFLGDTVNSVNYKLLVSHETGPVQKDL
FFTRDDSGNIIYPDFFLNIINKFN
NT seq
2235 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagcacacactattactgactgttctttttctgaatttgatttgtactcccgtt
tttgctcaaaactggcaggtggcgacgtttggtcagtctacggatctcaacttttcatcg
ctgatagattcggccaagatcggacggaataatgcctggcttgcaggaaacaataatttt
cttgaagctggaaaattttacactttaccaacagatttttttattgaaagccgtggggga
aaaattgctaactcccatgacggtatgaccgtcttttatactattgttccggttactcag
acattccgactggaggctgatttgacattagaacagattggtccggaggtgaatggaaaa
tcaccagcgggacaggagggagctggattgtttgtcagagatattatcggtcctcagcga
caggaacctcagtcagctggaacagaagaatatccccaggcctctaatatattgatgaat
gcctttattacacagaataaaaagaatgataacttagtacagattacttcaattgttcgt
gaaggagtaataaaaacatggggtaatgaaggtattacaattaagaaacagccgatcatt
gagaatataaactttacgcaaaaaagaaatattcatatgacgatcgagcgactaccagag
aagttcatcctgaccgcttttgataccgatcgtaaagaaaatcagtcatggcaattttct
gattactcaggctttatgaatcaactggataataatagtttagctattggtttttttgcc
gcacgaaatgcgaaactaagggtgaaaaatgcatcatttaaaccgggcaagccactggtt
gattacaaacaattaacttcacgtcaattcagtcgtgtccggcataaagcccctgaactt
tttcttgcttcacctcaatccgttgtaagaaactcaacaactcttcaatttttggccaat
caggctggaatagtcagtattgataatgataagcagactaagcaggtgcaggcgggtgaa
ctggtacagtttccagttactttgcaaaaaaaacataatgacttcaccgtcaactttaac
gttgatgggaatatatcaaaaaaagctatacgcatagagcaggttaaatcaaacctgact
gatccttatgagatttacgtatgtagtgattgtcgacagggggccagaggcagcaaaaat
gaccctgtagatttacagacagccgtaaaatttgtcgcacccggcggtaatatatacctt
aacgatggtcaatatcatggaattaccttagatcgggaattaagtggaatacctggcaag
tataaaacaatttctgccattaatccacataaagccatttttataaacaagacattcaat
ctggatgcaagttactggcatctaaaatccgtggtctttgacggcaatgtggataatgga
aataataaaccagcatatttgcgtatagctggtagctataatattattgagcatgtgata
gccagaaataatgatgatacgggaatttctatttcagcgaaagataaaaaccgttttttc
tggccagctcataacttagttttaaactcagattcatataataatcttgatttatccggg
attaatgccgatggttttgctgcaaaattaggtgtcggaccgggaaacatttttcgagga
tgcattgcacataataatgcagatgatggttgggacctatttaacaaaattgaagatggt
ccaaatgcatctgttactattgagaattctgtagcctatgaaaatggcctgccatacaat
aaagcggatatcctaaaagggagtattggcaatggctttaaattaggtggtgaaggtcaa
ccagtaaatcacaaagttattaattccattgctattaataataatatggatggattcact
gataattttaatactgggtcattgatagttagaaataatatagcaatgaacaatgcacgc
tataattatattttaagaactaacccatataaattcccatcatctatcctttttgataat
aattattcaatcagagatgattgggaaaataaaataaaagacttcttaggtgatacagtt
aacagtgtgaattataaattgcttgtttcacatgaaacaggaccggtacaaaaagattta
tttttcacacgagatgatagtggaaatattatctatcctgatttttttcttaatatcatt
aataaatttaattag
DBGET
integrated database retrieval system