Candidatus Ecksteinia adelgidicola: F7X37_00437
Help
Entry
F7X37_00437 CDS
T08924
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
eag
Candidatus Ecksteinia adelgidicola
Pathway
eag03030
DNA replication
eag03430
Mismatch repair
eag03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eag00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
F7X37_00437 (dnaE)
03430 Mismatch repair
F7X37_00437 (dnaE)
03440 Homologous recombination
F7X37_00437 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
eag03032
]
F7X37_00437 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
eag03400
]
F7X37_00437 (dnaE)
Enzymes [BR:
eag01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
F7X37_00437 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
eag03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
F7X37_00437 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
eag03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
F7X37_00437 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
DNA_pol_IIIA_C
tRNA_anti-codon
RMI2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UDG79451
LinkDB
All DBs
Position
complement(862317..865805)
Genome browser
AA seq
1162 aa
AA seq
DB search
MPKPRFIHLRIHSDYSMIDGLSKVKSLVKRAANLGMPALAITDFTNLFGLVKFYNYSYDQ
GIKPIIGSDFYLQNNIVGVKLGHITILAMNNKGYQNLILLISHAYQRGYDSHGPFINQEC
LVKYREGLLIISGACHGDIGQLLLCKNKSKINQCLDFYKKYFPNAYYLELIRTGRLNEER
YLHSAVELAIEHNLPVVATNDVRFLSKNDFDAHEIREAIHKGITLNDPKRIKKYSSEQYM
RSEEEMCKLFSDIPEALINTIEIAKRCNVFIRLGEYFLPQFPTGNMNTENFLILKSKEGL
NKRLLFLFPDHKIRHKNNKKYNDRLNLELKVINKMGFSGYFLIVMEFIHWSKKNKIPVGP
GRGSGAGSLVAYALNITDIDPLEFDLLFERFLNPERISMPDFDIDFCMEKRDLVIDHVSE
IYGRESVSQIITFGTMTAKAVIRDVGRALGYPYSFVDRIAKLIPIDPGITLKKAFFSESK
LLEMYKTDEEVKILIDMAKKLEGVIRNAGKHAGGVVISPTKITDFSPLYYDQEGHYPVTQ
FDKNDIEHVGLVKFDFLGLRTLTIIDWTIRMINEKNVKIGALPIDITTIPLNDKESFNIL
KRAETTAVFQLESRGMKDLIKRLKPDCFEDIIALVALFRPGPLQSGMVDNFINRKHGREA
ISYPDFYCQHESLKPVLESTYGIILYQEQVMKIAQILAGYTLGNADILRRAMSKKDPIEM
KKQRSIFENGSKLQGLNSEMSVKIFNLVEKFAGYGFNKSHSAAYALVSYQTLWLKAHYPV
EFMAAVMTADMDNTNKVVGLIDECWRMGLKILPPDINSGQYYFHVNDNEEIVYGIGAIKG
LGESLIKSIIKIRNSNTQAYFKDLFDLCSRSNIRKLNRRVLEKLIMSGALDQLGPHRAAL
MHTLDDALKSADQYTRNLAVGQVDMFGLIKKDSDQIDKINANIPKWKEQVVLEGERETLG
LYLTGHPITQYLKEIQFYSSGQRLKDIQSVDRGRIVTIVGLVLNVRVIMTKLNNPIGICT
LDDRSGHLEVILFTEVLKTYKKFLQKDRILIVNGQVHLNHFNKKLKIIARKIMDISDARK
KYVRRISILITNTQNNHQFFNSFKKLLKLHELGTVPVNIYYQQKNIRTTLCYGETWHVTL
NDSLLNDLKMLVGSNQVKLEFN
NT seq
3489 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctaaacctcgttttattcatttacgcattcatagcgattattcaatgattgatggt
ttatctaaagttaaatctttagtaaaacgagctgctaatttaggtatgcctgctttagca
attactgattttactaatttatttggcttagtaaaattttacaattattcttacgatcaa
ggtattaaaccaattattggatcagatttttatcttcaaaataacattgttggtgttaaa
ttaggacatataacaatattagcaatgaataataaaggttatcaaaatctaatattatta
atctctcatgcttatcaacgtggttatgattctcatggaccatttattaatcaagaatgc
ttagtaaaatatcgtgaagggttgttgataatatctggtgcttgtcatggtgatattggt
caacttttactttgtaaaaacaaatcaaaaataaatcaatgtttagatttttacaaaaag
tattttcctaatgcttactacttagaattaattcgtactggtcgattaaatgaagaacgt
tacttacattctgcagtagaattagctatagaacataatttaccggttgttgctactaat
gatgtgcgttttttatcaaaaaatgattttgatgctcatgaaattcgtgaagctattcat
aaaggcataacattaaatgatcctaaaagaatcaaaaaatatagttcagaacaatatatg
cgtagtgaagaagaaatgtgcaaattattctctgatattccagaagcgttaattaatact
attgaaattgctaagcgttgtaacgtatttatccgtttaggtgaatattttttacctcag
tttccaactggaaatatgaatactgagaattttttaattctaaagtcaaaagaaggttta
aataaacgtcttttatttttatttcctgaccataaaattcgtcataaaaataataaaaaa
tataacgatcgtttaaacttagagttaaaagtaattaacaaaatgggcttttctggttat
tttttaattgtaatggaatttattcactggtcaaaaaaaaataaaataccagttggccca
ggacgtggttctggtgctggttcacttgtagcttacgcattaaatatcactgatatagat
ccgttagaatttgatttattatttgagcgatttttaaatccagagcgcatttcaatgcca
gattttgatattgatttttgtatggagaagcgtgatttggttattgatcatgtatcagag
atatatggtcgtgaatctgtatctcaaatcattacttttggtacaatgacagcaaaagca
gtaattcgagatgtaggtcgtgcactaggttatccatatagttttgttgatcgaattgct
aaattaattccaattgatcccggtataacactaaaaaaagcttttttttctgaatcaaag
ttacttgaaatgtataaaacagatgaagaagttaaaatattaattgatatggctaaaaaa
ttagaaggtgtaatacgcaacgctggaaaacatgcaggtggtgtggttatttcaccaact
aaaattactgatttttcaccattgtactatgatcaggaaggtcattacccagtaactcaa
tttgataaaaatgatatagaacatgtaggattagtaaaatttgattttcttggtcttcgt
actttaacaattattgattggacaataaggatgattaatgaaaaaaatgttaaaattgga
gctttaccaattgatattactactattccgcttaatgataaagaaagttttaacatttta
aaacgtgcagaaactactgctgtatttcagcttgaatcaagaggaatgaaagacttaatt
aaacgattaaaacctgattgttttgaagatataattgcattagtagcattatttcgtcct
ggtcctcttcaatcaggcatggtagataatttcattaatcgaaaacatggacgggaagca
atttcttatcctgacttttattgtcagcatgaatctcttaaaccagtgttagaatcaact
tacggtattattctttaccaagaacaagtaatgaaaatagctcagatacttgctggatat
actttaggaaatgcagatatcttgcgtcgtgcaatgagcaaaaaagatccgatagaaatg
aaaaaacagcggagtatttttgaaaatggttcaaaattacagggtttaaattctgaaatg
tcagttaaaatttttaatttagtagaaaaatttgctggttatggctttaataagtctcat
tctgctgcttatgcattagtatcttatcaaactctttggttaaaagcgcattatccagtt
gaatttatggcagcagtaatgactgcagatatggataacactaataaagtagttggatta
atagatgaatgttggcgaatgggattaaaaatcttaccaccagatattaatagcggacaa
tattactttcatgtaaatgataacgaagaaatagtatatggtattggggcaataaaaggt
ttaggagaaagtttaattaaaagtattataaaaatacgcaatagtaatactcaagcttat
tttaaagatttatttgatctctgttcacgttctaatattagaaaattaaatcgtcgtgtt
ttagaaaaattaattatgtctggagcacttgaccagttaggtcctcaccgtgcagcttta
atgcatacattagatgatgcattaaaatcagctgatcaatatactagaaacttagctgtt
ggtcaagtagatatgtttggtcttataaaaaaagactctgatcaaatagataaaattaat
gctaatataccaaaatggaaagaacaagtagttcttgaaggtgaaagagaaactctaggc
ttatatttaactggccatccaattactcaatatttaaaagagattcaattttattcttct
ggtcagagattaaaagatatacaatccgtagatcgggggagaatagttaccatagtaggt
ttagttttaaatgttcgagttataatgactaaactcaacaatcctattggtatttgtaca
ttagatgatcgatcaggtcatttagaagttatattatttacagaagtattaaaaacatat
aaaaagtttcttcaaaaagatcgtattttaattgttaatggacaagttcatttaaatcat
tttaataaaaaactaaaaataatagctcgaaaaataatggatattagcgatgctcgaaaa
aaatatgtacgtagaatttctattctaataacaaatacgcaaaacaatcatcaatttttt
aactcttttaaaaaattgttaaaattgcatgaattaggtactgttccagtaaatatttat
tatcaacaaaaaaatattcgcacaacattatgttatggtgaaacctggcatgtaacatta
aatgattctttactaaatgatttaaaaatgttagttggttctaatcaagtaaagttagaa
tttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system