Candidatus Ecksteinia adelgidicola: F7X37_00461
Help
Entry
F7X37_00461 CDS
T08924
Symbol
recB
Name
(GenBank) RecBCD enzyme subunit RecB
KO
K03582
exodeoxyribonuclease V beta subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
eag
Candidatus Ecksteinia adelgidicola
Pathway
eag03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eag00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
F7X37_00461 (recB)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
eag03400
]
F7X37_00461 (recB)
Enzymes [BR:
eag01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
F7X37_00461 (recB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
eag03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
F7X37_00461 (recB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
AAA_11
DUF7396
PDDEXK_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UDG79474
LinkDB
All DBs
Position
complement(906160..909699)
Genome browser
AA seq
1179 aa
AA seq
DB search
MTHKTIQQLDLIKLPLLNAQLIEASAGTGKTFTISMLYLRLLLGLTQDTAFSRPLTVKEI
LVLTFTEIATKELIERIRINIHKFRLVCMRNKSQDKYFSLLLNKISNFDQAICQLRLAEQ
QMDEASIFTIHSFSKQILTKYPLESKIFFKKKIVKNELLLYKKACIDFWRRCCYKLPLEI
SCIINKEWSGPDELLSDIIDYLHGEVPSFVCFSTEKETLLSRHEKIIAHIKKIKLDWRKT
SNNLQELIIKFNLNKRSYNNKNISRWIYKIDKWAIQETLDYQLPKELNKFRQSFFLKESK
QDKVPTHSLFIAIDILFNSSLTLRDLFISDAIIEIRSLIWKEKCQQATLGFDDLIRLLNY
ALHGIKGEELSQSIRHSYPIAIIDEFQDTDPEQYRIFEKIYINQLNCALLLIGDPKQAIY
TFRGANIFTYMKVRSVISSIYTLKINWRSSSLMVESINILFSQVEKPFIFNQIPFIKTYA
SKKNDNLFFKLNNKSQPAIKFWLQQRKNIKISDYRKFMARLCAAHICDWLIAGKKGKAWI
GNKESYRLVNACNIVVLVRNRDEGMLIYNALSALLIPSVYLSNHDSVFRTLEAKDVLWLL
KSILNPEDECTLRCAISTELIGLDAHTLFTLINNENTWNSLVDEFNQYRVIWKNKGILLM
LHEVIKTRCLLESILSTPHGKRRLTNILHLSELLQEASLKFNTEHGLIQWFMDQIVQPDV
KCNNQQLRLEEDNNIVRIISIHKSKGLEFDLVWLPFISSFREQDQALYHDRHSFKLLLDL
QYRKKSLILAEEERLSEDLRLLYVALTRSIYHTSIGIAPIVKNINKTNSTTDLHRSALGY
LVQSGQSGDTMHLNECLKKLVNHNYIDYETINVLNETIYQEKLTNFKKLDVKNFTRKIKD
FWKIISYTSLIQHHENAKKTIPIQLKITKNKTILNKNNLIFSPHTFPRGKFSGIFLHSLL
EILDFKRKVDKKWLLEQLQKKGFSDQWQPILEEWINQVVVTPLNNFNLTLSLLKKEHKQS
EFKFYLSINQLLKVRKLDKLMKQYDPLSISCPELDFKKIYGILRGSIDLVFFWKEKYYLL
DYKSNWLGKDSSAYTQLEMKKAIIEHRYDLQYQIYTLALHRYLRHRITDYSYQKNFGGVI
YLFLRGMTKNHLNNGIFTCFPSKKLIEGIDCLFENKNII
NT seq
3540 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactcataaaacaattcaacaacttgatttaattaaactaccattattaaatgcgcaa
ttaattgaagcttctgctggaactggaaaaacattcactattagtatgctttaccttcgt
cttttattaggtcttacgcaagacacagcattctctagaccattaactgtaaaagaaatt
ttagtattaacatttacagagatagctactaaagagcttattgaacgtattcgtattaac
atacataaatttcgtcttgtttgtatgcgaaataaaagtcaagacaaatatttttcactc
ttattaaataaaatatcgaattttgaccaagctatatgccaattacgtttagctgaacaa
caaatggatgaagcatcaatttttactattcattctttttctaaacaaattttaactaaa
tatccactagaatctaaaatcttttttaaaaaaaaaatagtaaaaaatgaactcttatta
tataagaaagcatgtattgatttttggcgacgttgttgttataaacttccattagaaatt
tcttgcattattaataaagaatggagtggtccagatgaattactttctgatattattgat
tatttacatggtgaagtaccttcttttgtctgtttttcaacagaaaaagaaacattatta
agtcgtcatgagaaaattatagcacatattaagaaaattaaattagattggaggaaaact
tccaataatcttcaagagttaattattaaatttaatcttaacaaacgtagttataataat
aaaaatatatcacgttggatatataaaattgacaaatgggcgatacaagaaacattagat
tatcaattaccgaaagaattaaataaatttcgtcaatcgttttttttaaaagaaagtaaa
caagacaaagttccaactcattcattatttatcgctattgatatattgtttaattcttca
ttaacattacgtgacttatttatttcagacgcaattattgaaatacgttctttaatttgg
aaagaaaaatgtcaacaagctacgttaggatttgatgatttaatcagattgctaaactat
gcattacatggaataaaaggagaagaattatctcaatcaattcgtcattcttatcctata
gcaatcattgatgaatttcaagatactgatcctgagcaatatcgtatttttgaaaaaatt
tatattaatcaattaaattgtgctttactgttaattggtgatccaaaacaagcaatttat
acttttcgtggtgcgaatatttttacttatatgaaagttcgttctgtaataagttcaatt
tatacactgaaaataaattggcgttcctcttctttaatggttgaaagtattaatatattg
ttttctcaagttgaaaaaccttttatttttaatcaaataccttttataaaaacttatgca
tcaaaaaaaaatgataacttattttttaaattgaataacaaatcacaaccagcaataaaa
ttttggctacaacaaagaaaaaacataaaaatatctgattatagaaaatttatggcacga
ttatgtgctgcacatatttgtgattggctgatcgctggaaaaaaaggaaaagcttggata
ggaaataaagaatcttataggttagtgaacgcttgtaatattgtagtgctagttcgtaat
cgtgatgaaggaatgttaatatacaatgcacttagtgcacttttaatcccttcagtttat
ctttctaatcatgatagtgtgtttcgtacactagaagctaaagatgtattatggttatta
aaatctattttgaatccagaggatgagtgcacattacgttgtgctatttctactgagcta
atagggttagatgctcacactttatttactttaataaataatgaaaatacttggaattct
ttagtcgacgagtttaatcaataccgtgttatatggaaaaataagggtatattactaatg
ttacatgaagtaataaaaactcgttgtcttttagagagtatactctctacacctcatggt
aaaagacgattaactaacatacttcatttaagtgagttattacaagaagcttcattgaaa
ttcaatacagaacatggtttaattcaatggtttatggatcaaatagtacaacctgatgtt
aaatgtaataatcaacaactcagattagaagaagataataatatagtaagaataataagt
attcataaatctaaaggattagaatttgatttagtatggttgccatttatttcaagtttt
cgagaacaagatcaagcgttatatcatgatcgtcatagttttaaattgctattagatctt
caatatcgtaaaaaaagtttaattttagcggaagaagaacgtttatcagaagatttaaga
ttgttgtatgtagctttaactcgttctatatatcatactagtattggtattgcaccaatt
gttaaaaatataaataaaacaaatagtaccaccgatttacatcgtagtgctttaggttat
ttagtacaatctggtcaatctggtgatacgatgcatttaaatgaatgtttaaaaaaatta
gtaaatcataattatattgattatgaaactattaatgtattaaatgagacaatttatcaa
gaaaaattaactaattttaaaaaattagatgtaaagaattttactcgaaaaattaaagat
ttttggaaaattatcagttatacaagtttaatacaacatcatgaaaacgcaaaaaaaaca
ataccaatacaattaaaaattactaaaaataaaacaatattaaataaaaataacttaata
tttagccctcatacttttcctcgtggaaaattttctggaatttttttgcatagtttattg
gagatattagattttaagcgtaaagtagataaaaaatggctattagaacaattacagaaa
aaaggtttttctgatcaatggcaacctattttagaagaatggattaatcaagttgttgtt
acaccccttaataattttaatttaacattatcattattaaaaaaagaacataaacaatct
gaatttaaattttatttgtcaattaatcaattattaaaagtaagaaaacttgataaatta
atgaaacagtatgatcctttatctattagttgtccggaattagattttaaaaaaatttat
ggtattcttagaggaagtattgatttagtatttttttggaaagaaaaatattatttatta
gattataaatctaactggttaggaaaagacagtagtgcatacactcaattagaaatgaaa
aaagctataatagaacatcgttatgatcttcaatatcaaatttatactttagcattacat
agatatttacgtcatcgcattacagattattcttatcaaaaaaatttcggtggagtaatt
tacttatttttgagaggaatgactaaaaatcatctaaacaatggtatttttacttgtttt
ccatcaaaaaaattaatagaaggaatagattgtttattcgaaaataaaaatattatttaa
DBGET
integrated database retrieval system