KEGG   Escherichia coli BL21(DE3): ECD_03531
Entry
ECD_03531         CDS       T00931                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K12678  autotransporter family porin
Organism
ebl  Escherichia coli BL21(DE3)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ebl00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:ebl02000]
    ECD_03531
   02044 Secretion system [BR:ebl02044]
    ECD_03531
Transporters [BR:ebl02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   ECD_03531
Secretion system [BR:ebl02044]
 Type V secretion system
  Autotransporter-1 (AT-1) family
   ECD_03531
SSDB
Motif
Pfam: Autotransporter AC_1 PATR VID Pertactin
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACT45327
LinkDB
Position
3716676..3720173
AA seq 1165 aa
MNKNIRILQFLVSIIYSVQSHFSGAQTIQLNGNGIPKSITRSITGVDGNAALNISVPYKT
SYTQNILSVESSINIKGGTSNTSIGGAGVYGENFTLNNNGSVWGGDGYNGGIAVSGNKIS
INNYRNVYGGNGLGGSGSSGGAGLSGDDIIVDNYRSIYGGDDVGGTGGSGVTGSNITVHN
SGGILGGNGVNGGDGINGSNLFITNDNMISGGYGIKQGGDAISGNQITLNNNGIVQGGYG
PDGGCSVYGEDIHINNHGNLSGLYNSQKDAYNTSIIFSGGYNSLDIYSDSVINGDIKLAS
IPVNGTNELIIKNINNATAINGGLMIGNGSSVYLSGKNSIFNGNISIDEDASMNLSVGNA
NVHANTITLKSDSWLNIDTSIKNWTQDYYTLLSSDTGISIADNSHIVQYNVLLTEGAESY
VYTSLNDDDNKLISMLRWNNTKGMGYGTFNIEKDATLNIGVSLSDNLSPLLYDGWDGKSL
TKSGNGTLILSATNNYTGNTEVKSGVLILAAPDALGRTEYLYLSRGAELDMNGYPQTISK
LLTAAGSVLNIHGGSLILNNGGESAGTIAGDGSLNINGGMLDITGNNRNFSGVFTVNKGA
HLAVSTADNLGTAFVDNYGTLTLNSTSAWQLTNNISGYGNVRKTGAGALNISDNAKWTGM
TDIIQGTVILGNADSPVMLGSNQVIVEEQGKLSGFGGVAGNLSNSGIVDLTTYMPGNILT
VGGNYTGRNGLILLQTETGGDNSKTDRLVIKGNASGRTRVAVTQAGGTGAETLNGIEVIH
VSGNADNAEFIQTERITAGAYDYILKRGQGINSTNWYLISRKDIPVPQPEAVPENHDNNL
RPEAGSYVASIAAANNLFVTNLYERQGQELYISHMTGEENEAGIWMYNKGKHNRWRDNSS
QLRTRGNSYVVLIGGDIAQWSLNGTDRWHTGMMAGYGHNNNSTNALSTGYHSEGRMNGYT
AGLYATWYANDETHNGSYLDSWLQYSWFDNHINGERLPAESWKSKGFTVSLEAGYSWKAG
EFTDNYKGSHEWYVQPQLQVVRMNVKSDKYHESNGTSIENTGNGNILTRLGARTWLTSKN
GKNTRYAVPFRPFVEAHWLHNSRVFGTSMNGVSIYQDGARDIGEINGGVVGMITPEVAFR
ADAGIQLGEHGYHNTSAMLSVEYRF
NT seq 3498 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataagaatatacgaattttacaatttctggtcagtataatttattctgtgcagtct
catttttctggtgcgcaaacaatacaactgaatggtaatggtatacctaaaagtataacc
aggagtattacaggtgttgatggaaacgcggcgcttaatatcagcgtgccgtataaaaca
agttatactcaaaatatactatctgttgaaagcagtattaacatcaaaggaggaacaagc
aatacatcaatcggtggtgcaggtgtctacggtgaaaactttacgctaaataataatgga
agtgtttggggaggagatggatataatggtggaattgctgttagtggcaacaaaatatct
ataaacaattacagaaatgtatatgggggtaatggtcttggtggctcaggaagtagcgga
ggtgcagggttaagcggggatgatattatagttgataattacagaagtatatacggaggt
gatgatgtaggtgggacaggtggttccggtgtaaccggtagcaatattacagtgcataat
tccggaggaatattgggcggtaatggcgtaaacggtggtgatggtattaatggtagtaat
cttttcattactaacgacaacatgatatctggaggatatggaataaaacaagggggagat
gctatttctggaaatcaaatcactttgaataataacggtattgttcaggggggatatggc
cccgacggtggttgctctgtttatggagaagatatccatattaataatcatggtaatctt
tcaggattatataatagccaaaaagatgcttataatacatcaataattttttctggcggg
tataattcattagatatttattcagattctgtgattaatggtgatattaaactagctagt
atacctgttaatggtacaaatgaattaattattaaaaacatcaataacgcaacagcaatt
aatggtgggctaatgattgggaatggctcatctgtttatctgtcaggcaagaactccatt
tttaacggaaatataagtattgatgaagacgcatctatgaacctgtctgtaggaaatgct
aatgttcacgcaaatactattacattaaaaagtgattcatggcttaatatagacacatca
attaagaactggactcaggactattacacattattgtcgtcagacacaggtatctcgatc
gctgataatagtcacattgtacaatacaatgtattactgacagaaggtgctgaaagttat
gtttatacgtctttaaatgacgacgataacaaactgatatccatgctgagatggaataat
acaaaaggcatgggatatggaacctttaatatagaaaaagatgccactctgaacataggc
gtttctctttccgataatctttcacctttattatatgatggctgggacggcaaaagtctg
acaaaatcaggtaatggtactcttatactttctgcaacaaacaattatacaggaaataca
gaggttaaatctggcgtattaattcttgctgcacctgatgctcttggtcggactgagtat
ttatatttatcccgtggcgcagaactggatatgaatgggtatcctcagacaataagcaaa
ctactgacggctgcaggctctgtgctgaacattcatggcggaagcctgatactgaataat
ggaggagaatctgcaggtactattgcaggggatggttctctgaacataaatgggggaatg
cttgatataacgggtaataatcgtaatttttccggtgtttttaccgtgaataagggggct
catttggctgtatccacggctgataatctggggacagcctttgttgataactatggcaca
ttaactctgaacagtacatcagcatggcagcttaccaacaatatcagtggttatggtaat
gttcgcaagacgggagcaggtgcactgaacattagcgataacgcaaaatggaccgggatg
acagatattattcaggggacagtgatactggggaacgcagattcaccggtgatgctcggc
agtaaccaggtcattgttgaagagcagggcaaactctccgggtttgggggcgttgcagga
aatctgagcaatagtggtatagtcgatctcactacatatatgccgggtaatatactgact
gtcggagggaattacactggcagaaatggacttattctcctccagacagaaacaggtggt
gacaattcgaaaacagatcgtctggtgattaaaggtaatgccagtggccgtacccgtgtc
gctgttactcaggccggtggtactggtgcagagacacttaatgggattgaagtgattcac
gtcagtggcaatgctgataatgctgaattcattcagacggaacgtattacagccggagct
tatgattacatactgaaacgtggtcaggggattaacagcactaactggtatctgattagc
agaaaagacattcctgtaccacaacctgaagctgtaccggaaaaccatgataataatttg
cgtcctgaggcaggtagctatgttgccagtattgctgctgcaaataatctgtttgtaacg
aatctgtatgaacgacagggacaggagttgtatatcagccacatgacaggagaagaaaat
gaagcaggtatctggatgtataataaaggaaaacataatcgctggcgtgacaacagtagt
cagctgagaacccgggggaatagctacgttgtgttaatagggggagatatagctcagtgg
agcctgaatggtaccgatcgctggcatacaggtatgatggctggctatggtcataataat
aacagtacgaatgccctgagcaccggataccattcggaaggaagaatgaatggatacaca
gcgggtctttatgcaacatggtatgccaatgatgaaacacacaatggttcttatcttgat
agctggctgcaatacagctggtttgataatcatataaatggagaacggctgcctgctgag
tcatggaagtcaaaagggtttacggtatctctggaagcaggatattcatggaaggctgga
gagtttaccgacaattacaagggaagtcatgaatggtatgttcagccgcagcttcaggtt
gtccggatgaatgtaaaatcagacaaatatcatgaaagtaacggaaccagtattgaaaat
accggtaacggaaatattctcacccgcctgggagcaagaacatggcttaccagcaaaaac
ggtaaaaatacgcggtatgcggttccgttcagaccatttgtggaggcacactggttgcac
aatagtcgtgttttcggcaccagtatgaatggtgtaagtatataccaggatggtgcgcgt
gatatcggagaaataaatggtggtgttgtgggaatgataacaccagaagtagcattccgg
gctgatgcaggcattcaacttggagaacatggataccataatacatctgccatgttgagt
gtggaatatcgtttctga

DBGET integrated database retrieval system