Enterobacterales bacterium endosymbiont of Anomoneura mori: SSAmo_0110
Help
Entry
SSAmo_0110 CDS
T10774
Symbol
pnp
Name
(GenBank) polyribonucleotide nucleotidyltransferase
KO
K00962
polyribonucleotide nucleotidyltransferase [EC:
2.7.7.8
]
Organism
ebo Enterobacterales bacterium endosymbiont of Anomoneura mori
Pathway
ebo03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ebo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
SSAmo_0110 (pnp)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ebo03019
]
SSAmo_0110 (pnp)
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
ebo03016
]
SSAmo_0110 (pnp)
Enzymes [BR:
ebo01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.8 polyribonucleotide nucleotidyltransferase
SSAmo_0110 (pnp)
Messenger RNA biogenesis [BR:
ebo03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Other RNA degradosome components
SSAmo_0110 (pnp)
Transfer RNA biogenesis [BR:
ebo03016
]
Prokaryotic type
tRNA degradation factors
SSAmo_0110 (pnp)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_PH
S1
PNPase
RNase_PH_C
KH_1
S1_2
OB_RRP5_4th
CvfB_2nd
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BFI91020
LinkDB
All DBs
Position
complement(14461..16548)
Genome browser
AA seq
695 aa
AA seq
DB search
MIKSYILEFKYGENNVKLKTGLIARQANSSVIVDIDDTVVLATVVVSKEVNNNYNFLPLS
INYQERSYAAGKIPGSFFRREGRPNEREILISRLIDRSIRPLFPKNFNNEIQINVIVMSL
NPQINPDIVSIIAVSTALSLSDIPFLGPIGVSRIGYINNNFILNPTIKQLKNSNLNLIIA
STYESIIMIESESNLINEKILLNAISFGHKKQQIVIKNINKFIKRKKIKKKKYKNNKIND
FLINEVSNLSKNSLIEIYNIKNKNERILKLNKNKEEVINKIILNNESIKKNDIENIYIDL
EKKILRDKIINTNKRIDGRKIDEIRNIDIHINYLPRTHGSALFTRGDTQSLVTVTLGTTK
DAQNLDELICEKTNNFIFHYNFPAFSVGEIGLLSIPKRREIGHGQLAKKSLLPTMPTYKK
FPYIIRIVSEITESNGSSSMASVCGASLALMDAGVPINFHIAGIAMGLIKNNKDFIILTD
IIGEEDNLGDMDFKVSGSYDGISSLQIDTKSQGINEKIIELTLKQAKIARLHILNKMKKI
INIPKKEISKFAPKINIIKINKNKIKDLIGKGGNIIRNLTEETDTIIEIENDGIIKISSN
DIKKINLAIQKINIITKDIEIGNIYKGKVTRILDFGAFLIINNYKEGLLHISQISNKKVN
RITDYLKIGQEINVKVIEIDKQGKIRLSIKDILKK
NT seq
2088 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgattaaatcttacattttagaatttaaatatggtgaaaataatgttaaattaaaaaca
ggtttaatagcaagacaagcaaattcttctgtaattgttgatattgatgatactgtagtt
ttagcaactgttgttgtaagtaaagaagtgaataataattacaattttttacctttatct
attaattatcaagaaagatcatatgctgcaggtaaaattccaggtagtttttttaggcgt
gaaggacgcccaaatgaaagagaaattttaatttctcgtttaattgatcgttctattaga
cctctttttccaaaaaattttaataatgaaattcaaattaatgtaatagttatgtcatta
aatccacaaattaatccagatattgtttcaataattgctgtttcaacagctttatcttta
tctgatataccatttcttggtcctattggagtttctcgaataggatatataaataataat
tttatattaaatccaactattaaacaattaaaaaatagtaatttaaatttaattattgca
agtacttatgaatcaattataatgattgaatcagaatctaatttaataaatgaaaaaata
ttattaaatgcaatttcttttggtcataaaaaacaacaaattgttataaaaaatataaat
aaatttataaaaagaaaaaaaattaaaaaaaaaaaatataaaaataataaaataaatgat
tttttaattaatgaagtatcaaatttatctaaaaattctttaattgaaatatataatata
aaaaataaaaatgaacgtatattaaaacttaataaaaataaagaagaagtaataaataaa
attattttaaataatgaatcaattaaaaaaaatgatattgaaaatatatatatagattta
gaaaaaaaaattttaagagataaaataattaatacaaataaaagaattgatggtcgtaaa
atagatgaaattagaaatatagatatacatataaattatttacctcgtactcatggttct
gctttgtttacaagaggtgatactcaatctttagtaactgttacattaggtacaacaaaa
gatgcacaaaatttagatgaattaatatgtgaaaaaacaaataattttatatttcattat
aattttccagcattttctgtaggagaaattggtttattatctattcctaaaagaagagaa
attggacatggacaattagcaaaaaaatcattattacctacaatgccaacatataaaaaa
tttccttatattatacgtattgtttcagaaattactgaatcaaacggttcttcttcaatg
gcatcagtttgtggtgcttctttagctcttatggatgctggtgttccaattaattttcat
attgcaggtattgcaatgggattaattaaaaataataaagattttataattttaactgat
ataataggtgaagaagataatttaggagatatggattttaaagtttctggtagttatgat
ggtatttcatctttacaaattgacactaaatcacaaggtataaatgaaaaaataattgaa
ttaactttaaaacaagcaaaaattgcaagattacatattttaaataaaatgaaaaaaata
ataaatatacctaaaaaagaaatttcaaaatttgctccaaaaattaatataataaaaatt
aataaaaataaaattaaagatttaattggaaaaggtggaaatataattcgtaaccttact
gaagaaactgatacaattattgaaattgaaaatgatggtattataaaaatttcttcaaat
gatataaaaaaaattaatcttgctattcaaaaaataaatattataactaaagatattgaa
ataggaaatatttataaaggtaaagttacacgtattttagattttggagcatttttgatt
attaataattataaagaaggtttattacatatttctcaaatttctaataaaaaagtaaat
agaataacagattatttaaaaatagggcaagaaattaatgttaaagtaatagaaatagat
aaacaaggtaaaataagattaagtattaaagatatattaaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system