Enterobacterales bacterium endosymbiont of Anomoneura mori: SSAmo_0440
Help
Entry
SSAmo_0440 CDS
T10774
Symbol
rpoD
Name
(GenBank) RNA polymerase sigma factor RpoD
KO
K03086
RNA polymerase primary sigma factor
Organism
ebo Enterobacterales bacterium endosymbiont of Anomoneura mori
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ebo00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
02040 Flagellar assembly
SSAmo_0440 (rpoD)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
ebo03021
]
SSAmo_0440 (rpoD)
Transcription machinery [BR:
ebo03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Sigma factors
SSAmo_0440 (rpoD)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma70_r2
Sigma70_r4
Sigma70_r3
Sigma70_ner
Sigma70_r1_2
KH_DEAH11_2nd
Ubiquitin_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BFI91053
LinkDB
All DBs
Position
49402..51078
Genome browser
AA seq
558 aa
AA seq
DB search
MNIKKKKNKKKKIILDEYNLNDKDDEEINKNIDKIINNIKLEICQKNDPVRIYMREINNT
ELLTREEEIDILRRIEQGTNQILCSLIKYPKIINYIFNKYNKIKKGNYRLSEFIIGFIEK
NEVTGKNVYVSFKQRRRKYEKYIIKNKKNFDLDQEINFSISDKIFNNLRISYKKICYYNI
KFGYNSIYYFKEIKNLIQCFKKIKFVPKEIDNLIKIVKSIIFYINKIKKRKIKIYKKKFK
MKPKILNFLFSNSNININYLKKKKKKIFSLILKNNYKNIKEIIKKVKKIENDIGINIKLI
KNINFQIFLGKNKINIAKRELIKSNLRLVISIAKKYSYKNMQFIDLIQEGNIGLIKAIEK
FEYRRGYKFSTYATWWIRQTITRSISEKARTIRIPTHMIEIINKINKIKKKIINKTGVKP
TSKELSLHMSISENKIYNILKITKEPISLETPINDENETNLGDLIKDTSIETPLKNAIYK
NLELTTNKLLSDLTPRESKVIRMRFGINMKSDYTLEEIGKKFNVTRERIRQIEAKALKKL
RHHNRSKILINFLENNFI
NT seq
1677 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatattaaaaaaaaaaaaaataaaaaaaaaaaaattatattagatgaatataattta
aatgataaagatgatgaagaaattaataaaaatatagataaaattataaataatattaaa
ttagaaatatgtcaaaaaaatgatccggtaagaatatatatgagggaaattaataataca
gaattattaactcgtgaagaagaaatagatattttaagaagaatagaacaaggtactaat
caaattttgtgttctttaataaaatatcctaaaattattaattatatttttaataaatat
aataaaattaaaaaaggaaattatcgtttatctgaatttattattggatttattgaaaaa
aatgaagttactggtaaaaatgtatatgttagttttaaacagagaagacgaaaatatgaa
aaatatataattaaaaataaaaaaaactttgatttagatcaagaaattaattttagtata
tcagataaaatttttaataatttaagaattagttataaaaaaatatgttattataatata
aaatttggttataattcaatatattattttaaagaaattaaaaatttaattcaatgtttt
aaaaaaattaaatttgttccaaaagaaatagataatttaataaaaattgttaaatctata
attttttatattaataaaattaaaaaaagaaaaataaaaatttataaaaaaaaatttaaa
atgaaaccaaaaattttaaattttttattttcaaattctaatattaatattaattattta
aaaaaaaaaaaaaaaaaaatattttctttaatattaaaaaataattataaaaatattaaa
gaaattattaaaaaagtaaaaaaaattgaaaatgatataggtataaatataaaattaatt
aaaaatattaattttcaaatatttttaggtaaaaataaaataaatattgctaaacgagaa
ttaataaaatcaaatttacgtttagtaatttctatagctaaaaaatatagttataaaaat
atgcaatttatagatttaatacaagaagggaatataggtttaataaaagcaatagaaaaa
ttcgaatatagaagaggatataaattttcaacatatgcaacttggtggattagacaaact
atcacaagatctatttctgaaaaagctagaactataagaattcctacacatatgattgaa
ataattaataaaattaataaaattaaaaaaaaaattattaataaaacaggtgttaaacca
acttctaaagaattatctttacatatgtcaatttcagaaaataaaatttataatatttta
aaaattactaaagaacctatatctttagaaactcctataaatgatgaaaatgaaacaaat
ttaggtgatttaattaaagatacatcaattgaaactccattaaaaaatgctatttataaa
aatttagaattaactacaaataaacttttatctgatcttactccacgtgaatctaaagtt
ataagaatgagatttggaattaatatgaaatctgattatactcttgaagaaattggtaaa
aaatttaatgttactcgtgaacgtattagacaaattgaagcaaaagcacttaaaaaatta
agacatcataatcgttcaaaaattttaataaattttttagaaaataattttatataa
DBGET
integrated database retrieval system
