| Entry |
|
|---|
| Symbol |
rpoC
|
|---|
| Name |
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
|
|---|
| KO |
|
|---|
| Organism |
ebo Enterobacterales bacterium endosymbiont of Anomoneura mori
|
|---|
| Pathway |
|
|---|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:ebo00001]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
SSAmo_0690 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:ebo03021]
SSAmo_0690 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ebo03400]
SSAmo_0690 (rpoC)
Enzymes [BR:ebo01000]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
SSAmo_0690 (rpoC)
Transcription machinery [BR:ebo03021]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
SSAmo_0690 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:ebo03400]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
SSAmo_0690 (rpoC)
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
complement(76814..80989)
|
|---|
| AA seq |
1391 aa
MSKTLKLLSNQDKVTEFDAIKISLASPKKIISWSYGEVKNSETINYRTLKPEKDGLFCSK
IFGPIRDYECLCGKYKKKKYYGRKCEKCGVEITKKNERRKRMGHIKLSIPIAHIWYSKTL
PSYICLLLNMSMKDLEKILYYESYIIIKKGKVNFKKKKLINEKQYLLLKKEFGNKFIAKI
GAEAILYLLKKINLKTEYVKLRYKLNEINSNNKKKKTINRIKLIESFINTSNKPEWFILT
VLPVLPPDLRPLVPLDSGRFASSDLNELYRRIINRNNRLKKLINLSAPEIILKNEKRMLQ
EAVDSLFDNGRRGKIILGSNKQPLKSLSDIIKGKTGRFRQNLLGKRVDFSGRSVITVGPF
LKLNQCGLPKKMALELFKPYILGKLQSLKISDTIKTAKKMIDDKSDIVMNLLEEITNLHP
ILLNRAPTLHRLGIQAFNPILTEENSIQLHPLVCSAYNADFDGDQMAVHIPLTNESQLEA
RILMMSTNNILSPANGEPIITPSQDIVLGLYYMTREYINSKGSGMLITNIKEAKILYLNG
IVSLHARVKIRISENIKKENIWFKTKKIVNTTIGRAILWSIFPKGLSFNIINKNLVKNEI
SNILSICYHTLGIKKTIVLLDKLMSIGFKYSTKSGISVSIDDMKIPKKKKQIIEDAQKEV
IKIQKQFEFGFITDYERYNKIIDIWSIANDKVTKELIKYLSFEKNIIYNGKKVKQFSFNN
IFMMADSGSRGSIAQTRQLSGMRGLMMKPDGSIIETPIISNFKEGLNIIQYFISAHGARK
GLADTALKTSNSGYLTRRLVDVSQDLVISENDCGTKEGIWITSIIEGDSIKDSMSDRIIG
RLISKDVKINNGTKILFKKNTYINREICKILEKYSINKIRVRSVVTCETNFGVCVKCYGM
DLSKGSIINKGEAIGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHIGGVAFREIIESYIQVKNNGIIILE
DFKCIKNIKGKFIVTSRNSKLKIINKLNQIKEIYKIPYGANILKLNNKIVKKNEIIVNWE
PHTKLVISEIYGFAKFLGVIEGENAIFQNDKLTGISSMIIINNNKISDEGKKITPVLMIV
DYYNRPKFFPNSKIFAHYILTPKSIIRIKEGDEINIGDVISRKPQETENIKDITGGLPRV
VDIFEVKKSKNPAILAEFDGIITFNKKFKNKIHATLKSNDNKIINFVIPKWREINVFEGE
NIKKGDIICDGEIIPNDILRLKGISELTKYIVDKVQEVYRLQGVKINDKHIEVIIHQMLK
KVIIINSGDSEFLPGESIDFSRIKIINEQLKMQNKRIITFVRYLSGITKCSLSTDSFISA
ASFQETTRILTKASVFQKIDELRGLKENVIIGRLIPAGSGYMYHKKKILKSIERIKEDKK
KKTDKLFKNKE |
|---|
| NT seq |
4176 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgtcaaaaactttaaaattattatctaatcaagataaagttactgaatttgatgcaatt
aaaatttctttagcatcaccaaaaaaaattatttcttggtcttatggagaagtaaaaaat
tctgaaacaattaattatagaactttaaaaccagaaaaagatggtttgttttgttcaaaa
atatttggaccaattagagattatgaatgtttatgtggaaaatataaaaaaaaaaaatat
tatggtagaaaatgtgaaaaatgtggagtagaaattactaaaaaaaatgaacgtagaaaa
agaatgggacatattaaattatctattcctattgcacatatttggtattcaaaaacatta
ccttcatatatttgtttattattaaatatgtctatgaaagatctagaaaaaattttatat
tatgaatcatatataataataaaaaaaggaaaagtaaattttaaaaaaaaaaaattaata
aatgaaaaacaatatttattattaaaaaaagaatttggtaataaatttattgctaaaata
ggtgctgaagctattttatatttattaaaaaaaattaatttaaaaacagaatatgttaaa
ttaagatataaattaaatgaaataaattctaataataaaaaaaaaaaaacaataaataga
attaaattaattgaatcatttataaatacttctaataaacctgaatggtttatattaact
gtattacccgttttaccaccagatttacgtccattagtgccattagattcaggacgtttt
gcatcatctgatttaaatgaattatatagacgtattataaatagaaataatcgtttaaaa
aaattaataaatttatctgcaccagaaattattttaaaaaacgaaaaacgtatgttacaa
gaagcagttgattcattatttgataatggtcgtagaggaaaaataatattaggttcaaac
aaacaaccattaaaatctttatcagatataattaaaggtaaaacaggtagatttagacaa
aatcttttaggaaaaagagtagatttttcaggaagatctgtaattacagttggaccattt
ttaaaattaaatcaatgtggtttaccaaaaaaaatggcattagaattatttaaaccatat
attttaggtaaattacaatcattaaaaatttcagatacaataaaaactgcaaaaaaaatg
atagacgataaatctgatattgtaatgaatttattagaagaaattactaatttacatcca
atattattaaatagagcaccaactttacatcgtttaggtatacaagcatttaatccaata
ttaacagaagaaaattcaatacaacttcatccattagtatgttctgcatataatgcagat
tttgatggagatcaaatggctgttcatatacctttaacaaatgaatctcaattagaagca
cgtatattaatgatgtcaacaaataatattttatctccagctaatggtgaaccaataatt
actccttctcaagatattgttttagggttatattatatgacaagagaatatataaattca
aaaggtagtggtatgttaattacaaatattaaagaagcaaaaattttatatttaaatgga
attgtttcattacatgcacgtgtaaaaattagaattagtgaaaatattaaaaaagaaaat
atttggtttaaaactaaaaaaattgttaatacaactattggtagagcaattctttggtca
atatttcctaaaggtttatcatttaatattattaataaaaatttagttaagaatgagatt
tcaaatattttaagtatttgttatcatactttaggaattaaaaaaacaattgttttatta
gataaattaatgtctattggatttaaatattctactaaatcaggtatttcagtttctatt
gatgatatgaaaatacctaaaaaaaaaaaacaaattatagaagatgctcaaaaagaagta
attaaaattcaaaaacaatttgaatttggttttataacagattatgaacgttataataaa
ataattgatatttggtcaatagcaaatgataaagttactaaagaattaataaaatattta
tcatttgaaaaaaatattatatataatggaaaaaaagtaaaacaattttcttttaataat
atttttatgatggcagattctggatctagaggatcaattgctcaaactagacaactttca
ggtatgagaggattaatgatgaaacctgatggatcaattattgaaactcctattatatca
aattttaaagaaggattaaatataatacaatattttatttcagctcatggtgcgagaaaa
ggtttagcagatacagcgttaaaaacatcaaattctggttatttaacaagaagattagta
gatgtttctcaagatttagtaatatctgaaaatgattgtggaacaaaagaaggaatatgg
ataacttctataattgaaggagattctattaaagattctatgtctgatcgaataattgga
agattaatatcaaaagatgttaaaattaataatggaacaaaaattttatttaaaaaaaat
acatatattaatagagaaatatgtaaaattttagaaaaatattcaattaataaaataaga
gttcgttctgttgtaacttgtgaaactaattttggagtatgtgtaaaatgttatggaatg
gatttatctaaaggtagtataattaataaaggtgaggcaattggaataattgcagcacaa
tctataggtgaaccaggaacacaattaacaatgagaacatttcatattggaggtgttgca
tttcgtgaaattattgaatcttatatacaagttaaaaataatggtattattatattagaa
gattttaaatgtattaaaaatattaaaggaaaatttattgttacttcacgtaattcaaaa
ttaaaaataattaataaattaaatcaaataaaagaaatttataaaattccttatggagca
aatattttaaaattaaataataaaattgttaaaaaaaatgaaattatagttaattgggaa
ccacatactaaattagtaataagtgaaatatatggttttgctaaatttttaggtgttata
gaaggtgaaaatgctatatttcaaaatgataaattaactggaatatcatcaatgataata
ataaataataataaaattagtgatgaaggaaaaaaaataacaccagttttaatgatagta
gattattataatagacctaaattttttccaaattctaaaatatttgcacattatatatta
actccaaaatcaataattagaattaaagaaggtgatgaaattaatataggagatgtaatt
tcaagaaaaccacaagaaacagaaaatattaaagatattacaggaggtttaccacgtgtt
gtagatatatttgaagttaaaaaatctaaaaaccctgcaattttagctgaatttgatggt
attattacatttaataaaaaatttaaaaataaaattcatgcaactttaaaatcaaacgat
aataaaattattaattttgttattccaaaatggagagaaataaatgtttttgaaggtgaa
aatattaaaaaaggtgatataatttgtgatggtgaaattattccaaatgatattttacgt
cttaaaggaataagtgaacttactaaatatattgttgataaagtacaagaagtttatcgt
ttacaaggtgttaaaatcaatgataaacatattgaagtaattattcatcaaatgttaaaa
aaagtaattataataaattctggagatagtgaatttttacctggtgaaagtattgatttt
tcacgtataaaaattatcaatgaacaattaaaaatgcagaataaaagaataataacattt
gttcgttatttatcaggtattacaaaatgttctttatcaactgattcatttatttctgct
gcttcttttcaagaaacaactagaattttaacaaaagcttctgtttttcaaaaaattgat
gaacttagaggattaaaagaaaatgtaattattggacgtcttatacctgctggaagtggt
tatatgtatcataaaaaaaaaatattaaaaagtattgaaagaattaaagaagataaaaaa
aagaaaactgataaattatttaaaaataaagaataa |
|---|
