Empedobacter brevis: F0358_00865
Help
Entry
F0358_00865 CDS
T06196
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
ebv
Empedobacter brevis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ebv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ebv02000
]
F0358_00865
Transporters [BR:
ebv02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
F0358_00865
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_NUP210_4th
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QES91367
LinkDB
All DBs
Position
complement(177153..180152)
Genome browser
AA seq
999 aa
AA seq
DB search
MKKLYFFKASLLTCLLTGFAFGQGTETFESQTALSNSYATGSFDGETGGIVWNYTNARNE
GTYPITNKGILFQASGNTLETTISNGIGKLSFDVRKAFTGGSNNRKIEVLVDNVVVYASP
TFGTSQTDSTIHNYEVEINKTGAVTITFRNAGPQLTLDNISWTAAGVATEKPVVSPRTIT
GTYGVLLSDGAVTATNNPTSWTQTGTLPLGITFDNGVFSGAPEQPGTFTAQVTATNQYGT
SDPANVTFEIAKSNQTVNYTFEHLTQNQGTTFSGLPSQTDQGLNIVYTSADNSIVSVNGN
KLSFDGIGSTTITATAVSNNNYNEFNTTFDVSVTDPNATYCFEEEFEGLSGNNTSTTGSS
ASWNGNSNFPTVATVYQAGNAIRLGSSNNKGGITSKVLDQISGNVTVSFEVKGWTAVEGS
INLTLGSETKNVVYTAKMADNFETQTVSFENVAAGSTLKLETSARRAFIDNVKIQCSTGE
NSTTWDGTAWSNGTPDLTKDVIIKGEVTIDTQLEAKTLTVSDAGGSIVVKSGAYLIVDGK
IDNQAGLTGLVVENGANLIQNQNVANSGAITVNRDSKSMVRNDMTFWSSPVQQEAWQQTI
RSFSPETLYNRFWTYNETTDEFSQILTSDTDSKLFEPGKGVSIRVKNTLPTGQNTIHNGA
FLGVPFNGDVTVPVQFTANGYNLVGNPYASNINVEKFLLANENVNSLYFWTHQFPVGSSE
YANNYAAFNVVGGVIPDLSNISVGQGFIVGLSQATSTVNFNNAMRTSQDAFFYKNSIAEK
NRVWLSLSKESKTISQILLAYMDGATNDADNQIDAKVMQRGSSAIYSLINNEAYAIQGRS
LPFKTDDVVKLGFEALEQGNYSINIEKVDGLFEKGQIVYLRDKELNQVHNLSESAYSFAS
KAGIFDTRFELVYTNKTLGTDELSKENVIVYTKNNTIVVDAKQNKISSVEVYDIQGRKIF
VKDNIRTSVYQVESSAKGVLVIKVLTEDGKVKTQKVINK
NT seq
3000 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaactttacttttttaaagcatctctgctaacctgtttgttgacaggatttgct
tttggacagggaacagaaacttttgagtcccaaacagcattaagtaattcttatgcaaca
ggatcatttgatggagaaacaggaggaattgtatggaattatacaaatgcaagaaatgaa
ggtacatatccaatcacaaacaaaggaattttatttcaagcttcaggaaatacattagaa
actacaatttctaatggaatcggaaaattatcttttgatgtcagaaaagcttttactgga
ggttcaaataatagaaagattgaagttttagtagataatgtagttgtttatgcttcacca
acatttggaacatcccaaacagattctactattcataattatgaagtagaaataaacaaa
acaggggctgtaactataacttttagaaatgcaggaccccaacttactttagataatatt
tcttggacagctgcaggagtagcaacggaaaaaccagttgtgtctccacgaacaattaca
ggaacttatggtgtattgttgtctgatggagctgtgacagcgactaataaccctacctct
tggacgcaaacagggacattacctttaggaattacctttgacaatggcgttttctcaggt
gcacctgaacaaccaggaacatttacagcacaggtaacagccacaaatcagtatggaact
tctgatccggctaatgtaacttttgaaatagcaaaatcaaatcaaacagtcaattatact
tttgagcatttaactcaaaaccaaggaactactttttctggtttaccatcacaaacagat
caagggttaaatattgtgtatacttctgctgataattctattgtttcagtaaatggaaat
aagttatcttttgacggaattggttctacaactattactgcaactgccgttagtaataat
aattataacgaatttaatacaacttttgatgtttcagtaacagatccaaatgcaacgtat
tgttttgaagaagaatttgaagggttatcaggaaataacacatcgacaactggttcatca
gcaagttggaatgggaattctaattttcctactgtagcgactgtttatcaagcaggaaat
gctattagattaggttcaagtaataacaaaggggggataacatcaaaagtgttagatcaa
atatcaggaaatgttacagtttcttttgaagtaaaaggttggacagctgttgaaggaagt
atcaatcttacattaggttcagaaactaaaaatgttgtttatacagcaaaaatggcagat
aatttcgaaacacaaactgtaagttttgaaaacgtagctgccggttctactttaaaatta
gaaacttcagcgagaagagcatttattgacaatgttaaaattcaatgttcaacaggtgag
aattctacaacttgggacggaacagcatggtctaacggaacgccggatcttacaaaagat
gtaatcatcaaaggcgaagtaacgattgatacgcaattagaagctaaaacacttacagtt
tcagatgctggaggttcaattgtcgtaaagtcaggtgcttatttaatcgttgatgggaaa
atcgacaatcaagctggtcttacaggattagttgtagaaaatggtgctaatttaatccaa
aatcaaaacgttgcgaactcaggagcgattacagttaatcgtgatagtaaatcgatggtt
cgtaatgatatgacgttctggtcttctccggttcagcaggaagcatggcaacaaactata
cgttcattctctccggaaacattatacaatcgtttttggacatataatgaaacaacagat
gaatttagtcaaatcttaacttcagatacagattcaaaattatttgaaccgggtaaaggg
gtttctatccgtgttaaaaacactttaccaacaggacaaaatacaattcataatggtgca
tttttaggtgttccgttcaatggagatgtaacagtacctgttcaatttacagcaaatgga
tacaatttagttggtaacccttatgcttctaacattaatgtggaaaaattcttattagct
aatgagaatgttaattcattgtatttctggacacatcaattccctgttggttcttcagaa
tatgcaaataattatgccgcattcaatgttgtaggtggtgttattcctgatttgtcaaac
atttctgttggacaagggtttatcgtaggactttctcaagctacatctacagttaatttt
aacaatgcaatgagaacttcacaagatgcatttttctataaaaattcaattgcagaaaaa
aacagagtttggttgagtttatcaaaagaaagtaaaacaattagccaaattctattggct
tatatggatggagctacgaacgatgcggataatcaaattgatgcaaaagtgatgcagaga
ggttcttcagcaatctactcattgattaataatgaagcatatgccatccaaggacgtagc
ttaccttttaaaaccgatgatgtcgtaaaattaggttttgaggcgttagagcaaggaaat
tactcaattaatattgagaaagttgatggattgttcgaaaaaggtcaaattgtttattta
agagataaagaattaaatcaagtacataacttatcagaatcagcttattcatttgcttct
aaagcagggatatttgatactcgttttgaacttgtgtatacaaataaaacattaggtaca
gatgaattgtcaaaagaaaatgttattgtttatactaaaaacaacacaattgtagtggat
gcaaaacaaaataaaatttcttcggtagaggtatatgatattcaaggaagaaaaatattt
gtaaaagataacattcgtacaagtgtttatcaagttgaatcttctgcaaaaggagtttta
gttataaaagttctgactgaagacggaaaagtgaagactcagaaagttataaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
