Empedobacter brevis: F0358_05985
Help
Entry
F0358_05985 CDS
T06196
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
ebv
Empedobacter brevis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_14
Por_Secre_tail
DUF1081
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QES92294
LinkDB
All DBs
Position
complement(1264434..1266461)
Genome browser
AA seq
675 aa
AA seq
DB search
MKKILLVFTLFIISNSFAQIDSQTDKEAIKELYKKLGRYEEDYFNSPLNLIYGITIEEFE
GVNRVTKINLPESHSFTNNSNSFLLSGDIDLSIELNKLEKLKEVSLSKDRKVNLTQRLNY
IIDFDKLSNLVDLEVLKFTDATNNTSKYLLSLITNNIKNADNLVHLKELSLSQFNSRYGD
QKIEIPNFKSLKKLEIFNGFVYSDKFIFNSNIESLRLDIAGDYSQNYFDNLKNLKSLYLK
GDYTYLPNSLGNLTSLESLSLNNNIIPKLPATITNLQNLKSIFYSNFVNVYLNNELVDIK
SLREIGMGNSYSNTAGASLSIYNKEIINNLTQLETIKILLTTDHQSDLSSFDFAKLNNLK
NLEYNIDWYSIYDENDYQNYVLPKNIDKLINLEHLYLTIGNEPQDISTLNKLRNLQVTYN
YKKHLPKVDFSKNVNLENLVFMNYDDSESTNSLKFKENDFKDLNKLSYLDFNNIPVDFTL
TNKLNKPSLKVLSFGDWNSSIKNNFEGILNLCNTDLEYLGFIGTMPEVIDIRNNQLTPDF
LFLQSRNNFSPQFIVDDINKFKQLYGNTYYDYLQQKEIPFNLTTSTEPCERSLTTVNINK
TGVKIYPNPVVDILNIETDVNKNSIKIIDLTGKTTESYTINEKKISVQVNHLPKGIYIVE
VENENGKTNSKFIKK
NT seq
2028 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaattttactcgtttttactctatttattatttcgaatagttttgcgcaaata
gattcacaaacagataaggaagcaataaaagaactttacaaaaaactgggtcgttatgag
gaagactattttaattcacctcttaatcttatttatggtattacaatagaagaatttgaa
ggagtaaaccgtgtaacaaaaataaatctacctgaaagtcattcatttacaaataactct
aattcatttcttttatccggtgatatagatttgagtatagaattaaacaaattagaaaaa
ttaaaagaagtatcattgtctaaagatagaaaagtaaatttgactcaaagattgaattac
attatagattttgataaattatctaatttagttgatctcgaagtattaaaatttacggat
gctactaacaatactagtaaatacttgttatctttaattacgaacaatataaagaatgca
gataatttggttcatttgaaagaattaagtttgagtcagtttaattcgaggtatggagat
cagaaaattgagattccaaactttaagtcccttaaaaagttggaaattttcaatgggttt
gtctattcagataaatttatatttaattctaatatagagtcattaagactggatattgcg
ggagattatagtcaaaattattttgataacttaaaaaatttaaagtcgctttatcttaaa
ggtgattatacttatttaccaaattctttaggaaacctaacttcattagaaagtttaagt
ttaaataataatataattccaaaacttccggctactataacaaatcttcagaatttaaaa
tcaatattttattcgaattttgtaaacgtatacctaaacaatgaattagtagatataaaa
tcattgagagaaattgggatgggtaatagttattctaacacagctggcgcatctctcagt
atttataacaaagaaattatcaataatcttacccaacttgaaactattaaaatattacta
actactgatcatcagtccgatctttctagttttgactttgctaaattaaataatctaaaa
aacttagaatacaatattgattggtatagtatttatgatgaaaatgattatcaaaattat
gttcttcctaaaaatattgacaaattaattaatctggagcacctatatttaacaattgga
aacgaacctcaagatataagtacgttaaacaaattaagaaatttacaagttacatacaat
tacaaaaaacatcttcctaaagtagatttttctaaaaatgtaaatttggaaaatttagtt
ttcatgaattatgatgattcagaaagcacaaattctctaaaatttaaagaaaatgatttt
aaagatttaaataagttaagttatttagattttaataatattcctgttgattttacttta
acgaataagttaaacaaaccttctttaaaggttttaagttttggagattggaattcatca
atcaaaaataattttgaaggaattcttaatctttgtaatacagacttagaatatcttgga
tttattggaacaatgccagaagtcattgatattagaaataaccaacttactccagatttt
ttatttttacaatcccgtaacaacttctctcctcaatttattgtagatgatatcaataaa
tttaaacaactgtatggaaatacatattacgattatctacaacaaaaagagattcctttt
aatcttacaacctcaacagagccttgtgaaagaagtttaacaacagtaaacatcaataaa
acaggtgttaaaatttaccctaatccggttgtagatattttgaatatagaaacagatgtc
aacaaaaattcaatcaaaataatcgacttaaccgggaagaccactgaatcttataccata
aatgaaaagaagatttctgtacaggttaatcatttaccaaaaggtatttatatcgtagag
gttgaaaatgagaatggaaaaacaaattcaaaatttatcaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
