Erigeron canadensis (horseweed): 122581131
Help
Entry
122581131 CDS
T07610
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
ecad
Erigeron canadensis (horseweed)
Pathway
ecad03015
mRNA surveillance pathway
ecad03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ecad00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
122581131
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
122581131
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
ecad03041
]
122581131
Spliceosome [BR:
ecad03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
122581131
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122581131
NCBI-ProteinID:
XP_043609223
LinkDB
All DBs
Position
9:4301290..4307486
Genome browser
AA seq
483 aa
AA seq
DB search
MSGYGHEGDGSAPPPVGGGYGGGGYGNSGGGGYGGSGGSGSYGGNRGGGGGNYGGGGGRG
GAGGGGGGYGSRGGRDGGGGGYNGGGGYQGGDRGRSGGDRGGGGGRGGSREGDWPCPNPG
CSNSNFSWRTECNKCGTPNPAGGSGGGGDRGRNDGRGRNDSGGYNRSGGGRSDGGSYNRG
GSGGAGYGSERGGRGDHDGGNRGGGGSYGGNQGRDSGGYAQDAAVAYGGSDSGYPQQPPN
TYGSNLAYGTDAVPPPTSYNGGPTSYPPSYGGTGTGYAGNPLPDNRGGGGPRGGSTGGYG
SAPQSQGAYGGAPQSQGSYGGAPAEAPAKVKQCDETCDDSCDNARIYISNLPPDVSVDEL
RELFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWPYNIKIYTDEHGKNKGDAALVYEDPSAAHSAGGFYNG
YELRGHKISVGMAEKSAPRPPPAQGQGGGGRGGGYGGGGGRRDNYRDGGPDRNYHGGNRS
RPY
NT seq
1452 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggttacggtcacgaaggagacggatctgctccaccgcccgtcggtggtggctat
ggaggcgggggttatggaaactccggtggaggcggttatggaggcagcggcggaagtgga
tcttatggcggaaaccgtggcggcggcggtggtaattatggtggcggaggtggccgtggc
ggcgctggtggcggaggcggtggatatggtagtcgtggtggtagagatggtggcggaggc
ggatacaatggtggaggtggatatcaaggaggagatcgagggcgcagcggaggcgataga
ggaggcggtggtggacgtggtggcagtagagaaggagattggccttgtcctaatccaggc
tgtagcaactcaaatttttcatggaggactgaatgcaacaaatgtggtacccctaaccct
gcaggtggcagtggtggcggtggtgatcgtggccgtaatgatggtaggggtcgcaatgat
agtggcggctacaatagaagtgggggtggacgcagtgatggtggcagttacaatagaggt
ggtagtggtggagcaggatatggtagtgaaagaggaggcaggggtgatcacgatggtggc
aatagaggtggtggtggttcttatggaggcaaccaaggaagagacagtggtgggtatgct
caggatgctgctgttgcttatggaggatctgatagtggttaccctcaacagccacctaac
acatatgggtctaaccttgcatatggaactgatgctgttcctcctcctacaagctacaac
ggtggaccgacttcatatccgccttcttatggtggtactggtactggttatgctggtaat
cctttgcctgacaatcgtggtggtggtggtccccggggtggctcaaccggtggatatggc
agtgctccccagagtcaaggtgcctatggtggtgctccacagagtcaaggtagttatggt
ggtgctcctgcagaagcaccagctaaggtcaagcaatgtgatgaaacttgtgatgactcc
tgtgacaatgcaaggatctacatttcaaatttgcccccagatgtgtctgttgatgaattg
agagagctatttggaggcattggacaagttgggaggatcaagcagaagcgaggctataaa
gaccagtggccctataacattaagatttacactgacgaacacggtaaaaacaaaggagat
gctgctttggtctatgaagatccttctgcagcacattctgctggtggattttacaatggt
tatgagctgagaggtcacaaaatcagcgttggaatggctgagaaatctgctccaagacct
cctcctgcacaggggcaaggtggtggtggaagaggtggcggctatggtggtggtggtgga
cgcagagacaactatagagatggtggcccagataggaattatcatggtggaaaccgttct
cgtccatactga
DBGET
integrated database retrieval system
