KEGG   Erigeron canadensis (horseweed): 122599595
Entry
122599595         CDS       T07610                                 
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
ecad  Erigeron canadensis (horseweed)
Pathway
ecad03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ecad00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    122599595
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:ecad03019]
    122599595
   03041 Spliceosome [BR:ecad03041]
    122599595
Messenger RNA biogenesis [BR:ecad03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     122599595
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     122599595
Spliceosome [BR:ecad03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    122599595
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 RRM_PARP14_3 RRM_RdRP1_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 122599595
NCBI-ProteinID: XP_043628061
LinkDB
Position
5:complement(29770932..29774565)
AA seq 369 aa
MGSKRPDFGDGASPGKIFIGGLAKDTTIDEFVKYFGKYGELTDSVIMKDRQTGRPRGFGF
ITFADPVVVDTVIAETHVINGKQVEIKRTIPKGSGESKDFKTKKVFVGGIPTAVTEEELK
GFFSKYGKVVEHEIIRDHASKRSRGFGFVVFDSEQVVDTILVNGNMIDMNGTKVEIKKAE
PKKSSNSGAMSYGGEPRGRGYNDSYAGYGDSYGGYGAGGGGGGGGGGYGPPYRSLGGLSS
RYGGDSYSGYGPSGSEFSSRYADYGGDYGGAYRGGEPPLGGYSSRYSSYGGAGYGGAYGG
SGLGGYGRGGGGGGGYAGYGGPGGGGGGGYESGAGYGGAGGPYGSRAGYGPGGGGGAPPG
GGRYHPYGR
NT seq 1110 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggttcaaaacgccctgattttggagatggtgctagccctggaaagatattcattggt
gggttagctaaagatactactatagatgagtttgttaagtactttggcaagtatggagag
cttactgattcggttattatgaaagatcgacaaacgggtcggcctagggggttcgggttt
attacttttgctgatcctgttgttgttgatactgttattgctgagactcatgtcatcaat
gggaaacaagttgagatcaaacggaccattccaaaaggctctggcgagtccaaggatttc
aaaaccaaaaaggtatttgttggtgggattccgacggcagttactgaagaggagctcaaa
ggtttcttctcaaagtatggaaaagtggtggagcatgagattatccgagatcatgcctca
aagcgttctcgaggatttggatttgttgtattcgatagtgaacaagtcgttgacactatc
cttgtcaatggaaatatgattgatatgaatggtacaaaggtcgagatcaagaaggcagaa
ccaaagaaatcctcaaattcaggagctatgtcatatggtggtgaacctagggggcgtggg
tataatgatagttatgctggatatggtgattcctatggtggatatggagcgggtggtggt
ggtggtggcggtggcggcggctatggccctccctacagatcacttggaggactttcgagc
agatatggtggtgattcttatagtggatatggcccaagtggcagtgagttcagcagtcgt
tatgctgattatggaggtgactatggtggtgcttacaggggtggcgagcctccactaggt
ggctactctagtcgatatagctcatatggtggtgcagggtacggtggagcttatggaggt
agtggtcttggtggatatggtcgtggaggaggaggtggaggcggttatgcaggatatggc
ggaccaggaggaggtggaggtggtggttatgaatctggtgctggttatggtggggcagga
ggaccgtatggaagtagagcaggttatggccctggtggcggcggtggcgcccctcctggc
ggtggtcgttatcacccttatggtaggtag

DBGET integrated database retrieval system