Erigeron canadensis (horseweed): 122600181
Help
Entry
122600181 CDS
T07610
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2-like
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
ecad
Erigeron canadensis (horseweed)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PUF
NABP
PUF_NOP9
Ribosomal_60s
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122600181
NCBI-ProteinID:
XP_043628790
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(29398912..29407088)
Genome browser
AA seq
919 aa
AA seq
DB search
MISDIGYIKMMSDMGMRSLVSNNEELGFLLREKRRQEVSGSSSSSDPEMEMNMYRSGSAP
PTVEGSLSAVSGLFDGGISEDELRSDPAYVSYYYANVNLNPRLPPPLLSKEDWRFSQRMQ
GGNGNGNGSSAIGDRRKVGRDSGNESMTMFGSGVSEARNGQGGGGGNSSVEWGGNGLIGL
PGLGLGSRQKSIAEIIQDDIGQTTSVSRQPSRPASRNTFDENVDLSESHFAQLHHNLASM
DALRSSPNHQGMSSGSHTYASALGASLSKSTTPDPQLMARSASPRVSAGGGGRINAPSDL
IAGFSGMTLSANGMADGIQNASHLAKGPYQYMGKNGVLAADAHGSPVNSYIKGLASGGGG
SPQYQNHDSPSSSFYGSYMMNPASPTMLANQIGGVNAPPLFDNSAVAAAMGVSAMDSRAM
GGGFGLGSNRVGNHSPTGLQAPLMDPLYLQNLSEYAAALNDTTIDRELVALQKAYLAGLL
SPQKSQYGLSHGYYGNSGYGLGMSYLGSPLGSSLLPNSAIGSGSPVRHGDRSLRFPSGIR
NLVGSESFASSLLDEFKSNKTKCFELSEIMGHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATVEEKDM
VFNEIMPQAFSLMTDVFGNYVIQKFFEHGSASQIRELAEQLDGHVLTLSLQMYGCRVIQK
AIEVVDLDQQTKMVVELDGHVMRCVHDQNGNHVIQKCIECVPEEAIHFIISTFYDQVVKL
STHPYGCRVIQRVLEHCHNPKTQSIVMDEILKSIIMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERT
TIIDQLTGQIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGTPEERQTLVTEMLGTTDENEPLQVMMKDQF
ANYVVQKVLETCDDQQLEMILNRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIGALAG
YAAAAAAAAAAAADNNGTT
NT seq
2760 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcagtgatattggctatataaagatgatgagtgatatgggaatgagatcactggtt
tcaaataatgaagaattagggtttttgttaagggaaaaacgtaggcaagaagttagtggt
agttcaagtagtagtgatcctgaaatggagatgaatatgtatagaagtgggtcggctcca
ccgaccgtagaaggatcgttgagtgcggtttccgggttatttgatggtggtatttctgag
gatgagttaaggtctgatcctgcttatgttagttattactatgctaatgtgaatttgaac
cctaggctgccaccgcctttgctgtcgaaggaagattggcggttttcgcagagaatgcag
ggtgggaatgggaatgggaatgggagttctgcaattggggataggaggaaagtgggtaga
gatagtgggaatgagagtatgacaatgttcggtagtggggttagtgaggcgaggaacggt
caaggtggtggtggtggaaatagttcggtcgagtggggtggaaatgggcttatcgggttg
ccagggttagggttagggagtaggcaaaagagcattgctgagatcattcaggatgatatt
ggtcaaactacttctgtttctaggcagccatctcgtccagccagccgtaacacatttgat
gaaaatgttgacctttcagagtctcattttgctcagcttcatcacaatttggcttctatg
gatgctttacgatccagcccaaaccatcaaggaatgtcatctggttcacacacttatgct
tcggctcttggtgcatctttatctaaaagcaccacccctgacccgcagctcatggctcga
tcagctagccctcgggtttctgctggtggaggggggaggattaatgcgccttcagattta
attgctgggttttctggaatgactctttcagctaatggtatggcagatggaatccaaaat
gcctcccatttggctaaaggaccgtatcagtatatgggaaaaaatggtgtacttgctgct
gatgctcatggatcgccagtgaattcgtatattaaagggctagccagcggtggaggtggt
tctcctcaataccagaatcatgatagtccaagttcatctttttatggcagttatatgatg
aatccagcatcaccaaccatgttggcaaaccagataggcggtgttaatgcaccaccttta
tttgacaatagtgctgttgcagcggcaatgggtgtctccgccatggattctagagcaatg
ggtggagggtttggtttaggatctaatagagttggaaaccacagccccactggtcttcag
gcacctcttatggacccgctgtatcttcaaaacttgagtgaatatgctgcggctctgaat
gatacaacaattgatagggaattagtggcactccagaaagcttacctggctggtttgcta
tctcctcaaaagagtcaatacggtcttagccatggttactatggaaactctggttatggt
cttggcatgtcgtatcttgggagcccattgggaagctctcttctacctaactcggctatt
ggttctggtagtccagttagacatggtgaccggagcttgaggtttccttctgggattcgt
aatttagttggaagtgaaagttttgcttcttctttgctagatgagttcaaaagcaataaa
accaagtgtttcgagctctcagaaattatggggcatgttgttgaattcagtgcggatcaa
tatggaagtcgttttattcaacagaaacttgagacagctacggtagaagagaaagacatg
gtgttcaatgaaattatgccacaagcattttcactgatgacggatgtatttggtaattat
gtcattcagaagttttttgaacatggaagtgcttctcagataagagaactagctgagcag
ctcgacgggcatgttctaacacttagtcttcaaatgtatggttgtcgcgttattcaaaag
gctattgaggttgttgaccttgatcaacagacaaaaatggttgtagagcttgatggtcat
gtgatgcgttgtgtgcatgatcaaaatggaaatcatgttattcagaagtgtattgaatgt
gtaccggaagaggctattcatttcattatctctacattttatgatcaagttgttaaattg
tcaacccatccttatggttgccgtgtcatacagagggtcttggagcactgtcacaaccct
aaaacacaaagcattgtgatggatgaaatcttgaaatctattatcatgctggcgcaagat
caatatggaaattatgttgttcagcatgtactggaacatggaaagccacatgagcgtaca
actattatagatcaattaaccgggcagatagttcaaatgagtcaacaaaagtttgcctct
aatgttgttgaaaagtgtttgacttttggtacaccagaggaacgccagaccctggtgaca
gagatgctaggcaccactgatgaaaatgaaccacttcaggtgatgatgaaagatcagttt
gctaattacgttgtgcagaaagttttggagacatgtgatgaccagcaacttgagatgatt
cttaatcgtatcaaggttcatttgaatgctctgaagaaatatacttacgggaaacatata
gttgctcgtgtagagaaacttgttgctgctggagaaaggaggattggggctctggctgga
tatgctgctgccgccgctgcggctgctgctgccgctgctgataataacggtactacttaa
DBGET
integrated database retrieval system