Erigeron canadensis (horseweed): 122604794
Help
Entry
122604794 CDS
T07610
Name
(RefSeq) adhesive plaque matrix protein-like
Organism
ecad
Erigeron canadensis (horseweed)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122604794
NCBI-ProteinID:
XP_043633595
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(35833697..35846606)
Genome browser
AA seq
1627 aa
AA seq
DB search
MRSLGVLRQWPQLIYAFGFLLIATVIAGSYPPYSYNSPPPPSPSPPPPYVYNSPPPPSPS
PPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYMSPPP
PSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYK
SPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPP
YIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPS
PPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPP
PSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYK
SPPPPTPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPAPYVYKSPPPPSPSPPPP
YVYKSPPPPSPSPPPLYIYKSPPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYLEAFRLGVKALYMNASH
VNVLEKLSAFENPYGYKPPNSNGWKLPKPVKHTQPNSPYVYKSPPPPFKHTWPHLPYLHK
STPPSYIYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPYPPPPYVYKSPP
PPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYVY
KSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSPSPPP
PYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSP
SPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPAPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPP
PPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVY
KSPPPPSLSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPP
PYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPTP
AHSHPSYFKLPHPLPKYPSPPAYFYKSPPPPKNPYGYKPPNSNGWKLPKPVKHTQPNSPY
VYKSPPPPFKHTWPHLPYLHKSPPPSYIYKSPPPPSRSTPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYV
YKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPP
PPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPLPSPPPPYVYKSPPPPS
PSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSP
PPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYV
YKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPP
PPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPS
PSPPPPYIYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPTHNHPTYFKLPHPLPKYPSPPVYLYKS
PPPPRNY
NT seq
4884 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaagcctcggggtgttgaggcaatggcctcaactaatttatgcctttggtttcctg
ttaattgcaactgttattgctgggtcatatccaccttactcatacaactctcctccacca
ccatcaccgtctccaccacctccatatgtttacaactctccaccaccgccttcaccatca
cctcctcctccgtatgtctacaaatctccacccccgccgtcaccatcaccaccacctcct
tacgtgtataaatctccacctcctccatccccgtcacctccgccaccatatgtgtataag
tctccacctcccccttcaccatcacctccgcctccatatgtgtatatgtcaccaccacca
ccttcgccatcacctccacctccttacatttataagtctccaccaccaccttccccatct
ccacctcctccttatgtttacaagtctccacctcctccatcaccatctccaccacctcca
tatgtgtataaatcaccaccgccaccttcaccatcacctccacctccgtatgtttacaag
tctcctcccccaccatcaccttcaccaccacctccatacgtttacaagtccccgccacca
ccttcaccatctccaccccctccttatgtttacaagtctccacctcctccatcaccatct
cctccacctccatatgtgtacaaatcacctcctccaccttcaccatcaccaccacctcca
tacatttacaaatctcctcctccaccatcaccctcacctccaccaccgtatatttataag
tctccccctccaccgtcgccatcacctccacctccatacatttacaagtctcctcctcca
ccgtcgccatcacctccacctccatacatttacaagtctcctcctccaccatcaccatca
cctcctcctccatatgtgtacaaatctcctcctccaccatcaccatcacctccgccgccg
tatgtttataagtctcctccaccaccttcaccatctccgcccccaccatacgtttataag
tctccccctccaccatctccatcaccgccacctccttacatttacaagtccccacctccg
ccttccccatccccaccacctccatatgtgtataagtctcctcctccaccatcaccatca
ccacctcctccatatgtctataagtctccacctccgccttccccatccccaccacctcca
tatgtgtataagtctcctcctccaccatcaccatcaccacctcctccatatgtctataag
tctccacctccaccaacaccgtcgccaccacctccatacatttataagtccccgccacca
ccttcgccatctccaccaccaccgtatgtatacaagtctcctccaccaccatctccatca
cctcctgctccgtatgtctataagtctccacccccaccatcaccatcaccaccgcctcca
tatgtttacaagtctccccctccaccatcaccatcgccaccaccactgtacatctacaaa
tcccctcctccgcctccatacgtgtacaagtctcccccaccaccatccccttcaccccct
cctccatatcttgaagcttttagattaggagtaaaagctctatatatgaatgctagtcat
gttaacgttttggaaaagctatcagcttttgagaacccttatggatacaagcctccaaac
tctaatggctggaaattgccaaaacccgtaaagcatacacaaccaaattcaccttatgtt
tacaagtctccgccaccgccatttaagcacacatggccacatctaccttacctccacaaa
tctacccctccttcttatatctataagtctccaccaccaccatctccatccccgccacca
ccttatgtgtataagtcccctcctccaccatcaccttccccaccacctccatacatatac
aagtctccccctccaccatcaccttacccaccacctccgtacgtttacaagtctccccct
ccaccatcaccttcaccaccacctccatacatttacaagtctccccctccgccatcacct
tccccaccacctccatacgtttataagtctcccccgccaccatcaccatccccaccacct
ccatacatatacaagtctcccccaccaccatcaccttccccaccacctccatatgtttac
aagtctccaccgccaccatcaccttcaccaccaccaccttatgtatataagtcccctcct
ccaccatcaccttccccaccacctccgtatatttacaagtcccctcctccaccatcacct
tcaccaccacctccatacatttacaagtctccccctccaccatcaccatccccaccacct
ccatacgtatacaagtctcccccaccaccatcaccttccccaccacctccatatgtttat
aagtcccctccaccaccatcaccatctccaccccctccttatgtttataagtctccccca
ccaccatctccatcacctcctcctccgtatgtctataagtctccacccccaccatcacca
tcaccaccgcctccatatgtttacaagtctccccctccaccatcaccatcgccaccacct
ccttatgtttataagtccccaccaccaccagcaccatctccaccacctccatacgtttac
aagtctcccccgccaccatctccttcaccaccacctccatatgtttacaagtccccacca
ccaccatcaccatctccaccacctccatatgtttacaagtctccccctccaccatcgcca
tcaccaccacccccatatgtttacaagtctccccctccaccttcgccttccccaccacct
ccttatgtatacaagtcccctccacctccatctccatcacctcctcctccatatgtctat
aagtctccacccccaccttcactatccccaccacctccatatgtttacaagtctcccccg
ccaccatcaccatccccaccacctccatatgtttataagtctcccccaccaccatcacct
tccccaccacctccatatgtttacaagtcccctccaccaccatcaccatctccgcctcct
ccgtatgtttacaagtccccaccgccaccatcaccatctccaccacctccatatgtttac
aagtctccaccgccaccatcaccatctccaccacctccatatgtttacaagtctccacct
ccaccatcaccctccccaccacctccatatgtttacaagtctcctcctccaccaacccca
gcacacagccatccatcttactttaagttgccacatccactaccaaagtatccatctcct
ccagcttacttctataagtctccaccaccaccaaagaacccttatggatacaaacctcca
aactctaacggctggaaattgccaaaacccgtaaagcatacgcaaccaaattcaccttat
gtttacaagtctccgccaccgccatttaagcacacatggccacatctaccttaccttcac
aaatctccccctccttcttatatttataagtccccaccaccaccatcacgatccacaccc
cctccatacatttacaagtcacctccacctccatcaccatccccaccacctccatacgtc
tacaaatctccaccaccaccatctccatccccaccaccaccttatgtgtataagtcccct
cctccaccatcaccttcaccaccgcctccttatgtttacaagtcccctcctccaccatca
ccttcaccaccgcctccttatgtttacaagtcccctcctccaccatcaccttcaccaccg
cctccttatgtttacaagtcccctcctccaccatcaccatcaccaccacctccatatgtt
tacaagtcccctcctccaccatcaccttcaccaccacctccctatgtttacaagtctcca
cctccaccattgccttctccaccacctccatatgtttataagtctcctcctccaccgtca
ccgtccccacctcctccatatgtttacaagtctcctcctccaccgtcaccttcgccacca
cctccatatgtatacaagtctccaccaccaccgtcaccatctccacctcctccatatgtg
tacaagtccccccctccaccatcaccttcaccaccacctccatatgtttacaagtctcct
cctccaccgtcaccttcgccaccacctccatatgtatacaagtctccaccaccaccgtca
ccatctccacctcctccatatgtgtacaagtccccccctccaccatcaccttcaccacca
cctccatatgtttataagtcccctcctcccccatcaccttccccaccacctccatatgtg
tacaagtctcctcctccaccgtcaccgtccccacctcctccatatgtttacaagtctcct
cctccaccgtcaccttcgccaccacctccatatgtatacaagtctccaccaccaccgtca
ccgtctccacctcctccatatgtgtacaagtccccccctccaccatcaccttcaccacca
cctccatatgtttataagtcccctcctcccccatcaccttccccaccacctccatatgtg
tacaagtctccacctcctccgtcaccgtctccacctcctccatatgtgtacaagtcacca
ccgcccccatcaccgtctccaccacctccatacgtttacaagtctccgccaccaccatca
ccatctcctccacctccatatatctacaagtctccccctccaccatcaccctccccacca
cctccatatgtttacaagtctcctcctccaccatctccaacacacaaccatccaacttac
tttaagttaccacatccattaccaaagtatccatctcctccagtttacttgtataagtct
ccaccaccgccaaggaattattaa
DBGET
integrated database retrieval system
