Erigeron canadensis (horseweed): 122607382
Help
Entry
122607382 CDS
T07610
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
ecad
Erigeron canadensis (horseweed)
Pathway
ecad03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ecad00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
122607382
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ecad03019
]
122607382
Messenger RNA biogenesis [BR:
ecad03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
122607382
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122607382
NCBI-ProteinID:
XP_043636280
LinkDB
All DBs
Position
7:33614784..33619967
Genome browser
AA seq
408 aa
AA seq
DB search
MDSDEGKLFLGGIAWETTEERLNDYFTKYGVVSQTVIMRDKITGRPRGFGFVVFADPSVL
DSVLQDRHTIDGRNVEAKRALSREEQQASKPANNAGRNSGGTGNYRTKKIFVGGLPSTLT
EEQFRQYFESYGDVTDVVIMFDQNTNRPRGFGFISFDTEDAVDRVIQKTFHELNNKLVEV
KRALPKDANPGGGGGGGGGRGGGYQGHNAGSFDSQMDGNRFTQQQNSGGGYPAYSGYGQP
SYGYGAPNGNTGYGSYGAAGYGAPAGGYGNPNAGSNPGALKSPWGGGQTPGYGGAGYGAN
TGYGGAGYGANTGYGGAGYGAPVGQSPSGGSSYGNQGYGYGNYGTNEGYNTNTAGYGAAA
GGRPGPGVAANSMVGSGVDQQGPSGGGYMGGPYNGQPGYSNAAWRSDT
NT seq
1227 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatgaagggaaacttttcttaggtggaatagcatgggaaacaactgaagaa
agattaaatgattatttcaccaaatacggcgtcgtttcacagactgttatcatgcgagac
aagatcactggtcgtccacgtggatttggttttgttgtttttgcagatccctctgttctt
gattctgttcttcaagatagacacaccattgatggcagaaatgtggaagctaagagggct
ttatccagagaagaacaacaagcgtctaagcctgcgaataatgccggcagaaactctgga
ggaactggaaattacagaaccaaaaagatatttgttggtggattgccttccacattaaca
gaagaacaattccgccagtattttgaaagttatggagatgttactgatgttgtaattatg
tttgaccaaaatactaacaggcctcgtggatttggtttcatatcctttgatacagaagat
gctgttgatagagtcattcagaagacattccatgagctcaacaataagctggttgaggta
aaacgagcactccctaaagacgcaaaccccggaggtggtggtggtggcggcggcggccgt
ggtggaggttatcaaggtcacaatgctggctcgtttgatagtcagatggatggtaataga
ttcacgcagcaacaaaactcaggtggtggctaccctgcatattcgggttatggtcaacca
agttatggctatggtgcaccgaatggtaatactggttatggaagttatggtgctgctggt
tatggtgctcccgctggaggatatggcaacccaaatgcaggtagtaatcctggtgcattg
aaaagcccatggggtggtggtcagactcccggctatggtggtgcaggttatggtgcaaac
acgggctatggcggtgcaggttatggtgcgaacacgggttatggtggtgcaggctatggt
gcaccggtgggtcaatctccaagtgggggttccagttatgggaaccaaggttatgggtat
ggtaactatgggactaatgaaggctacaatacaaatactgccggatatggagcagcagct
ggtggccgacctgggccaggtgttgctgcaaatagcatggttggaagtggcgtagatcaa
caagggccaagtggtggtggctatatgggtggtccttataacgggcagcctggttactct
aatgctgcctggagatccgacacttaa
DBGET
integrated database retrieval system
