Erigeron canadensis (horseweed): 54108607
Help
Entry
54108607 CDS
T07610
Symbol
ndhF, HGF93_pgp008
Name
(RefSeq) NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit 5
KO
K05577
NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5 [EC:
7.1.1.2
]
Organism
ecad
Erigeron canadensis (horseweed)
Pathway
ecad00190
Oxidative phosphorylation
ecad01100
Metabolic pathways
Module
ecad_M00145
NAD(P)H:quinone oxidoreductase, chloroplasts and cyanobacteria
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ecad00001
]
09100 Metabolism
09102 Energy metabolism
00190 Oxidative phosphorylation
54108607 (ndhF)
Enzymes [BR:
ecad01000
]
7. Translocases
7.1 Catalysing the translocation of protons
7.1.1 Linked to oxidoreductase reactions
7.1.1.2 NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
54108607 (ndhF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Proton_antipo_C
Proton_antipo_M
Proton_antipo_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
54108607
NCBI-ProteinID:
YP_009747375
UniProt:
A0A6G7IXD8
LinkDB
All DBs
Position
Pltd:125470..127689
Genome browser
AA seq
739 aa
AA seq
DB search
MEQTYQYAWIIPFLPLPVPMLIGLGLLLFPTATKSLRRMWAFQSVLLLSIVMIFSMNLSI
QQINSSSVYQYVWSWIINNDFSLEFGYLIDPLTSIMSILITTVGILVLIYSDNYMSHDHG
YLRFFAYMSFFSTSMLGLVTSSNLIQIYIFWELVGMCSYLLIGFWFTRPVAAKACQKAFV
TNRVGDFGLLLGILGFYWVTGSFEFRDLFQIFNNLISNNEVDFLFVTLCAVLLFAGAIAK
SAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLMPLFIVIPYIMNFISLIGII
TVFLGATLALAQKDIKRGLAYSTMSQLGYMMLALGMGSYRSALFHLITHAYSKALLFLGS
GSVIHSMETLVGYCPKKSQNMVLMGGLTKHVPITKTSFLLGTLSLCGIPPLACFWSKDEI
LNDSWLYSPIFAIIAWSTAGLTAFYMCRIYLLTFEGHLNVNFQNYSGKRNTPLYSISLWG
KEGSKKSNKNFRLVTLLNKNGGPSFFSNRVYKIDENVRKMTPPLLSIPNFGNTKTSLYPY
ESDNTMLFPILILIIFTLFVGFLGIPLTQDVDILTKWLTPSINLLHKNSNNSIDWYEFCK
DAFFSVSIASFGIFIAFFLYKPVYSSFQNLDLINSFFKMGPRRNFYDKIKNAIYDWSYNR
GYIDAFYGRFFIVGTRKFAEFTHFFDRRIIDGIPNGVGLISFFVAEVIKSVGGGRISSYL
FFYFSYVSIFLVIYYFLNI
NT seq
2220 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacagacatatcaatatgcgtggataataccttttcttccacttccggttcctatg
ttaatagggttgggacttcttctttttccgacggcaacaaaaagtcttcgccgtatgtgg
gcttttcagagcgttttgttgttaagtatagttatgattttttccatgaatctttctatt
cagcaaattaatagtagttctgtctatcaatatgtatggtcttggattattaataatgat
ttttcgttagaattcggatacttgatcgatccacttacttctattatgtcaatactaatc
actactgttggaattttggttcttatttatagtgataattatatgtctcatgatcacggt
tatttgagattttttgcttatatgagttttttcagtacttctatgttgggattagttact
agttcaaatttgatacaaatttatattttttgggaattagttggaatgtgttcgtatcta
ttaataggattttggttcacacgacctgttgcagcaaaggcttgtcaaaaagcctttgta
actaatcgtgttggcgattttggtttattattaggcattttagggttttattgggtaacg
gggagttttgaatttcgtgatttattccaaatattcaataacttgatttctaataatgag
gtcgattttttatttgttaccttgtgcgctgttcttttatttgccggtgcgattgctaaa
tctgcacaatttcctcttcatgtatggttacctgatgcgatggaagggccgactcctatt
tcggcccttatacatgctgctacgatggtagcagcgggcatttttcttgtagcccgactt
atgcctcttttcatagtcataccctacataatgaattttatctctttgatagggataata
acagtttttttaggagctactttagctcttgctcaaaaagatattaagaggggtttagcc
tattcaacaatgtctcaattgggttatatgatgttagctttaggtatggggtcttatcgc
agtgctttatttcatttgattactcatgcttattctaaagcattattgttcttaggatcg
ggatccgttattcattcaatggaaactcttgttgggtattgtccaaaaaaaagtcagaat
atggtgcttatgggaggtttaacaaaacatgtaccaattacaaaaacttcttttttatta
ggtacactttctctttgcggtattccaccccttgcttgtttttggtccaaagatgaaatt
cttaatgatagttggttgtattcacctatttttgcaataatagcttggtctacggcggga
ttaacggcattttatatgtgtcggatttatttacttacttttgaaggacatttaaacgtt
aattttcaaaattacagtggaaaaaggaatacccccttatattcaatatcgctatggggt
aaagaaggttcaaaaaaaagtaacaaaaactttcgtttggtaactttattaaataagaat
ggaggtccttcttttttttcaaatagagtatataaaattgatgagaatgtaagaaaaatg
accccaccccttctttctattccgaattttggcaataccaagacttctttgtatccttat
gaatcggataatacgatgttattcccaatacttatattaattatatttactttgttcgtt
ggattcttaggaattcctttaactcaagacgtggatatattaacaaaatggttaaccccg
tctataaatcttttacataaaaattcaaataattcaatagattggtatgaattttgtaaa
gatgcctttttttcagtcagtatagcctctttcggaatatttatagcattttttttatat
aaacctgtttattcatcttttcaaaatttggacttaattaattcattttttaaaatgggt
cctaggagaaatttttatgacaaaataaaaaatgctatatatgattggtcatataatcga
gggtacatagatgccttttatggaagattctttattgtggggacgagaaaattcgccgaa
ttcactcatttttttgatagacgaataatagatggaattccaaacggagttggtcttatc
agtttctttgtagcagaggttattaaatcggtagggggggggcgtatttcttcttatctg
ttcttttatttttcttatgtatccatttttttagtaatttattactttttgaatatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
