Enterococcus cecorum: NCTC12421_01380
Help
Entry
NCTC12421_01380 CDS
T07091
Name
(GenBank) Snf2 family protein
Organism
ecec
Enterococcus cecorum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
SNF2_assoc
Helicase_C
ResIII
DUF5125
AAA_22
DUF4901
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SQE55429
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(1324752..1327973)
Genome browser
AA seq
1073 aa
AA seq
DB search
MNKDQYQNIFKKARVLINQNSLINLRDYRKSGFYYGEFYHDFVILKTKVSMGSVRSDSCQ
CQTYGKYGACEHTMALRAEVGLSISWEDAYVELHDEENEKKIETYKVDALTQFMDSLQNH
FLVSVSPEQLQPLKLYYQLDYAQKSGQTAFYLRLYVNNGKRNYLIKNIHEFLNKCFYTDH
YKLTPKVSIAVAPECFSKEDFALIQWLMATHLGHLNYVDYREHSQEKEVVLDSTTMDELL
EKFPNHLLKITVDNQEFTQFHTMPADLDSFITCHIQKVDENLVTLFFEDNLEMTDFTYLC
AVIKGQLYRLDYQSVLLYDTYSDFQQKLYRYVTWQFDRLIYGFDSIFRFSLQEANAFLSK
YLPVIQKFAVVDIDPTLTENMIVAPLVPKFYFSEVRFGVQLDLTLQYGDIVLAKKSAYRQ
NADQANQLIRDIDQENRIEQFILANQFVEKKASYQLSISRDEDFYHFLKYTLTQFAQFGE
VILDEKLQEMFVNQEQYKPKLSIIKNGGFLDVSFEVDGIELEDVERALVALSKNADFVRL
NDGRLLDLSQEEFQKASESLSLIRQVSEQKANQFQMPLYRGGQLARLENEQIEVNQDFTT
FVQHLTHPQDYPVDLPSGLNASLRPYQLTGFRWLKMLSDYQLGGILADEMGLGKTIQTIT
YLLSEKQNDPSMKALIIVPASLVYNWYQECKQFAPELKVQVVNGGKDKRAEQLATEADVY
VTSYQSFRQDEKLHAKIAYQVLILDEAQMVKNSQTKTAQALRKLTIPKRFALSGTPVENK
LEELWSIFQVIIPGFFPSKAKFKKFPTELIAQMIQPFVLRRTKEEVLLDLPERIETNYFN
ELNKEQKEIYLAQLEQIQKTLAQMNSDEFKKNRISILAGLTRLRQICCSPQLYLDDFHGE
SGKLEQLKELLTQALENNRRILIFSQFASMLNLIEVELAQLDIPCFKLDGSTPSKQRMEM
VGAFNQGAKSVFLISLKAGGTGLNLTGANTVILYDLWWNPAVEDQATSRAHRMGQKEVVE
VWRLITEGTIEEKIYELQQSKRELFDKVMQGDESSLSQLTEEDIRQIFQVGIE
NT seq
3222 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaagaccaatatcagaacatttttaagaaagctagagtattaataaatcaaaat
agtctcattaatttacgtgattatcgtaaaagtggtttttattatggagaattttatcat
gattttgttatcctcaagacaaaggttagtatggggtctgttagaagtgatagttgtcaa
tgccagacatatggaaaatacggtgcttgcgagcatactatggctttaagggcagaagta
ggattgtcgatttcgtgggaggatgcttatgtagaattgcacgatgaggaaaatgaaaag
aaaatcgaaacatacaaggttgatgctttaacacaattcatggatagtctgcaaaatcat
tttttagtttccgtaagtccagaacaattacagccacttaaactttattatcagctcgat
tatgctcaaaaatcagggcaaactgccttttatttaagactgtatgtcaataatggaaag
cgtaattatttgataaaaaatattcatgaatttttaaataagtgcttttatacagatcac
tataagttgacgcctaaagtatcgatagcagtagccccagagtgtttttcaaaagaggac
tttgcgttgattcaatggttaatggctactcatttaggacatttaaactatgtagattat
cgcgaacatagtcaagagaaagaagttgtgttggatagtacgacaatggacgagctgtta
gaaaaattcccgaatcatttattaaaaattactgtagacaatcaagaatttacgcaattt
cacaccatgccagcggatttggattcatttattacttgtcatattcaaaaggtcgatgag
aatctagtaacactgttttttgaagataatcttgaaatgaccgactttacgtatttgtgt
gcggtgattaagggacaattgtatcgtttggattatcagtctgttttactatatgacact
tattctgactttcaacaaaaattatatcgttatgtgacgtggcagtttgataggttgatt
tacggttttgattcaatctttcgtttctccttacaagaggcaaatgctttcttatctaaa
tatttaccagtaattcaaaaatttgcggttgtggatattgatccgactttgacagaaaat
atgattgttgcgccattagttccgaagttttatttttctgaggtaagatttggggtccag
ttagacttgacgttgcaatatggtgatatcgtgcttgcgaaaaaatcagcttatcgccaa
aatgctgaccaagccaatcagttaattcgtgatatcgatcaggaaaatcgtatcgaacag
tttattttggctaatcaatttgtcgaaaaaaaggctagttatcaattatcgatttctcgt
gatgaagacttctatcatttcttaaaatatacactgacgcaatttgcccaattcggtgaa
gtgattttagatgaaaaacttcaagaaatgtttgtcaatcaggaacagtataagccaaaa
ttgtcgattattaaaaatggtggttttttagatgtatcttttgaagtcgacggtattgaa
ttagaagatgtcgagcgtgctttagttgctttaagtaagaatgcggattttgtgcgatta
aatgatggccgcttgcttgatttgtctcaagaggagttccaaaaagcaagtgagtcattg
tccttgattcgacaagtcagtgaacaaaaagccaaccaattccagatgcccttatatcgc
ggtggacagttagcccgattagaaaatgagcaaatcgaggtcaaccaagactttacgact
tttgttcaacatttaacccatccacaagactatccggtggatttaccaagtggattaaat
gctagtttacgtccttaccaattaacgggatttcgctggttgaagatgttaagtgattat
cagcttggggggattttggcggatgaaatgggtctaggaaaaacgattcagacgattact
tatctgttatctgaaaagcaaaatgatccatcaatgaaggctttaattatcgtaccagcc
agccttgtttataattggtatcaagagtgtaagcagtttgcacctgagttaaaagtgcaa
gtcgtaaatggtgggaaagataaacgggctgaacaactcgcgactgaagcggatgtatat
gtgacaagctatcaaagtttccgtcaagatgaaaaattacatgccaaaatagcctatcaa
gtgttgattttagatgaagcgcagatggtgaaaaatagtcaaacgaaaacggcccaagcc
ttgcgtaaattaacgattccaaaacggtttgcccttagtggtacgccagtggaaaataaa
cttgaggaattatggtcaatttttcaagtgattattccgggatttttcccaagtaaggcg
aagtttaagaaattcccaaccgaattaattgctcagatgattcagccatttgtgttaaga
cgaacgaaagaagaagtcttgcttgatttgccagaacgaattgagacaaattatttcaat
gaattaaacaaagagcaaaaagaaatctatctagcacagttagaacaaattcaaaaaacg
ttagcccaaatgaatagtgacgagtttaaaaagaatcgcattagcattttagctggtcta
actcgcttaagacagatttgttgttcgccgcagctttatttagatgattttcatggggag
tctggaaaattagaacagttaaaggaattactgactcaggctttggaaaacaatcgccgc
atcttaattttctcgcagtttgctagtatgttgaacttaatcgaagtagagttagcgcag
ttagatattccatgcttcaaattagatggcagcacaccgagcaagcagcgtatggaaatg
gtaggagcctttaatcaaggagccaaatctgtctttttaatttcgcttaaagctggtggt
acgggattgaacttaactggggcgaatacggtgattctgtatgatttatggtggaatcca
gctgtagaagaccaagcaacaagccgtgcccatcgaatgggacaaaaagaagtggtcgaa
gtatggcgtttgattacagaaggtacgattgaagaaaaaatctatgagctccaacaaagc
aagcgtgaactctttgataaagtcatgcaaggggatgagtcttccctttctcaattaacc
gaagaagatatccgccaaattttccaagtagggatagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
