Escherichia coli O157 H7 EC4115 (EHEC): ECH74115_5054
Help
Entry
ECH74115_5054 CDS
T00778
Name
(GenBank) intimin C-type lectin domain protein
KO
K12790
intimin
Organism
ecf
Escherichia coli O157:H7 EC4115 (EHEC)
Pathway
ecf05130
Pathogenic Escherichia coli infection
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ecf00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05130 Pathogenic Escherichia coli infection
ECH74115_5054
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
IAT_beta
Intimin_C
Big_1
Big_2
DUF4198
LysM
Big_3_5
MG4
PilX
DUF6795
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACI37768
LinkDB
All DBs
Position
complement(4699562..4702366)
Genome browser
AA seq
934 aa
AA seq
DB search
MITHGCYTRTRHKHKLKKTLIMLSAGLGLFFYVNQNSFANGENYFKLGSDSKLLTHDSYQ
NRLFYTLKTGETVADLSKSQDINLSTIWSLNKHLYSSESEMMKAAPGQQIILPLKKLPFE
YSALPLLGSAPLVAAGGVAGHTNKLTKMSPDVTKSNMTDDKALNYAAQQAASLGSQLQSR
SLNGDYAKDTALGIAGNQASSQLQAWLQHYGTAEVNLQSGNNFDGSSLDFLLPFYDSEKM
LAFGQVGARYIDSRFTANLGAGQRFFLPANMLGYNVFIDQDFSGDNTRLGIGGEYWRDYF
KSSVNGYFRMSGWHESYNKKDYDERPANGFDIRFNGYLPSYPALGAKLIYEQYYGDNVAL
FNSDKLQSNPGAATVGVNYTPIPLVTMGIDYRHGTGNENDLLYSMQFRYQFDKSWSQQIE
PQYVNELRTLSGSRYDLVQRNNNIILEYKKQDILSLNIPHDINGTEHSTQKIQLIVKSKY
GLDRIVWDDSALRSQGGQIQHSGSQSAQDYQAILPAYVQGGSNIYKVTARAYDRNGNSSN
NVQLTITVLSNGQVVDQVGVTDFTADKTSAKADNADTITYTATVKKNGVAQANVPVSFNI
VSGTATLGANSAKTDANGKATVTLKSSTPGQVVVSAKTAEMTSALNASAVIFFDQTKASI
TEIKADKTTAVANGKDAIKYTVKVMKNGQPVNNQSVTFSTNFGMFNGKSQTQATTGNDGR
ATITLTSSSAGKATVSATVSDGAEVKATEVTFFDELKIDNKVDIIGNNVRGELPNIWLQY
GQFKLKASGGDGTYSWYSENTSIATVDASGKVTLNGKGSVVIKATSGDKQTVSYTIKAPS
YMIKVDKQAYYADAMSICKNLLPSTQTVLSDIYDSWGAANKYSHYSSMNSITAWIKQTSS
EQRSGVSSTYNLITQNPLPGVNVNTPNVYAVCVE
NT seq
2805 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattactcatggttgttatacccggacccggcacaagcataagctaaaaaaaacattg
attatgcttagtgctggtttaggattgtttttttatgttaatcagaattcatttgcaaat
ggtgaaaattattttaaattgggttcggattcaaaactgttaactcatgatagctatcag
aatcgccttttttatacgttgaaaactggtgaaactgttgccgatctttctaaatcgcaa
gatattaatttatcgacgatttggtcgttgaataagcatttatacagttctgaaagcgaa
atgatgaaggccgcgcctggtcagcagatcattttgccactcaaaaaacttccctttgaa
tacagtgcactaccacttttaggttcggcacctcttgttgctgcaggtggtgttgctggt
cacacgaataaactgactaaaatgtccccggacgtgaccaaaagcaacatgaccgatgac
aaggcattaaattatgcggcacaacaggcggcgagtctcggtagccagcttcagtcgcga
tctctgaacggcgattacgcgaaagataccgctcttggtatcgctggtaaccaggcttcg
tcacagttgcaggcctggttacaacattatggaacggcagaggttaatctgcagagtggt
aataactttgacggtagttcactggacttcttattaccgttctatgattccgaaaaaatg
ctggcatttggtcaggtcggagcgcgttacattgactcccgctttacggcaaatttaggt
gcgggtcagcgttttttccttcctgcaaacatgttgggctataacgtcttcattgatcag
gatttttctggtgataatacccgtttaggtattggtggcgaatactggcgagactatttc
aaaagtagcgttaacggctatttccgcatgagcggctggcatgagtcatacaataagaaa
gactatgatgagcgcccagcaaatggcttcgatatccgttttaatggctatctaccgtca
tatccggcattaggcgccaagctgatatatgagcagtattatggtgataatgttgctttg
tttaattctgataagctgcagtcgaatcctggtgcggcgaccgttggtgtaaactatact
ccgattcctctggtgacgatggggatcgattaccgtcatggtacgggtaatgaaaatgat
ctcctttactcaatgcagttccgttatcagtttgataaatcgtggtctcagcaaattgaa
ccacagtatgttaacgagttaagaacattatcaggcagccgttacgatctggttcagcgt
aataacaatattattctggagtacaagaagcaggatattctttctctgaatattccgcat
gatattaatggtactgaacacagtacgcagaagattcagttgatcgttaagagcaaatac
ggtctggatcgtatcgtctgggatgatagtgcattacgcagtcagggcggtcagattcag
catagcggaagccaaagcgcacaagactaccaggctattttgcctgcttatgtgcaaggt
ggcagcaatatttataaagtgacggctcgcgcctatgaccgtaatggcaatagctctaac
aatgtacagcttactattaccgttctgtcgaatggtcaagttgtcgaccaggttggggta
acggactttacggcggataagacttcggctaaagcggataacgccgataccattacttat
accgcgacggtgaaaaagaatggggtagctcaggctaatgtccctgtttcatttaatatt
gtttcaggaactgcaactcttggggcaaatagtgccaaaacggatgctaacggtaaggca
accgtaacgttgaagtcgagtacgccaggacaggtcgtcgtgtctgctaaaaccgcggag
atgacttcagcacttaatgccagtgcggttatattttttgatcaaaccaaggccagcatt
actgagattaaggctgataagacaactgcagtagcaaatggtaaggatgctattaaatat
actgtaaaagttatgaaaaacggtcagccagttaataatcaatccgttacattctcaaca
aactttgggatgttcaacggtaagtctcaaacgcaagcaaccacgggaaatgatggtcgt
gcgacgataacactaacttccagttccgccggtaaagcgactgttagtgcgacagtcagt
gatggggctgaggttaaagcgactgaggtcactttttttgatgaactgaaaattgacaac
aaggttgatattattggtaacaatgtcagaggcgagttgcctaatatttggctgcaatat
ggtcagtttaaactgaaagcaagcggtggtgatggtacatattcatggtattcagaaaat
accagtatcgcgactgtcgatgcatcagggaaagtcactttgaatggtaaaggcagtgtc
gtaattaaagccacatctggtgataagcaaacagtaagttacactataaaagcaccgtcg
tatatgataaaagtggataagcaagcctattatgctgatgctatgtccatttgcaaaaat
ttattaccatccacacagacggtattgtcagatatttatgactcatggggggctgcaaat
aaatatagccattatagttctatgaactcaataactgcttggattaaacagacatctagt
gagcagcgttctggagtatcaagcacttataacctaataacacaaaaccctcttcctggg
gttaatgttaatactccaaatgtctatgcggtttgtgtagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
