Ehrlichia chaffeensis Jax: ECHJAX_0638
Help
Entry
ECHJAX_0638 CDS
T03189
Symbol
priA
Name
(GenBank) primosomal protein N'
KO
K04066
primosomal protein N' (replication factor Y) (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
echj
Ehrlichia chaffeensis Jax
Pathway
echj03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
echj00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
ECHJAX_0638 (priA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
echj03400
]
ECHJAX_0638 (priA)
Enzymes [BR:
echj01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
ECHJAX_0638 (priA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
echj03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
ECHJAX_0638 (priA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PriA_C
DEAD
PriA_3primeBD
ResIII
Zn_ribbon_PriA
Helicase_C
AAA_22
AAA_19
nSTAND3
TsaE
PIF1
UPRTase
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHX05698
LinkDB
All DBs
Position
complement(738352..740328)
Genome browser
AA seq
658 aa
AA seq
DB search
MIAEILLPVPINKTFYYTIPENDMFCVGEYVLVPFGARTLVGVILKLNDMIPSDCNVEKL
QLKVVISKNSLPRVNVALLNFIKWVSDYNIVPAGLVLKMVFSNVVNAKSFSKLKFYAKQN
DRCNSVEINLSNEQRIAYNSIVNKISGYSVIVLDGETGSGKTEVYCEVIRELIKRDSTAQ
ALILLPEIVLTLQLIKRIKHYFDSYYPVEWHSNLTLKNRKEYWLSIAYGQSLIVIGARSA
LFLPYKNLKMIIVDEEHDSSFKQECGVLYNARDMSIVLAKNLDIPIILSSATPSLEAINN
VLKSQYYHVKLTQRFGNAKLPSVRIVDLCKSKMVNVWLSNKLYNSILETLQRQDQVMLFL
NRRGYAKLRLCKACGFKINCKNCATWLVEHKKKNILLCHYCGYSCPMQDECTNCSDKSSL
ISYGVGVEKIAEDIVALIPNAKVAIISSDISSKDVSVMIDMIMRNEVNVIIGTQVIAKGH
NFPRLTLVGIIDADLSLNNSDLRATERTYQLLHQVSGRSGRFADNGEVILQTYDTNSPLI
KSLSSYNRELFYSLELESRLLTKMPPYTRLIGIIISGKDETHVINVSKQIVKSLPHTLTV
LGPAPAPISFLNRKYRYRILIKVQHNVIIQKLLAKYKEYYAKANKIRITIDVDPVNFM
NT seq
1977 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagctgaaattttacttccggtaccgattaataagacattttattacactattcca
gagaatgatatgttctgtgttggtgaatatgttcttgtaccttttggagctagaaccttg
gtaggtgttatattgaaattgaatgatatgataccttcagattgtaatgtagaaaagtta
caattaaaagttgtaatttctaaaaattctttgccaagagttaatgttgcgttacttaat
tttattaaatgggtgagcgactataatattgttccagcaggtttagtattaaagatggtg
ttcagtaatgtagtaaatgctaaatcttttagtaagctaaaattttatgcaaaacaaaat
gacagatgtaatagtgtagaaattaatttatctaatgaacaaaggattgcatataatagt
attgttaataagatttcaggttattcagttatagtattagatggggaaactggctctgga
aaaactgaagtttattgtgaagttatacgtgaattaataaaaagggatagtacagcacaa
gcattaattttacttccagagatagtgttaacattgcagttaataaagcgtataaagcat
tattttgatagttattatccagtagaatggcattcaaatttaacattaaagaatcgtaag
gaatattggttatccatagcatatgggcagtctttgattgttataggtgcaagatctgct
ttatttctaccatataaaaaccttaagatgattattgtagatgaagaacatgattcatcg
tttaagcaggaatgtggagtgctatataatgcacgtgatatgtctattgtgttggcaaaa
aatttggatataccaataattttgtcttcggctactccatctctagaggcgatcaacaat
gtattaaagtctcagtattatcatgtgaaattaacgcaaaggtttggaaatgctaaattg
ccatcagtgaggattgttgatttatgtaagagcaagatggtcaatgtgtggttatcaaat
aaactttataatagtatattggaaactttgcaaaggcaagatcaagttatgcttttcttg
aatcgtcgtggatatgcaaaattgagattatgcaaagcttgcggttttaaaataaactgt
aaaaactgtgctacttggcttgtagaacataaaaagaaaaacatattattatgtcattat
tgtgggtattcttgtcccatgcaagatgagtgtactaactgttcagataaatcttctctt
atatcatatggggtaggtgtagaaaaaatagcagaggacattgttgcactaataccaaat
gctaaagttgcgataattagcagtgatattagtagtaaggatgtaagtgttatgattgat
atgattatgcgtaatgaggtaaatgttattattggtactcaagtgatagcaaaaggtcat
aattttcccagattaacgttagttggtataatagatgctgatttaagtttgaataatagt
gatttgcgtgctacagagagaacttatcagctgttgcatcaggtatcagggcgttctggt
agatttgcagataacggtgaagtaattttacaaacttatgataccaatagcccattgatt
aaatcattgtcatcttataatcgtgaattgttttatagtttagagctagaatctaggtta
ttaactaaaatgccaccatatacaagattaataggtataataattagtggtaaggatgaa
actcatgtcataaatgtgtcgaagcaaatagtaaagagtcttccccatactttgactgtt
ttgggtccagctcctgctcctataagttttttaaataggaaatatagatatagaattttg
attaaggtacagcataacgttattatacaaaaactacttgctaagtataaggagtattat
gcaaaagcaaataaaattaggattactatagatgttgatccagtaaattttatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system