Escherichia coli K-12 W3110: JW5422 Help Entry JW5422            CDS       T00068                                  Symbol ypjA Name (GenBank) adhesin-like autotransporter Organism ecj  Escherichia coli K-12 W3110 SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  AIDA Autotransporter Pertactin Trypan_PARP DUF421 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  BAA16514 UniProt:  P52143 LinkDB All DBs Position complement(2776802..2781382) Genome browser AA seq 1526 aa AA seqDB search MNRTSPYYCRRSVLSLLISALIYAPPGMAAFTTNVIGVVNDETVDGNQKVDERGTTNNTH IINHGQQNVHGGVSNGSLIESGGYQDIGSHNNFVGQANNTTINGGRQSIHDGGISTGTTI ESGNQDVYKGGISNGTTIKGGASRVEGGSANGILIDGGSQIVKVQGHADGTTINKSGSQD VVQGSLATNTTINGGRQYVEQSTVETTTIKNGGEQRVYESRALDTTIEGGTQSLNSKSTA KNTHIYSGGTQIVDNTSTSDVIEVYSGGVLDVRGGTATNVTQHDGAILKTNTNGTTVSGT NSEGAFSIHNHVADNVLLENGGHLDINAYGSANKTIIKDKGTMSVLTNAKADATRIDNGG VMDVAGNATNTIINGGTQNINNYGIATGTNINSGTQNIKSGGKADTTIISSGSRQVVEKD GTAIGSNISAGGSLIVYTGGIAHGVNQETGSALVANTGAGTDIEGYNKLSHFTITGGEAN YVVLENTGELTVVAKTSAKNTTIDTGGKLIVQKEAKTDSTRLNNGGVLEVQDGGEAKHVE QQSGGALIASTTSGTLIEGTNSYGDAFYIRNSEAKNVVLENAGSLTVVTGSRAVDTIINA NGKMDVYGKDVGTVLNSAGTQTIYASATSDKANIKGGKQTVYGLATEANIESGEQIVDGG STEKTHINGGTQTVQNYGKAINTDIVSGLQQIMANGTAEGSIINGGSQVVNEGGLAENSV LNDGGTLDVREKGSATGIQQSSQGALVATTRATRVTGTRADGVAFSIEQGAANNILLANG GVLTVESDTSSDKTQVNMGGREIVKTKATATGTTLTGGEQIVEGVANETTINDGGIQTVS ANGEAIKTKINEGGTLTVNDNGKATDIVQNSGAALQTSTANGIEISGTHQYGTFSISGNL ATNMLLENGGNLLVLAGTEARDSTVGKGGAMQNLGQDSATKVNSGGQYTLGRSKDEFQAL ARAEDLQVAGGTAIVYAGTLADASVSGATGSLSLMTPRDNVTPVKLEGAVRITDSATLTL GNGVDTTLADLTAASRGSVWLNSNNSCAGTSNCEYRVNSLLLNDGDVYLSAQTAAPATTN GIYNTLTTNELSGSGNFYLHTNVAGSRGDQLVVNNNATGNFKIFVQDTGVSPQSDDAMTL VKTGGGDASFTLGNTGGFVDLGTYEYVLKSDGNSNWNLTNDVKPNPDPIPNPKPDPKPDP KPDPNPKPDPTPDPTPTPVPEKRITPSTAAVLNMAATLPLVFDAELNSIRERLNIMKASP HNNNVWGATYNTRNNVTTDAGAGFEQTLTGMTVGIDSRNDIPEGITTLGAFMGYSHSHIG FDRGGHGSVGSYSLGGYASWEHESGFYLDGVVKLNRFKSNVAGKMSSGGAANGSYHSNGL GGHIETGMRFTDGNWNLTPYASLTGFTADNPEYHLSNGMKSKSVDTRSIYRELGATLSYN MRLGNGMEVEPWLKAAVRKEFVDDNRVKVNSDGNFVNYLSGRRGIYQAGIKASFSSTLSG HLGVGYSHSAGVESPWNAVAGVNWSF NT seq 4581 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaacaggaccagtccctattattgtcgccgctcagtactttccttattgatatctgcc ttgatatatgccccgcccgggatggctgccttcactactaatgttattggtgtggtaaac gatgagactgtagatggcaaccaaaaagtggatgaacgaggtacaacaaataacactcat attatcaaccatggccagcagaatgttcatggcggggtatctaatggaagtcttattgaa tctggtggatatcaagatataggaagtcataacaattttgtggggcaggctaataataca accattaacggtggcagacagtcaattcatgacgggggtatttccacaggtacgacaatc gagagtggcaatcaggacgtttataaagggggtatcagcaatggaacgacaattaagggc ggtgcttcacgcgtagagggagggagtgcgaatggaatactcattgatggtggtagccag atagtaaaagttcaagggcatgctgatggtacaacgataaataagtctggctctcaggac gtagtacaaggaagtctggcaacgaacacaaccataaatggtggtcgacagtatgttgaa cagagcacagtagaaacaacaaccattaaaaatggcggtgagcaaagagtatatgagagc cgtgcgctggacacgacgattgaaggcggaactcagtctctgaatagtaagtcaacggca aaaaatacgcatatctattctggtggcacgcaaattgttgataacaccagcacctcggat gttattgaagtttattctggtggcgtgcttgatgttaggggtggtacggcaacaaatgtt acccagcacgatggtgcaattttaaaaactaacactaacggtacgacggtgagcggtacg aatagtgaaggtgcattctccatccacaatcacgtggcagacaatgtgttgctggaaaac ggtggtcatttagacataaacgcatatggttcggcaaacaagacgattattaaagataaa ggaacaatgtcagttttaaccaatgctaaagctgatgcgacccgaatagataatggcggg gttatggatgttgcaggaaacgcgacaaataccataattaatggtggcacacagaatatt aataattatggcatagccacaggcaccaatatcaacagcggaacgcaaaatatcaaaagc ggcgggaaagctgacacaacaattatatcctccgggagccggcaggttgttgagaaagat ggtacggcaattggcagcaatattagcgccggaggctcgctgattgtctataccggcggt attgcacatggggttaaccaggagacgggcagtgctttagttgccaacacgggtgcaggg actgatatcgaaggatacaacaagctctctcacttcactattaccggaggggaggctaat tatgttgtgctggaaaataccggcgaactgacggtagtggctaaaacctcggcgaaaaat actaccattgatactggcggtaagctgattgtccagaaggaggctaaaacagatagcacc agacttaataatggcggcgttctggaggttcaggacggtggtgaggctaagcatgttgag caacaatccggcggcgcattaattgcttccacgacctccggaacacttatcgaaggaacc aacagttatggtgatgctttctacatcaggaattcagaagctaaaaatgtagtgctggaa aacgctggctcattaacagtcgtcactggttcccgcgcagttgacacgattattaatgcc aacggcaaaatggatgtttatggaaaagatgttggcactgtactcaatagtgctggcacc caaacaatatatgccagtgccacttctgataaagcaaatatcaaaggtggcaagcaaacg gtatatggtttagccactgaagcaaatatcgaaagtggtgaacaaattgttgatggtggg tcaacagagaaaacacacatcaatggtggcacgcaaaccgttcagaattatggtaaggca atcaataccgatatcgtctctggcctacaacaaattatggcaaacgggacagcggaaggt tccattattaatgggggttcacaggtagttaatgagggcggcctggctgaaaactcggtg cttaatgacggcggcacactcgatgtgcgggagaaaggcagcgcaacggggatacagcag agtagccagggcgctttggttgcaaccaccagggcgacgcgggtcacaggaacacgcgcg gatggcgtcgcgttcagcatcgagcagggtgcggcgaacaatatcctgctggcaaatggc ggcgtgttaaccgtggagtcagacacctcttctgacaaaacacaggtcaatatgggcgga cgggagatcgtcaaaacaaaagccactgcgacaggcacgacgctcaccggcggtgaacaa attgtcgagggtgtggcgaatgagacaacaattaacgacggcggaatacaaacagtttca gctaacggagaggcaataaaaacaaagatcaatgaaggcggtacgctgacagtcaacgat aatggcaaagcgacagatatcgtccagaacagcggtgccgctctccagacgagcacggct aacggtattgaaatcagcggtactcaccagtacggtactttttccatttccggcaattta gcgaccaatatgttgctggaaaatggcggtaatttattggtattagcaggtaccgaagct cgcgactccacggttggcaagggtggggcaatgcaaaacctgggtcaggactccgccaca aaggttaactctggcgggcaatatacccttgggcggtcaaaagatgagtttcaggctctg gcccgggcagaagatctccaggtcgctggcggtacggcaatcgtctacgcaggtacgctg gcggatgcatcggtcagtggcgcgacaggaagcctgtcgttaatgacgccacgggataat gttacgccagttaaactcgaaggggcggtccggattaccgatagcgcgacattgactctg ggaaatggcgtcgataccacgcttgccgacctgacggctgccagccggggcagtgtctgg cttaacagcaataattcctgtgcaggtaccagcaactgcgaatatagagtaaacagtttg ctactcaacgacggtgatgtttatttgtcagcacaaacagcagcgcctgccacaactaac ggtatctacaatacgctgacaaccaatgaactttccggtagcggtaatttctacctgcat accaacgttgcaggctcccggggcgatcaactggtcgtcaacaacaacgccactggtaat tttaaaatctttgttcaggataccggcgtcagcccacagtctgacgacgcgatgacgctg gtgaaaacagggggaggggatgcttcgtttacgctgggcaataccggcggtttcgttgat cttgggacctatgagtatgtcctgaaaagtgacggcaacagcaactggaacctgaccaat gatgtcaaacccaacccggaccccatcccaaatccaaagccagacccaaaacccgatcca aagccagacccaaatccaaaaccagaccctactcccgatccaacgccgacacccgttccg gagaaacgcattacgccttctacggcagccgtactcaatatggcagcaacattaccgttg gtatttgatgctgagctaaacagtattcgcgagcggttgaacataatgaaagcgagtcca cacaacaataatgtctggggggcgacgtataacacccgtaataatgtcaccaccgatgcg ggtgccgggtttgagcagacgctgaccggaatgacagtggggatcgacagccgtaatgat attcctgaaggaattaccacgctaggcgcttttatgggctattcccattcacatatcggt tttgatcgcggaggacatggcagtgtgggcagttattctctgggcggctatgccagttgg gaacatgaaagtggtttctatctggacggtgtcgtgaagctgaaccgttttaaaagtaac gtagcaggtaaaatgagcagcggtggagccgccaatggcagttaccacagcaacgggctg ggcggtcacattgaaaccgggatgcgatttaccgatggtaactggaacctgacgccgtat gcatcgttaacggggttcaccgctgataaccccgaatatcatttatccaatggcatgaaa tcgaaatcagtcgatacccgcagtatatatcgtgaactgggcgcaacgctgagttacaac atgcgtctggggaacggtatggaagttgagccgtggctgaaggcggctgtgcgcaaagaa tttgtcgatgataaccgggtgaaagtgaatagtgacggtaatttcgtcaattatttgtcg ggcagacgtggaatataccaggcaggtattaaagcctcattcagcagtacgttaagcggg catcttggggtggggtatagccatagtgccggtgtggaatccccgtggaacgcggtagct ggtgtgaactggtcgttctga

DBGET integrated database retrieval system