Escherichia coli SMS-3-5 (environmental): EcSMS35_1139
Help
Entry
EcSMS35_1139 CDS
T00672
Name
(GenBank) MATE efflux family protein
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
ecm
Escherichia coli SMS-3-5 (environmental)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ecm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ecm02000
]
EcSMS35_1139
Transporters [BR:
ecm02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
EcSMS35_1139
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACB20148
UniProt:
B1LPW1
LinkDB
All DBs
Position
1157310..1158764
Genome browser
AA seq
484 aa
AA seq
DB search
MNISSALRQVVHGTRWHAKRKSYKVLFWREITPLAVPIFMENACVLLMGVLSTFLVSWLG
KDAMAGVGLADSFNMVIMAFFAAIDLGTTVVVAFSLGKRDRRRARVATRQSLVIMTLFAV
LLATLIHHFGEQIIDFVAGDATTEVKALALTYLELTALSYPAAAITLIGSGALRGAGNTK
IPLLINGSLNILNIIISGILIYGLFSWPGLGFVGAGLGLTISRYIGAVAILWVLAIGFNP
ALRISLKSYFKPLNFSIIWEVMGIGIPASVESVLFTSGRLLTQMFVAGMGTSVIAGNFIA
FSIAALINLPGSALGSASTIITGRRLGVGQIAQAEIQLRHVFWLSTLGLTAIAWLTAPFA
GVMASFYTQDPQVKHVVVILIWLNALFMPIWSASWVLPAGFKGARDARYAMWVSMLSMWG
CRVVVGYVLGIMLGWGVVGVWMGMFADWAVRAVLFYWRMVTGRWLWKYPRSEPQKCEKKP
AVSE
NT seq
1455 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaatatctcctctgctttacgccaggttgttcacggcactcgctggcacgctaaacgc
aagagctacaaagtgttgttctggcgcgagataaccccgcttgctgttcctatcttcatg
gagaatgcctgtgtcctgttgatgggtgtcctgagcacttttctggtcagctggctggga
aaagatgcgatggccggcgtgggattggcggacagcttcaatatggtcattatggctttt
tttgctgctatcgatcttggtactactgtcgttgtggcatttagtctcggtaagcgggat
cgacgacgagcgagggtggcgacgcggcagtcattggtgatcatgacgttgtttgccgta
ctgttggcaacgcttattcatcattttggcgaacaaattattgatttcgtcgcgggtgat
gccacgacagaagttaaagcactggcgttgacttatctggagctgacggcactcagttat
ccagcagctgccatcactttgattggtagcggggcacttcgtggtgcagggaatacgaaa
ataccgctactgattaacggtagcctgaatattcttaatattattattagcggcatattg
atttacggccttttctcctggccgggactgggatttgtcggggctgggttgggtttaacc
atttctcgttatattggcgcagttgcaattttgtgggtgctggcgattggttttaatcct
gcgctaaggatttcgttaaagagctattttaaaccgctgaattttagcattatctgggaa
gtcatggggattggtattccagcgagtgtcgaatcagtgttatttaccagtggtcggtta
ttaacccaaatgttcgttgccgggatggggaccagtgttattgccggaaattttatcgcg
ttttcaattgcggctcttatcaacttacccggaagtgcgctcggctctgcttctacgatc
attacaggccgaaggttgggggtagggcagatagcgcaagcagagattcagttgcggcat
gtgttctggctttccactcttggattaacggccatcgcctggctaacggctccctttgcc
ggggttatggcatcgttttacacccaggatccacaggttaaacatgtcgttgtgattctg
atttggctaaatgctttatttatgcctatttggtccgcctcatgggtgctacccgctgga
tttaaaggtgctcgcgatgcccgttacgccatgtgggtttctatgttgagcatgtggggt
tgccgggttgtcgtcggttatgtgctgggcatcatgcttggctggggtgtggttggtgtc
tggatgggaatgtttgccgactgggctgtgcgggccgtgctgttttactggcgaatggtt
actggacgttggctgtggaaataccctcgatccgaaccgcaaaagtgtgaaaaaaagcca
gctgtgtcggaataa
DBGET
integrated database retrieval system
