Escherichia coli SMS-3-5 (environmental): EcSMS35_3959
Help
Entry
EcSMS35_3959 CDS
T00672
Name
(GenBank) O-antigen polymerase
KO
K02847
O-antigen ligase [EC:
2.4.99.26
]
Organism
ecm
Escherichia coli SMS-3-5 (environmental)
Pathway
ecm00540
Lipopolysaccharide biosynthesis
ecm01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ecm00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00540 Lipopolysaccharide biosynthesis
EcSMS35_3959
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
ecm01005
]
EcSMS35_3959
Enzymes [BR:
ecm01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.26 O-antigen ligase
EcSMS35_3959
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
ecm01005
]
Core region
EcSMS35_3959
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Wzy_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACB18664
UniProt:
B1LK61
LinkDB
All DBs
Position
complement(4037015..4038268)
Genome browser
AA seq
417 aa
AA seq
DB search
MSFCWKEINSGVKSLILILCMLSLMTLSLWDDVATKFLHAAGIISTLYFLATAKKTITNN
PTLLIFISLCLLGIVNIIWYSHYKVSGSVYTNAYRGPMETGKIALCSAFIFLVLFAKDEM
RTKIKFGKLILFASLATQLLFFAHAMWQHFYLNVDRVALSASHATTAGYIILFPSLLASI
LILKCDFRHKTTLYTINFMLSLCAVIVTETRAAILVFPFFALILIVMDSYINKRINYKLY
CFIAIALLAGVFSFKDTLLMRMNDLNNDLVNYSHDNTRTSVGARLAMYEVGLKTYSPIGQ
SLEKRAEKIHELEEKEPRLSGALPFVDSHLHNDLIDTLSTRGIPGVVLTILAFSAIFIYA
LRTAKEPYILILLFSLLVVGLSDVILFSKPVPTAVFVTIILLCAYFKAQSDQCLLDK
NT seq
1254 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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atgttgtctttaatgactttgtctttgtgggatgatgttgcaacaaagtttcttcatgca
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ttgctttgtgcttattttaaagcacaatcggaccaatgtttattagataagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
