Ehrlichia canis: Ecaj_0170
Help
Entry
Ecaj_0170 CDS
T00270
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
ecn
Ehrlichia canis
Pathway
ecn03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ecn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
Ecaj_0170
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
ecn03021
]
Ecaj_0170
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ecn03400
]
Ecaj_0170
Enzymes [BR:
ecn01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
Ecaj_0170
Transcription machinery [BR:
ecn03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
Ecaj_0170
DNA repair and recombination proteins [BR:
ecn03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
Ecaj_0170
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
Biotin_lipoyl_2
RPOC_hybrid
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ68221
UniProt:
Q3YST4
LinkDB
All DBs
Position
252485..256717
Genome browser
AA seq
1410 aa
AA seq
DB search
MKMLDLYGYTSIAQSFDKICISIASPESIRAMSYGEIKDISTTNYRTFKVEKGGLFCPKI
FGPVNDDECLCGKYRKKRYRGVICEKCGVEVTSSKVRRERMGHIELVSPVAHVWFLKSLP
SRIGALLDMPLKLIESILYSGDFVVIDPIATPLSKGEVISESAYNQAKDNYGEDSFLALT
GAEAIRELLVRLDLHAINANLRTELESTTSEMKRKKIVKRLRIVENFINSGNKPEWMILT
VIPILPPDLRPLVSLENGRPAVSDLNHHYRTIINRNNRLGKLLKLNPPAIMIRNEKRMLQ
EAVDALFDSTRRSYVSNKAGSVGYKKSLSDMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGP
NLKLHQCGLPKKMALELFKPFICSKLKMYGIVPTVKLANKMIQNEKPEVWDILDEVIHEH
PILLNRAPTLHRLGIQAFDPVLIEGKAIQLHPLVCSAFNADFDGDQMAVHIPLSLEAQLE
ARILMMSTNNILSPSNGKPIIVPSKDIVLGIYYLTLQDQAQSEDEVLFFGDFSHVEYALH
NKDVHLCSKIKYRMTYCNYDVEGNKPSYYSKIIETTPGRLILWQIFPQHKNLTFDLINQV
LTVKEITSIVDLVYRNCGQSETVEFSDKLMSLGFKYASQSGISFGCKDMIIPDTKTMHVD
NASDKIKEFAVQYQDGLITRSERYNKVIDEWSKCTDLIAKDMMKAISVYDEENKLNSIYM
MAHSGARGSASQMKQLSGMRGLMAKPSGEIIETPIISNFREGLNVFEYFNSTHGARKGLA
DTALKTANSGYLTRRLVDVAQDCIVVEYDCKTHNGFAIRSVVEGGAVVETLDNIILGRVA
AVDVYNPITEELLVKAGELIDEAKVEKIKIAGLDAVKVRSPLTCEAKKGICALCYGRDLA
IGDVVSIGEAVGVIAAQSVGEPGTQLTMRTFHVGGTAMRGVETSNLIALLDAKAKLVNSN
VVEDKHGNKIVMSRSCEIVLLDSVGNEKMRHNIPYGARLYVNDGQFVKITEKIAEWDPYT
MPIITEKTGIIKYMDLIDGVSINEVLDESTGISNRVVVDWKLHLQGANLRPRLVLVDDNG
NIITLSNGLEANYFIPIGAVLNVQDGQKVHAGDVITRIPRESIKTRDITGGLPRVIELFE
ARRPKEHAIVSDIDGYVEFGKDYYRSKRRIFIKPVDDKLTPVEYLVPKGKHTIVNEGDFV
HKGDLLMDGDPDPHDILRVLGVEALANYMISEIQQVYRLQGVRIDNKHIEIILRQMLQKV
EIFEPGDTMYLVGENIDMEEVIKTNNSMVKMGKSPAKYAPILQGITRASLDTNSFVSAAS
FQETTKVLTEAAFSGKEDSLYGLKENVIVGRLIPAGTGFLMNKIKKLSLLNKEDYSMYYD
SEYQDPALLQSDSNNFGHDLPKGNNNIVDY
NT seq
4233 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagatgttggatttgtatggctatactagtattgcacaatcatttgataagatttgt
atatctatagctagtcctgaaagcattagagcaatgtcgtatggtgagattaaagatatt
tctactactaattaccgtacgtttaaagtggaaaaaggaggtcttttttgtcctaaaatt
tttggacctgtaaatgatgatgaatgtttgtgcggtaagtacagaaaaaaacgttataga
ggagtaatttgtgaaaagtgtggagttgaggttacttcttcaaaggtgcgtagagaaaga
atgggtcatatagaacttgtgtcacctgtagcacatgtttggttcctaaagtctttgccg
tctcgtataggtgcattgcttgatatgccacttaagttaatagaaagtatcctatatagt
ggtgattttgtggtaattgaccctattgcgactccattatctaagggtgaggtgataagt
gagagtgcatacaatcaagcaaaggataattatggtgaggatagttttcttgctcttact
ggagctgaggctattagggaattgctggtgcgattggatttacatgcaattaatgcaaat
cttagaacggagttagagtctacaacttcagaaatgaagcgtaagaaaatagtcaaaagg
ttacgtattgttgaaaattttataaattctggtaataaacctgaatggatgatattaact
gttatcccaattttaccacctgatttaagaccgctagtttctttggaaaatggaagacca
gcagtttctgatttaaatcatcattatcggactattattaatcgtaataatagattaggt
aagttattaaaattgaatccacctgcaattatgattcgtaatgaaaagagaatgctgcag
gaagctgtagatgctctttttgatagtacacgtcgtagttatgtttctaataaagcagga
agtgtaggatacaagaaatcattaagtgatatgttaaaaggtaagcaaggacgctttagg
caaaacttgctagggaaaagggtagattattctggcagatcagtaattgttgtaggtcct
aacttaaaattacatcagtgtgggttaccaaagaaaatggctcttgaattgtttaagccg
tttatttgttctaagctgaaaatgtatggtattgtgccaacagtaaagttagcaaataag
atgatacaaaatgaaaaaccagaagtctgggatattctggatgaagtaatacatgaacat
ccaatattattaaatagagctcctactttgcataggctagggatacaagcctttgatcca
gtattaatagaagggaaagcaatacaattacatcctttagtatgtagtgcttttaatgct
gattttgatggagatcaaatggctgtacatatcccattgtcattagaagcacagcttgaa
gctagaatattaatgatgtctactaataatatcttaagtccttctaatggtaagccaata
attgttccttcaaaagatatagtacttggtatatattacttaactttacaagatcaagca
cagtctgaagatgaagttttattctttggtgattttagtcatgtggaatatgctttacac
aataaggatgtccatctatgtagtaaaattaaatataggatgacttattgtaattatgat
gtagaagggaataagccttcatattattctaaaattattgaaactactcctggtaggttg
atattatggcaaatatttccacaacataagaatttaacttttgatttaataaatcaagtt
ttgactgtaaaagaaattacatcaatagttgacttagtatatagaaactgtggtcaaagt
gaaactgttgaattttcagataaattaatgtctcttgggtttaagtatgcttcacaatct
ggtatttcatttggatgtaaagatatgattatcccagatactaagacaatgcatgtagat
aatgctagtgataaaataaaagagtttgctgtgcagtatcaggatggtttaattacaaga
agtgaaagatataataaagtaatagatgagtggtctaaatgtactgatctaatagctaaa
gatatgatgaaagctatttctgtatatgatgaagaaaataagttgaattctatttatatg
atggcacattctggggctagaggatctgcatcgcagatgaaacagttatctgggatgaga
ggattaatggctaagccttcaggtgagattattgaaactccaataatatctaacttccgt
gaagggttgaatgtgtttgaatatttcaattcaactcatggggcaagaaaaggattagca
gatactgctttaaagactgcaaattctggttacttgactcgtaggcttgttgatgttgct
caagattgtatagttgttgaatatgattgcaaaacacacaatggatttgcgataaggtct
gttgttgaaggtggtgctgtagttgaaacattagataatattatacttggaagggttgct
gctgttgatgtatataaccctattactgaagagttgcttgttaaagctggagaattaata
gatgaagctaaagttgagaagataaaaatagcaggattagatgctgtgaaggtaagatca
cctcttacttgtgaagctaaaaaaggtatttgtgctttatgttatggtagagaccttgct
attggtgatgttgtgtcaataggtgaagctgttggtgtgatagctgctcaatctgttggt
gaacctggtactcaattaactatgcgtactttccacgtgggtggtactgcaatgagaggt
gttgaaacttccaacttaatagcattattagatgctaaagcaaaattagtgaatagtaat
gttgttgaagataaacatggtaataagattgtcatgagtagatcttgtgaaatagtattg
cttgatagtgttggaaatgaaaaaatgcgtcataatataccttatggagcaagactttat
gttaacgatggtcaatttgtaaaaattacagaaaaaattgctgaatgggatccttataca
atgcctattattacagaaaagactggtattattaagtatatggatttaatagatggtgta
tctatcaatgaagtattagatgagtctactggtatttctaatagagtagtagttgattgg
aaattacatttacaaggtgctaacctgagacctagactagttttagttgatgataatggt
aatataattacattatctaatggactagaagcaaattatttcataccgataggagcagta
ttaaatgtacaagatgggcaaaaagttcatgctggtgatgttataacaaggattccaaga
gaatctataaaaactagagatattacaggagggttgcctagagtaattgagttatttgaa
gcacgtcgtccgaaagaacatgctatagtaagtgatattgatggttatgttgagtttgga
aaagattattataggtctaaaagacgtatatttattaagcctgtagatgataaattgaca
cctgttgagtatttggtgcctaaaggtaagcatactattgtgaatgaaggtgactttgta
cacaaaggagatttattaatggatggtgatcctgatcctcatgatatcttgcgtgtttta
ggtgttgaagcactggcaaattatatgatctctgagatccaacaggtttataggctacaa
ggtgtacgtattgataataagcatatagaaataatcttaagacaaatgttgcaaaaagtt
gagatatttgaaccaggggatactatgtatttagttggagagaatatagatatggaagaa
gtaataaagaccaataacagcatggtaaagatgggcaaatctcctgctaagtatgctcca
atacttcaaggtattactagagcaagtcttgatactaattcatttgtttctgcagcgtca
ttccaggagactacgaaagttttaacagaagcagcattttctggtaaggaagattcttta
tatggattaaaggaaaatgtaatagtaggtagattaatacctgcgggtactggtttctta
atgaataagataaagaaactgtctttattgaataaggaagattattctatgtattatgat
agtgaatatcaagatcctgcattgttacaatctgatagtaacaactttggtcatgacttg
ccaaaaggtaataataatattgttgattattag
DBGET
integrated database retrieval system
