Escherichia coli APEC O78 (APEC): APECO78_14790
Help
Entry
APECO78_14790 CDS
T02445
Name
(GenBank) outer membrane autotransporter
Organism
ecoa
Escherichia coli APEC O78 (APEC)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pertactin
Autotransporter
AIDA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGC87683
LinkDB
All DBs
Position
complement(3054200..3056488)
Genome browser
AA seq
762 aa
AA seq
DB search
MASTVEYGETVDGVVLEKDIQLVYGTANNTKINPGGEQHIKEFGISSNTEINGGYQYIEM
NGTAEYSVLNDGYQIVQMGGAANQTTLNNGVLQVYGAANDPTIKGGRLIVEKDGITVLAA
IEKGGLLEVKEGGLAIAVDQKAGGKLIVSTNALEVSGTNSKGQFSIKDGVSKNYELDDGS
GLIVMEDTQAIDTILDEHATMQSLGKDTGTRVQANAVYDLGRSDQNGSITYSSKAISENM
VINNGRANVWAGTMVNVSVRGNDGILEVMKPQINYAPAMLVGKVVVSEGASFRTHGAVDT
SKADVSLENSVWTIIADITTTNQNTLLNLANLAMSDANVIMMDEPVTRSSVTASAENFIT
LTTNTLSGNGNFYMRTDMANHQSDQLNVTGQATGDFKIFVTDTGASPAAGDSLTLVTTGG
GDAAFTLGNAGGVVDIGTYEYTLLDNGNHSWSLAENRAQITPSTTDVLNMAAAQPLVFDA
ELDTVRERLGSVKGVSYDTAMWSSAINTRNNVTTDAGAGFEQTLTGLTLGIDSRFSREES
STIRGLFFGYSHSDIGFDRGGKGNIDSYTLGAYAGWEHQNGAYVDGVVKVDRFANTIHGK
MSNGATAFGDYNSNGAGAHVESGFRWVDGLWSVRPYLAFTGFTTDGQDYTLSNGMRADVG
NTRILRAEAGTAVSYHMDLQNGTTLEPWLKAAVRQEYADSNQVKVNDDGKFNNDVAGARG
VYQAGIRSSFTPTLSGHLSVSYGNGAGVESPWNTQAGVVWTF
NT seq
2289 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggcatcaacagttgagtatggtgagacagttgatggtgttgtcctggaaaaagatatc
cagctggtttatgggaccgccaataatacgaaaatcaatcctggcggagaacagcatatt
aaagaatttggtataagtagtaatactgaaattaacggcgggtatcagtacattgaaatg
aatggcaccgcagaatactcagtattaaatgacggttatcaaattgttcaaatgggtggc
gcggcaaaccagactaccctcaataatggtgtgctacaggtttatggcgcagcgaatgat
cccacgattaaaggcgggcgcttaatcgttgaaaaagatgggattaccgtccttgccgct
atcgaaaagggaggattactggaggttaaagaggggggattagcgattgcggtagatcag
aaagcaggcggaaaattaattgtctcaacgaatgcgctggaagtgagtggtacaaacagt
aaaggtcaatttagtataaaagatggtgtgtcaaaaaattatgaactggatgatggttcc
gggctcattgttatggaggacacgcaggccattgatactatccttgatgagcatgccact
atgcaatcgctgggaaaggatactgggacgagagtgcaggcaaatgcggtgtatgatctc
ggtcgatcagatcagaatggaagtatcacgtattcctcaaaagccatctctgaaaatatg
gttatcaacaatggccgcgctaacgtctgggctggcacaatggttaacgtttcagtcaga
gggaatgatggcattcttgaggtcatgaagccgcaaataaattatgcacccgcaatgttg
gtgggtaaggtagtggtttctgagggcgcttcttttagaacgcatggtgccgtggatacc
agcaaagcggacgtttcgctcgaaaatagcgtatggaccatcattgccgatatcactacg
acgaaccaaaacaccctcctcaacttagccaaccttgcgatgtctgacgcaaatgtgatt
atgatggatgagccagtgactcgttcatcagtgacggcaagtgcggaaaatttcattacg
ttgaccaccaataccctgtcgggaaacggcaatttttatatgcgtaccgatatggctaat
catcagagcgatcagctcaacgtcaccggtcaggcaacaggtgatttcaaaatattcgtg
acggacaccggtgccagcccggcagcaggagatagccttacactggtaacaacgggcggc
ggtgatgctgcatttacgttgggcaatgctggaggcgttgttgatatcggtacgtatgaa
tataccttgctggataatggcaaccatagctggagtttggcagagaatcgcgcgcaaatt
accccttcaaccactgatgtgctgaatatggcggccgcacaaccgctggtatttgatgca
gaactggacaccgtgcgtgagcgtcttggtagcgtaaaaggcgttagttacgatacggcg
atgtggagttcggcaattaacacccgcaacaacgtgaccactgatgcgggagctggtttt
gagcaaacattgacgggcctgacgctcggtatcgatagccgtttctcccgtgaagaaagc
agtacaattcgcggcttgttctttggttactctcattctgatattggttttgatcgcggc
ggaaaaggtaatatcgatagctataccctgggggcttatgccggttgggagcatcagaac
ggtgcctatgttgatggggtggtgaaagttgaccgttttgccaacaccatccatggcaag
atgagtaatggggcaacagcgtttggcgattacaatagtaacggcgcgggtgctcatgtt
gagagcgggttccgttgggttgacggattgtggagtgttagaccctatctggcctttacc
ggctttaccacagatggtcaggactacacgttatcaaacggcatgcgcgctgatgtggga
aatacccggatattacgcgctgaagcgggaacggcggtaagctatcacatggacctgcaa
aatggtacgacgctggaaccctggctgaaagccgccgtacgtcaggaatacgccgattct
aaccaggtgaaagttaatgacgatggcaaatttaataatgatgtggctggagcccgtggc
gtttatcaggctgggataaggtcatcgtttaccccgacgttaagcggtcatttgtcagtc
agctatggcaatggcgcaggggtagaatcgccgtggaatactcaggcgggtgtggtctgg
acgttctga
DBGET
integrated database retrieval system