Eupeodes corollae: 129939180
Help
Entry
129939180 CDS
T09463
Name
(RefSeq) E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12 isoform X1
KO
K10590
E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12 [EC:
2.3.2.26
]
Organism
ecoe
Eupeodes corollae
Pathway
ecoe04120
Ubiquitin mediated proteolysis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ecoe00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
129939180
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
ecoe04121
]
129939180
Enzymes [BR:
ecoe01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.26 HECT-type E3 ubiquitin transferase
129939180
Ubiquitin system [BR:
ecoe04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
HECT type E3
129939180
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HECT
WWE
Arm
WWE_5
HEAT_Maestro
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129939180
NCBI-ProteinID:
XP_055903061
LinkDB
All DBs
Position
1:123258122..123366059
Genome browser
AA seq
2263 aa
AA seq
DB search
MAKYANSPLLSALTEGQDCASLNIFQSKEDTNQYSIASSPSSINYSLPKASSHCKSLHVN
KHKSDGTGNTHNLRSKCTKTSRKGLKRQINTTGTNTIIKKHRVIVLDKNLKEQSKFPSDC
IAHRTRSKTLFLQNPSIILGRISSEKDTPKVQLQSAISTVRSHSSSSKNKKNILLNYYRE
TRHISHNCPKKGHTCPNPLSTQTINSTLNLKKNTSYSINLNSKNKLNNTFNTKSDPRKIK
KYRQPSKRNKYNATPLAPQNVPLKYTETLHNSRTSQKTKSLIIENNLKQSVHNIRVSSDG
KNYNLMAQELSNTPTGEEHTTSVGSSGSDKNAEGSASMTETAPHDSEGDDSEVGRLQALL
ESRGLPPHLFGALGPRMTHILHKTIGNSSSSKAQQLLQGLQSNDESQQLQSVIEMCQMLV
MGNEDTLAGFPIKQVVPSLVNLLRMDHNFDIMNNACRALSYMLEALPRSSGTVVEAVPIF
LEKLKVIQCMDVAEQSLTALEILSRRHNKVILQAGGVAACLKFLDFFSINAQRAALSTTA
NCCLNLHPEEFNFISDSMPLLAQLISQQDKKCVESVCTAFSRLVESFQHDSSGLEEIASK
ELLKNCQVLLVMSPSILNTGTFTSVIRMLCLICSRCPNLAIVLLKNDIASTILYLLTGSA
QSITSSEVEIIPRSPPELFEITCLIGELMPRLPADEIFAVDALVDRPFINTKDEVQWEWR
DDRGTWHSYSVINSRLIESAHINSDNEINLSTRGRTYTVDFHSMQQINDETGTTRPIQRK
LNHNYVVTSTFSFDGQDLSTNSTAIPKLGFDQSVKSSDMTIEFTKHENQKTAIKTQYEDC
GLVSAFTKKLFNVLYEVYSSSAGPNVRYKCLRAILRMVYYASPDLLKNILKKQLVSSHIA
GMMASNDLRIVVGGLQMSEILMRKLPDIFGIHFRREGVLYQINQLANPNGAFGKINPSIM
QNPSREFVTHSTTSRPQVNLSINSYISAANTSQLKNSLNSPNQHKTKGIILPSSSPTELS
ADFFEVTLAGSTPGSEGYQINNPHYRNSPEDALASSVPVTEKYFVYSTPGSYSCHFNDQL
RLHKEHEPRSHFQSNRNTNTISTPSPLNTYNSFLEDASSSTGLSSSESISLATQSKVSDI
LIRNAPPKRKAQPSCKSKSRQDDFIAQDLLNRTSGGASSSCNSRFTLSGHSESNRSRFCA
NTSSGNSSKQSFLSSLNPVRWGRQVSNNSSLIKDSSTERCTSSNLNTNILNINQVAAANR
EKTRKWIWEQAISFVKRYTEQEISKSIISGSIILCRLSGVITNLEGSYSQCLEALRELKT
ILMENDISPFEVNHSGLIKSMLRFMASENGLVSRNKRLRAFLHEFTGLPLDSSISSNVVA
NLDPSAFSAFVAKLHGCVTQLEQFPVKVHDLSMGIGGHSNISALKFFNTHQLKCNLQRHP
DCKNLREWKGGTVKIDPLALVQAIERYLLSRGYGGIREESDDDSEEELDDNETGGLMSNS
TFKHKLQILIGDNVLPYAMTVYQAIKQYSTLINDQSEADAEHEIYLENDNIWAHQHKLFY
RLLEEHHPINPLCSNSLGKALSTTKSAITPLSKKNGTKNSSKLIKKRNELWYEGVVPEIV
SPLKLCLVKEFPNEIVSVDDASIDALCMLRIIHALNRDWECLYDCVLRHNIISQANFIHT
KLTAKANRQLQDPLVIMTGNLPQWLQQIPMACPFLFPFETRHLLFYAVSFDRDRALQRLL
DTTPDLNSIETSDRVGPRLDRRKRTIAREEILKQAEHIFQDFGHSKALLEIQYENEVGTG
LGPTLEFYALVSSELQRVELGLWNVDSCYSIAASPFVEVVKPRSSHRKIHKQNKGSLQQD
VKLKKKTRLEDTPPSVSSSRFDGKNKTANTNDSIILNVVELGHQQILEQESFHRTEIDSV
QHVFKNNNLTSVVDSSPSYVHSIHGLFPLPMGKSSKLTYVSKVKSKFKFLGKLMAKAVMD
SRMLDLPFSTPFYRWLLNEEHSIGLVDLEHVAPEVQKTLVRLKHIVQNREWIKQDTNLDS
LQKKEKIELLSLDGCVISDLGLDFVLPGHPNIELRRGGRDIPVTIHNLHQYISLVSHWFL
FEGVQKQFDAFREGFDMVFPSHRLKIFYPEELENVFCGSGKAKLWDVKMLQECCRTDHGF
TQDSQAIKFLFEILASYSEDEQRMFLQFVTGSPRLPTGGFKSLTPPLTIVRKTLDPGQNP
NDYLPSVMTCVNYLKLPEYSNSEVMRTKLKVASTEGRMSFHLS
NT seq
6792 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccaagtatgctaacagcccattgctctctgcattgacggaggggcaggattgcgct
tcattaaatatttttcaaagtaaagaagatactaaccaatattcgatagccagctcccca
tcttcaatcaattactctttaccaaaagctagttctcattgcaagtcgctacatgtaaac
aaacataaaagtgacggaacaggtaacacacataatttgcgcagtaaatgtacaaaaact
tcaagaaaaggactcaaacggcagataaacactactggaacaaacaccatcattaaaaag
cacagagtcatcgtattggacaagaatttgaaagaacagtcaaaattcccaagtgattgt
attgctcatagaacaagatcaaaaacacttttccttcagaatccttccataattttagga
cgtatttcatcggaaaaagacaccccaaaagttcagttacaatcagcaattagtactgtc
cggagtcattcatcatcttcaaaaaacaaaaaaaacattctactgaattactatcgtgaa
actcgacacataagtcacaactgtccaaaaaaaggccatacatgtcctaacccattatca
actcaaacaatcaattcgacattaaatttaaaaaaaaatacaagctattccattaacctt
aattctaaaaataaactcaataacaccttcaataccaaatctgatccaagaaaaataaag
aagtatcgacagcctagcaagagaaataaatataacgccacaccactagcacctcaaaac
gtacctcttaaatatactgaaactttacataatagccggacaagtcaaaaaaccaaatct
ttgataatcgaaaataacttaaaacaatctgtacacaatatcagagtttcttcggatggg
aaaaattataatttaatggcccaggaattatcaaacacacctactggagaagagcatacc
acctcagtgggatctagtggatcagataaaaatgctgaaggatcagcaagtatgactgaa
acagcacctcatgactcagaaggcgatgatagtgaagttgggcgtttgcaagcactctta
gagtccagagggctaccacctcatttgttcggagcgttgggacctcgaatgactcatatt
ctgcacaaaacaattgggaacagtagttcttctaaggctcaacagcttttacaaggtctt
cagtccaatgatgaaagccaacaactacaatctgttatagaaatgtgccagatgttggtt
atgggaaatgaggatactttagcaggtttcccaataaaacaagtcgttccttctcttgta
aatttactgcgcatggaccataacttcgatataatgaataatgcatgtcgagcgctctct
tatatgttagaagctttaccccggtcttctggaacagtagttgaagcagttccaatattt
ttggaaaaattaaaggtcattcaatgtatggatgttgctgagcaaagtctaacggcacta
gaaatcctatctcgacgacataataaagtaatacttcaggcaggcggagtagcggcatgt
cttaaatttttggattttttttcaataaatgcacaaagagccgctctttctactacggct
aactgctgccttaacttgcatccagaggaatttaactttatatcagacagtatgccactt
cttgcacaactaatatcacaacaagacaagaaatgcgtcgaaagtgtttgtactgctttt
agtcgtttggttgagagttttcaacatgattcgtctggattagaagaaattgccagtaaa
gaactacttaaaaactgccaggttctgcttgtaatgtccccttctattctcaatacgggc
acgttcactagtgtaataagaatgctgtgtttgatatgtagtagatgtcccaatttagca
atcgttttactaaaaaatgatattgcatcaacaattctttacttgctaacagggtcagca
caatcaataacctcaagtgaagttgaaattattcctcgtagtccgccagaactttttgag
ataacttgcctcataggagaactcatgcctaggttacctgcggatgaaatttttgctgta
gatgctttggtagaccgcccgtttattaacacaaaagacgaagtgcaatgggaatggcgt
gatgatcgtggcacatggcattcatattccgtgattaattcacgccttatagagtccgca
cacataaattcagataatgagattaacttaagtactcgtggtcggacgtatactgttgat
tttcattcgatgcagcaaattaacgatgaaacaggaactactcgtcccattcagcgaaaa
cttaatcacaactacgtcgtgacatcaacattttctttcgatggccaagatttatcaaca
aatagtacagcaattccaaagttaggttttgatcagtccgtaaaaagcagtgatatgact
attgaatttacaaaacatgaaaatcaaaagacagcaattaaaactcaatatgaagattgt
ggtttagtgtcggcttttacaaaaaaactatttaatgtactatatgaagtttacagttca
tcagcaggtcctaatgtacgctataaatgcctgcgggcaatacttagaatggtttattat
gccagcccagatcttcttaagaacatacttaagaaacaattggtttccagccatattgcc
gggatgatggcgtctaacgacttgcgcattgtagttggtggattacagatgtctgaaatt
ttaatgcgaaaattacctgacatttttggaatacattttcgaagagaaggtgtgctttac
caaataaatcaattagcaaacccaaatggtgcttttggcaaaatcaacccttctatcatg
caaaatcccagtagagaatttgtcacgcattccacaacttctaggccgcaagttaatctt
tctatcaatagttacatttctgcagcaaatacatcacagcttaaaaattcattaaacagt
ccgaatcaacacaaaacaaaaggtataatattaccatcctcgtctccaactgaattgagt
gctgatttctttgaagttactctagcaggaagcacacctggatcggagggttaccaaatt
aataatccacactaccgtaactcgccagaggatgctttggcgagttctgttccagttacc
gaaaaatatttcgtctattctactcctgggtcttattcttgtcattttaatgatcaactg
cggctacataaagaacatgaaccacgctcacatttccagtcaaatcgcaataccaataca
atttcaacaccaagtcccttaaacacatataactcatttcttgaagatgcttctagttct
acaggattgtcttcgtcagaaagtataagcttagcaacacaaagcaaggtgtctgatatc
ctcataaggaacgcaccaccaaagagaaaggcacaaccaagttgtaagtctaaatccaga
caagatgattttattgcccaagatcttcttaatcggaccagtggaggagccagtagcagc
tgtaacagtcggtttacattaagcgggcactctgaaagtaatcggtcgcgtttttgcgca
aacacatcaagtggtaacagttctaagcagtcttttttgtcttctcttaatccagttcgt
tggggccgccaagtatctaacaatagttctttaattaaagattcatctactgaacgttgt
acttcaagcaatttgaatacgaatattttaaatataaatcaggtggcagctgctaatcgc
gaaaaaactcgcaagtggatatgggagcaggcaatttcattcgttaaacgctatacggag
caagaaatatcgaagtctattatatcgggttccataatattatgtcgtttatctggtgtt
ataacaaatttagaaggaagttacagtcagtgccttgaagcacttcgagaacttaaaact
atactaatggaaaatgacatttctccatttgaagtaaaccactcgggattaattaaatcc
atgttgcgctttatggcctcagaaaatggtttagttagccgtaataagagacttcgtgca
tttttgcacgaatttacgggacttccgctggatagctctatcagttctaatgttgtggca
aacttagacccctcggcattcagcgcatttgttgcaaaactccacggctgcgtaacacag
ttagaacagtttccagttaaagttcatgatctttccatgggaattggtgggcattcaaac
ataagtgctctaaaatttttcaatacacatcaacttaaatgtaatttgcaacggcatcca
gactgtaaaaatctacgtgagtggaaaggaggcactgttaaaattgacccgttagccttg
gtacaagcaattgagcggtacttgctatcaagaggatatggtggcatacgagaagagtcc
gatgatgattcggaagaagaattggatgacaatgaaacagggggtttaatgtcaaatagc
acattcaaacataaattacaaattttgattggagataatgttttgccctacgctatgacg
gtataccaagctataaaacagtactcaactcttattaacgatcaatcagaagcagacgca
gaacatgaaatatatttagaaaatgacaacatatgggcccatcaacataaacttttctac
cgacttctggaagagcaccatccaattaacccattgtgcagcaatagtttgggtaaagct
ttaagcaccactaaatcagcaataactcccttgtcaaaaaaaaacggtactaaaaattca
tcgaaattaattaaaaaaaggaatgagttatggtatgaaggtgttgttcccgaaattgtt
tccccgttaaaactgtgcttagtaaaggagtttcctaacgaaatagtaagtgtggacgat
gcttcaatcgatgcactttgcatgttgcgaattattcatgccttgaatcgtgattgggaa
tgtctttatgattgtgttctaaggcacaacattataagccaagccaatttcatacataca
aaactaacagctaaagctaatcgccaacttcaagatcctcttgtgataatgactggaaat
ttgccacaatggcttcagcaaatacctatggcatgtccatttctttttccgtttgaaact
agacatctattattttatgcagtttcatttgatcgggatagagccctgcagcgcctttta
gacacgactcctgatttaaattctatagaaacttcagaccgcgttggcccacgattagat
cgacgtaagcgcacaatagctcgtgaagaaattttaaaacaagctgaacacatctttcaa
gattttggccactcaaaagccttgttggagattcaatatgaaaatgaagttggtactgga
ttgggtcctacacttgaattttatgcccttgtgtcatccgaactgcaacgcgttgaattg
ggtctatggaatgttgatagttgctatagtattgctgcttctccatttgtagaagttgtt
aaaccaagatcttcacataggaaaattcataaacaaaataaaggatctcttcagcaagac
gtcaaattgaagaaaaaaacacgactcgaagacactccccctagtgtttcatcaagtagg
tttgatggcaaaaataaaactgcgaatacaaatgattcaataattttgaatgttgtagaa
ttagggcatcaacagatcctagaacaagaaagtttccatagaactgagatagatagtgtt
caacacgtgtttaaaaataataacttaacatctgtagtggactcgtcgccttcctatgta
cactcaattcacggtttatttccattgcctatgggaaaatcatctaaacttacatatgta
tcaaaggtcaaatcaaagttcaaatttttaggtaaattaatggccaaagcagtaatggat
agcagaatgcttgatttgccattttcaacaccattttatcggtggctcttaaatgaagaa
cattcgattggtctcgtagatttagaacatgtcgcacctgaagttcagaaaacgttggta
cgattaaaacatattgtacaaaatcgtgaatggattaaacaagatacaaatttagattcc
ttgcaaaaaaaagaaaagatcgaactgttgagtctagacgggtgcgttatatcggactta
ggactcgattttgtattgcctggtcatcccaacatcgaattgagacgcggaggaagagat
atacctgtaacaattcataatttacatcaatatatctctctagtctcccactggtttctt
tttgaaggcgttcaaaaacaattcgacgcttttcgggaaggatttgatatggtctttcct
agtcatcgtttaaaaatattttatcctgaagaactggaaaatgtattttgcggatcaggc
aaagcaaagctatgggacgttaaaatgttgcaggaatgttgtcgaactgaccatggtttt
actcaagactctcaagcaattaaatttttgtttgagatattagcatcttacagcgaagat
gaacagcgaatgttcttgcaatttgttactggaagtccaaggttgccgactggtggattt
aaatcactaaccccaccgcttacaattgttcgaaaaaccctggatcctggtcaaaatcca
aatgattatcttccttctgtgatgacttgtgttaactatcttaaattacctgaatattcg
aatagcgaggttatgaggactaagctaaaagttgcatctactgagggaaggatgtctttt
catttgtcttaa
DBGET
integrated database retrieval system