Eupeodes corollae: 129943244
Help
Entry
129943244 CDS
T09463
Name
(RefSeq) TATA-binding protein-associated factor 172
KO
K15192
TATA-binding protein-associated factor [EC:5.6.2.-]
Organism
ecoe
Eupeodes corollae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ecoe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
ecoe03021
]
129943244
Transcription machinery [BR:
ecoe03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Other transcription-related factors
Others
129943244
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3535
SNF2-rel_dom
Helicase_C
HEAT
TOR1L1_N
HEAT_EF3_N
HEAT_2
HEAT_EZ
ARM_ECM29
MMS19_C
HEAT_ECM29
mTOR_dom
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129943244
NCBI-ProteinID:
XP_055908525
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(137160218..137214000)
Genome browser
AA seq
1880 aa
AA seq
DB search
MTSRLDRLFILLESGSSAVTRRAAAKQIGEVQKLYPHELHHLLNRLITYLHSNSWDTRIA
AAQAVEAILKNVPDWTPIVIKKEQNQQQKQEQIKCESDEKNNIETANLLSFAEFNLSHIL
QKGARLIGSEGSEFDVHEEGDATKSAERLSRQRALLNEKLGITQATKLGVNLTDMITDED
VKEASNDYNINEEKVPVEHILNINTNSSHSASTSSNGHTLSCREINRAKRKARQNVAINA
TTSSANLSRSNSSSNGSIPPDEPDKKKIKSETVGRAATELFYSINAPVPDATGTWVDAVS
WPLENFCGRLYLDLFNPKWEIRHGAATALRKLINTHSAGAGKSMNVTQDEMEHGHTLWLE
DAALRLLCVLALDRFGDFVSDQVVAPVRETCAQVLGTIVRDMPTEKVHETVSVLLKLIKQ
NDWEVRHGGLLGLKYIFVAREDLLEIFLPLTISDILIGLFDSVDDVGAVAASTLIPVASW
LPKLLNPSQVSTIVKMLWDLLLDQDELTSACNSFMGLLAAILCLPNASTWIQMEPMSTLV
PRLWPFLSHNTNSVRKSTLTTLKTLTQGTKGEEGVAPGQKLETDAKDDISFDSKNLKLNF
GVIDWQPPLLQEALRHIYQRILVEPQWDIQELAKEVWMNLIDYANLTALLHAACPYVSPW
ICLAMQPARLPFDTNILIQAAHTQVSERRRIRDDLGGGSNLQQKLFLGGNEATPIEVREK
NFVRARINAARVLGALSHFLVQPAPGVEYNSVTESPMDCYTKVLHGHLQSRSAVQRTVCG
LIIAFWAQSDSTVRPDCPKLQEKLRYCVMEYVYYDEVALSLTRLLQEAHDFIATLKQYKI
PINDFNNAKILTLEQIDALSTKMTENLKLKHNLKPKLGDMLEERRKGLQNSYQQTNTERN
VLDISTQAALAGAIVCMRCLPEKLNPIVKPLMESIKREERELLQQLSAEFLVYLMDQISN
RNPSPNNKIVTNLCTLLKSDTEFTPPILTPDLPLEMSPQTNGTDSKDHYYGILTLSIQQK
IGGSNNNNTNASRGPGRPPTIVELPAENGNPTIDSNEAKQCRIQRIGSTYTVEFICKYFG
VNLNTKVPVIWQIMFGKIDSFLLANPTMDLLKDKLVDPIATNDLMTALQLIEIAAPCIDV
SLNEELFQLLPKLGVLITHPLKAVRHMVARCIATIGNIDICKTMNFVVDHLMGLLKKIEN
VICRQGAIETIERMVEKLQIKMVPYVVLLVVPLLGCMSDPDESVRLLSTHCFATLIQLMP
LDSKLSKTEIASKELQARKTRDREFLDYLFAPKTIPDFKVPVPITVELRSYQQAGVNWLW
FLNKYNLHGILCDDMGLGKTLQAICILAGDHHQRIAEKCTELPSLVICPPTLTGHWVYEV
EKFLKSSFLRPLHYVGLPGGREKLRPKIGKCNLVVASYDTVRKDIEYFSTVHWNYCILDE
GHIIKNGKTKSSKAIKQLKANHRLILSGTPIQNNVLELWSLFDFLMPGFLGTEKQFIARF
SRPILSSRDSKSSPKEQEAGVLAMESLHRQILPFLLRRVKEDVLTDLPPKITQDLLCELS
PLQERLYEDFSRTHLNSELKDCLANLGESENLNKKTHIFYALRYLQNVCNHPKLVLLPSH
PEYSKITQELSQYNSCLNDIEHSAKLPALKQLLLDCGIGVETESVNQHRALIFCQLKAML
NIVENDLLKKHLPSVSYLRLDGSVPASCRQEIVNNFNSDPSIDVLLLTTQVGGLGLNLTG
ADTVIFVEHDWNPMKDLQAMDRAHRIGQKKVVNVYRLITRKSLEEKIMGLQKFKILTANT
VVSAENASMDTMATEQLFDLFNLSDNKLKGGTGDATNASTSNSSGQMSVASVIENLPELW
SENQYDEEYDITQFVQGLKK
NT seq
5643 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacttcgagactcgatcgattatttatcctgcttgagtcaggttcttccgcagtaacg
cgtagagctgcagcgaaacaaataggcgaagttcaaaaactttatccacacgaattgcat
catcttttaaatagattgataacttatttgcatagtaattcatgggacacgcgtatagct
gcagctcaagcagttgaggcgatattaaaaaatgtacccgattggactccaattgttatt
aaaaaagaacaaaaccaacaacaaaaacaagaacaaataaaatgtgaaagcgatgagaaa
aacaatattgaaaccgcaaatttgttatcttttgccgagttcaatctatcacatattctt
cagaaaggagcacgtttaatcggttccgagggaagtgaatttgacgttcacgaggaaggt
gatgccacaaagtcagcagaacgtttaagcagacaaagagcgttgctaaatgaaaaactt
ggaatcacgcaagcaacaaaactcggtgttaatctcacagatatgattacagatgaagat
gttaaggaagcatcgaatgattataatataaatgaagaaaaggtacccgttgaacatatc
ctaaatattaacacaaactctagccattcagctagtacttcatcaaatgggcacacccta
agttgccgtgaaataaaccgcgctaaaaggaaagctcgacaaaatgttgcgataaatgca
accacctcatccgccaatctcagtcgcagtaactcgtccagtaacggcagcataccccca
gatgagcctgataagaaaaagattaaatcagaaacagtgggtcgagctgctacagagctt
ttctatagcataaatgctccagttcctgacgcaactggtacatgggttgatgctgtgtcc
tggcctctggagaacttctgtggtcgcctctacctggatctattcaatcctaagtgggaa
atacgacatggtgcggcaacagctttaagaaaattgataaacactcactcggcgggcgct
ggaaaatcaatgaatgtgactcaggacgagatggagcacggtcatactttgtggttggaa
gacgctgctctacgacttctgtgtgtacttgcccttgaccgatttggtgattttgtatca
gatcaagttgtggcgcctgtaagagaaacttgtgctcaggtcttaggtaccatagttcgt
gatatgccaacagaaaaggtccatgagacagttagcgttcttctgaagttaatcaaacaa
aatgattgggaagtacgtcacggtggattgcttggcttgaagtatatttttgtagctcgt
gaagatctcctggaaatatttcttcccctgaccatatctgacatcttgataggattattc
gattctgtagatgatgttggtgcagtagctgcttccactttaattccagttgcatcatgg
cttccaaaattattaaatccaagtcaagtatcgacgattgttaaaatgctatgggacctg
ctgcttgatcaggacgaattaacatcagcttgcaatagtttcatggggttattggcagct
attctatgtttgccaaatgcttcgacatggattcaaatggaacccatgtctactctagtc
ccacgattgtggccgtttctcagtcacaacacaaattctgttcgaaaatcaacactaaca
accctcaaaacactaacgcagggaacgaaaggtgaagaaggagtcgccccaggccagaaa
ttagaaacagatgccaaagatgatataagttttgattctaagaatttgaaattgaatttc
ggagttattgattggcagccaccattgttacaagaagcacttcgacatatctatcaaaga
attctagtagaacctcaatgggatattcaagagctagccaaggaagtttggatgaatctt
atagattatgcgaatttgacagcattacttcatgctgcttgtccttatgtctctccttgg
atttgtctggcaatgcaaccagcgcgtttaccattcgacaccaatattctcattcaagct
gcccacacccaagtcagtgaacgacggcgcatacgggatgatttaggtggaggttctaat
cttcaacaaaaattgtttctaggtggtaatgaagccacacctattgaagtgagagagaaa
aattttgttcgtgctcgtataaatgcggcgagggttctaggtgccctatcacactttctc
gtacaaccagcacctggagttgaatataattcggttacagaaagtccaatggactgttat
accaaagttttacatggccatttgcaatctcgatcagctgtacaacgcacagtttgtgga
ttgattatcgccttttgggcacaatccgattcaactgtgaggcctgactgtccaaagctg
caggaaaaacttcgttactgtgtaatggaatacgtttactacgatgaagtagctttgtcc
ttaacaagacttttacaagaggcacatgattttattgccactttaaagcaatataaaatt
ccaataaatgattttaacaatgccaaaattcttacgcttgaacaaatagatgccttaagc
acaaaaatgactgaaaatctgaaattgaaacataatcttaaaccaaaattaggagatatg
cttgaagaaagacgtaaaggattgcaaaattcttatcaacaaacaaatacggaacgtaat
gttcttgatatcagtacgcaggctgcacttgctggtgcaattgtttgtatgcgttgtctg
ccagagaagctgaatccaattgttaaaccattaatggaatcaatcaaacgtgaagaacgt
gaattgttacagcagttgtcagcggaatttttagtttatttaatggatcaaataagtaat
aggaatcctagtccgaataataaaatagtcactaacttgtgtacattactaaaaagtgat
acagaatttactcctccaatattgactccagatcttccacttgaaatgtctcctcaaaca
aatggaacggattcaaaagatcattactacggaatactcacgctatcaatacaacagaaa
attggtgggagtaacaacaataacactaacgcatctagaggtccgggtagacctccaact
atagttgaacttccggctgagaatggaaatcccactatcgatagcaacgaagcaaaacaa
tgtcgtatacaacgtattgggtcaacatacacggttgagtttatttgtaaatatttcgga
gtcaatttgaatacaaaagttccggttatctggcaaatcatgtttggtaaaattgatagt
tttcttctggccaatcctacaatggatttgttaaaggataaattggtagatccaatagcc
acaaatgatctaatgactgcgttgcagttaattgaaatagcagctccttgcattgatgtt
agcttaaatgaagaactttttcaattgcttccaaaattgggagtgttaataacgcatcca
ttaaaagccgtgcgacacatggtagcacgttgtattgcaactattggaaatatcgatatc
tgtaaaactatgaatttcgttgttgatcatttgatgggtcttctaaagaaaattgagaat
gtcatatgtcgacaaggtgccatcgagactattgagagaatggttgagaagttgcaaata
aaaatggttccttatgttgtacttctagtcgttccattacttggttgcatgagcgatcca
gatgagtcagtccgtttattatcaacacattgctttgctacgctaattcaactaatgcct
ctggatagtaaattaagtaaaacagaaatagcttcaaaggaacttcaagcccgaaaaact
cgagatcgggaatttttggattatttatttgcgccaaaaaccattccagattttaaggtt
cctgtaccaataactgtagagttgcgatcttatcagcaagccggtgttaactggctttgg
tttcttaacaaatataatttacatggaattctatgcgatgacatgggcctgggcaaaaca
cttcaggcgatatgtattttggcaggagatcaccatcagcggatagcagaaaaatgcacc
gaattgccgagccttgttatctgtccaccaactttgaccggccattgggtatatgaagtt
gagaaatttctaaaatcatccttcctaagaccattgcactacgtcggcttgcccggagga
cgtgaaaagctaagaccgaaaatcggcaaatgtaatttagtggttgcctcatatgacacc
gtccgaaaagacattgaatattttagtacggtccattggaattattgtattctcgatgaa
gggcacatcattaaaaatggcaaaaccaaaagctcgaaagccatcaagcaattaaaagcc
aatcatcgtttgattctctcagggactccaattcaaaataacgtcctagagctgtggtca
ttgtttgatttcctcatgcctgggttcttaggaacagaaaaacaattcattgctcgtttt
agtcgtccaattttatctagtcgtgattcaaagagttcccccaaagaacaggaggccggg
gtacttgctatggaatctttgcatcgtcagatattgccatttttattgcgaagagtcaaa
gaggatgtgttaaccgatcttccaccaaaaataacccaagacttgttgtgcgaattgagt
cctctgcaggaacgtctctacgaggactttagtcgaacacatttgaattcagaactaaaa
gactgtttggcaaatctcggcgaaagtgaaaatctaaataagaaaacgcatatattctat
gcattgcgttatttgcaaaatgtctgcaaccatccgaaacttgtcctgctccctagtcat
ccagaatattctaagataacgcaagaactaagccagtataatagttgcttgaacgatatt
gagcattcagcaaagctgcctgctttaaaacaacttctattagactgtgggattggagtt
gaaacggaaagtgtaaaccaacatcgtgctctgatattctgtcaacttaaagcgatgttg
aatattgtggagaacgatctgctgaagaaacatttaccttctgtttcgtatttaagattg
gacggaagtgtaccagcatcatgcagacaagaaattgtgaataatttcaatagcgatcct
agtatcgatgttttgttattaacgactcaggttggaggattgggcttgaatttaacagga
gccgatacagttatctttgtcgaacatgattggaatcccatgaaagatttgcaggcaatg
gatcgtgcacatcgtattggtcaaaagaaagttgttaacgtttatcgcttgattacccga
aaatctctcgaagaaaaaattatgggattacaaaaattcaaaattttaacagcaaataca
gtagttagtgctgaaaatgcctccatggatacaatggccacagaacagttatttgatctc
ttcaatttaagtgacaacaagctaaaaggtggcactggcgatgcaactaatgcatctacg
agtaattcaagtggacaaatgtctgtggcaagtgttattgaaaatcttccagaactgtgg
tccgaaaatcaatatgacgaggaatatgatataacccagtttgtgcagggattaaaaaag
taa
DBGET
integrated database retrieval system