Escherichia coli K-12 MDS42: ECMDS42_3056
Help
Entry
ECMDS42_3056 CDS
T02541
Symbol
rfaL
Name
(GenBank) O-antigen ligase
KO
K02847
O-antigen ligase [EC:
2.4.99.26
]
Organism
ecok
Escherichia coli K-12 MDS42
Pathway
ecok00540
Lipopolysaccharide biosynthesis
ecok01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ecok00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00540 Lipopolysaccharide biosynthesis
ECMDS42_3056 (rfaL)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
ecok01005
]
ECMDS42_3056 (rfaL)
Enzymes [BR:
ecok01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.26 O-antigen ligase
ECMDS42_3056 (rfaL)
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
ecok01005
]
Core region
ECMDS42_3056 (rfaL)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Wzy_C
Flp1_like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAL40216
LinkDB
All DBs
Position
3226162..3227421
Genome browser
AA seq
419 aa
AA seq
DB search
MLTSFKLHSLKPYTLKSSMILEIITYILCFFSMIIAFVDNTFSIKIYNITAIVCLLSLIL
RGRQENYNIKNLILPLSIFLIGLLDLIWYSAFKVDNSPFRATYHSYLNTAKIFIFGSFIV
FLTLTSQLKSKKESVLYTLYSLSFLIAGYAMYINSIHENDRISFGVGTATGAAYSTMLIG
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TSSIVLLIAILASIVIIFNKPIQNRYNEALNDLNSYTNANSVTSLGARLAMYEIGLNIFI
KSPFSFRSAESRAESMNLLVAEHNRLRGALEFSNVHLHNEIIEAGSLKGLMGIFSTLFLY
FSLFYIAYKKRALGLLILTLGIVGIGLSDVIIWARSIPIIIISAIVLLLVINNRNNTIN
NT seq
1260 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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ggcattgtggggattggactcagtgatgtgatcatatgggcacgcagcattccaattatc
attatatccgctatagtcctcttactcgtcattaataatcgtaacaatacaattaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
