Escherichia coli O8 IAI1 (commensal): ECIAI1_4520
Help
Entry
ECIAI1_4520 CDS
T00828
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
Organism
ecr
Escherichia coli O8 IAI1 (commensal)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GmrSD_N
AIPR_N
Viral_helicase1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAR01261
LinkDB
All DBs
Position
complement(4594262..4596178)
Genome browser
AA seq
638 aa
AA seq
DB search
MLNFEQVLNDIENLLFGKQLQPINPSTPPLCIISIDRENGKYKVSSNSESKTRSLSELES
IYSNLNIRGFCNVEQVLYGSSSSRNQPETIFANLPYIQHFKYENKKHLLLRSHNVHEAAT
LSEVQGSEFRVLRKKIDNFLNLNLGKIYEQQIELVQSLDDAYQIVLKKFPSEIASKKVEV
TLKRFKDLSADMANSVVTLDYNIEVPTLKISNNTTVEELIESPNTYGVDEGENDTTSSQL
NLELKTLQAKLGVARITSKTPVLSLIFDRVHFGDIELQPDFQRKDRIWNNEKKSKLIESI
LLKLPLPVFYFGNRIAEDKWVVVDGLQRITTIYDFMSGEFKLSKLDILEDLNGKEFGELT
RTEQRAIREYEITAYFIEMNKDSTDLIVELFHRINTYGVKLSDQEIRSALNQGSSVKFLR
YLASKNEFKQATHGKVKPDRQKDMELCLAALAFINIGFKNYNFNSYDKFLSKAMENLNLY
KLNLLNEKEIDLGSAYISNECNEYLQIERKYLRALNLAYDVFGDLAFIKEIGSNTSPISK
QLYEVIIYYFYYVTEEQEELLLKNSDKLVDTLYSAIDSNSKEYATWDSQTYIEAERGFKD
SISTSTGKKITILYRFNSFAKILEQSTGIKIVNANEGN
NT seq
1917 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaactttgaacaagtgctaaacgacatcgaaaatcttctttttggcaaacagcta
cagccaattaatccttctacgcctccactatgtattataagcattgatcgtgaaaacggt
aaatataaagtctcttctaattctgaatctaaaacacgttcattatcagagcttgaatcg
atttacagcaatttaaatattagaggtttttgtaatgtagagcaggttctttacggtagt
tcttcgagcaggaaccaaccagaaacaatatttgctaacttaccctatattcaacatttc
aagtatgaaaacaaaaaacatctgttattgcgtagtcataatgtccatgaggcagcgaca
ttatcagaagttcaaggatctgaatttagggttttaagaaaaaaaattgataattttctc
aatttgaatcttgggaaaatttatgaacagcagattgaattagttcaaagtcttgatgat
gcttatcaaatagttttgaagaaattcccatctgaaattgcttcaaaaaaggttgaggtt
actcttaagagatttaaagatctttccgcagatatggctaactcagttgtgactcttgat
tataatatagaggtgccaacattaaaaattagtaataatactactgtagaagaacttata
gagtcacccaatacttatggagtagatgagggtgaaaatgatacaacatcatcacagttg
aacttggaattaaaaactctacaagctaaacttggtgttgcaagaattacctccaagact
ccggttttatctctcatttttgatcgggttcattttggtgatattgaactacaacctgac
ttccaaagaaaagatcgtatttggaataatgagaagaagtctaaattaatcgagtctatt
ctcttaaaactcccacttcctgtattttattttggcaatcgaatcgcagaagataagtgg
gtcgttgttgatggtttacaacggatcacaacaatttatgatttcatgagtggagaattt
aaactttctaaacttgatatccttgaggatttaaatggtaaagagtttggtgagcttact
cgcactgaacaaagagccataagagaatatgaaatcacggcttactttatagaaatgaat
aaagatagcactgatctcatagttgaattattccaccgtatcaatacatatggtgttaag
ttaagtgatcaagaaattcgttcggccctgaatcaaggttcaagtgttaagtttttacgg
tatctggcatccaaaaacgaattcaaacaagcaacgcatggtaaggttaagcctgataga
caaaaggatatggagctttgccttgctgctcttgcatttataaatattggctttaaaaat
tataattttaattcctatgataagtttttatcaaaagccatggaaaacttaaatctatat
aaactaaacttattaaacgaaaaagaaatagatttaggaagtgcatacatttcgaatgaa
tgcaacgagtatcttcagatagaaagaaaatatttgagggctttaaacctcgcctatgat
gttttcggtgatttagctttcataaaagagattggctctaatacatcacctataagtaag
caactttatgaagtgataatttactatttctattatgttactgaggaacaagaagaatta
ttgctgaaaaattctgataaattggttgataccctttattctgctattgatagcaattca
aaagaatatgccacatgggattcacagacttacattgaagcagagcgagggtttaaggac
tctatctctacctcaacaggaaagaaaataactatattatatagattcaactcttttgcg
aaaattcttgaacaaagcacaggcattaagattgttaatgctaatgagggtaattga
DBGET
integrated database retrieval system
