Entamoeba dispar: EDI_091010
Help
Entry
EDI_091010 CDS
T01083
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K12867
pre-mRNA-splicing factor SYF1
Organism
edi
Entamoeba dispar
Pathway
edi03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
edi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
EDI_091010
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
edi03019
]
EDI_091010
03041 Spliceosome [BR:
edi03041
]
EDI_091010
Messenger RNA biogenesis [BR:
edi03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
EDI_091010
Spliceosome [BR:
edi03041
]
Complex B
Other components
Prp19-related factors
EDI_091010
Complex C
EDI_091010
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HAT_Syf1_CNRKL1_C
HAT_Syf1_CNRKL1_N
HAT_PRP39_N
HAT_Syf1_M
HAT_PRP39_C
Suf
ARM_TT21
Mfa_like_2
NRDE-2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5881351
NCBI-ProteinID:
XP_001736363
UniProt:
B0EDK1
LinkDB
All DBs
AA seq
1628 aa
AA seq
DB search
MEGIAIDLYSGNNSVEIRRKAFDVVSSINGFQWACNILNNYSTERLEVILFSLQIIKHWI
YLFDNNDAQLIVLLNLLNNSLKQVYKLNQRLLCVKIGECFNGIICRRLNENDSILSIYLS
LIKDIKYQPLIVLLFQLLLEDLNSTKVKQNILIKQLFIIKNSLKRNGFEIIQFLIKMISV
SPQNSIVSIKLIAQYIDMKCVLNTMLIPGLRELFIKYKQLQDDIFDCVNDLISNKNITKE
VIPLFLDIIQIFLKSGDDKALIVLLTFINSVGLMLNQEMIYFIIENLLNYYQLNINKIDI
LHHEIEVIYTILKLPCISNVFKIENSSQLIIQLIQLIIYSSYHSINHQMNCIDFSSNGPN
ESQYKRVLNLNINTLEIIFLNDPQIVISQIQQSLNQISSIILLKHSKRLNEMELVDLASL
CYFFIFLQPKYVIHSLPFQELLSLYNPFFEILNYLQQEKDSVILKELIEQLLTVLESFYI
CVSLIYSNQLDQWANNYIQKLILTSQKCSSSNVSIFFIKTTFCFIQTIGIQCLQFPFTLS
IHQQPLHFFSHFQGFTQIEAISQFLNTLLSFTESNNTQSYFIQITFQNVFNNLCIQPLLN
SIKNKDQSLIKHLCLIIITFINEAINLNAIQKEMISVHINTLIGTIELSEILQFSDDTLN
IITRMISCCFMKLTNTLKEEIISIVLQKYMNIFSGHTLEIVTSSNQLKINVICMFIQLLS
KFILVWSSIYGDSPSKTFSDTTFLAFLFCLNDIANILSEYTIGSEVFREGFNILFDVIQV
FYKNIDDFPEFSEIASKLIEKGIQSSDIEMVQIISKRLLTLNKTISLFSLTSFCSSLPSF
LNTFIKVLISSMHSFDVLSELLYSIISSSPSKYSSFYNVVSSFLSTTLTDAIKNRYYQYL
LQYIELKQDESLVQFQQQLKYFQTIFYHHMNEEKNISIYEFDVKQNPQSFKTWWNYVEYF
DESHFQSKIIIFQRALHELPGSYKLWYHYLQTIITNARNSEINTEIRKSVNEGFEESLVY
MNKMPVIWKLYIEWLIENREITQMRRVFDRSLQSLPIGQHNELWKVVMKFVITLDTPLLF
EKLVLRHILLDRGMIGEYIQICKKKGERYYPLALKLLIQNVSLHSFRMKKEEYDFMIHIF
ESLTVQDKGIDIQDIMKKGIQEFPEDAGSLWVGMSLYEIKEGRIETGIAILEEAMDEVIT
LRDLYIVRQCYEQVIHNCINKPGIKEIEKQVIEERKEYVLGNQSIQMNLVLLKKDPYNVK
EWIERGRLYVKNGDVLSGIKTLIEGIKTIHGGKEVNGKKNELWSELIGWYLKGNKRNEAK
ELFKKAKEDNLTQGEEAEIWYKMIKNEIKNNNINEARALCEEATLRQSKVKNERMIWKGY
LEIEEISHNIMGKWSIYEKMIELKIITGRELIEYINERKEKGNGDDIWRIYEKGIDIFEY
PVKGMLYNQYINEWCSLYGEKKKERTRDLFENAIESAPIEWKKKMYDQYIEYEIKNNSFK
RVIDLYKKEVNEILNEEKCEVWIRYAQQVDEVFGFEETKKVYLEGLNSIGRIDEWKLCLS
FAEYLENQEDIGGAREIFSVGSKRCSIKEHEEYWDRWKEFEERYGSENTFKDYLVTKKTV
MKYFGEAE
NT seq
4887 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaggtattgcaattgatttatattctggaaataattcggttgaaattagaagaaaa
gcgtttgacgttgtctcttcaataaatggatttcaatgggcctgtaatatactaaataat
tactctacagaacgattagaagttattttattttcacttcaaattataaaacattggatt
tatttatttgataataatgacgcacaactaattgttttattaaatttattaaataattca
ttaaaacaagtgtataaattaaatcaacgtttactttgtgtgaaaattggagaatgtttt
aatggaataatttgtagaaggttaaatgaaaatgattcaatactttctatttatttatca
ctaataaaagacattaaatatcaaccattaattgttttattatttcaattattattagaa
gaccttaattctacaaaagttaaacaaaatatattaattaaacaactttttattataaaa
aattcattgaaaagaaatggatttgaaattattcaatttttaattaaaatgatttcagtg
tctccacaaaattctattgtatcaattaaattaatagcacaatatattgatatgaaatgt
gttttaaatacaatgttaatacctggattaagagagttatttattaaatataaacaactt
caagatgatatctttgactgtgttaatgatttaatttcaaataaaaacattactaaagaa
gttattccattatttttagacattattcaaattttcttaaaatcaggtgatgataaagct
cttattgttcttttaacatttattaattctgttggattaatgttaaatcaagaaatgatt
tattttattattgaaaatttattaaattattaccaacttaatataaataaaattgatatt
cttcatcatgagatagaagtaatttatacaattttaaaactaccatgtatttctaatgta
tttaaaattgaaaattcttcacaacttattattcaattaattcaattaattatatattca
tcatatcattcaattaatcatcaaatgaactgtattgacttctcctctaatggaccaaat
gaaagtcaatataaaagagttcttaatttaaatattaatacattagaaattatattttta
aatgaccctcaaatagttattagtcaaattcagcaatctttaaatcaaatatcttctatt
attcttttaaaacactcaaaaagactaaatgaaatggaattagttgatttagcatcatta
tgttatttctttatatttctccaaccaaaatatgttattcattcattaccttttcaagag
ttattatcattatataatccattttttgaaatattaaattatttacaacaagaaaaagat
tcagttattttaaaggaattaatagaacaattattaactgtccttgaaagtttttatatt
tgtgtttcattaatatattctaaccaacttgatcaatgggcaaataattatattcaaaaa
ctaatattaacaagccaaaaatgctcatcttctaatgtttcaatattctttattaaaaca
acattttgctttattcaaacaattggtatacaatgtttacaatttccatttactttatca
attcatcaacaaccattacattttttttctcattttcaaggttttactcaaatagaagca
atatcacaattcttaaatactcttctaagttttacagaatcaaataatactcaatcttat
ttcattcaaataacttttcaaaatgttttcaataatttatgtattcaaccattgttaaat
tcaatcaaaaataaagaccaatctcttattaaacacttatgtctcattatcattacattt
attaatgaagcaattaatcttaatgcaattcaaaaagaaatgataagtgtacatattaat
acattaattggaacaattgaactctcagaaattttacaatttagtgatgatacattaaat
attataactagaatgataagttgttgttttatgaaattaacaaataccttaaaagaagaa
attatttcaatagttttacaaaagtatatgaatattttttctggtcatacacttgaaata
gtaacatcttcaaaccaattaaaaattaatgttatatgtatgttcatacaattactttct
aaatttattttagtatggagttctatatatggggattctccttctaaaactttttcagat
actactttcttagcttttttattctgtttaaatgatattgcaaatattctttcagaatat
actattggctcagaagtatttagagaaggatttaatattctttttgatgtaattcaagta
ttttataaaaacattgacgattttccagagttctccgaaattgcttctaaacttattgaa
aaagggatacaatcttccgacattgaaatggttcaaattatttcaaaaagattacttaca
ttaaataaaactatttctttattttctctcacttcattctgttcttctttaccatcattt
ttaaatacatttattaaagtactcatatcgtcaatgcacagttttgatgtattatcagaa
ttactttattctattatttcatcttcaccttctaagtactcttcattttataatgttgta
tcatctttcttatctacaacgctgactgatgcaataaaaaatagatactatcaatattta
cttcagtacattgaactaaaacaagatgagtcattagttcaattccaacaacaactaaag
tattttcaaacaatattttatcatcacatgaatgaagaaaagaatatttcaatctatgaa
tttgatgtaaaacaaaatccacaatcatttaaaacttggtggaattatgttgagtatttt
gatgaaagtcattttcaatctaaaataattattttccaacgggcattacatgaattacca
ggaagttataaattgtggtatcattaccttcaaaccattattacaaatgcaagaaatagt
gaaattaatactgagattagaaagagtgtaaatgagggatttgaagagagtttagtatat
atgaataaaatgccagtcatatggaaattatatattgaatggttaatagaaaatagagaa
ataactcaaatgagaagagtatttgataggtcattacaatctttaccaattggtcaacac
aacgaactttggaaagttgttatgaaatttgtgattacgttagatacgccattattattt
gagaaattagtattgagacatattttattggataggggaatgattggagaatatattcaa
atttgtaaaaagaaaggagaaaggtattaccctcttgcattaaaattgttaattcaaaat
gttagtttacattcatttagaatgaagaaagaagaatatgactttatgattcatattttt
gaaagtcttactgttcaagataaaggaattgatattcaagatataatgaaaaaaggaatt
caggaatttcctgaagacgctggtagtttatgggttggaatgtctttgtatgaaataaaa
gaagggagaatagaaacaggaattgcaatattagaagaagcaatggatgaggtgattaca
ttaagagatctttatattgtgagacaatgttatgaacaggttatacataactgtataaat
aaacctggaataaaagaaatagaaaaacaagtaatagaagaaagaaaagagtatgtactt
ggaaatcaaagcattcaaatgaatttagtattacttaagaaagacccgtataatgtcaaa
gaatggattgaaagaggtagactttatgtaaaaaatggagatgttttaagtggtattaaa
acattaatagaaggaattaaaacaatccatggaggaaaagaagttaacggaaaaaaaaat
gagttatggagtgaacttattggatggtaccttaaagggaataaaagaaatgaagcaaaa
gaattatttaaaaaagcaaaagaagataatttaacacaaggagaagaagctgaaatttgg
tataaaatgataaaaaatgaaattaaaaataataatataaatgaagcacgagcattatgt
gaagaagcaacgttaagacaatcaaaagtaaagaatgaaagaatgatttggaaaggatat
cttgagatagaagaaatatcacataatataatggggaagtggagtatttatgaaaaaatg
atagaattaaaaattattacagggagagaattaatagagtatattaatgaaagaaaagaa
aaaggaaatggagatgatatatggagaatttacgaaaaagggattgatattttcgaatac
ccagtaaaagggatgttgtataatcaatatattaatgaatggtgttcattgtatggagaa
aagaaaaaagaaagaacaagagatctctttgaaaatgctattgaaagtgcacctattgaa
tggaaaaagaagatgtatgaccaatatattgaatatgaaataaagaataattcatttaaa
agagttatcgatttatataaaaaagaagttaatgaaatacttaatgaagaaaagtgtgaa
gtgtggatcagatatgctcaacaagtggatgaagtctttggatttgaagaaacaaaaaaa
gtatatttagaaggtttaaattcaattggaagaatagatgaatggaaattatgtctttca
tttgctgagtatttggaaaaccaagaagacattgggggtgcaagagaaattttttctgtt
ggaagtaaaaggtgtagtattaaagaacatgaagaatattgggatagatggaaagaattt
gaagaaaggtatggtagtgaaaatacatttaaagattatttagttacaaagaaaacagtt
atgaaatattttggagaagcagaatga
DBGET
integrated database retrieval system