KEGG   Entamoeba dispar: EDI_091010
Entry
EDI_091010        CDS       T01083                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K12867  pre-mRNA-splicing factor SYF1
Organism
edi  Entamoeba dispar
Pathway
edi03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:edi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    EDI_091010
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:edi03019]
    EDI_091010
   03041 Spliceosome [BR:edi03041]
    EDI_091010
Messenger RNA biogenesis [BR:edi03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     EDI_091010
Spliceosome [BR:edi03041]
 Complex B
  Other components
   Prp19-related factors
    EDI_091010
 Complex C
    EDI_091010
SSDB
Motif
Pfam: HAT_Syf1_CNRKL1_C HAT_Syf1_CNRKL1_N HAT_PRP39_N HAT_Syf1_M HAT_PRP39_C Suf ARM_TT21 Mfa_like_2 NRDE-2
Other DBs
NCBI-GeneID: 5881351
NCBI-ProteinID: XP_001736363
UniProt: B0EDK1
LinkDB
AA seq 1628 aa
MEGIAIDLYSGNNSVEIRRKAFDVVSSINGFQWACNILNNYSTERLEVILFSLQIIKHWI
YLFDNNDAQLIVLLNLLNNSLKQVYKLNQRLLCVKIGECFNGIICRRLNENDSILSIYLS
LIKDIKYQPLIVLLFQLLLEDLNSTKVKQNILIKQLFIIKNSLKRNGFEIIQFLIKMISV
SPQNSIVSIKLIAQYIDMKCVLNTMLIPGLRELFIKYKQLQDDIFDCVNDLISNKNITKE
VIPLFLDIIQIFLKSGDDKALIVLLTFINSVGLMLNQEMIYFIIENLLNYYQLNINKIDI
LHHEIEVIYTILKLPCISNVFKIENSSQLIIQLIQLIIYSSYHSINHQMNCIDFSSNGPN
ESQYKRVLNLNINTLEIIFLNDPQIVISQIQQSLNQISSIILLKHSKRLNEMELVDLASL
CYFFIFLQPKYVIHSLPFQELLSLYNPFFEILNYLQQEKDSVILKELIEQLLTVLESFYI
CVSLIYSNQLDQWANNYIQKLILTSQKCSSSNVSIFFIKTTFCFIQTIGIQCLQFPFTLS
IHQQPLHFFSHFQGFTQIEAISQFLNTLLSFTESNNTQSYFIQITFQNVFNNLCIQPLLN
SIKNKDQSLIKHLCLIIITFINEAINLNAIQKEMISVHINTLIGTIELSEILQFSDDTLN
IITRMISCCFMKLTNTLKEEIISIVLQKYMNIFSGHTLEIVTSSNQLKINVICMFIQLLS
KFILVWSSIYGDSPSKTFSDTTFLAFLFCLNDIANILSEYTIGSEVFREGFNILFDVIQV
FYKNIDDFPEFSEIASKLIEKGIQSSDIEMVQIISKRLLTLNKTISLFSLTSFCSSLPSF
LNTFIKVLISSMHSFDVLSELLYSIISSSPSKYSSFYNVVSSFLSTTLTDAIKNRYYQYL
LQYIELKQDESLVQFQQQLKYFQTIFYHHMNEEKNISIYEFDVKQNPQSFKTWWNYVEYF
DESHFQSKIIIFQRALHELPGSYKLWYHYLQTIITNARNSEINTEIRKSVNEGFEESLVY
MNKMPVIWKLYIEWLIENREITQMRRVFDRSLQSLPIGQHNELWKVVMKFVITLDTPLLF
EKLVLRHILLDRGMIGEYIQICKKKGERYYPLALKLLIQNVSLHSFRMKKEEYDFMIHIF
ESLTVQDKGIDIQDIMKKGIQEFPEDAGSLWVGMSLYEIKEGRIETGIAILEEAMDEVIT
LRDLYIVRQCYEQVIHNCINKPGIKEIEKQVIEERKEYVLGNQSIQMNLVLLKKDPYNVK
EWIERGRLYVKNGDVLSGIKTLIEGIKTIHGGKEVNGKKNELWSELIGWYLKGNKRNEAK
ELFKKAKEDNLTQGEEAEIWYKMIKNEIKNNNINEARALCEEATLRQSKVKNERMIWKGY
LEIEEISHNIMGKWSIYEKMIELKIITGRELIEYINERKEKGNGDDIWRIYEKGIDIFEY
PVKGMLYNQYINEWCSLYGEKKKERTRDLFENAIESAPIEWKKKMYDQYIEYEIKNNSFK
RVIDLYKKEVNEILNEEKCEVWIRYAQQVDEVFGFEETKKVYLEGLNSIGRIDEWKLCLS
FAEYLENQEDIGGAREIFSVGSKRCSIKEHEEYWDRWKEFEERYGSENTFKDYLVTKKTV
MKYFGEAE
NT seq 4887 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaggtattgcaattgatttatattctggaaataattcggttgaaattagaagaaaa
gcgtttgacgttgtctcttcaataaatggatttcaatgggcctgtaatatactaaataat
tactctacagaacgattagaagttattttattttcacttcaaattataaaacattggatt
tatttatttgataataatgacgcacaactaattgttttattaaatttattaaataattca
ttaaaacaagtgtataaattaaatcaacgtttactttgtgtgaaaattggagaatgtttt
aatggaataatttgtagaaggttaaatgaaaatgattcaatactttctatttatttatca
ctaataaaagacattaaatatcaaccattaattgttttattatttcaattattattagaa
gaccttaattctacaaaagttaaacaaaatatattaattaaacaactttttattataaaa
aattcattgaaaagaaatggatttgaaattattcaatttttaattaaaatgatttcagtg
tctccacaaaattctattgtatcaattaaattaatagcacaatatattgatatgaaatgt
gttttaaatacaatgttaatacctggattaagagagttatttattaaatataaacaactt
caagatgatatctttgactgtgttaatgatttaatttcaaataaaaacattactaaagaa
gttattccattatttttagacattattcaaattttcttaaaatcaggtgatgataaagct
cttattgttcttttaacatttattaattctgttggattaatgttaaatcaagaaatgatt
tattttattattgaaaatttattaaattattaccaacttaatataaataaaattgatatt
cttcatcatgagatagaagtaatttatacaattttaaaactaccatgtatttctaatgta
tttaaaattgaaaattcttcacaacttattattcaattaattcaattaattatatattca
tcatatcattcaattaatcatcaaatgaactgtattgacttctcctctaatggaccaaat
gaaagtcaatataaaagagttcttaatttaaatattaatacattagaaattatattttta
aatgaccctcaaatagttattagtcaaattcagcaatctttaaatcaaatatcttctatt
attcttttaaaacactcaaaaagactaaatgaaatggaattagttgatttagcatcatta
tgttatttctttatatttctccaaccaaaatatgttattcattcattaccttttcaagag
ttattatcattatataatccattttttgaaatattaaattatttacaacaagaaaaagat
tcagttattttaaaggaattaatagaacaattattaactgtccttgaaagtttttatatt
tgtgtttcattaatatattctaaccaacttgatcaatgggcaaataattatattcaaaaa
ctaatattaacaagccaaaaatgctcatcttctaatgtttcaatattctttattaaaaca
acattttgctttattcaaacaattggtatacaatgtttacaatttccatttactttatca
attcatcaacaaccattacattttttttctcattttcaaggttttactcaaatagaagca
atatcacaattcttaaatactcttctaagttttacagaatcaaataatactcaatcttat
ttcattcaaataacttttcaaaatgttttcaataatttatgtattcaaccattgttaaat
tcaatcaaaaataaagaccaatctcttattaaacacttatgtctcattatcattacattt
attaatgaagcaattaatcttaatgcaattcaaaaagaaatgataagtgtacatattaat
acattaattggaacaattgaactctcagaaattttacaatttagtgatgatacattaaat
attataactagaatgataagttgttgttttatgaaattaacaaataccttaaaagaagaa
attatttcaatagttttacaaaagtatatgaatattttttctggtcatacacttgaaata
gtaacatcttcaaaccaattaaaaattaatgttatatgtatgttcatacaattactttct
aaatttattttagtatggagttctatatatggggattctccttctaaaactttttcagat
actactttcttagcttttttattctgtttaaatgatattgcaaatattctttcagaatat
actattggctcagaagtatttagagaaggatttaatattctttttgatgtaattcaagta
ttttataaaaacattgacgattttccagagttctccgaaattgcttctaaacttattgaa
aaagggatacaatcttccgacattgaaatggttcaaattatttcaaaaagattacttaca
ttaaataaaactatttctttattttctctcacttcattctgttcttctttaccatcattt
ttaaatacatttattaaagtactcatatcgtcaatgcacagttttgatgtattatcagaa
ttactttattctattatttcatcttcaccttctaagtactcttcattttataatgttgta
tcatctttcttatctacaacgctgactgatgcaataaaaaatagatactatcaatattta
cttcagtacattgaactaaaacaagatgagtcattagttcaattccaacaacaactaaag
tattttcaaacaatattttatcatcacatgaatgaagaaaagaatatttcaatctatgaa
tttgatgtaaaacaaaatccacaatcatttaaaacttggtggaattatgttgagtatttt
gatgaaagtcattttcaatctaaaataattattttccaacgggcattacatgaattacca
ggaagttataaattgtggtatcattaccttcaaaccattattacaaatgcaagaaatagt
gaaattaatactgagattagaaagagtgtaaatgagggatttgaagagagtttagtatat
atgaataaaatgccagtcatatggaaattatatattgaatggttaatagaaaatagagaa
ataactcaaatgagaagagtatttgataggtcattacaatctttaccaattggtcaacac
aacgaactttggaaagttgttatgaaatttgtgattacgttagatacgccattattattt
gagaaattagtattgagacatattttattggataggggaatgattggagaatatattcaa
atttgtaaaaagaaaggagaaaggtattaccctcttgcattaaaattgttaattcaaaat
gttagtttacattcatttagaatgaagaaagaagaatatgactttatgattcatattttt
gaaagtcttactgttcaagataaaggaattgatattcaagatataatgaaaaaaggaatt
caggaatttcctgaagacgctggtagtttatgggttggaatgtctttgtatgaaataaaa
gaagggagaatagaaacaggaattgcaatattagaagaagcaatggatgaggtgattaca
ttaagagatctttatattgtgagacaatgttatgaacaggttatacataactgtataaat
aaacctggaataaaagaaatagaaaaacaagtaatagaagaaagaaaagagtatgtactt
ggaaatcaaagcattcaaatgaatttagtattacttaagaaagacccgtataatgtcaaa
gaatggattgaaagaggtagactttatgtaaaaaatggagatgttttaagtggtattaaa
acattaatagaaggaattaaaacaatccatggaggaaaagaagttaacggaaaaaaaaat
gagttatggagtgaacttattggatggtaccttaaagggaataaaagaaatgaagcaaaa
gaattatttaaaaaagcaaaagaagataatttaacacaaggagaagaagctgaaatttgg
tataaaatgataaaaaatgaaattaaaaataataatataaatgaagcacgagcattatgt
gaagaagcaacgttaagacaatcaaaagtaaagaatgaaagaatgatttggaaaggatat
cttgagatagaagaaatatcacataatataatggggaagtggagtatttatgaaaaaatg
atagaattaaaaattattacagggagagaattaatagagtatattaatgaaagaaaagaa
aaaggaaatggagatgatatatggagaatttacgaaaaagggattgatattttcgaatac
ccagtaaaagggatgttgtataatcaatatattaatgaatggtgttcattgtatggagaa
aagaaaaaagaaagaacaagagatctctttgaaaatgctattgaaagtgcacctattgaa
tggaaaaagaagatgtatgaccaatatattgaatatgaaataaagaataattcatttaaa
agagttatcgatttatataaaaaagaagttaatgaaatacttaatgaagaaaagtgtgaa
gtgtggatcagatatgctcaacaagtggatgaagtctttggatttgaagaaacaaaaaaa
gtatatttagaaggtttaaattcaattggaagaatagatgaatggaaattatgtctttca
tttgctgagtatttggaaaaccaagaagacattgggggtgcaagagaaattttttctgtt
ggaagtaaaaggtgtagtattaaagaacatgaagaatattgggatagatggaaagaattt
gaagaaaggtatggtagtgaaaatacatttaaagattatttagttacaaagaaaacagtt
atgaaatattttggagaagcagaatga

DBGET integrated database retrieval system