Entamoeba dispar: EDI_116030
Help
Entry
EDI_116030 CDS
T01083
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1
KO
K03018
DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
edi
Entamoeba dispar
Pathway
edi03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
edi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
EDI_116030
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
edi03021
]
EDI_116030
Enzymes [BR:
edi01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
EDI_116030
Transcription machinery [BR:
edi03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
RNA polymerase III
Core subunits
EDI_116030
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
Mab-21
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5882273
NCBI-ProteinID:
XP_001737245
UniProt:
B0EG66
LinkDB
All DBs
AA seq
1379 aa
AA seq
DB search
MSKGKTRQLKGVGKIEIDKENIEFVGPSERPGKVCDIQFTMFSQEEMNRESEFEVTEHFL
FQPNTRKPNPNGVLDRRLGVCDSLSVCETCGKRIEECSGHFAVINLELPVFHIGFFRPII
QVLQCVCKNCNRILLTNEERDFYLRRMRNKKTDTVARTYLVRALITQCRKHYNSCPHCNA
INGSIKKYGNLRLVHDKYHRDATITEMNEFYDGFEESIKLDKDINAFVDNAQEDLDPRKV
LSIFRSLIREDIETMDFDPDNAPPENMILTSVPVPPIAIRPSVAMDGGNASNEDDLTTQL
KEIMECNDRIKEMIKRGASPYQYYDSWDQLTIAVSMFINSDLPGCDDKGKPLRSICQRLK
GKHGRFRGNLLGKRVDFSGRTVISPDPNLDIEQIGVPKLMAIKLTYPERVTKHNIDKLRQ
LVINGSNIYPGCNSIIGGTDGLRRSMCIKLEMREKFAKDLKIGDIVERHLEDNDIVLFNR
QPSLHRISIMCHKAKILPWRTLRFNECVCTPYNADFDGDEMNLHVPQTEEARAECLMLMH
SAKNLQTPRTGQMIIAETQDFLTTSYLLTSKDFVIEEEDMMQWACWFHNAGTEIDLPTPA
YLKPKKLWTGKQLYGLALKPNKHEGVNISLDVPSKLYSKEGKWMCVKDGWICFKNSQLLC
GQIEKSIIGSGNKTGLFHLILRDYGTLESAKIMAHISRFCARFLGDYGFSIGISDVTPSA
DLTQMKEELVSEGYKKCDQFIEDYKSGKQEVQAGSTPEQTLEALLNNELSEIRERAGKRC
IEELKSDNSPLVMALSGSKGSVINISQMIACVGQQTVNGGRVSDGFISRSLPHFALHSRT
PQAKGFVKNSFFTGLNATEFFFHTMGGREGLVDSAVKTAETGYMQRRLMKALEDLHVHYD
GTVRSASLTVIEFKYGDDGLDPLKVESDKYPINLESVLSNLQQNQKPDDEYITPENFDKE
YNAIISQTKIVSELWKQQLETFLKEKKEEMIEIYNRYDQENAQHGLCGITIQTLKEFISI
CQKKGLRSVCEAGTPVGALAGQSMGEPSTQMVLKTFHFAGVASMNIALGVPRIKEIINAS
KKIQTPIVTAKLVNSQDLTSARIVKGRIEATRLKEIAKSIKIVFKPAEAYISVKLDFETI
KQLELECTIEKVQDVLLNYRGLKLKDNQVIIRNKQKLRVYVDKASTSLLFALNSLRNQLL
EVIVCGIENTGRAVINKNKGLFELLVEGSELLKVMGTPGVIGEETTSNHIAVVEKVLGIE
AARSTIISEIKNVMDAYGLSIDVRHLLLLSDLMTFKGVILGITRYGISKMKDSVFTFASF
ERTNDHLFDAAVHSRKDEIKGVSESIIVGNQVGLGTGLMQILYDPPKPIFLKRKYDPLF
NT seq
4140 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaaaggaaaaacacgccaacttaaaggtgttggaaaaattgaaattgataaagaa
aatattgaatttgttggtccatcagaaagacctggtaaagtatgtgatattcaatttact
atgtttagtcaagaagaaatgaatcgagagagtgagtttgaagttactgaacattttttg
tttcaaccaaacacaagaaaaccaaatcctaatggtgttcttgatagaagattaggggtt
tgtgattcactaagtgtttgtgaaacatgtggtaaaaggatagaagaatgtagtggtcat
tttgctgtaattaatttagaattaccagtatttcatattggattctttagaccaattatt
caagtattacaatgtgtttgtaaaaattgtaatagaattcttttaactaatgaagaacgt
gatttttatttaagaagaatgagaaataaaaaaacagatactgttgcacgtacttatctt
gtaagagcattaattactcaatgtagaaaacattataatagttgtcctcattgtaatgct
attaatgggagtattaaaaaatatggtaatttaagacttgttcatgacaaatatcataga
gacgctactattactgaaatgaatgaattttatgatggttttgaagaatcaattaaactt
gataaagatattaatgcatttgttgataatgcacaagaagatcttgacccaagaaaagtt
ctttcaatattcagaagtcttattagagaagatatagaaacaatggactttgatccagat
aatgcaccaccagaaaatatgattttaacttctgtcccagttcctcctattgccattaga
ccatctgttgctatggatggtggaaatgcttcaaatgaagatgatttaacaacacagtta
aaagaaattatggaatgtaatgatagaattaaagaaatgattaaaagaggagcttcacca
tatcaatattatgactcatgggatcagttaacaattgcagtgtcaatgtttattaattca
gatttgcctggttgtgatgataaaggaaaaccattaagatcaatatgtcaaagattaaaa
ggaaaacatggtagatttagaggaaatttattaggtaaaagggttgatttttctggaaga
acagttatctcccctgaccctaatttggatattgaacaaattggagttcctaaattaatg
gcaataaaattaacatatccagaaagagtaactaaacataatattgataagttaagacaa
ttagtcattaatggatctaatatttatccaggatgtaatagtattattggtggtactgat
ggattaagaaggtctatgtgtattaaattagaaatgagagaaaaatttgctaaagattta
aaaattggggatattgttgaaagacatttggaagataatgatattgtattgttcaacagg
caaccttcattacatagaattagtattatgtgtcataaggcaaaaattcttccttggaga
actttacgttttaatgaatgtgtatgtacaccatataatgcagattttgatggagatgaa
atgaatttacatgtaccacaaacagaagaagcaagggctgaatgtttaatgttaatgcat
tcagcaaagaatcttcaaacaccaagaactggtcaaatgattattgcagaaacacaagat
tttcttactacgtcatatcttcttacaagtaaagattttgttattgaagaagaagatatg
atgcaatgggcgtgctggttccataatgcaggaacagaaattgatcttccaacaccagca
tatttgaaaccaaaaaaattatggaccggaaagcaattatatggattagcattaaaacca
aataaacatgaaggagttaacatttcattagatgtaccaagtaaattgtatagtaaagaa
ggtaaatggatgtgcgttaaagatggatggatatgttttaagaatagtcaattgttatgt
ggtcaaatagaaaagtcaattattgggtctggtaataaaactggattattccatttaatt
ttaagagattatggaacattagaaagtgctaaaattatggctcatatctcaagattttgt
gcaagatttcttggagattatggattttctattggaatctcagatgttacaccatctgca
gatttaactcaaatgaaagaagaattagtgagtgaagggtataaaaaatgtgatcaattt
attgaagattataaaagtggtaaacaagaagttcaagctggttcaacaccagaacaaaca
ttagaagctttacttaataatgaactatcagaaattagagaaagagctggtaaaagatgt
attgaagaattaaaatctgataattctccattagttatggcattgtctggaagtaaaggt
tctgttattaatatttctcaaatgattgcatgtgttggacaacaaacagttaatggtgga
agagtttctgatggttttatttcacgttctttacctcattttgcattacattcaagaact
ccacaagcaaaaggatttgtaaagaattcattctttacaggattaaatgctacagaattt
ttcttccatactatgggtggtagagaaggattagtagactctgctgtaaagactgcagaa
actggttatatgcaaagaagattaatgaaagcattagaagatttacatgttcattatgat
ggaacagttagaagtgcatcattaacagttattgaatttaaatatggagatgatgggtta
gatccattaaaagtagaaagtgataagtatccaattaatttagaatctgttttatctaat
ttacaacaaaaccaaaaaccagatgatgaatacattacaccagaaaattttgataaagaa
tataatgcaataattagtcaaacaaaaattgtttcagaattatggaaacaacaattagaa
acatttttaaaagaaaaaaaagaagaaatgatagagatttataatcgttatgaccaagaa
aatgctcaacatggattatgtggaattactattcagacattaaaagaatttatttctatt
tgtcaaaaaaaaggtcttagaagtgtttgtgaagctggaacacctgttggtgcattggct
ggacaatctatgggtgaaccatcaacacaaatggtattaaagacattccactttgcaggt
gtagcgtcaatgaatattgctcttggtgtaccacgtattaaagaaattattaacgcaagt
aaaaaaattcaaacaccaattgttactgctaaattagttaattctcaagacctgacatca
gcaagaattgttaaaggaaggattgaagctactcgattaaaagaaattgctaaatcaatt
aaaattgtatttaaaccagctgaagcatatatatcagtaaagttagattttgaaacaatt
aaacaattagagttagaatgtactattgaaaaagttcaagatgtattattaaattatcgt
ggattaaaattaaaagataaccaagttattataagaaataaacaaaaattaagagtttat
gtagataaagcaagtacttcattattgtttgcattaaattcattaagaaatcaattatta
gaagttattgtttgtggaattgaaaatactggtagagctgttattaataaaaataaaggt
ttatttgaattattagttgaaggaagtgaattgttaaaagtaatgggtactcctggagta
attggagaagaaactacatctaaccatattgctgttgtagaaaaagtacttgggattgaa
gctgctagaagtacgattatttcagaaattaaaaatgttatggatgcatatggtttatct
attgatgtaaggcatttgttattattatctgatttaatgacattcaaaggagttatatta
ggtatcacaagatatggtatttctaaaatgaaagattctgtatttacttttgcatcattt
gaacgtactaacgatcatttgtttgatgctgctgtccattctagaaaagatgaaattaaa
ggggtttctgaaagtattattgttggtaatcaagtaggtcttggaactggattgatgcag
attctctatgatccaccaaaaccaattttcttaaaaaggaaatatgacccacttttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
