Entamoeba dispar: EDI_135380
Help
Entry
EDI_135380 CDS
T01083
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K15192
TATA-binding protein-associated factor [EC:5.6.2.-]
Organism
edi
Entamoeba dispar
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
edi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
edi03021
]
EDI_135380
Transcription machinery [BR:
edi03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Other transcription-related factors
Others
EDI_135380
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
DEAD
Helicase_C
TPR_IPO5
HEAT_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5881667
NCBI-ProteinID:
XP_001736671
UniProt:
B0EEH0
LinkDB
All DBs
AA seq
1391 aa
AA seq
DB search
MSRLDKLLDLIETAPTPAARRAAALQLGEIINSKPEEIGRLLTRLYPYTIHKKFETRTAA
GIAVEAMAKNVPVVRCAPLKEPWTFETFNLDEIMKTHKVLLAMDDSKQKAQPVEIVSSSK
LSTRQKLMMKRKAKKAQEKETEVIETTEKLDFNCDGWPFELFCEKMMQNIFDPKWEIRHG
AAICLREVLRAQSNAVGKEWRIDLTLKLLSVISLDRFGDFISDTVIAPVRDTCAQVIGIA
IRNLGDEVSKFIKIICQMYHKDEWEVKHGALLVLKYTVAIVDKKQIQSIFIIIKPILIEA
LTDVGHDESVAVAAEVMRELVDFMKSDFELIQKIRSLLWDVLEDLDELTASTNNVLQLLE
CVDRIAAEQAPIPITILIDQYIPKLLPFSGHVLPSVRTAVMETYHSVLSQILSQLTAALP
HQPKIPPTGKSLEKLFFQCCAAVVSEANDYLPTIDDLLNEPIDNPIPHNNRLLHHAVANA
GLLITIITHAFPETINNIVKELPKLLRVFELGSEGKIDKKVVSVISKVKRDAPIAEQKER
IDILFNGGTIVARIIEAARKVGNDAENCILQSLNSPQSIMLAALATEFEETHAPLIRTKL
EEIYSNYQYDDFNSFDWKMIVETYKENSAGLNLPSINNSRELIQILPKLRELVPNKISKL
EHSLKTYNEMVQGVICRTKAIVIGAIYPSVRDPTLLHEPILREYSPLLTEHFTMLFHRLY
QNTTDTQSLGFFFATLIDHLKPMYSNIIELINNEQITFYNLTLPYSLHYFLKFLAQNIEY
KHYLLSILTPLLVEPPPDDPTTSLYYPLSISVLPFLPTCPLHVDHIKTLLKNVHSSHAFL
IATTLSRLLRLHKELLTTFITLIYPQLSVTSPTLLAALHIFHHMCLSPTMATLLIPVFPL
LITPFLGVMNSNHESNIRRLGAQCFSVVLRYLPLHVTPPPDLPDKLRDEIEQKKIFISFL
FDGIRSQSISQFSVFNHPINGKLRPYQLDGISWLLFLHKYCINGILCDDMGLGKTLQTLC
LLVTVHKEAEYPSLIVCPPTLTGHWKHEIEQFISQSDLKGVLYTGSVKERSVVLNSLRKK
DILIASYEMVRHDLEQFKTKRFTYCVLDEGHIIKNPKTKLTQAVKQIISLHRLILTGTPI
QNNVLELWSLFDFLMPGFLGTEKEFSERYSKPILAAKDAASPEDQERGVIVMEKLHRQVL
PFILRRLKESVLQDLPPKIIQDYYCDMSPVQRMLYQEFESTNDMDEIVQQKSDKKQKNHI
FQILNYFRRLCVHPMLVLDEQHPMKQKVDAYLKQEGKSIDDITNSPKLMALAELLEMCNI
GKDGEHRVLIFAQMNITLELIEKQLFAKQFPYISYYRLDGSVPQNKRTEIVDKFKMIQQL
MFYYLLQELVD
NT seq
4176 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctcgattggataaattacttgatttaatcgaaactgctccaacacctgctgctcgt
agagctgcagctcttcaattaggtgagattattaattcaaaaccagaagaaattgggaga
ttactgacacgattatacccatataccattcacaaaaaatttgaaacaaggactgcagct
ggaattgctgtagaagcgatggcaaagaatgttcctgtagtgagatgtgctccattaaaa
gagccctggacttttgaaacatttaatttagatgaaattatgaaaacacataaagtatta
ttagcaatggatgatagtaaacaaaaagcacaacctgtagaaatagtttcaagtagtaaa
ttaagtactcgtcaaaagttgatgatgaaaagaaaagcaaaaaaagcacaagaaaaggaa
actgaagttatagaaacaacagaaaaattagattttaattgtgacggatggccatttgaa
ttattttgtgagaaaatgatgcaaaacatatttgaccctaaatgggaaatcagacatggt
gcagctatatgtctaagagaagttttaagagcacaatcaaatgcagtaggaaaagaatgg
agaatagatttaacattaaaattattatcagttatttcattagatagatttggtgatttt
atttcagatacagtgattgcaccagttcgtgatacttgtgctcaagttattggtattgct
attagaaatttaggagatgaagttagtaaatttattaagattatttgtcaaatgtatcat
aaagatgaatgggaagtaaaacatggggctttattagtattaaaatatactgttgctatt
gttgataaaaaacaaattcaatcaatttttattataattaaaccaattctaattgaagca
ttaacagatgttggccatgatgaatcagttgctgtggcagcagaagttatgagagaatta
gtagattttatgaaatctgactttgagcttattcaaaaaatacgttctttgttatgggat
gttttagaagatttggatgaactaactgcatcaacaaataatgttcttcagttattagag
tgtgttgatagaatagctgctgaacaagccccaattccaattacaatattaattgatcaa
tatattcctaaattgctcccattttctggacatgtattaccaagtgtacgaacagcagta
atggaaacttatcatagtgttttatctcaaattctttcacaactaactgctgctttacct
catcagccaaaaattcctccaacaggaaagtcacttgaaaaattatttttccaatgttgt
gctgctgttgtatctgaagctaatgattatttacctacaatagatgatttattgaatgaa
cctattgataatcctattccacataataatcgtcttctccatcatgctgtagctaatgca
ggtttattaattactattattactcacgctttcccagaaacaataaataacattgttaaa
gaattaccaaaattattaagagtgtttgaattaggtagtgaaggtaaaattgataaaaaa
gttgtttctgtgattagtaaagtaaaacgagatgctcctattgcagaacaaaaggaaaga
attgacatactttttaatggaggaacaattgttgctcgtattattgaagctgcaagaaag
gttggaaatgatgctgaaaattgtattcttcaatcactaaattctccacaatcaattatg
cttgctgcattagcaactgaatttgaagaaacacatgcaccattaattagaacaaaatta
gaagaaatatattctaattatcaatatgatgattttaattcatttgattggaagatgatt
gttgaaacatataaagagaatagtgctggattaaatttaccttcaattaataatagtaga
gaacttattcaaattttacctaaattaagagaattagttcctaataaaatttctaaactt
gaacattcattaaaaacatataacgaaatggttcaaggagttatttgtaggacaaaagca
attgtcattggtgctatttatccttctgtaagagatcctactttattacatgaaccaata
ttaagagaatattctccattattaactgaacattttactatgttatttcatcgtttatat
caaaatacaactgatacacaatcattaggatttttcttcgctacattaatcgaccatctt
aaaccaatgtattctaatatcatagaattaattaacaatgaacaaattactttttataat
cttactttaccatattctttacattatttcttaaaattcttagcacaaaatattgaatat
aaacattatttattatcaatattaactccactacttgtagagcctccacctgatgatcca
acaacatccttatattatcctttatcaatttctgttttaccatttcttcctacttgtcca
ttacatgtagaccatattaaaacattattaaaaaatgttcattcaagtcatgcttttctt
atcgcaacaacactttctcgtttattaagattacataaagaattattaactacatttatt
acattaatataccctcaattatcagtcacttctccaacattattagctgcattacatatt
ttccaccacatgtgtttatcacctacaatggctacattattaattcctgtcttcccatta
ttgataactccatttttaggagttatgaattcgaatcatgaaagtaatattaggagatta
ggtgctcaatgctttagcgttgtactaagatatcttccacttcatgtcactccaccacct
gatcttcctgataaattacgtgatgaaattgaacaaaagaagatttttatttcattcctt
tttgatggtattagaagtcaatctatatctcaattttctgtatttaatcatccaattaat
ggaaaattaagaccgtatcaattagatggtatttcatggcttttattcttacataaatat
tgtattaatggaattttatgtgatgatatgggtttaggaaaaacattacaaacactctgc
ttattagttactgttcataaagaagctgaatatccaagtctaattgtttgtccaccaaca
ttaacaggacattggaaacatgaaatagaacaatttataagtcagtcggacctcaaagga
gttttgtatacagggtcagtaaaagaacggtctgttgttttaaattcactaagaaagaaa
gatatattgatagcttcatatgaaatggttagacatgacttagaacagtttaaaacaaag
agatttacttattgtgtattagatgaaggccatattatcaaaaatcctaaaacaaaatta
acacaagcagtaaaacaaattatttcattacatagattaatattaactggtacaccaatt
caaaataatgtattagaattatggtcattatttgatttcttaatgccaggatttttagga
acagaaaaagaatttagtgagagatattctaaaccaattcttgctgcaaaagatgctgct
tctccagaagaccaagaacgaggagttattgtaatggaaaaattacatagacaggtctta
ccatttattttaagaagacttaaagaaagtgtacttcaagatttaccacctaagattatt
caagattattattgtgatatgagcccagtgcaaagaatgttatatcaagagtttgaatca
acaaatgatatggatgaaatagttcaacaaaaatctgacaagaaacaaaagaatcatatt
ttccaaattttaaattactttagaagattatgtgttcatccgatgttagttcttgatgaa
caacatccaatgaaacaaaaagttgatgcttatttaaaacaagaaggaaaatcgatagat
gatattactaactctccaaaattaatggcattagcagaattattggagatgtgtaatatt
ggaaaagatggagaacatagagttcttatttttgctcaaatgaatattacattagaatta
atagaaaaacaattatttgctaaacaatttccttatatctcatattatagattagatgga
agtgttccacaaaataaaagaacagaaattgttgataaatttaaaatgatccaacaattg
atgttttattacttactacaagagttggtggattag
DBGET
integrated database retrieval system