Entamoeba dispar: EDI_138790
Help
Entry
EDI_138790 CDS
T01083
Name
(RefSeq) WD repeat-containing protein
KO
K14554
U3 small nucleolar RNA-associated protein 21
Organism
edi
Entamoeba dispar
Pathway
edi03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
edi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
EDI_138790
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
edi03009
]
EDI_138790
Ribosome biogenesis [BR:
edi03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
EDI_138790
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Beta-prop_EML_2
WD40_CDC20-Fz
WD40_Prp19
Utp21
WD40_WDHD1_1st
ANAPC4_WD40
Beta-prop_WDR90_POC16_2nd
EIF3I
WDR55
WD40
Beta-prop_NUP159_NUP214
WD40_MABP1-WDR62_2nd
Beta-prop_WDR75_1st
Beta-prop_WDR19_1st
Beta-prop_EML
Beta-prop_IFT140_1st
Beta-prop_RIG_2nd
Beta-prop_HPS5
Beta-prop_Vps41
Beta-prop_CAF1B_HIR1
Utp12
Beta-prop_TEP1_2nd
Cytochrom_D1
Beta-prop_VPS8
Beta-prop_NWD2_C
Beta-prop_IFT140_2nd
KNTC1_N
Beta-prop_WDR35_TULP_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5883077
NCBI-ProteinID:
XP_001738013
UniProt:
B0EIH0
LinkDB
All DBs
AA seq
884 aa
AA seq
DB search
MTENFVTQSNLLRCFRTLGLFAGNQHATCCSVGKLLHLMVPVEHSFISYDITHKLDFLYR
SQEFKERVMAVYMRNYQAIVVTKHSVYFEGEVQTFNEVSIEGTISSSLLFGDHLIISTES
RLIIITIDTHKIYKKISLPCESPVIFHPREYLNKITLTYENQLYLMNVNTEKLLFTFKFP
EKIVGIAQSPDVDIHAIALESGEIQIFNLKQNKKICSLINSHQPTAINFISGLPNDDLFL
VVGCINGFINIFSIKTGVIVGSLFHHTARVHTLITFPNELHFYSVGDDNAIRQYVIDPSS
GSLIPALIRERSGHPMKPIYVKITGNNVITGSVDGSIRSSSLFNPMLTKEFSQKVSIKAK
RMGIEQSKLKLNQVNCIDVNERYYLLRDTVVTTHNGKNLAVTWDIVKMRIGDNKMRSSIV
DKRNPNKKFQHSSAPELEVQVNEICHTTYCCFSHCGNFVCIGNSQGLIDKFNVQSGEHKC
IFNCHKMEITGLAVDSNNKYLISSSMDGKVLLWNFETGELIDTIVNILSGITHFSFNKKN
NLCAITTASNELMILDLTTRKIIRQTDMRGIASNIKLNTNGNFVFVSYTNGCLTVYDIIT
MKIVDVIRFSSAVISMDISADGRFFVCYLSKSFELQVYYLRDYFSNILLDTPSKPYYIRF
YKSELSDSTNIKNYCYDDINVKMETEAQEIRETTILLEATDNPIAKWINLPELDRLRKEM
QIEQTRLNPVEIPFFIPINQHSDTIFKPLKADSKLLSNQPSLMESTLLLHLTESNEAILT
YLMSLNSSHIDLEIRNLSNNNYQHLNTFLKFLNEELNTSRNYDFIITITQVTLRTHIREM
MKHLSKYYHELTNLKETIEKMWGPVDELFNEDFSLVAFLSGIKI
NT seq
2655 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgagaattttgttacacaatccaatttacttagatgttttagaacattaggatta
tttgctggaaatcaacatgcaacatgttgtagtgttgggaaattattacatttaatggtt
ccagtagaacattcatttatttcatatgatattacacataaattagattttttatatcgt
tcacaagaatttaaagaacgtgttatggcagtttatatgagaaattatcaagcaatagta
gtaacaaaacactcagtttattttgaaggagaagttcaaacatttaatgaagtaagtatt
gaaggaacaatttcatcgtcattactttttggagatcatttaattatttcaacagaaagt
agactaataattattacaattgatacacataaaatttataagaaaatttcgcttccatgt
gagtcaccagtaatatttcatccaagagaatatttaaataaaattacattaacatatgaa
aatcaattatatctaatgaatgttaatactgaaaaacttttatttacttttaaattccca
gaaaaaattgttggaattgcacaatcaccagatgttgatattcatgcaattgctttagaa
tcaggtgaaattcaaatttttaatttaaaacaaaataaaaaaatatgttcacttattaat
tctcatcaacctacagcaattaattttattagtggattaccaaatgatgatttattctta
gttgttggttgtattaatgggtttattaatatcttctcaattaaaactggtgttattgtt
ggatctttattccaccatactgctcgtgttcatactcttattacttttccaaatgaatta
catttttattcagtaggagatgataatgctattagacaatatgtcattgatccatctagt
ggtagtttaattcctgcattaattagagaacgatctggtcatccaatgaaaccaatttat
gtaaagattacaggtaataatgtaattacaggatcagttgatggaagtattagaagtagt
tctttatttaatccaatgttaacaaaagaattttcacaaaaagtttctataaaagcaaaa
agaatgggaatagaacaatcaaaattaaaattaaatcaagtaaattgtattgacgtaaat
gaaaggtattatcttttaagagatactgttgtcactactcataatggaaagaatttagct
gttacatgggatattgtaaaaatgagaataggagataataaaatgcgtagttctattgtt
gataaaagaaatcctaataaaaagtttcaacattcaagtgcacctgaacttgaagttcaa
gttaatgaaatatgtcatacaacatattgttgtttttcacattgtggaaattttgtttgt
ataggaaattctcaaggattaattgataaatttaatgttcaaagtggagaacataaatgt
atatttaattgtcataaaatggaaataacagggttagcagttgattcaaataacaaatat
ttaataagttcatctatggatggaaaagtattattatggaattttgaaacaggagaattg
attgatactattgtgaatattttaagtggaattactcatttttcatttaataaaaagaat
aatctttgtgctattacaactgcttctaatgaattaatgattcttgatttaaccacaaga
aaaataattcgtcaaacagatatgagaggaattgcatcaaacattaaattaaatacaaat
ggtaattttgtatttgtttcttatacaaatggatgtcttacagtttatgacattattaca
atgaaaatagttgatgttataagatttagttcagcagttatttctatggatataagtgca
gatggtagattctttgtatgttatctttctaagtcatttgaattacaagtttattattta
agagattacttttctaatatacttcttgatacaccaagtaaaccttattatattagattt
tataaaagtgaattgtctgattctactaatatcaagaattattgttatgatgatattaat
gttaaaatggaaactgaagctcaagaaatacgtgaaacaactatattattagaagcaaca
gataatcctattgctaaatggattaatttaccagaattagatcgtcttagaaaagaaatg
caaattgaacaaacaagattaaacccagttgagataccattttttattccaattaatcaa
cactctgacactatctttaaacctctaaaagcagattcaaaattgttatcaaatcaacct
tcattaatggaatcaacattacttttacatttaacagaatcaaatgaagcaatattaaca
tatttaatgagtttaaattcatctcatattgatttagaaataagaaatttatcaaataat
aattatcaacatcttaatacttttcttaaatttttaaatgaagaattaaatacttctcgt
aattatgattttattattacaattactcaagttactttaagaactcatattagagaaatg
atgaaacatctttctaaatattatcatgaattaactaatttaaaagaaacaattgaaaag
atgtggggaccagtagacgaattatttaatgaagacttttcattggtagcattcttgtca
ggtatcaaaatatga
DBGET
integrated database retrieval system