KEGG   Entamoeba dispar: EDI_138790
Entry
EDI_138790        CDS       T01083                                 
Name
(RefSeq) WD repeat-containing protein
  KO
K14554  U3 small nucleolar RNA-associated protein 21
Organism
edi  Entamoeba dispar
Pathway
edi03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:edi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    EDI_138790
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:edi03009]
    EDI_138790
Ribosome biogenesis [BR:edi03009]
 Eukaryotic type
  90S particles
   U3 small nucleolar RNA-associated proteins
    EDI_138790
SSDB
Motif
Pfam: Beta-prop_EML_2 WD40_CDC20-Fz WD40_Prp19 Utp21 WD40_WDHD1_1st ANAPC4_WD40 Beta-prop_WDR90_POC16_2nd EIF3I WDR55 WD40 Beta-prop_NUP159_NUP214 WD40_MABP1-WDR62_2nd Beta-prop_WDR75_1st Beta-prop_WDR19_1st Beta-prop_EML Beta-prop_IFT140_1st Beta-prop_RIG_2nd Beta-prop_HPS5 Beta-prop_Vps41 Beta-prop_CAF1B_HIR1 Utp12 Beta-prop_TEP1_2nd Cytochrom_D1 Beta-prop_VPS8 Beta-prop_NWD2_C Beta-prop_IFT140_2nd KNTC1_N Beta-prop_WDR35_TULP_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 5883077
NCBI-ProteinID: XP_001738013
UniProt: B0EIH0
LinkDB
AA seq 884 aa
MTENFVTQSNLLRCFRTLGLFAGNQHATCCSVGKLLHLMVPVEHSFISYDITHKLDFLYR
SQEFKERVMAVYMRNYQAIVVTKHSVYFEGEVQTFNEVSIEGTISSSLLFGDHLIISTES
RLIIITIDTHKIYKKISLPCESPVIFHPREYLNKITLTYENQLYLMNVNTEKLLFTFKFP
EKIVGIAQSPDVDIHAIALESGEIQIFNLKQNKKICSLINSHQPTAINFISGLPNDDLFL
VVGCINGFINIFSIKTGVIVGSLFHHTARVHTLITFPNELHFYSVGDDNAIRQYVIDPSS
GSLIPALIRERSGHPMKPIYVKITGNNVITGSVDGSIRSSSLFNPMLTKEFSQKVSIKAK
RMGIEQSKLKLNQVNCIDVNERYYLLRDTVVTTHNGKNLAVTWDIVKMRIGDNKMRSSIV
DKRNPNKKFQHSSAPELEVQVNEICHTTYCCFSHCGNFVCIGNSQGLIDKFNVQSGEHKC
IFNCHKMEITGLAVDSNNKYLISSSMDGKVLLWNFETGELIDTIVNILSGITHFSFNKKN
NLCAITTASNELMILDLTTRKIIRQTDMRGIASNIKLNTNGNFVFVSYTNGCLTVYDIIT
MKIVDVIRFSSAVISMDISADGRFFVCYLSKSFELQVYYLRDYFSNILLDTPSKPYYIRF
YKSELSDSTNIKNYCYDDINVKMETEAQEIRETTILLEATDNPIAKWINLPELDRLRKEM
QIEQTRLNPVEIPFFIPINQHSDTIFKPLKADSKLLSNQPSLMESTLLLHLTESNEAILT
YLMSLNSSHIDLEIRNLSNNNYQHLNTFLKFLNEELNTSRNYDFIITITQVTLRTHIREM
MKHLSKYYHELTNLKETIEKMWGPVDELFNEDFSLVAFLSGIKI
NT seq 2655 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgactgagaattttgttacacaatccaatttacttagatgttttagaacattaggatta
tttgctggaaatcaacatgcaacatgttgtagtgttgggaaattattacatttaatggtt
ccagtagaacattcatttatttcatatgatattacacataaattagattttttatatcgt
tcacaagaatttaaagaacgtgttatggcagtttatatgagaaattatcaagcaatagta
gtaacaaaacactcagtttattttgaaggagaagttcaaacatttaatgaagtaagtatt
gaaggaacaatttcatcgtcattactttttggagatcatttaattatttcaacagaaagt
agactaataattattacaattgatacacataaaatttataagaaaatttcgcttccatgt
gagtcaccagtaatatttcatccaagagaatatttaaataaaattacattaacatatgaa
aatcaattatatctaatgaatgttaatactgaaaaacttttatttacttttaaattccca
gaaaaaattgttggaattgcacaatcaccagatgttgatattcatgcaattgctttagaa
tcaggtgaaattcaaatttttaatttaaaacaaaataaaaaaatatgttcacttattaat
tctcatcaacctacagcaattaattttattagtggattaccaaatgatgatttattctta
gttgttggttgtattaatgggtttattaatatcttctcaattaaaactggtgttattgtt
ggatctttattccaccatactgctcgtgttcatactcttattacttttccaaatgaatta
catttttattcagtaggagatgataatgctattagacaatatgtcattgatccatctagt
ggtagtttaattcctgcattaattagagaacgatctggtcatccaatgaaaccaatttat
gtaaagattacaggtaataatgtaattacaggatcagttgatggaagtattagaagtagt
tctttatttaatccaatgttaacaaaagaattttcacaaaaagtttctataaaagcaaaa
agaatgggaatagaacaatcaaaattaaaattaaatcaagtaaattgtattgacgtaaat
gaaaggtattatcttttaagagatactgttgtcactactcataatggaaagaatttagct
gttacatgggatattgtaaaaatgagaataggagataataaaatgcgtagttctattgtt
gataaaagaaatcctaataaaaagtttcaacattcaagtgcacctgaacttgaagttcaa
gttaatgaaatatgtcatacaacatattgttgtttttcacattgtggaaattttgtttgt
ataggaaattctcaaggattaattgataaatttaatgttcaaagtggagaacataaatgt
atatttaattgtcataaaatggaaataacagggttagcagttgattcaaataacaaatat
ttaataagttcatctatggatggaaaagtattattatggaattttgaaacaggagaattg
attgatactattgtgaatattttaagtggaattactcatttttcatttaataaaaagaat
aatctttgtgctattacaactgcttctaatgaattaatgattcttgatttaaccacaaga
aaaataattcgtcaaacagatatgagaggaattgcatcaaacattaaattaaatacaaat
ggtaattttgtatttgtttcttatacaaatggatgtcttacagtttatgacattattaca
atgaaaatagttgatgttataagatttagttcagcagttatttctatggatataagtgca
gatggtagattctttgtatgttatctttctaagtcatttgaattacaagtttattattta
agagattacttttctaatatacttcttgatacaccaagtaaaccttattatattagattt
tataaaagtgaattgtctgattctactaatatcaagaattattgttatgatgatattaat
gttaaaatggaaactgaagctcaagaaatacgtgaaacaactatattattagaagcaaca
gataatcctattgctaaatggattaatttaccagaattagatcgtcttagaaaagaaatg
caaattgaacaaacaagattaaacccagttgagataccattttttattccaattaatcaa
cactctgacactatctttaaacctctaaaagcagattcaaaattgttatcaaatcaacct
tcattaatggaatcaacattacttttacatttaacagaatcaaatgaagcaatattaaca
tatttaatgagtttaaattcatctcatattgatttagaaataagaaatttatcaaataat
aattatcaacatcttaatacttttcttaaatttttaaatgaagaattaaatacttctcgt
aattatgattttattattacaattactcaagttactttaagaactcatattagagaaatg
atgaaacatctttctaaatattatcatgaattaactaatttaaaagaaacaattgaaaag
atgtggggaccagtagacgaattatttaatgaagacttttcattggtagcattcttgtca
ggtatcaaaatatga

DBGET integrated database retrieval system