Entamoeba dispar: EDI_237980
Help
Entry
EDI_237980 CDS
T01083
Name
(RefSeq) clathrin heavy chain
KO
K04646
clathrin heavy chain
Organism
edi
Entamoeba dispar
Pathway
edi04142
Lysosome
edi04144
Endocytosis
edi05100
Bacterial invasion of epithelial cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
edi00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04144 Endocytosis
EDI_237980
04142 Lysosome
EDI_237980
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
EDI_237980
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
edi04131
]
EDI_237980
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
edi04147
]
EDI_237980
Membrane trafficking [BR:
edi04131
]
Endocytosis
Clathrin-mediated endocytosis
Clathrin
EDI_237980
Exosome [BR:
edi04147
]
Exosomal proteins
Proteins found in most exosomes
EDI_237980
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Clathrin
Clathrin_H_link
Clathrin_propel
TPR_IF140-IFT172
B-prop_COPA_B_2nd
TPR_COPA_B
Clathrin-link
DUF5036
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5879515
NCBI-ProteinID:
XP_001734599
UniProt:
B0E8A8
LinkDB
All DBs
AA seq
1702 aa
AA seq
DB search
MAIRPPIQIKEVVRLDRFVKPESIGFTSVSIEGDKHFTVLEKGEEKRVRIFHNNKINSPD
SRSCGADFAIMHPTKQIMAVAAGTTVQMFDVQSKSKVADITLQTPLVFWKWANEHILAIV
TSTTVFHFDLNNPNIAPKKIVDRHSELAASQIIGYKIDPTEKWVAILALLQKNNEIIGKI
QLYSIEKNASQIIDGYAASFYNYKFDGASQASVMFAFAQKFPTPRLGLIEVIKGEVSKPN
VNTVIDIPIQPQQQADFMVGLVVSIKYETILLISRMGYIYGFYSGDGTLFFQGRVIDDII
FLTAYNQSTDGVTVVGKKGVVTNIYIEGDKLVPFICNGLKNVGLGCKVAARCNLPGADDI
FVERFNALLNAGQIREAALIAANSPGELIRNSNTINKLSQMQAQPGQNPPLFLYFATILE
TSSLNALEGFTLIQLLIPQNKLPAVEAWIVNDKIECSEKAGDLVKPYDQRLALMIYSKAH
ATGKVVQSLAEMGQSDKIVAYCERAGFSPDYLQILQQILPASGEAAKAYTTSLIQQKGYD
ELDMISIIDLFARYRYLKEITALILDTLDGDNEQYANIQTKILEMNLIGAPQIADTIFEN
DMLKHFDHNRIGKLCEQAGLFKRALQIFEEFDDIRRVLAHASAIPPELIIESFRKLEPEQ
AILVLQDLLRTNPRGNLQIIIKILLEFHTGLGDDKVIDLLQKFDCWEGLFYFLSQIVNTT
NDKMVVFKYIEACARSGQFQELARVVQENDVYDPNEVKEFLKNARIADQIPFIIVCDKHG
YVEEMTQYLYQNGNHRFIEAYVKKINPMNTPKVVGALLDCGCGEDYIQQLINAVGGICPA
DELIKTCESRNRLIILLPWLEQRLSEGSPDVSLHTALAKVYVDQGKDAEKFLNNDMYYDS
LIVGKYCEDRDPYLSYICYKRKNLDDELIDVTNRHNLFKYQAKYLVEREDLELWNKVLTE
ENEHRKSVVEQVIHTALPECIDPNQILKTVQAFLQNDLPNDLIDLLDKLVSQNPEYSTNP
TLQKLLIQTSIKAAPNRVMDYIRKLNDYDPKEIGESCIADNLFEEAYEVYTKFDLQEEAM
DVLLQYIKDLTRAKDFADKAKKDILYKKLGEAQLNEMKVKDAIISLMKAKDISLRSRVID
IAESDGSYEDLINYLLMCKEETKDMIVETELLYCYAKLKKNEEIENFLKTANCANLTSIA
ERCYNEELYGAAKILYTSLNNYIKLASCLLKLKDYAGAVEAAKKANSTRTWKEVTFACID
AKEFTLAQETGINILIAGDEITELVYYYEKNELYDQVIELLEAGLKIENVHVSMFTELAI
LYSKYKEEKLYDYLKQYITKIQCQKVIPTVNMNQQWKELVFLYVQVDQVKAIETMISYPD
NCFDHQLMKELLISVPRIDMIYKAESYYLAEKPEKINEMLIAVAHRCDHTQVISIARKEK
DLNTIREYLLYCLDLNNDSVNEALIDLFIDDGDAKSLKSLIEKNTNFNKIGLANRLKVHE
DIEFRKIAAYLYSSSDDYKSAIELCKKEGFDDDAMEIAKKSKDEEKVTDLLNFFVEQDKK
EAFGNCLNVCYDYVPTEVALELGYKNKLMDQTMPFMCKKMKDTNDRIKKLEQAEKDRQNA
KKEPQLAQQDTPFGMLALPAAPGMMPIQQPMGGMGMMNQPMQGMTPSIQPQTAMGGMGMM
NQPMQGMTPMGTTSTSNGEFIF
NT seq
5109 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctattagaccaccaattcaaataaaagaagtagttagattagacagatttgtcaaa
ccagaaagtattggatttaccagtgtttctattgaaggagataaacattttacagtatta
gaaaaaggagaagagaaaagagttagaatattccataataataaaattaatagtccagat
tcaagatcatgtggtgcagattttgctattatgcatccaacaaaacaaattatggcagtt
gctgcaggaactacagttcaaatgtttgatgttcaatctaaatctaaagtagcagatata
acacttcaaacaccattagtattttggaaatgggctaatgaacatattttagctattgta
acatcaacaacagtatttcattttgatttaaataatccaaatattgcaccaaagaaaatt
gttgatagacattcagaacttgcagcatcacaaattattggatataaaattgatccaaca
gaaaaatgggttgctattcttgcattattacaaaaaaataatgaaattattggaaaaatt
caattatattctattgaaaagaatgcatcacaaattatagatggatatgcagctagtttt
tataattataaatttgatggagcatcacaagcatcagttatgtttgcatttgcacaaaaa
ttcccaacaccaagacttggattaattgaagttattaaaggagaagtatctaaaccaaat
gtaaatacagtaattgatatacctattcaaccacaacaacaagcagattttatggtagga
ttagttgtttcaataaaatatgaaacaatattattaatatcaagaatgggatatatttat
ggattttattcaggagatggtacattatttttccaaggaagagtaattgatgatattatt
ttcttaactgcatataatcaaagtacagatggagtaacagttgtaggaaaaaaaggagtt
gtaactaatatttatattgaaggagataaattagttccatttatttgtaatggattaaaa
aatgttggacttggatgtaaagttgcagctagatgtaatcttccaggagctgatgatatt
tttgtagaaagatttaatgcacttttaaatgcaggacaaattagagaagcagctcttatt
gcagctaattcaccaggtgaattaattagaaattcaaatacaattaataaattaagtcaa
atgcaagcacaaccaggacaaaatccaccattattcctttattttgctactattttagaa
actagttcacttaatgcacttgaaggatttactcttattcaattacttattccacaaaat
aaacttccagcagttgaagcatggattgtaaatgataaaatagaatgtagtgaaaaagca
ggagatttagttaaaccatatgatcaaagacttgcattaatgatttattctaaagcacat
gctacaggaaaagtagttcaatcattagcagaaatgggacaaagtgataaaatagttgca
tattgtgaaagagcaggattttcaccagattatcttcaaattcttcaacaaattcttcca
gcatcaggagaagctgctaaagcatatactacaagtttaattcaacaaaaaggatatgat
gaattagatatgatttcaataatagatctttttgctagatatagatatcttaaagaaatt
actgcattaatacttgatactcttgatggagataatgaacaatatgctaatattcaaaca
aaaattcttgaaatgaatttaattggagcaccacaaattgctgatactatttttgagaat
gatatgttaaaacattttgatcataatagaattggtaaattatgtgaacaagctggatta
tttaaaagagcacttcaaatttttgaagaatttgatgatattagaagagttcttgcacac
gcatctgctattccaccagaattaattattgaaagttttagaaaattagaaccagaacaa
gcaattcttgttcttcaagatcttttaagaacaaatccaagaggaaatcttcaaattatt
attaaaatattacttgaattccatactggacttggagatgataaagtgattgatttactt
caaaaatttgattgttgggaaggattattttatttcttatctcaaattgttaatactact
aatgataaaatggttgtatttaaatatattgaagcatgtgctagatctggacaattccaa
gaattagcacgtgttgttcaagaaaatgatgtttatgatccaaatgaagttaaagaattc
ttaaaaaatgcaagaattgcagatcaaattccatttattattgtttgtgataaacatgga
tatgttgaagaaatgacacaatatctttatcaaaatggaaatcatagatttattgaagca
tatgttaaaaaaattaatccaatgaatactccaaaagttgttggtgcattattagattgt
ggatgtggagaagattatattcaacaattaattaatgcagttggaggtatttgtccagct
gatgaattaattaaaacatgtgaaagtagaaatagattaattatattattaccatggtta
gaacaaagattatctgaaggatctcctgatgtttctcttcatacagctcttgctaaagtt
tatgttgatcaaggaaaagatgcagagaaatttttaaataatgatatgtattatgattca
ttaattgtaggtaaatattgtgaagatagagatccatatttatcatatatttgttataag
agaaagaatttagatgatgaattaattgatgtaactaatagacataatttatttaaatat
caagcaaaatatcttgttgaaagagaagatcttgaattatggaataaagtattaacagaa
gaaaatgaacatagaaagagtgttgttgaacaagttattcatactgcacttccagaatgt
attgatccaaatcaaattcttaaaactgttcaagcattccttcaaaatgatcttccaaat
gatttgattgatttattagataaattagtttcacaaaatccagaatatagtactaatcca
acattacaaaaattattaattcaaactagtattaaagcagcaccaaatagagttatggat
tatattagaaaacttaatgattatgatccaaaagaaattggtgaaagttgtattgctgat
aatttatttgaagaagcatatgaagtttacactaaatttgatttacaagaagaagctatg
gatgtattattacaatatattaaagatcttactcgtgctaaagattttgctgataaagct
aaaaaagatattttatataaaaaacttggagaagcacaacttaatgaaatgaaagttaaa
gatgctattatttcattaatgaaagctaaagatattagtttaagatctagagtaattgat
attgcagaatcagatggatcatatgaagatttaattaattatttacttatgtgtaaagaa
gaaactaaagatatgatagttgaaacagaattattatattgttatgctaaattgaaaaag
aatgaagaaatagaaaatttccttaaaacagctaattgtgcaaatcttacatctattgca
gaaagatgttataatgaagaattatatggagctgctaaaattctttatacatcattaaat
aattatattaaattagcatcttgtttacttaaattaaaagattatgctggagctgtagaa
gctgctaaaaaagctaatagtactagaacatggaaagaagttacatttgcatgtattgat
gcaaaagaatttacattagcacaagaaacaggaattaatattttaattgctggagatgaa
attactgaattagtttattattatgaaaagaatgaattatatgatcaagttattgaatta
cttgaagcaggattaaaaattgaaaatgttcatgtttctatgtttactgaattagctatt
ctttattctaaatataaagaagaaaaattatatgattatcttaaacaatatattactaaa
attcaatgtcaaaaagttattccaacagttaatatgaatcaacaatggaaagaacttgta
ttcctttatgttcaagttgatcaagttaaagctattgaaactatgatttcatatccagat
aattgttttgatcatcaattaatgaaagaattattaattagtgttccaagaattgatatg
atttataaagctgaatcatattatcttgcagaaaaaccagaaaaaattaatgaaatgtta
attgctgtagctcatagatgtgatcatactcaagttatttctattgctcgtaaagaaaaa
gatcttaatactattcgagaatatcttctttattgtcttgacttaaataatgattcagtt
aatgaagcacttattgatcttttcattgatgatggtgatgctaagagcttaaagagtctt
attgaaaagaatacaaacttcaataaaattggattagctaatagattaaaagttcatgaa
gatattgaatttagaaaaattgctgcatatctttatagtagttctgatgattataagagt
gcaattgaattatgtaagaaagaaggatttgatgatgatgctatggaaattgctaaaaaa
tctaaagatgaagaaaaagttactgatttattaaatttctttgtagaacaagataagaaa
gaagcctttggaaattgtttgaatgtttgttatgattatgttccaacagaagtagcactt
gaacttggatataagaataaattaatggaccaaacaatgccatttatgtgtaagaaaatg
aaagatactaatgatagaattaaaaaacttgaacaagctgaaaaagatagacaaaatgct
aaaaaagaaccacaacttgctcaacaagatactccattcggtatgttagctcttcctgct
gcaccaggtatgatgccaatccaacaaccaatgggtggaatgggtatgatgaatcaacca
atgcaaggtatgactccttctattcaaccccaaactgctatgggtggaatgggtatgatg
aatcaaccaatgcaaggaatgactccaatgggaactacatcaacttcaaatggtgaattc
attttctaa
DBGET
integrated database retrieval system