Entamoeba dispar: EDI_317110
Help
Entry
EDI_317110 CDS
T01083
Name
(RefSeq) ubiquitination factor E4
KO
K10597
ubiquitin conjugation factor E4 B [EC:
2.3.2.27
]
Organism
edi
Entamoeba dispar
Pathway
edi04120
Ubiquitin mediated proteolysis
edi04141
Protein processing in endoplasmic reticulum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
edi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04141 Protein processing in endoplasmic reticulum
EDI_317110
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
EDI_317110
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
edi04121
]
EDI_317110
Enzymes [BR:
edi01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.27 RING-type E3 ubiquitin transferase
EDI_317110
Ubiquitin system [BR:
edi04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
U-box type E3
EDI_317110
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ufd2P_core
U-box
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5880492
NCBI-ProteinID:
XP_001735537
UniProt:
B0EB37
LinkDB
All DBs
AA seq
959 aa
AA seq
DB search
MDVNEIRRKRLEAFKNKIHKIEGSNQINDKQQESICQTTQLKVKQNKDSEEIKKQKAYLY
LVQKVFQCKMTDSCDYGDIDCKKFYSDHLVVDEPFIDNIIIHCLTNPTNLMSLSYLAECL
NRLSDCSYFDKTLLEMIQKKVIDYMVIVLQFPDSFPSKESVYVMIWKLISGSQGRMIMKS
IQNHPDMMEITEIFYQVFLKQLGKIKLTSPEFFEFFSFIDNLLMNEAVALNIVYHDNFLP
KEMTINQLSKTLLGRLLQIFFLEKLDGYGDPMKRDYLTILQRLLPLGATGQKMIGEVLCS
LMKYEDSREETFKWIDCFYTINKERMKIGYNKDSVFPDSLLLLFYYSLCYVFEKEVKNST
VNFNYFLNTNILELENTTLFQATPSEIKQYIFINDSYTNSLDFTHSTYPIQSDTKFPQIK
VEAPSVSTLLFFNILKLSPVCLTQILGTNKNIARALLRAQEEQNFYAGTYLKRVLLSNNA
QQFNVQACCSMDNFCEYLVKFIFHCLPQTVSPLLDQSNKIPLPLALLPEYIIGILSDFIH
SESFIRNNNLKSLMNLPENLSVIICSFVSSQHICHSPYTRAELGVAITEAILNEKDIFKR
PHKLLMNEFSKQYLVFSLLCFYVDCEKTGSHSQYYDKLNWRKMLQECFKVLWEFEDYQKK
MIEIFESNNERIFPAFVQYIISDTNLILEDSLLKLSDIKIAEDKLKDKEKWNLLDKQTQN
DIIYSMKENGSIVKNLFAITECTFDFLKLVLQKSQRPFLDKLVINDVAACFNYFLSCIVG
ERSSEFKVSNFEKYNFHPKEMLNSFFDIFLYLGQSDKFIQAIYEDARSFKEKTFEAALVN
VQYIHSKSQKEMDEFQKLIDKIKNYSSHDIFAQVEEMVGMDLPEEYCDALLGTLMKDPVK
LPNSHVVVDRTTIEKHLMNAKEDPFDRTPLELSMVIPMNDLKQQIMEYVMDKAKELKQK
NT seq
2880 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgtaaatgaaatacgccgtaaacgtcttgaagcattcaaaaataaaatacacaaa
atagaaggttctaatcaaataaatgataagcaacaagagagcatttgccaaacaacacaa
ttaaaggtaaaacaaaataaggatagtgaggaaattaaaaaacagaaggcttacttgtac
ttagttcaaaaagtttttcaatgtaaaatgactgatagctgtgactatggagatattgat
tgtaaaaaattttatagtgatcatttagtggttgatgaaccttttattgataacatcata
atacattgcctaacaaacccaacaaatcttatgtcattaagttatttagctgaatgtctt
aataggttatctgattgttcatattttgataaaacgttattagaaatgattcaaaaaaaa
gttattgattatatggttattgtgttacaattccctgactcatttcccagtaaagaatca
gtatatgtgatgatttggaaattaatttcaggaagtcaaggaagaatgataatgaaaagt
attcaaaatcatccagatatgatggaaataacagaaatattctatcaagtatttttaaaa
caacttggtaaaataaaactaacatctcctgaattttttgaattcttttcatttattgat
aacttattaatgaatgaagctgttgcattaaatattgtttaccatgataattttttacca
aaagaaatgacaataaatcagttatcaaaaacattattaggtagattgcttcaaattttc
tttcttgagaaattagatgggtatggtgatcctatgaaacgtgattatttaactatatta
caaagactattacctttaggagcaacaggacaaaaaatgattggtgaagtactttgttca
ttaatgaaatatgaggatagtagagaagaaacttttaaatggatagattgtttctataca
attaataaagaaagaatgaaaattggatataataaggatagtgtatttcctgattcattg
ttattactcttttattactctttatgttatgtatttgaaaaagaagttaaaaactcaaca
gttaactttaattatttcttaaatacaaatattcttgaacttgaaaatactacattattt
caagctactccaagtgaaattaaacaatatatttttattaatgactcatatactaattca
ttggactttactcattcaacctatcctattcaaagtgatactaaatttcctcaaattaaa
gtagaagcaccatctgtttcaacactactattttttaatattttaaaattatctccagta
tgtttaactcaaatcttagggactaataaaaatattgctagagctttattaagagctcaa
gaagagcaaaatttctatgcaggtacttatcttaaaagagtcttactttctaataatgct
caacaatttaatgttcaagcttgttgcagtatggataatttttgtgaatatcttgttaaa
tttatctttcattgtttacctcaaacagtatctccattgttagatcaatccaataaaatt
cctctaccattagcacttcttcctgaatacattattggtattctatctgattttattcac
agtgaatcttttattagaaataataatcttaaatctttgatgaatttacctgagaatctt
agtgttattatttgttcatttgtttcatcacaacatatttgtcatagtccttacacaaga
gcagaacttggagttgctattactgaagctattctaaatgaaaaagatatttttaaaaga
ccacataaattattaatgaatgaatttagtaaacaatacttggtattctcattactttgt
ttttatgtggattgtgagaagacaggaagtcattctcaatactatgataaattaaattgg
agaaaaatgcttcaagagtgttttaaggtattatgggaatttgaagattatcaaaagaaa
atgattgaaatattcgaatcaaacaatgagagaatattccctgcatttgtacaatacatt
attagtgatactaatttaatattagaagattcactattaaaattaagcgatattaaaatt
gcagaagataaactaaaagataaagaaaaatggaatctattagataaacaaactcaaaat
gacattatttattctatgaaagaaaatggttcaatagtaaagaatttatttgctataaca
gaatgtacattcgattttctaaagttggttcttcaaaaaagtcaacgaccctttttagat
aaattagttattaatgatgtagctgcatgttttaattatttcttgtcgtgtattgtagga
gaacggtcaagtgaatttaaggtgagtaactttgaaaagtataatttccatcctaaagaa
atgttaaacagtttttttgatatcttcttatatcttggtcaaagtgataagtttattcaa
gccatatatgaagatgctcgttccttcaaagaaaaaacttttgaagctgctttggttaat
gttcagtatatccactctaagtcacaaaaagaaatggatgaattccaaaaattgattgat
aaaattaaaaattattcttctcatgatatttttgctcaagttgaagagatggttggtatg
gatcttcctgaagaatattgcgatgccttacttggaacattaatgaaagaccctgttaaa
ctgcctaatagtcatgtcgttgttgaccgtaccactattgaaaaacatttgatgaatgcc
aaagaagacccatttgatagaaccccattagaattatcaatggtgattccgatgaatgac
ctgaaacaacaaatcatggaatatgttatggataaagcaaaagaacttaaacagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system