Enterobacteriaceae endosymbiont of Macroplea mutica: GJT87_02080
Help
Entry
GJT87_02080 CDS
T07660
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K03583
exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
eem
Enterobacteriaceae endosymbiont of Macroplea mutica
Pathway
eem03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eem00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
GJT87_02080
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
eem03400
]
GJT87_02080
Enzymes [BR:
eem01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
GJT87_02080
DNA repair and recombination proteins [BR:
eem03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
GJT87_02080
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Exonuc_V_gamma
RecC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJC31412
UniProt:
A0A6H2FB64
LinkDB
All DBs
Position
complement(428720..431791)
Genome browser
AA seq
1023 aa
AA seq
DB search
MFTIYKSNKMKILLQILKLQILNCNKTNILQSKKILINNKNNINEFKLYLTNNIKIHANI
NYSTIDIFIMDIIKKTLTFLTKGNNVFLNKYSIIWSIMHLIPKLIHLPEFLFLKKYFHKM
KYLYSNLDIAIHIADIFDQYQKYKPELLILWEQQNYFDNNQNEIWQSKLWYSITQYYINT
LQTKLWHYGNLYYFLKTQNILKLDLPYTKIFIFEIYNIPYIYIKLLQLFEKQLEIHLFCY
NPCQYYWLALNDNSLLNKLGEYGLYMNNICLDISARDIDAFVSIKDHNLLTAIQKDILYV
TDSTVCKKKIQNIDTSIQIFSCENIQNEITLLYQNIMSILNSYNNYLLHDIVVISPKLEV
YAPLIQDLFCEKNIPINIRTKSNFLNINIINIFLYLLQLMHQNITPNKIYLLLDNKYILN
KLDIKDTDIEYLHFWIQNMDIRYDINLCNMKNFDLLKNQYTWTLALQRLYVGYALGNTQQ
IWNNILPYPGIDNTTGIILGKFTKLLFLLYKWKNYLQKSYFLVKWTBILKKIYLDFFPKK
TFYNIQIYKFFHKIKKCIQYGTYTQYKNKVDIFTIINLINYICDIQDYQSFKIDKINFCN
LNNFFIKPTKIYILIGMNEEYFPRKSHGIPFNLLNNYLKQNNNKNIDQYTFLKLLTLTKQ
KLYISYVSRPHEHQNVSNTIQTLITYMYNNFVLHNNIIHYIPYQKFQITKNIVQTNKFNL
KFKILDINNINICNLISFWQHPLKGFFNQRLGIYLQNINDIKYFQIQSFNINYLQKYIIN
NDIFNTYINHGNIMTLYKYYLNHSLLPFGNYNKTWWLETVHKISVIYNKYYGSKQYNIIT
KKVHLNFDNIILYGKMKYLYSHNTLLEFQPKYLDIKSIIAFWIKYLILCVHDNSVIHSAK
IIGFKDTQYNFGYIPTNIALNLLNKYIQGYVIGMNNPIILPMKSSWAWINICYNANINSI
NYSSKIQKQAEKKFFYYWENYFFGEKTDLYFQKINFDIQSKTFLDIQNIIITWLLDILYF
KIK
NT seq
3072 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttactatatataaatcaaataaaatgaaaattttattacaaatattaaaattacaa
attttaaattgtaataaaactaatattttacaatctaaaaaaatattaattaataataaa
aacaatattaatgaattcaagttatatttaacaaataatataaaaatacatgcgaatatt
aattattctacaatagatatatttatcatggatattataaaaaaaactcttactttccta
acaaagggcaataacgtttttttaaataaatattctattatttggtctataatgcatttg
atacctaaattaattcatttgccagagtttttatttttaaaaaaatattttcataaaatg
aaatatttatattctaatttagatattgctatacatattgctgatatatttgatcaatat
caaaaatataaaccagaattattaattctctgggaacaacaaaattattttgataataat
caaaatgaaatttggcaatctaaattgtggtatagtattacacaatattatataaacaca
ttacaaacaaaattatggcattatggtaatttatattattttttaaaaacacaaaatatc
ttaaaattagatttaccatatactaaaatatttattttcgagatatataatattccttat
atttatataaaattattacaattatttgaaaaacaacttgaaatacatttattttgttat
aatccatgccaatattactggctggccttaaatgataatagtttactaaataaactgggt
gaatatggattatatatgaataatatatgtttagatatctcagcaagagatattgatgct
tttgtatctataaaggatcataatttattaactgcaatacaaaaagatattttatatgtt
accgatagtacagtatgtaaaaaaaaaatacaaaatatagatacttctatacaaattttt
tcttgtgaaaatattcaaaatgaaataacgttattatatcagaatattatgagtatttta
aattcatataataattatttacttcatgatattgtggttatatctcctaagttagaagta
tatgcaccattaatacaagatttattttgtgaaaaaaatatacctattaatattagaact
aaatctaattttttaaatataaatatcattaacatatttttatatttattacaattaatg
catcaaaatattactcctaacaaaatatatttattattagataataaatatattttaaat
aaattagacattaaagatacagatatagaatatttacatttttggatccaaaatatggat
attagatatgatataaacttatgtaatatgaaaaattttgatttattaaaaaatcaatat
acttggactttagcattacaacgtttatatgttggatatgctttaggtaatacacaacaa
atctggaataatattcttccatatcctggtattgataatactactggtattatattagga
aaatttacaaaattattatttcttttatataaatggaaaaattatttgcaaaaatcatat
tttttggtaaaatggactratattttaaaaaaaatatatttagattttttccctaaaaaa
actttttataatatacaaatatataagttttttcataaaataaaaaaatgcatacaatat
ggtacatatactcaatataaaaataaagttgacatttttacgattataaatcttattaat
tatatttgtgatatacaagactatcaatcttttaaaattgataaaattaatttttgtaat
ttaaataatttctttatcaagccaactaaaatatatattttaataggtatgaatgaagaa
tatttcccccgtaaatcacatggtattccatttaatttattaaataattatttaaaacaa
aataataataaaaatatagatcaatatacatttttaaaattattaacacttactaaacaa
aaattatatattagttacgtgtcacgaccccacgaacatcaaaatgtttctaatacaata
caaacattaattacatatatgtataataattttgttcttcataataatattatacattat
ataccatatcaaaaatttcagattacaaaaaatattgtacagacaaataagtttaactta
aaatttaaaatacttgacattaataatattaatatttgtaatttaattagtttttggcaa
catcctctaaaaggtttttttaatcaaagattaggaatatatttacaaaatattaatgat
ataaaatattttcaaattcaatcttttaatattaattatttacaaaaatatatcattaat
aatgatatatttaacacatatattaatcatggtaatattatgacattatataaatattat
ttaaatcatagtttattaccttttggcaattacaataaaacatggtggttagaaactgta
cacaaaatatctgttatatataacaaatattatggttcaaaacaatataatattataact
aaaaaagttcatttaaattttgataatataatattgtatggtaaaatgaagtatctatat
agtcataatacattattagaatttcaaccaaaatatttagatattaagtctattatagct
ttttggattaagtatttaatattatgtgtgcatgataatagtgttatacacagtgctaaa
attataggttttaaagatacacaatataattttggatatatacctactaatattgcgtta
aatttattaaataaatatattcaaggatatgttataggaatgaataacccaataattctr
cctatgaaaagttcttgggcttggataaatatttgttataatgccaacattaatagtatt
aattatagtagcaaaatacaaaaacaagcggaaaaaaaatttttttattattgggaaaat
tatttttttggtgaaaaaactgatttatatttccaaaaaataaattttgatatacaatca
aaaacatttttagatatacaaaacattataataacatggttattagatatattgtatttt
aaaataaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
