Enterobacteriaceae endosymbiont of Plateumaris pusilla: GJT83_00140
Help
Entry
GJT83_00140 CDS
T07640
Name
(GenBank) exoribonuclease II
KO
K01147
exoribonuclease II [EC:
3.1.13.1
]
Organism
eep
Enterobacteriaceae endosymbiont of Plateumaris pusilla
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eep00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
eep03016
]
GJT83_00140
Enzymes [BR:
eep01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.13 Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.13.1 exoribonuclease II
GJT83_00140
Transfer RNA biogenesis [BR:
eep03016
]
Prokaryotic type
3'processing and CCA adding factors
3'processing factors
GJT83_00140
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNB
CSD2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJC29337
UniProt:
A0A6H2F573
LinkDB
All DBs
Position
complement(26002..27948)
Genome browser
AA seq
648 aa
AA seq
DB search
MLYNNKLLLSLKEKFSNKSFLVKGIVKIFDNKSGILETESNHIYEISNIHIKYVIHEDYI
IASIKNINNKLIAIPIKLLKSSVNIFIGHIQINNNKLFIIPEKKYLNNMTILCFPKENIK
HIIKNKDKVIVNIINHPLKTQKNIFIAEIIEYITNNNKYLIPWWSILFKYNLSINPPSDN
LCKNIQILDENLYRKDLTNLYFITIDNNDTKEIDDALYIEEISSKELIINIAIADPTSYI
LENSELDKIALKRMFTNYLPGFTVPLLPKFLSENLCSLNPNQKRSALICKIKINEYGFLS
KNINFFLAWIKSKAKLNYYNVSNWLENIGSWKPIDNNVRKQILLLYKFYQYRIKWTNKNV
LLFNNIDYKFIFNKKGKILNIIIEEKRIAHKIIEEAMITANICAAKILKDNLGFGIYNIN
NGFNYKKINQVIFLLKEYNIQCDKNYLMNLKGFKEINDKLQNLNLKSLIHRLKKYQLMTI
FHLKPAPHFYLGVKYYATWTSPIRKFGDMINHRLLKSIIKKEKINKPSDKIFFLMNKKKC
LNKQASRDLSSWLYYKYLKKSIYTKEIFISEIIDILYTGIRVRLIKNGAYAFIPKKFLYP
IINEININSKMGLIYIKNKLFFKLNDIIKVIIKEININTYNIIVKLAK
NT seq
1947 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatataataataaattattattatcattaaaagaaaaattttctaataaatctttt
ctagtaaaaggaattgtaaaaatttttgataataaatcaggtattttagaaacagaatct
aatcatatatatgaaatatctaatatacatataaaatatgtaatacatgaagattatatt
attgctagtattaaaaatattaataataaattaatagctattcctattaaattattaaaa
tcatcagtaaatatttttataggacatatacaaattaataataataaattatttattatt
ccagaaaaaaaatatttaaataatatgactatattatgttttcctaaagaaaatattaaa
catattattaaaaataaagataaagtaattgtaaatataattaatcatcctctaaaaaca
caaaaaaatatttttattgcagaaataatagaatatattacaaataataataagtatttg
attccatggtggtctatactttttaagtataatctttcaattaatccacctagtgataat
ttatgtaaaaacatacaaatcttagatgaaaatttatatagaaaagatcttacaaattta
tattttattacaatagataataatgatactaaagaaatagatgatgctctatatatagaa
gagatatcttcaaaagaattaattattaatatagctatagctgatcctacatcatatatt
ttagaaaatagtgaattagataaaattgcattaaaacgtatgtttactaattatttacct
ggatttactgttcctttattacctaaatttttatcagaaaatttatgttctttgaatcct
aatcaaaaaagatctgcattaatatgtaaaataaaaataaatgaatatggttttttatca
aaaaatataaatttttttttagcttggataaagtcaaaagctaaattaaattattataat
gtatctaactggctagaaaatataggaagttggaaaccaatagataataatgttagaaaa
caaatattattattatataaattttatcaatatcgtattaaatggacaaataaaaatgtt
ttattatttaataatatagattataaatttatatttaataaaaaaggaaaaatattaaat
attataatagaagaaaaacgtattgcacataaaattattgaagaagcaatgataactgct
aatatatgtgcagctaaaattttaaaagataatttaggttttggtatttataatataaat
aatggttttaattataaaaaaattaatcaagtaatatttttattaaaagaatataatatt
caatgtgataaaaattatctgatgaatttaaaaggatttaaagaaattaatgataaatta
caaaatttaaatttgaaatcattaatacatcgtttaaaaaaatatcaattaatgacaatt
tttcatttaaaaccagctccacatttttatttaggagtcaaatattatgctacttggaca
tcacctattcgtaaatttggagatatgatcaatcatagattattaaagtctataattaaa
aaagaaaaaattaataaaccatcagataaaattttttttctaatgaataaaaaaaaatgt
ttaaataaacaagcttcaagagatttatcttcttggttatattataaatatttaaaaaaa
agtatttatacaaaagaaatttttatatctgaaataattgatatattatatactggaatt
cgtgttcgtttaataaaaaatggagcatatgcttttataccaaaaaaatttttatatcca
attattaatgaaattaatattaattctaaaatgggtttaatttatattaaaaataaatta
ttttttaaattaaatgatataattaaagttattattaaagaaataaatattaatacatat
aatattattgttaaattagcaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
