Endosymbiont of Euscepes postfasciatus: NAREPO1_01810
Help
Entry
NAREPO1_01810 CDS
T07679
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
eeu
Endosymbiont of Euscepes postfasciatus
Pathway
eeu03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eeu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
NAREPO1_01810 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
eeu03021
]
NAREPO1_01810 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
eeu03400
]
NAREPO1_01810 (rpoC)
Enzymes [BR:
eeu01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
NAREPO1_01810 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
eeu03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
NAREPO1_01810 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
eeu03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
NAREPO1_01810 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
RPOC_hybrid
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA84698
UniProt:
A0A2Z5T2S6
LinkDB
All DBs
Position
complement(157315..161340)
Genome browser
AA seq
1341 aa
AA seq
DB search
MNNLYKKFNSIKLSIASPDIIRSWSYGEVKKPETINYRTFKPERDGLFCSKIFGPIKDYE
CLCGKYKKVKFKGIKCEKCGVEIIESKVRRIRMGHIELSSPVAHIWFLRSLPSKIGLLLD
MSIKDIEKVLYFESYIITKSNNNKFPIGKIISEKEFLDINNFDFEVKMGAEAIQILLKNI
NLQQELIKLNKILSYTQSDFKNKRILKRIDLIKSFINSNNKPDWMILNVLPILPPDLRPL
VPLDGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLRKLINLSAPDIIIKNEKRMLQESVDSLLDNSRQ
DKTISSKRHLKSLSDMIKGKHGRFRQNLLGKRVDYSGRSVITVGPYLKLNQCGIPKEMAL
ELFKPFIYNKLIENGISNNLKSSKKIVDSKDSIVWDVLLEIIKDYPILLNRAPTLHRLGI
QSFYPILIEGKSIQLHPLVCTAYNADFDGDQMAIHIPISIESKIESKILMMSTNNILSPS
NGDPVIIPSQDIIIGIYYLTVNIDENIKYNSIFSNLNEVKKYYDMNIISIHTNIKVRILE
IINNEEIYNIVSTTVGRILLWDFFPKKLRFNLINKCLRKKDILNLINISYKLLGIKDTIK
LIDNLMYIGFIYASKSGISVSLDDLVIPDKKFNIINKADIEVENIQNQYKSGLLSNEERY
NKIINIWLNVSEEITTEMINNLSKYKNSSNYKELLNSIFIMYDSGARGSSTQIRQLSGIR
GLMTKPDGSIIENPIKSNFKEGLDVFQYFISTHGARKGLADTALKTANSGYLTRRLVDVA
QDLVITKYNCNTKEGIYIYDILENEKIKEEIYNKIFGRFIINDICINNKIIIRDNTIIDS
NICNIIEFNLINKLKIRSVIMCDNEFGICSVCYGIDLSNGNIVSQGESVGVIAAQSIGEP
GTQLTMRTFHIGGAAFSNSIIDSNIYSKYSGILDFNNLKYVKNKFDQFVVISKNSEIKIF
NNNELQGKYKIPYGSIIYKMNNDFVKSGDLLIKYDPYYIPIISNIDGRVKFKDIIVDKTV
INKLDEITGIDFIMIIDYHDRLIENRNFLPTIEIINSNNESYQFIIPDKSIIQVHDNEYI
NCGDIIAKIPQNKGSIKEDITGGLPRISDLFEVRNPKNQAILAEENGIIFINNLPKGKRK
IIIKSIDNNKILYETIIPKWKNLQVLNESLVEKGDIISDGQASLNDILRLRGLNKLINFM
IDEIQSIYKLQGVKINDKHIEIIIKQMLKKVLIIDPGESFLNKNDSIEFIKVKKINYDLN
KKNKKNIKYQHILLGITKSSLITDSFISSASFQETTRVLTESSILGKIDFLKGLKENVIV
GRLIPAGTGYIDYQKKMNFEK
NT seq
4026 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatttatataaaaaatttaattcaataaaattgtctatagcttcacctgatatt
ataagatcatggtcgtatggagaggtaaaaaagcctgaaactataaattatagaacattt
aaacctgaaagagatggattattttgttctaaaatttttggtcctataaaagattatgag
tgtttatgtggaaaatataaaaaggttaaatttaaaggaataaaatgtgaaaaatgtggt
gttgaaattatagaatctaaagttagaagaattagaatgggtcatatagaattatcttct
cctgttgctcatatatggtttttaagatcattaccttcaaaaataggtttattattagat
atgtctattaaagacatagaaaaagttttatattttgaatcttatattataactaaaagt
aataataataaatttccaataggaaaaataatatctgaaaaagaatttttagatattaat
aattttgattttgaagttaaaatgggagctgaagcaattcagattttattaaaaaatata
aatttacaacaagaacttataaaattaaataaaatattaagttatactcaatcagatttt
aaaaataaaagaatattaaaaagaattgatttaataaaatcttttataaattctaataat
aaacctgattggatgatattaaatgtattacctatattacctccagatttaagaccttta
gttccattagacggtggaagatttgctacatcagatttaaatgatctttatagaagagta
ataaatagaaataatagattaagaaaattaataaatttatctgctcctgatattataata
aaaaatgaaaaaagaatgttacaagaatctgttgattctttattagataatagtcgtcaa
gataaaactataagttctaaaagacatttaaaatcattatctgatatgataaaaggtaaa
catggtagatttagacaaaatttattaggaaaaagagttgactattctggaagatctgtt
ataactgttggaccatatttaaaattgaatcaatgtggaattccaaaagaaatggcttta
gaattatttaaaccatttatttataataaacttattgaaaatggtatatcaaacaattta
aagtcttctaaaaaaattgttgattctaaagattctattgtttgggatgtattattagaa
ataattaaagattatccaattcttcttaatagagctcctactttacatagattaggtata
caatctttttatcctatattaatagaaggaaaatctattcaattgcatccattagtatgt
acagcatataatgcagatttcgatggagatcaaatggctattcatatacctatatcaata
gaatctaagatagaatctaaaatattaatgatgtctactaataatattttatctccttca
aatggagatcctgttataataccttctcaagatataataataggaatatattatctaact
gttaatatagatgaaaatataaaatataattcaatattttctaatttaaatgaagttaaa
aaatattatgatatgaatattataagtattcatacaaatataaaagttagaatattagaa
attataaataatgaagaaatatataatatagtatctactactgtaggaagaatattatta
tgggatttttttccaaaaaaattaagatttaatttaataaataaatgtttaagaaaaaaa
gatatattaaatcttattaatataagttataaattacttggtataaaagatactataaaa
ttaatagataatttaatgtatattggttttatatatgcatctaaatctggaatttctgtt
agtcttgatgatttagtaataccagataaaaaatttaatataataaataaagctgatatt
gaagtagaaaatatacaaaatcagtataaatcaggattattaagtaatgaagaacgttat
aataaaattattaatatatggttaaatgttagtgaagaaataactactgaaatgataaat
aatttatctaaatataaaaatagttctaattataaagaattattaaatagtatttttata
atgtatgattcaggagcaaggggttcttcaactcaaattagacaattatcaggtataaga
ggtttaatgactaaaccagatggttctataatagaaaatcctataaaatctaattttaaa
gaaggattagatgtttttcaatattttatatcaactcatggagctagaaaaggtttagct
gatactgctttgaaaacggcaaattctggatatttaactagaagattagtagatgtagcg
caagatttagtaataacaaaatataattgtaatacaaaagaaggaatatatatatatgat
atattagaaaatgaaaaaataaaagaagaaatatataataaaatttttggaagatttatt
ataaatgatatatgtattaataataaaatcataatacgtgataatacaataatagatagt
aatatttgtaatataatagaatttaatttaataaataaattaaaaataagatctgttata
atgtgtgataatgaatttggaatatgttctgtgtgttacggaatagatttatcaaatgga
aatattgttagtcaaggagaatctgttggagttattgctgctcagtctataggtgaacct
ggtactcaattaactatgagaacttttcatataggaggagctgcttttagtaactccata
atagattcaaatatatattccaaatattcgggaatattagactttaataaccttaaatat
gttaaaaataaatttgatcaatttgtagttatatcaaaaaattctgaaattaaaatattt
aataataatgaattacaaggcaaatataaaattccatatggatcaataatatataagatg
aataatgattttgtaaaatctggagatttattaataaaatatgatccatattatatacct
ataatttcaaatattgacggtagagtaaaatttaaagatataatagtagataaaactgtt
ataaataaattagatgaaataactggaatagattttataatgataatagattatcatgat
agattaatagaaaatagaaattttttaccaacaatagaaattataaatagtaataatgaa
tcatatcaatttataattcctgataaatctataattcaagttcatgataatgagtatatt
aattgtggagatattatagcaaaaatacctcagaataaaggatcaataaaagaagatata
actggaggtttacctagaatttctgatttatttgaagttcgtaatcctaaaaatcaagct
attttagcagaagaaaatggaattatttttattaataatttacctaaaggtaaaagaaaa
attattataaaatctattgataataataaaatactatatgaaacaataattccaaaatgg
aaaaatttacaagttttaaatgagagtttagtagaaaaaggagatattatatcagatggt
caagcttctttaaatgatatattaagattaagaggattaaataaattaattaattttatg
atagatgaaatacaatctatatataaattacagggagttaaaataaatgataaacatata
gaaattataattaaacaaatgttgaaaaaagttttaataattgatccaggagaatcattt
ttaaataaaaatgatagtatagagtttataaaggtaaaaaaaattaattatgatttaaac
aaaaaaaataaaaaaaatattaaataccaacatattttattaggaattacaaaatcatca
ttaataactgattcatttatatcttcagcatcatttcaagaaactactagagttttaaca
gaatcttctatattaggaaaaatagattttttaaaaggattaaaagaaaatgttattgta
ggcagattaatacctgctggaactgggtatattgactatcaaaaaaaaatgaattttgaa
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system
