Endosymbiont of Euscepes postfasciatus: NAREPO1_01820
Help
Entry
NAREPO1_01820 CDS
T07679
Symbol
rpoB
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta
KO
K03043
DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:
2.7.7.6
]
Organism
eeu
Endosymbiont of Euscepes postfasciatus
Pathway
eeu03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eeu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
NAREPO1_01820 (rpoB)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
eeu03021
]
NAREPO1_01820 (rpoB)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
eeu03400
]
NAREPO1_01820 (rpoB)
Enzymes [BR:
eeu01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
NAREPO1_01820 (rpoB)
Transcription machinery [BR:
eeu03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
NAREPO1_01820 (rpoB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
eeu03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
NAREPO1_01820 (rpoB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_45
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA84699
UniProt:
A0A2Z5TN19
LinkDB
All DBs
Position
complement(161348..165337)
Genome browser
AA seq
1329 aa
AA seq
DB search
MNILKKNFRKSFNKYNSIIELPNLLDIQKESFSKFIEFGINNILNSIFPIFNYNNNIELR
YINYNIEKNVNVDSDECKLKGLTYSICLKIILELIIYNKNNEIINKIEQEVYIGDIPNMT
KNGSFIINGVEKVIVSQLHRSPGVFFDIVKEKNIQLKNLYNARIIPYRGSWIDFEFDIKD
CIFARIDRKKKFPVTMFLHCINYSNKDIINLFYKILEIDIIDNKFYINIDFLLNKKSNFN
IYIENVLEINKSEIFTLEIILNLKSKNISFLEIEDNEIINSIIFDDCFDNSKNIFLKSFS
KISKDLVNKILKFCNKLFIIDILNSSYGLSIFNTLKKDYTIDYKDSINEIQKYIRPGEFS
SFESSEYLFKSLFFKKNKYDLSNVGRLKINQSINNYDSNENILNNNDIILILKKLINIKN
GIYKIDDIDNLENRRIKLVGEMIENQFRIGLLRIEKNVKDKLSVVNDLCNITPQKIISSK
QLSATIKEFFNSSQLSQFMDQNNPLSEITHKRRISSLGPGGLTRERAGFEVRDVHYTYYG
KLCPIETPEGPNIGLINSLSIYSRVNKYGFLETPYRVVNNGIVTNKVKYLSSNEEFNNII
VQANYNLDKNNKFKDIKLICRYNGEFNLFNSNDINYMDISNQQIVSVGSSLIPFLEHNDA
NRALMGANMQRQAVPLMISESPLVGTGMEIIVSKDTNYTIYAKRGGIVSYLDSDCIIIEV
NNEEVNESNPLYIDIYRLKKFNKSNQNTCINYIPIVNINDKINKNDIISDSQSTNFGELS
LGKNIRVAFMSWYGYNFEDSMIISEKLVRDNIFTSIHIQEFSCICRETKLGKEEITADIP
NISDSLLSKLDECGIIYKGSYVSPGDILVGKVTPKNETQLTPEEKLLRAIFGEKASDIKD
TSLRVPNGIFGTVIDVQIFIKDGIKKDKRYIDIENDKLNKFKKFIDDEKNILSNILINNI
KNLCIKNNINYDYNNLKNKQFEYLLKDNKITNDLKKIIKYLESIDSIYDNKYALFKNKII
QYDDLSNDILKIVKIYIATKKYIQIGDKMAGRHGNKGVISKINSIEDMPFDEYGNTIDII
LNPLGVPSRMNIGQILEAHLGSSLKNIGKNIQYLYDKYNDIERIRKYLSKIYNFDKKDNI
IDFNKFTNSEIYIIYNNIKNGLKISTPVFDGINEYEIKKMLNLSNLPDSGQIDLFDGFTG
DKFDRKVTVGYIYMMKLNHLVDDKMHARSTGSYSLITQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWAL
EAYGAAYTLKEMLTVKSDDVDGRSNMYKNIIYGNNNIESNIPESFNVLFNEIKSLAINIE
LNEKTKNNE
NT seq
3990 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatattttaaaaaagaattttagaaaaagttttaataaatataattcaattatagaa
ttaccaaatttattagatatacaaaaagaatctttttcaaagtttatagaatttggaata
aataatatattaaattctatatttcctatatttaattataataataatatagaacttaga
tacataaattataatatagaaaaaaatgttaatgtagattctgatgaatgtaaattaaaa
ggattaacttattcaatttgtttaaaaattatattagaattaattatttataataaaaat
aatgaaataattaataaaattgaacaagaagtttatattggagatattcctaatatgaca
aaaaatggatcatttataattaatggagtagaaaaggtaattgtatctcaattacataga
agtcctggagttttttttgatattgtaaaagaaaaaaatatacaattaaaaaacttatat
aacgctagaataattccatatagaggatcatggattgattttgaatttgatataaaagat
tgtatatttgctagaatagatagaaagaaaaaatttccagttacaatgtttttacattgt
ataaattattctaataaggatataataaatctattttataaaattttagaaatagacatt
atagataataaattttatataaatatagattttttattgaataaaaaatctaattttaat
atatatattgaaaatgttttagaaattaataaatcagaaatttttacattagagattata
ttaaatttaaaaagtaaaaatataagttttttagaaatagaagataatgaaattattaat
agtataatatttgatgattgttttgataatagtaaaaatatatttttaaaatcttttagt
aaaataagtaaagatttagtaaataaaattttaaaattttgtaataaattatttataata
gatattttaaattctagttatgggttatctatatttaatacgttgaaaaaagattatact
attgattataaagattctataaatgaaatacaaaaatatattagacctggtgaattttct
tcttttgaatcgtcagaatatttatttaaatctttattttttaaaaaaaataaatatgat
ttatcaaatgttggtagattgaaaataaatcaatctataaacaattatgatagtaatgaa
aatatattaaataataatgatattatattaatattaaaaaaattaattaatataaaaaat
ggaatatataaaatagatgatatagataatttagaaaatcgtagaattaaattagtagga
gaaatgatagaaaatcaatttagaataggattgttaagaatagaaaaaaatgttaaagac
aaattatcagtagtaaatgatttatgtaatataactccacaaaaaataataagttctaaa
cagctttctgcaacaataaaagaattttttaattctagtcagttatctcagtttatggat
caaaataaccctttgtcagaaataactcataaaagaagaatatcatctttaggtcctggt
ggattaacaagagaaagagctggatttgaagttagagatgttcattatacttattatgga
aaattatgtcctatcgaaactccggaagggccaaatataggtttgattaattctttatct
atatattcaagagttaataaatatggttttttagaaactccatatagagttgtaaataat
ggaatagttactaataaagttaaatatttatcttctaatgaagaatttaataatataata
gttcaagctaattataatttggataaaaataataaatttaaagatattaaattaatatgc
agatataatggagaatttaatttatttaattcaaatgatattaattatatggatatatca
aatcaacaaatagtttctgttggttcttcattaataccttttttagaacataatgatgct
aatagagcattaatgggagctaatatgcaaagacaagcagttccattaatgatttctgaa
tctccattagttggaactggtatggaaataatagtttctaaagatactaattatactata
tatgctaaaagaggaggaatagttagttatttagatagtgactgtattattatagaagta
aataatgaagaggtaaatgaaagtaatccattatatattgatatatatagattaaaaaaa
tttaataaatctaatcaaaatacatgtataaattatatacctattgtaaatataaatgat
aagattaataaaaatgatataatatctgattcacaatcaacaaattttggagaattatct
ttaggcaaaaatataagagtagcatttatgtcttggtatggatataattttgaagattct
atgataatttctgaaaaattagtaagagataatatatttacaagtatacatatacaagaa
ttttcttgtatatgtagagaaacaaaattaggaaaagaagaaataacagctgatattcct
aatatttctgattctttactttcaaaattagatgaatgtggaataatatataaaggttct
tatgttagtccaggagatatattagttggaaaagttactccgaaaaatgaaactcaattg
actccagaagaaaagttattaagagctatatttggagaaaaagcttctgatataaaggat
acttcattgagagttcctaatggtatttttggaactgtaatagatgttcaaatatttata
aaagatggaattaaaaaagataaaagatatattgatatagaaaatgataaattaaataaa
tttaaaaaatttattgatgatgaaaaaaatatattatcaaatattttaataaataatata
aaaaatttatgtataaaaaataatattaattatgattataataatttaaaaaataaacaa
tttgaatatttattaaaagataataaaattacaaatgatttaaaaaaaataataaaatac
ttagaaagtatagatagtatatatgataacaaatatgctttatttaaaaataagattatt
caatatgatgatttgtctaatgatatattaaaaatagttaaaatatatatagctactaaa
aaatatattcaaataggagataagatggctggtagacatggaaataaaggagtaatatct
aaaataaattctatagaagatatgccttttgatgaatatggaaatactatagatattata
cttaatccattgggagtaccatctagaatgaatataggtcaaatattagaagcacattta
ggatcttctttaaagaatataggaaaaaatattcaatatttatatgataaatataatgat
atagaaagaataagaaaatatttaagtaaaatatataattttgataagaaagataatata
atagattttaataaatttacaaattcagaaatatatattatttataataatataaaaaat
ggtcttaaaatttctactcctgtatttgatggaattaatgaatacgaaattaaaaaaatg
ctaaacttatcaaatttgccagattctggacaaattgatttatttgatggatttactgga
gataaatttgatagaaaagttactgttggatatatatatatgatgaaattaaatcattta
gttgatgataaaatgcacgctagatctactggatcttatagtttaattactcaacaacct
ttaggaggtaaagctcaatttggaggtcaaagatttggagaaatggaagtttgggcttta
gaggcttatggagccgcatatacattaaaagaaatgttaacagttaaatcagatgatgta
gatggtagatctaatatgtataaaaatataatttatggtaataataatattgaatcaaat
ataccagaatcatttaatgtattatttaatgaaataaaatctttagctataaatatagaa
cttaatgaaaaaacaaaaaataatgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
