Endosymbiont of Euscepes postfasciatus: NAREPO1_02230
Help
Entry
NAREPO1_02230 CDS
T07679
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA-directed DNA polymerase
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
eeu
Endosymbiont of Euscepes postfasciatus
Pathway
eeu03030
DNA replication
eeu03430
Mismatch repair
eeu03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eeu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
NAREPO1_02230 (dnaE)
03430 Mismatch repair
NAREPO1_02230 (dnaE)
03440 Homologous recombination
NAREPO1_02230 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
eeu03032
]
NAREPO1_02230 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
eeu03400
]
NAREPO1_02230 (dnaE)
Enzymes [BR:
eeu01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
NAREPO1_02230 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
eeu03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
NAREPO1_02230 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
eeu03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
NAREPO1_02230 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
DUF4447
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA84731
LinkDB
All DBs
Position
198793..201558
Genome browser
AA seq
921 aa
AA seq
DB search
MNKFIHLKVHSEYSIIDSIIKIENLIKKIKLFNMKSVAINDFYNFFGLIKFYEESCKNEI
KPIIGIDILINNDFDNNNNNNYCYLTLIACNLLGYKNIISIISESYIKSKKKYNKYPIVN
NDILFKYKDEIIVLSGGINGYIGKSIINNNNNNNLKKYINLYLKTFKDKFYLEISRIGLK
NEELYINESKIISKKYNISIVATNNVIFINKNEFDIHNIKILINKNIHGIKNNYTVNQYL
KSEEEMNNLFLDIPEAIINTFEIYKRCNVILNFDKYYLPKFYKKFKSTEKILYRYSKYKL
YKKINEKDNNIDYKKHKIYYDRLYKEIKIINKMGFSGYFLIVMEFIKWSKNNDIPVGPGR
GSGTGSLVSYVLNITELDPIKFNLIFERFLNPNRLSMPDFDIDFCVKKRDFVINHIINKY
SINNVARIITFNSMTAKSSIKDVGRVLNYPYGFINKITNIIPNIPGMTISKCFKINEFMN
LYNENDEIKYLIDVSIKLEGIIKGIGKHAGGIVITPCKITNLIPVYYDNIYNCYITQFDK
NDIEKSGLVKFDFLGLKTLSLIDETIKLINIRYNKNININKISLSDKNSFNLLKLGLTNA
IFQLESKGIKNIIKKINPNKFEEIIDIIALFRPGPIKSKMVDNYINRKNKKEKIYYPSMD
IKSNILKKILYSTYGIILYQEQIIEIAQKFSNYSIIEADLFRIAISKKNTKEMRKQKEKF
INGIILKNNNMNYNTSEKIFNIIEKFSGYGFNKSHSTAYAMIAYQTLWLKSNYKKEFMLS
IMNLEINNNSKIINLIKECNNLNIKINKININSSKYEFYINKNNEIEYGLGFIKGISENI
IKKIIDNRIKYGIYKNMLDFSTRVNLSKIGKKNLEILINNNIINFEKIKNINDFINKYFN
ISKQYFNNINNKQINLFKNLI
NT seq
2766 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaatttattcatttaaaagtacatagtgaatattcaataattgatagtattatt
aaaatagaaaatcttattaaaaaaattaaattatttaatatgaaatctgtagcaataaat
gatttttataatttttttggtttaataaaattttatgaagaatcttgtaaaaatgaaata
aaaccgattataggtatagatatattaataaataatgattttgataataataataataat
aattattgttatttaacattaatagcttgtaatttattaggatataaaaatattatatca
ataatatcagaatcatacataaaatctaaaaaaaaatataataaatatccaatagtaaat
aatgatatattatttaaatataaagatgaaatcattgtattatctggaggaataaatgga
tatataggaaaatcaataattaataataataataataataatttaaaaaaatatataaat
ttatatttaaaaacttttaaagataaattttatttagaaatatctagaataggtcttaaa
aatgaagaactttatataaatgaatcaaaaataatatcaaaaaaatataatatatccatt
gttgcaacaaataatgtaatttttataaataagaatgaatttgatatacataatattaaa
atacttataaataaaaatatacatggaattaaaaataattatacagtgaaccaatattta
aaatccgaagaagaaatgaataatttatttctagacattccagaagctataataaataca
tttgaaatatataaaagatgtaatgttatattaaattttgataaatattatttaccaaaa
ttttataaaaaatttaaatctacagaaaaaatcttatatagatatagtaaatacaaatta
tataaaaaaataaatgaaaaagataataacatagattataaaaaacataaaatttattat
gatagattatataaagaaataaaaataataaataaaatgggattttctggatattttctc
attgtaatggagtttataaaatggtcaaaaaataatgatattcctgttggacctggaaga
gggtctggaactggatcattagtttcatatgtattaaatataacagaattagatcctata
aaatttaatttaatttttgaaagatttttaaatccaaatagattatcaatgccagatttt
gatatagatttttgtgtaaaaaaaagagattttgttataaatcatataataaataaatat
agtattaataatgttgctagaataattacatttaatagtatgacagcaaaatcatcaata
aaagatgtaggtagagtattaaattatccatatggttttataaataaaataacaaatata
atacctaatataccaggaatgacaatatcaaaatgttttaaaataaatgaatttatgaat
ctatataatgaaaatgatgaaattaaatatttaattgacgtttctattaaactagaagga
ataataaaaggaataggaaaacatgctggaggtatagtgataactccttgtaaaataact
aatttaattccagtctactatgataatatatataattgttatataactcaatttgataaa
aatgatattgaaaaatcaggattagttaaatttgattttttaggattaaaaactttatct
ttaatagatgaaactataaaattaattaatattagatataataaaaatataaacataaat
aaaatatcattatcagataaaaatagttttaatttgttaaaattaggattaacaaatgct
atatttcaattagaatctaaaggaataaaaaatataattaaaaaaataaatcctaataaa
tttgaagaaataattgatataatagctttatttagaccaggtcctataaagtctaaaatg
gttgataattatataaatagaaaaaataaaaaagaaaaaatatactaccctagtatggat
attaaaagtaatattcttaaaaaaatattatatagtacatatggaataatattatatcag
gaacaaataatagaaatagcacaaaaattctcaaattactcaataatagaagctgattta
tttagaatagctataagtaaaaaaaatacaaaagaaatgagaaaacaaaaagaaaaattt
attaatggaataatattgaaaaataataatatgaattataatacatcagaaaaaattttt
aatattattgaaaaattttcaggatatggttttaataaatcacattcaacagcatatgct
atgattgcatatcaaacattatggttaaaatctaattataaaaaagaatttatgctatct
ataatgaatctagaaataaataataatagtaaaataataaatttaattaaagaatgtaat
aatttgaatataaaaataaataaaattaatattaattcaagtaaatatgaattttatata
aataaaaataatgaaattgaatatggattaggatttataaaaggaatatctgaaaatata
ataaaaaaaataatagataatagaataaaatatggaatttataaaaatatgttagatttt
tctacaagagtaaatttaagtaaaattggaaaaaaaaatctagaaatattaattaataat
aatattattaattttgaaaaaataaaaaacattaatgattttataaataaatattttaat
atatcaaaacaatattttaataatataaataataaacaaataaatttatttaaaaattta
atataa
DBGET
integrated database retrieval system