Elizabethkingia ursingii: BBD34_06880
Help
Entry
BBD34_06880 CDS
T05036
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ego
Elizabethkingia ursingii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TEN_YD-shell
RHS_repeat
FG-GAP_3
SpvB
FG-GAP
Hph
Crystall_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQX08384
UniProt:
A0AAJ3N9V2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1492317..1498943)
Genome browser
AA seq
2208 aa
AA seq
DB search
MKDLQKVALSNGATNANDINIDINWDELPDTPYGTIGTIPFHDTTGQIDVNGGGQLQYTL
PIALPPGIKSVAPQINLVYTSGSGNGIAGYGWNISGITAISRMGKTLEKDGEIKGVQLDY
SDFYQFSGQRLILKSGEYGKDGAEYVTEKYSNIKIKSVGTNSGMNGPRYFEVTFEDGSQA
WYGRTPAGNTEMEQYAATPVEYNIVKWIDTQGNYITYKYVQGDRVAIIYSIEWGGNETAG
TLHFNKIDFNYIRRDLREITYLNGDPYIQNYILSNVEVNANGSLFKKYSIEYKKDDKGNQ
YQFVKSITESNSKGETANPVTFEYQESKSGEWKESRISNTGDSPILYGDFNGDGKMDALR
YLNDFEECVEFVDGIDMETPKEDDFFGRIIYNDLCQRKEKWPAGLYLFNSVFDDSRPKRI
NIANTQLTAKDIQNSMAITLKTSDGEILPRQGFITHYRVRNMDERNYQLHLKAYSINPDS
YELSEAYTRIIPASVYDRNAIISNIDRVLIWRATEVEGVREIDLDGDGNPELLFILKDTT
YRGELNKEVLETKYRYVIVNTEENNSESYEMEISLINGNFFGKEIKSGDFNGDGIVDFIS
FDSSGRISLTNFKKNTLEKFEAYTRPYSDIVIEGLREEAVVGDFTGDGKSDLMVPQAVDS
KNWKLYLCTGRGFEVQELNNFALFKKDDHFEGETHARAINRQFFAQDLNKDGKADLIEFY
SHVYKGKFEESRFIMFYHENKGMDSNGKIVFEKQNIDGHWETGRPPYDQGTTWYPDEYDT
TQTNIKPYASTNVAEHFFPAIGDFRVNNFNENILIIQKGRLVRYSHYNVSQEARITSITQ
GGLTTEVKYKELDSQMNPGFYAGTKKEKFPYIEMDKVSGSYAVAQLIQEARKQDFKYRGM
VAHLQGKGMIGFRKSARSSWYVDGYENTKIWSGAEIDPLNEGIPVKDWTVRTVDDNALIF
PDDLSVNNTQLLSVKSIEYQIDTPSVGVKAIVPKKSISKDFLRDILEENNIVYNSYYLPK
ETTVKINNDFGIKSTVIEYSHNPEGLGRNYFIGRPESKTETVQSYGDTKSAKEEYIYENN
LLKVLKTYNRDNSGWVQETYNYDSFGNSIEKITSNSLDTMTQTVKSEYDSKGRFVVKKID
NLGLETNILYDDSGQIIKQTDPLGNVLENKYDGWGKIEILKTNLEGMTTYTYEKLEDGGN
KVIEYAPDGTPKETYTNKLGQQYKARVRGFNQDTFICSVTFHDMLGRKEYESEPYFESEG
VPTQVNKIEYDDSVFPTIITATAFNGKKVKTIVTGRTSIVEELTGNRRITKKTTDPLGNV
ISSEDKGGVINFSFNAAGEQLRAQYGNNIVTTQYDVWGRKASFHDPSNGAYSYEYNGFGQ
VKKEVSPKGYKEYIYDSKGQLITQVEKSNTTGLTDKSIDYSYNDKGLLIGKIGISNGKSY
SDSITYDTYGRVLENIENSNGKIYSQKDIVYDNKSRVLSYKKSLVSSGVTTAVQLENIYE
AWSGQLYQVKDKVSGKILWELQNANAKGQVLKSRLGASSIENTYDANSLLSQTLHQSSTG
MLFSSQYSFDPIKNELVERTRQGNFAMKEIFTYDDNNRLIQWTNPKTGGISSNKYDQQGR
ITENDQIGNVQFGDTTKVYQPTGVKLNTTGKQNYLNAQIQRIIYNENNDPLYIQSKKGDV
RFGYGLTDMRQMVTYGQTAPADTNGTIEDFATSNWEGTFTKYYSEDGSFEVVRNNTSGEE
KHILYIGGIPYESNVVYLKDFTQSSGSYKFLHKDYLGSIMAVSDEAGNLLQEAHFDAWGQ
LVRGSISLIDRGYTSHEHFEDIGIIHMNGRLYDPLLRRFLNADENIQDPYNTQNYNKYAY
VLNNPMLYNDPSGEFGFLIIGGFFLEFLAPMIFGALIGAAIGAVAYALSAAFSGNWSWGG
FLKSIAFGALGGAVSAGIGSLFQAATQSIGTSLFQAAAHSISQGILSVVQGGDFLQAFAS
GGFSSLGAAAFGLMGGSFANSAVGTVIFGAISGGIGSALTGGNFWQGVVIGSIVAGLNHA
FHKTSEPQNKKNDNGDDKGYKIPRKIITFSKTQPAYIPVEGFGIFGTYTISGTMIIEGNM
LTINVYGDTIASTQGQPFFKGSVSVSGTSKFGGITYNVTKPLVNDYSKSFVHPANKQYVG
QAEFYIPTKISAFNVRITAGYMIFTSDNQLSAPYPNNTIFNYGINRNK
NT seq
6627 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagatttacaaaaagtcgctctttcaaatggtgcgacaaatgcaaatgacatcaac
atagacataaattgggatgaacttccagatacaccttacggaactattggaacaattccg
tttcatgatacaacaggtcaaatcgatgtgaatggtggtggtcaattacaatatacttta
ccaattgctttgcctcctggaataaaaagtgtagcaccacagattaacctggtatatacc
agtggcagtggaaatggaattgcaggttatggctggaatatctccgggattactgctatt
tccagaatgggaaagactttagaaaaggatggtgaaattaaaggagtgcaattggattat
tctgatttctatcagtttagcggacaaagattaatcttaaagtctggagaatatggaaaa
gatggagcagaatatgttaccgagaaatattccaatattaagataaaatcagttggaaca
aattcaggaatgaatggacctcgttatttcgaagtgacatttgaagatggttctcaggca
tggtacggccgtactccagcggggaatactgaaatggaacagtatgcggctacaccagta
gaatataatattgttaagtggatcgatacccagggtaattatattacctacaaatacgtt
caaggggatcgagtggctattatatatagtatagaatggggaggtaatgaaactgccgga
actcttcattttaacaagattgacttcaattatatcaggagagaccttagggaaatcacc
tatcttaatggtgatccatatatccaaaattatattttatctaatgtcgaagttaacgcc
aatggaagtttgtttaaaaaatatagtattgagtataaaaaagatgataaaggaaatcaa
taccaattcgttaaaagtattacggagagtaattccaaaggagaaactgccaatccggta
acgtttgaatatcaagagtcaaagtcgggagagtggaaggagtcacgaattagcaatacg
ggagactctcctatattgtatggtgatttcaatggtgacgggaagatggatgctttaaga
tacctcaatgattttgaagaatgtgtagagtttgttgatggtatagatatggagactcca
aaagaagatgatttttttggaagaataatttataatgacttatgtcagcgaaaagagaaa
tggcctgccggactttatttattcaatagcgtttttgatgatagccgacctaaaaggata
aatattgccaatacccaacttacggctaaagatatacagaattctatggcaataaccctt
aaaacctctgatggagaaattttgccaagacaaggatttattacccactacagggttaga
aatatggatgaacgtaattatcagctacatctcaaagcatattcgatcaatccggattct
tatgagctttctgaggcatataccagaataatccctgctagtgtgtatgacagaaatgca
attatcagtaatatagatagagttctaatttggagagcaactgaggtagaaggtgttaga
gaaatcgatcttgacggggatggtaaccctgaattgctttttattcttaaagatacaacc
tacagaggagagcttaataaagaggtgcttgaaacgaaatatcgctatgttattgtcaat
actgaagagaataatagtgaaagctatgagatggaaatatctcttatcaacggtaatttt
tttggaaaggagattaaatcaggagattttaacggagatggcatagtggattttataagc
tttgatagctctggtagaatatctctcacaaatttcaaaaaaaatactttagagaaattt
gaagcttacacaagaccatattctgatattgtcattgaggggctaagagaggaagcggta
gttggtgattttacaggtgacgggaaaagtgatcttatggtacctcaagccgtagacagt
aagaattggaaactatacctatgtacagggagaggttttgaagtgcaggaacttaataat
tttgcattattcaaaaaagatgatcattttgaaggagaaacacatgcccgagctataaat
agacaattttttgctcaggatttgaataaggatggtaaagctgatcttattgaattttat
tcacatgtttataaggggaaatttgaggaaagccgttttatcatgttttatcatgaaaat
aaagggatggattctaatggaaaaattgtttttgaaaagcaaaacattgatggccattgg
gaaacgggtagaccaccatatgaccaaggtacaacatggtatccagatgaatatgataca
acccaaacgaatataaagccatatgcatctaccaatgttgcagagcatttctttccagcc
attggggattttagagtcaataactttaatgaaaatattcttatcattcaaaaaggaaga
ttggtaaggtactcgcattataacgtttcacaagaagctcgtattacttctattacccag
ggagggcttacaacggaagttaaatacaaagagcttgattcacagatgaatccgggattt
tatgcaggaactaaaaaagaaaaattcccttatatagaaatggataaagtctctggatct
tatgctgttgctcagcttattcaggaagcaagaaagcaggatttcaagtacaggggtatg
gtggcgcatttacaaggtaaaggaatgattggttttcgtaagagtgccagatcatcatgg
tatgtcgatggttatgaaaatactaaaatttggagtggagccgagattgatccattaaac
gaaggtattcctgtaaaagattggacagtaagaactgtagatgataatgctttaatcttt
ccagatgatctttccgtaaataatactcagctgttatctgttaaatccatagagtatcag
attgatactccatctgtcggtgtaaaagctattgttcctaaaaagtcaatttccaaagat
tttctaagggatattctggaagaaaataatattgtttataattcatattatctgcccaaa
gaaacaactgtcaagatcaataatgattttggaataaaatctacagtaatagagtattct
cataatccagaagggcttggtagaaattattttattggacgaccagaatcaaaaactgag
actgtacagtcttatggagatacgaaatctgctaaagaagaatacatctacgaaaataat
ctattgaaggtactgaaaacgtacaatagagataatagtggttgggtacaggagacttat
aattatgattcgtttggtaatagtattgaaaagattactagcaatagtttggatacaatg
actcaaactgtgaagtcagaatacgactccaaaggtaggtttgttgtgaagaaaattgat
aatcttggtttggaaactaatatcctttacgacgattcgggacaaattattaaacaaaca
gatccgttgggtaatgtattggagaataaatatgatggttgggggaaaatagagattctc
aaaaccaatttagagggtatgacgacttatacctatgaaaagttagaagatggaggaaat
aaagtaattgaatatgcgccggatggtactccgaaagaaacatataccaacaagttaggt
cagcaatataaagcaagagttaggggatttaaccaagatacctttatatgcagtgttact
ttccatgatatgcttggaagaaaggaatatgaatctgaaccttattttgaatcagaggga
gttcctactcaggttaataaaatagaatatgatgatagtgtattcccaactataataact
gctacagctttcaatggtaaaaaagttaagaccattgtaacaggtagaacaagtattgta
gaggaactgactggaaatagacgtattacaaagaaaaccactgatccacttgggaatgtg
atttcttcagaggataaaggaggagtaattaacttttctttcaatgccgccggagaacag
ctaagagcccaatatggaaataatatagttaccacacagtatgatgtatggggaagaaag
gcaagtttccatgatccttcgaatggagcatattcctatgaatataacggttttgggcaa
gttaaaaaagaagtcagtcccaaaggttacaaggagtatatctatgacagtaaaggtcag
cttattactcaagtagaaaaatctaatactacaggtttaacagataagagtattgattat
agttataatgacaaaggtcttttaattggtaaaataggtatttctaatggtaaaagctat
tctgatagtattacttatgatacttatggcagagtattggaaaatatcgaaaacagtaat
ggtaaaatttattcacaaaaagatattgtgtatgataataagtcccgggtactttcgtat
aaaaagagtcttgtttcttctggtgttacgacagctgtacagttagaaaatatttatgaa
gcttggagtggacagctataccaagtgaaagataaggttagtggtaaaattttgtgggaa
ttacagaatgctaatgctaaggggcaggtattgaaaagccgtttaggagcttctagcatt
gagaatacttatgatgctaatagtttattgagtcaaacgctacatcaatcgtcaacaggt
atgttgtttagtagtcagtattcgttcgatcctatcaaaaatgaattggttgaaaggact
agacaaggtaattttgcgatgaaggagatctttacctatgatgataataacagattaata
caatggacaaatcctaaaaccggaggtatttcatccaataaatatgatcaacaaggacgt
attacagaaaatgatcaaataggaaatgtgcagtttggagatactacaaaagtttaccag
ccaacaggtgtaaaactaaatacaactggaaagcaaaactatcttaatgctcagattcaa
agaatcatatataatgaaaacaatgatccgttatatattcagagtaaaaagggagatgta
cgttttggttatggactaaccgatatgcgtcaaatggttacttatggacaaacagcgcct
gcggacactaatggaactattgaggattttgcgacttctaattgggaaggaacatttacg
aaatattatagtgaagacggtagttttgaagtagtacgcaataatacttcgggagaagag
aagcatattttatacataggaggtataccatatgagagtaatgtagtatatttgaaggac
ttcacacagagcagtggttcttataagtttttgcacaaagactatttaggtagtattatg
gcagttagtgatgaagcgggaaatcttttacaggaagctcattttgatgcctgggggcag
cttgtaagaggaagtattagtcttattgatagaggttatacatctcatgaacattttgag
gatattggtattatccacatgaatggtcgattgtatgatcctttacttagaagattctta
aatgccgatgaaaatattcaagatccatacaatacacagaattacaataagtatgcatat
gtattgaacaatccaatgttgtataatgacccaagtggtgagtttggattcttgataatt
ggaggtttcttcttagagtttttggcaccgatgatttttggagcgttaataggcgctgca
attggcgctgtagcttatgcattaagtgctgcgttctcgggtaactggagttggggagga
ttcttaaaatctattgcatttggagcattaggaggagccgtttctgcgggaataggaagt
ttatttcaggcagcgacccaaagtattggtacatcattgtttcaggcagcagcccatagt
atctcacaaggtattctaagtgtggtacaaggaggagactttttacaggcttttgcttca
ggtggttttagtagcttaggtgcagctgcatttggccttatgggaggtagctttgctaac
agtgcagttgggacagttattttcggagcgatctctggtggaattggttctgctttgaca
ggaggaaatttctggcagggagttgttatcggaagtattgtagctggattgaatcatgca
tttcacaaaacgagtgagcctcaaaataagaaaaatgataatggagatgataaaggatat
aaaattccgagaaaaattattacattttctaaaactcaaccggcatatattcctgtagag
ggttttggaatttttggcacatacacaattagtggtactatgattatagaaggaaatatg
ttaactattaatgtttacggtgatacaatagcatctacacaaggacagcctttctttaag
ggtagtgtttctgttagtggaacatctaaatttggaggtattacctataatgttacaaaa
ccattagttaatgactattccaaatcctttgttcaccctgctaataaacaatatgttggt
caggcagaattctatattccaacaaaaatttctgcatttaatgttagaataactgctgga
tatatgattttcacatcagataatcaactttctgctccatatccaaataatacaattttt
aattatggtataaatagaaacaaataa
DBGET
integrated database retrieval system