Elizabethkingia ursingii: BBD34_12580
Help
Entry
BBD34_12580 CDS
T05036
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
ego
Elizabethkingia ursingii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ego00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ego02000
]
BBD34_12580
Transporters [BR:
ego02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
BBD34_12580
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarboxypepD_reg
CarbopepD_reg_2
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQX09428
UniProt:
A0AAJ3NBW3
LinkDB
All DBs
Position
2746612..2748984
Genome browser
AA seq
790 aa
AA seq
DB search
MTTFLLLCGMVMSYAQSSFTVQGTVKDSDNHAPVGQAQINIGGVKAISDAKGVFSLKINS
GEYAVVVSHPKFDAFKENLKVDKHLKLEINLEHRAEDIETVVLNVKHRTPGAMIVSSLDK
NMISRNVASNLGNLLTNISGVEGLKTGNNIVKPIIHGMYGSRVAILNNGVKMAEQEWGVE
HAPNVDINNYQHIDVVKGASALKFGGDAIGGVVLLEPAIYPKKDTLEGSVTLNGQSNGRG
GGVNVNLLKLWKNGWAINTNGAYNKLGDLKAPDYGLMNTGLESSSFNFGVQKKNAHRGFS
IDYYLTNQNLGIFRGSHIGSLKDFYAAVNATRPIYERNFSYDIDNPKQVVEHHLVKFNAY
NDFKNFGKLSLTYSFQYNHRQEYDVRVGDLNKLPALDMALITNQVNINHLLNRDNWSLES
GIDGTYQNNYSDPATKARRLIPNYDKYAGGVYSIFKYKFNSKWNGEASARYDFNRYDVQK
WYDTSDWNSRYAALYPEFKVKEDKSRTLTNPILNYHNFSFNAGVEYRPSSALNLKFNYSR
VSRTPNIAELFSDGLHHSASVIEVGDMGLKNETGNQFNLLIESKINALQGLQISLNPYFF
YTKNYINEVPTGIQYTIRGVFPIWSYQQIDAKMFGADLDVNWRLTSNLTYKGRAAYLYGQ
DMTNNVPLILMAPTNVYNAIEFNKPEWSNFYFNVNNRQVFHQNRYPYNPIDITLYRDTGE
AYTAILDLSTPPKVYNLWGLQAGVDIYKNFSVGLTVNNLLNTNYKDYLNRLRFFSYEAGR
NFILNLKYNF
NT seq
2373 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgacattcctgctgctatgtggtatggtaatgtcttatgcgcaaagtagctttacc
gtacaggggacggtaaaagattcggataatcatgctccggtaggtcaggcacagatcaat
attggaggtgttaaagcgatatctgatgctaaaggcgttttttctctaaaaataaatagt
ggagaatatgcagtggtggtttcacatccgaaattcgatgcatttaaagaaaatctgaaa
gtagataagcatcttaaacttgagattaatctggagcatagagctgaagatatagaaaca
gtagtactgaatgtaaaacatcgtactcctggtgctatgattgttagctctctggataaa
aatatgatttccagaaatgtggccagtaatctggggaatttgctaacaaatatatccgga
gttgaaggattgaaaactggtaataatattgtaaagccaattatccatgggatgtacggg
agccgtgttgcgatccttaataacggagtaaagatggctgaacaggaatggggtgtagag
catgctccaaatgtggatattaataattaccagcatatagatgttgtaaaaggagcttcg
gcgctaaagtttggtggtgatgctattggtggagttgtattgttggaaccggcgatatat
cctaagaaagatacactggaaggaagtgtaacgctgaatggacaatctaacggccgaggt
ggtggtgttaatgtaaaccttctgaagctatggaaaaatggctgggcaattaatactaac
ggagcctacaataaattaggagaccttaaggcacctgactacggattaatgaataccgga
ttggaatctagttcttttaattttggagttcagaagaaaaatgcacatagaggattttct
atagattattatctaactaaccaaaacctaggtattttcagaggttcacatattggcagt
ttaaaagatttttatgctgctgtaaatgctacacgtccaatttatgaaagaaatttcagc
tatgatatagataatcctaaacaggttgtagagcatcatctggtaaagtttaatgcttat
aatgattttaaaaactttggtaaactgtcattaacctacagtttccagtacaatcaccga
caggaatatgatgtccgcgttggggatcttaataaactaccagctctggatatggctttg
attacaaatcaggttaatattaatcatttactgaatagagataactggagtctggaatcc
ggaattgatgggacatatcagaacaattattcagatccggctactaaagccagaagactg
atccctaattatgataaatatgcaggtggtgtttattccatatttaaatataaattcaat
tcaaaatggaatggtgaagcatctgccagatacgattttaacagatatgatgtacaaaaa
tggtatgatacttcggattggaatagtcgttatgcagctttatatccggaatttaaagta
aaagaagataagagccgtacacttacaaatccaattctaaattatcataatttctctttc
aacgccggagtagaatatagaccctcttcagcgcttaacttgaaatttaattattccaga
gtaagcagaacaccaaatattgcagaactattctccgatggattacaccattcagcatcg
gttatagaagttggtgatatggggctgaaaaatgaaacgggtaatcagttcaatttgtta
atcgaaagcaaaattaatgcactacaaggattacaaatttcattgaatccatattttttt
tataccaaaaactatatcaacgaagttcctacaggaatacagtatacaattcgtggggtt
ttcccgatttggagttatcaacaaattgatgccaaaatgtttggtgcagacttagatgtt
aactggaggcttacttctaatttaacatacaaaggtcgtgcagcttatttatatggacag
gatatgacgaataatgttccactaatcctgatggcaccaactaacgtttacaatgctata
gagtttaataaaccggagtggagtaatttctatttcaatgtgaataacagacaggtgttt
caccagaacagatatccatacaatcctatagacattactctgtacagggatacgggagaa
gcttatacagcaatattagacctttcaactcctccaaaagtatataatctgtggggattg
caggccggagttgatatttataaaaacttctctgtaggacttactgtaaataatctttta
aatactaactataaagattatctcaacagactgcgtttctttagttatgaagctgggcgc
aattttatcttaaatcttaaatacaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system