Eucalyptus grandis (rose gum): 104454314
Help
Entry
104454314 CDS
T03547
Name
(RefSeq) pumilio homolog 1
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
egr
Eucalyptus grandis (rose gum)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104454314
NCBI-ProteinID:
XP_010067428
UniProt:
A0A059BHP6
LinkDB
All DBs
Position
7:55647598..55654517
Genome browser
AA seq
991 aa
AA seq
DB search
MITDTYPNMMPDISMRSMLKNRADYSEELDIHRSGSAPPTVEGSLNAVGGLFDAKRSDGK
GFVSEEELRTDPAYVNYYYSNVNLNPRLPPPLLSKEDWRSAQRLSGGSGGGGGGGGGGGG
GGGVGGIGDRRKVSRGSVRAGEREENGGMEAKRSEWGVDGLIGLPGLGFGSRQKSIAEII
QDDMSYATSASRHPSRPASRNAFDESTEASEVQFPQMHHELEHMDSLQSTANTSAMSAVH
GIGGRASHTYASAVGGSLSRSATPDPQLIDRAPTPRIPPVGAGRVNSMDKRSVSGQNSLS
SSVSPNMGETGDLVAALSGLNLSTNVMTNDKNHSQLQMQHDLGDHNNFYNFHDENQTKQQ
SFMSNEFQKPAVSASSSFLKGHSAQNLNGRGSSLSNHHDLERSSPTNPNYGLGGLAMNPS
SPTMMSSQLASGNLPPLLKNVAAASALGMNGLDPRALGGGSPLGPNSMAAAAELQNLSRA
GAHATGNGLQFPLMGPSYLQYSRSNEYAAAQLTALGDPTLLDREGMGDSYMDFMGLQKAY
LDLLLSSQKSQYGIPYLGKSGSFNHGYYGNLACGMGMSYPGNQLGSPLLPSSPLGCGSPV
RHGERNVRFSSGLRNLGGGVMGAWHSEAGSNLDESFSSSLLDEFKGNKTRCFELSEIAGH
VVEFSADQYGSRFIQQKLETASTAEKDMVFHEIMPRALTLMTDVFGNYVIQKFFEHGSAS
QIRELADQLDGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVELDQQTKMVMELDSQVMRCVRDQNGNH
VIQKCIECIPEDAIHFIVSTFYDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCHDSTTQRIMMDEILQ
SVCMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKSHERSAIIKKLTGQIVQMSQQKFASNVIEKCLAFGTP
TERQLLVNEMLGSTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQLELILNRIKVHLNALK
KYTYGKHIVARVEKLVAAGERRISIQNPHPA
NT seq
2976 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcaccgatacttatcccaacatgatgcctgatatttcaatgcgatcgatgctcaag
aacagagcagattactctgaagagctcgatatccatcggagtgggtctgcgccgcctacc
gtggagggctctctgaacgcggtgggaggattgtttgatgccaaaaggagcgatgggaaa
gggtttgtgtctgaagaggaactgagaactgatcctgcttatgtgaattactactattct
aatgttaatctgaatccgaggttaccaccgccgctgttgtctaaagaagattggaggtct
gcgcagagattgagtggtggtagtggtggtggtggtggtggaggaggaggaggaggagga
ggaggaggagtaggagggattggtgataggaggaaagtgagtagaggcagtgttagagct
ggagagagagaagaaaatggtggaatggaggctaaaaggagtgagtggggcgttgatggg
ttgattggcttgccagggttggggtttgggagcagacaaaaaagcattgcagagatcatt
caggatgacatgagttatgcaacgtcggcctctcgccacccttctcgtccagccagccga
aatgcatttgatgaaagcaccgaagcttctgaagtccaatttcctcaaatgcatcatgaa
ttggaacatatggattcgctacagtccactgcaaatacaagcgccatgtctgctgtccat
ggtattggcgggcgtgcttctcatacttatgcttctgctgttggtggctccttgtctaga
agcgccactcctgaccctcaacttattgaccgggctccgacgcctcgaattccgcctgtt
ggagctgggagggttaattcgatggataaaagaagtgttagtggccaaaattcgttgagt
tcttcagtctcgcctaatatgggagaaacaggagatctcgttgctgctctatctggcttg
aatctgtcgacaaatgtaatgacaaatgataagaatcactctcagttgcaaatgcaacat
gaccttggtgatcacaataatttttacaactttcatgatgagaaccaaaccaagcaacaa
tcattcatgagtaatgagtttcagaagcctgctgtttctgcttcgagctcattcttgaaa
ggacattccgctcagaatcttaatggccgagggagctcactgtctaatcatcacgatttg
gaaaggtctagtcctactaatccaaattatgggctaggtgggcttgctatgaatccctct
tcaccaaccatgatgtcaagccagcttgcaagtggtaatttgccgcctttgttaaaaaat
gttgctgctgcatcagccttgggcatgaatggtttggacccaagagcactggggggaggt
tcgcctttggggccaaattctatggctgcagcggctgaactacaaaatcttagtagagca
ggagctcacgcgactggtaatggtttgcagttccccctgatgggcccctcatatcttcag
tattcaagatcgaatgagtatgccgcagcacagctcactgctcttggtgatcccaccttg
ttggatagggaagggatgggcgactcctatatggattttatgggactccagaaagcttac
cttgatttgttgctttcgtcacaaaaatctcaatacggtattccttaccttgggaaatct
gggagttttaatcacggctactatggaaatcttgcatgtggtatgggcatgtcttatcct
ggaaaccaattgggaagtcccctccttccaagttctcctctaggatgtggtagtccagtc
cggcatggtgagcgcaatgttcgtttttcttctgggcttaggaacttaggtgggggagtc
atgggagcatggcactcagaagctggtagtaatttggatgagagcttctcgtcatctttg
cttgacgagttcaagggtaacaaaaccagatgttttgaactttccgaaattgctggtcat
gttgttgagttcagtgctgatcagtatgggagccgattcatccaacagaagcttgagact
gcgtcaacagcagagaaagacatggtgttccatgagattatgccgcgagcactaacactg
atgactgatgtctttgggaattatgtcattcaaaagtttttcgagcatggaagtgcatca
caaataagagaactggctgatcagcttgatgggcatgtgctgactctaagcctgcaaatg
tatggctgtcgagtgatccagaaggctattgaggttgttgaactggaccagcagactaag
atggtgatggagcttgacagtcaggttatgcgttgcgtccgtgatcagaatgggaatcat
gtcatccagaagtgtattgaatgtattcctgaggatgctattcatttcattgtctccacc
ttctacgatcaagttgtaacactgtccactcatccttatggttgtcgtgtcattcagaga
gtcctagagcattgccatgattcgacaactcaacgcataatgatggatgagattttgcaa
tcagtttgcatgctggcacaagatcagtatgggaattatgttgtgcagcatgttctagag
catggaaagtcgcatgagcgttctgccattataaagaagctgactgggcagatagttcaa
atgagtcagcaaaaatttgcctccaatgtcattgaaaaatgtttggcttttggaactccc
acagagcgccagctcctggtgaatgagatgcttggctcgactgatgagaatgagcctctt
caggcgatgatgaaagatcagttcgcaaactacgttgtacaaaaagtgctggaaacttgt
gatgaccagcaactggaactgatccttaatcgtataaaagtacatttgaatgctctgaaa
aagtatacttacgggaagcacatagttgcacgtgtagagaaactggttgcggctggagaa
aggaggattagcattcagaatcctcacccggcttag
DBGET
integrated database retrieval system