Elaeis guineensis (African oil palm): 105044197
Help
Entry
105044197 CDS
T03921
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
egu
Elaeis guineensis (African oil palm)
Pathway
egu03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
egu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
105044197
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
egu03019
]
105044197
Messenger RNA biogenesis [BR:
egu03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
105044197
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Smg4_UPF3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105044197
NCBI-ProteinID:
XP_010920312
UniProt:
A0A6I9R643
LinkDB
All DBs
Position
4:54565574..54577508
Genome browser
AA seq
463 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKMKEYFSNYGEVLQTVIMRDKATGRPRGFGFVVFADPSIL
DRVLQDKHNIDGRTVEAKRALSREEQQASKSGNPNVGRSGGGPVSGGNFRTKKIFVGGLP
PTLTEEIFCQYFQSYGEVEDVVVMYDQNTHRPRGFGFVSFKSEDAVDRVLHKTFHELNGK
LVEVKRALPKDANPSNASGRLVAGGPYQTNSASGVNMSSYDGRADAGRYMQPPAAGGGYP
AYGSTGYATPGYGYGAANNGVGYGGYGVGGYGSPTAGYGGPAGAYGNPNAPAAGYASGPP
GAPRSLWSNQAPSAYGSAGYGANASYGAPGAWNAAGSGGAAPPAGQSPSGTTGYGNQGYG
YGGYGGTEGSYGSHGGYGPVGGRGSGGPTNNPAVGPGEQGAGSGYMGGGYGDASGGSGYP
NSWRADPSQGVGYGSSQVNGPPGGPTGYGGAYGGAQSRQVQQQ
NT seq
1392 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcagggaaagctgttcatcggggggatatcgtgggagacgacggaggag
aagatgaaggagtatttctccaactacggggaggtgcttcagacggtgatcatgagggat
aaggcgacgggtcgccccaggggcttcggcttcgttgtcttcgccgatccctccatcctc
gaccgcgtcctccaggacaagcacaacatcgacggtcggacggtggaagcaaaaagggct
ctctcaagagaggaacaacaggcctccaaatctggaaaccctaatgttggcagaagtggt
ggaggacctgttagtggtggtaactttaggactaaaaaaatatttgtaggagggttgccc
ccaactttaacagaagaaatattttgtcagtactttcagagctatggagaggtggaggat
gttgtggtgatgtatgatcaaaacacccatcgtcctcgagggtttggttttgtctctttt
aaatcagaagatgctgttgatcgagttttacacaagaccttccatgagctcaatggaaaa
cttgtggaggtcaagcgtgcactcccaaaggatgcaaaccctagcaatgctagtggccgt
ctagtagctggaggtccctatcaaaccaacagtgcttctggtgtcaatatgagttcctat
gatggtagagctgatgccggtaggtatatgcaaccaccagctgctggtggtggttaccca
gcatatggttcaacaggctatgctacacctggatatgggtatggagcagctaacaatggt
gtaggatatggaggttatggtgttggtggctatggaagtcctacagctggatatggtgga
cctgctggagcctatggaaatccaaatgctccagctgcaggttatgcaagtggtccacca
ggtgcacctcgaagcctgtggagcaaccaagctccatctgcttatggctctgcaggctat
ggtgcaaatgcaagctatggggcaccaggtgcatggaatgctgcaggtagtggtggagca
gccccacctgctggtcagtctcccagcgggactactggatatgggaatcagggttatggg
tatgggggttatggtggaaccgaggggtcttatggcagtcatggtggctatgggcctgtt
ggcggacgtggcagtggcggtccaactaacaatcctgctgttggcccaggagaacaaggg
gctggttctgggtatatgggtggtggctatggtgatgcaagtggtggctctggttatcca
aattcatggagagctgacccttctcaaggagtgggttatggaagtagccaagtcaatggg
cctcctggtgggccaactggttatggtggtgcctatggtggtgctcagtcgaggcaggtt
cagcagcagtga
DBGET
integrated database retrieval system
