Egretta garzetta (little egret): 104122014
Help
Entry
104122014 CDS
T05152
Symbol
IGFN1
Name
(RefSeq) immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1
Organism
egz
Egretta garzetta (little egret)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
I-set
Ig_3
fn3
Ig_DSCAM-DSCAML_C
Ig_2
ig
Pur_ac_phosph_N
THB
Tissue_fac
Receptor_2B4
CRLF2-like_D2
C2-set_2
Ig_J_second
Lectin_like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104122014
NCBI-ProteinID:
XP_035745631
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2518 aa
AA seq
DB search
MTSHPPVKSLKKSSVPGVVITQFVDDIPEGCSTPDFERKPVTLTLQEGKNAIFRAVVKGV
PTPDVKWTRIQGGMDDPVKYKTFFNNITNEFILQINEITTDDSDLYRCFAVNEYGEAACS
AGLRIIQVRFKRKAKYVPVHPADELKKKLQDFRKLLRKRAPAPKPKPLDKEAVWQLLLHA
DRRDYEKICMKYGIVDFRGMLRKLQEMRKDTESEQGELINSIKNFEHIKVNKEGKATFSL
EMDLKNRNSKVYLLKDGERLRYGTGDEYRKHCLRRIGKRYNFIVNDVQPEDAGLYQVRVE
DVPVFSTELDAESIPVRFEQPLSDVRCPEEEDAVFECTLRTPCYDAVWLHKTHLLEASEK
HQISVTPDGLTHQLIIKNVVPSDNGMYTLDTGLCSSNAWLIVEYAKGKRRQGERGEREKS
EWLEETLPEKDRAKKLRRREYVDDEDHLMDTGMEKDGWYRNGQGHPSDVNGSHRFLGKDG
LRKAHRDGRTGFGQFSGADLEGDSMTNDGSIFGLKGLGGRSRLRPFHGKDSVTGRADTGD
ELGGAGEWYPVDGRDDGMLDAANIDMDDGEGLGSQHDKDGKLGDTSYRAGFGGVGRLGAP
DGSSMLDGLDPDSTRVGVGMRSPYGKDGLPTVADRNGASINREGQTGSPYGKDGLTLHAS
GHLGQAGRSALLYGPGGLPAGHGALSGAGGSSIGEMEALYGPDGQPVGTGGGDVGVAGAG
GVGYPYGKDGAVGYPYGKDGLPAGAGIGGGGAGGVGSPYGKDGLPAGAGLGGAGAGAVGS
PYGKDGLPAGAGLGGAGAGAVGSPYGKDGLPAGAGLGGAGAGAVGSPYGKDGLPAGAGLG
GAGAGAVGSPYGKDGLPAGAGLGGAGAGAVGSPYGKDGLPAGAGLGGAGAGAVGSPYGKD
GVAAGGGIGGADVAGAGRVGTPYGKDGLSSGVGGVGAGVAGAGGVASPYGKDGLPAAVGV
GGAGAGGVGGLGYAYGKDGVPAGAALAGAGLGGAGGVGSPYGKDGLPAGAGLGGAGVGGV
GSPYGKEGLPAGVGVGGDGLGGAGGVGSPYGKDGLPAGAGLGGAGVGGVGSPYGKEGLPA
GVGVGGDGLGGAGGVGSPYGKDGLPAGAGLVGTGLGGAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGLGG
AGVGGVGSPYGKEGLPAGVGVGGDGLGGAGGVGSPYGKDGLPAGAGLGGAGVGGVGSPYG
KEGLPAGVGVGGDGLGGAGVGGVGYPYGKDGVPVGTGLGGAGAGGVGSPYGKDGLPAGAG
LGGAGVGGVGSPYGKEGLPAGVGVGGDGLGGAGVGGVGYPYGKDGVPVGTGLGGAGAGGV
GSPYGKDGLPAGAGLGGAGVGGVGSPYGKEGLPAGVGVGGDGLGGAGVGGVGYPYGKDGV
PVGTGLGGAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGLGGAGVGGVGSPYGKEGLPAGVGVGGDGLGGA
GGVGSPYGKDGLPAGAGLGGAGVGGVGGLGSLYGKDGLSAGAVSGAAHFPSGGEEVLGSR
HGRDGTLSRSKGYIGGGGDGFPSEGGSGAGSAIRSAGSPYGKDNGSAGAGAGVGGVGRLG
GDERVLRGKEGVVGAVGRGGEYGLDSHPGKSSMGGETGKGTASNFRGSGNKGSSQERDSL
SGQGDARGEGRDLGHFGSLYGKNSAFGGSGSKSHNRSVDGRNSGGFGQGLLDYGQMSDLY
GGPASINQRKQEPSLDIKANDFLKNTESVGRRRYCLDDLKAPRCHINKQLLDVRVLKGES
AELSCTVSKDEVTGTWFKDGLKLTNMDGIYFEKEGLVHKLIINKVEDFHAGRYRFEGGDT
KTEASIFVEDPPQVDKVLLKNLTSVPTVAKAGQKVKIKIPFEGRLPVRATWLKDRMELVD
DTRIRVDKTETFTMLSISSSERKDCGDYKVRLKNDSGVLEINLKLVVLDKPQPPAGPIKI
VESSASDITIQWKPPKDDGGKPLQSYIVERQQVGKNDWVTLGETPRSCTTFTTNKVEQDM
SYYFRVRAVNVEGTSDALESEEVKAVSKASPGAPDPPEIVSASRDTITISWKAPRKTGNS
RIVGYIIQKRKKGTTTWLPVNNVPIADKKLKMTNLKKGLQYEFRVAAVNAAGIGDASEPS
RPVFARDSTKSPGQVQDLKVSSSDSTSITLTWKRPEAEDGGDVKGYEVEMRSSNNLNWTK
CNSLPIEVTTYTVKGLQAKEIYFLRVRALNDSGPGEATELEACIEAALPVVSPRLLIDDT
VKNFLVIKAGNTIRVNIPFEASPDPVVTWLKDGLPLPNRATINTKDGTTQLLIGEAEFAD
SGIYTVELQNALGKSEKFSFQVQVTDIPQSPGPIQLEEKVPNTVTVTWEPSASEKWENNL
YYTVLKRESQKGLWHVVGDLIYTNKFTFTKLIPGRDYYFRVVAKNYLGASGPSETAQPWR
IKKTKAEFQVKPQKYRSVNQNQPPRFLVPLKPHVVTTGSECQMSCAVGGHPAPKITWYKD
GRDLSTDPNYFCTNNFGVCSLVVMGVTKHDEGEYMVEATNESGRAFSKAFLAIKGNKL
NT seq
7557 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaagccatccaccagtaaaatccctcaagaaatcttctgtcccaggagttgttatc
acccagtttgtggatgatattccagaaggatgcagtacacctgactttgagcggaaacct
gtcactctgacgttgcaggaaggtaaaaatgccattttcagagctgtggtcaaaggtgtc
ccaacccctgatgtgaaatggacgcgtatacaaggaggaatggatgatcctgtcaaatac
aaaacattcttcaacaacattacaaatgaattcattctgcagataaatgaaatcactaca
gatgacagtgatttgtaccgttgctttgctgtgaatgaatacggggaagctgcgtgctct
gctggcctcaggatcatacaagttcgctttaaaaggaaagcaaaatatgttcctgttcat
cctgctgatgaattaaagaagaagcttcaggacttcaggaagctgctgcggaagcgggcc
ccagcaccaaaaccaaaacccttggacaaagaagcagtctggcaactgttgctgcatgca
gataggagagattatgagaaaatatgtatgaaatatggaattgttgacttccgtgggatg
ctgagaaagctgcaggagatgaggaaggacacagagagtgaacaaggagagttaataaac
agcatcaaaaactttgaacacatcaaagtcaataaggaggggaaagctacgttcagtctg
gagatggacctgaaaaacagaaacagcaaagtttatctgcttaaggatggtgagaggctc
aggtatggaacaggggatgaatacagaaagcactgcctgaggcgaattgggaaaaggtat
aatttcattgtcaacgatgtacagccagaagatgcaggcttgtatcaagtcagagtggag
gacgtacctgttttctcaactgaactggatgctgaatccatccctgtgagatttgagcag
ccgctcagtgacgtgcgttgtcccgaggaagaagatgctgtctttgagtgtacgctacgc
acgccctgctacgatgcagtgtggctacacaaaacccacctcctcgaggcaagtgagaag
caccagatctccgtaacacctgatggtctgacccaccagctgattatcaaaaacgttgtg
ccttctgacaatggcatgtacacactcgacactggactctgctcctcaaatgcctggctt
attgtagagtatgccaaagggaagaggagacagggtgaaagaggcgaaagagagaaatct
gagtggctggaagaaacattgccagaaaaagacagagctaagaaacttcgacgcagagaa
tatgttgatgatgaagatcatcttatggacactggcatggaaaaagatggctggtacaga
aatggtcaaggccaccccagtgatgttaatggaagccatagatttttgggaaaagatggg
ctacgcaaagcccacagagatggaaggacggggtttgggcagttttctggagcagaccta
gaaggagactcaatgacaaatgatggtagtatctttggattaaaaggcttaggaggcaga
agtagattaaggcctttccatggcaaggactctgtgacaggcagagcagatactggtgat
gaattaggaggagcaggtgaatggtatcctgtggatggcagagatgatggtatgctggat
gctgctaacattgacatggatgatggagagggtttgggctctcagcatgacaaggatggt
aaattaggtgatactagttacagagcaggcttcgggggtgttgggagattaggtgctcct
gatggaagttccatgttagatggactcgatcctgattcaaccagagtgggagttggaatg
aggtccccctacggcaaggatggtctaccaactgtagctgataggaatggagcaagtata
aatagagagggacaaacagggagtccttatggcaaggatggcctgacacttcatgctagt
ggtcatttaggtcaggcaggaaggtctgcattgctgtatggcccaggtggccttccagct
ggacatggggctctatctggtgcaggtggcagttctataggggaaatggaggctttgtat
ggtccagatggtcagccagttggaacaggtggtggtgatgttggtgtagctggtgcaggg
ggagttggatatccctatggaaaggatggggcagttgggtatccctatggaaaggatggt
ctcccagctggggctggcattggtggtggtggtgcagggggagtagggtctccctatgga
aaggatggtctcccagcgggggctggtcttggtggtgctggtgcaggggcagtagggtct
ccgtatggaaaggatggtctcccagcgggggctggtcttggtggtgctggtgcaggggca
gtagggtctccgtatggaaaggatggtctcccagcgggggctggtcttggtggtgctggt
gcaggggcagtagggtctccgtatggaaaggatggtctcccagcgggggctggtcttggt
ggtgctggtgcaggggcagtagggtctccgtatggaaaggatggtctcccagcgggggct
ggtcttggtggtgctggtgcaggggcagtagggtctccgtatggaaaggatggtctccca
gcgggggctggtcttggtggtgctggtgcaggggcagtagggtctccgtatggaaaggat
ggtgttgcagctggaggaggcattggtggtgctgatgtagctggtgcagggagggtaggc
actccctatggaaaggatggtctctcatctggagtaggtggtgttggtgctggtgtagct
ggtgcagggggagttgcgtctccctatggaaaggatggtcttccagctgcagtaggtgtt
ggtggtgctggtgcggggggagtagggggacttgggtatgcctatggaaaggatggtgtt
ccagctggggctgcacttgctggggctggtcttggtggtgctgggggagtagggtctccc
tatggaaaggatggtctcccagctggggctggtcttggtggtgctggtgtagggggagta
gggtctccatatggaaaggaaggtcttccagctggagtaggtgttggtggtgatggtctt
ggtggtgctgggggagtagggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggt
cttggtggtgctggtgtagggggagtagggtctccatatggaaaggaaggtcttccagct
ggagtaggtgttggtggtgatggtcttggtggtgctgggggagtagggtctccctatgga
aaggatggtctcccagctggggctggtcttgttgggactggacttggtggtgctggtgca
gggggagtagggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggtcttggtggt
gctggtgtagggggagtagggtctccatatggaaaggaaggtcttccagctggagtaggt
gttggtggtgatggtcttggtggtgctgggggagtagggtctccctatggaaaggatggt
ctcccagctggggctggtcttggtggtgctggtgtagggggagtagggtctccatatgga
aaggaaggtcttccagctggagtaggtgttggtggtgatggtcttggtggtgctggtgta
gggggagtgggatatccctatggaaaggatggtgtcccagttgggactggacttggtggt
gctggtgcagggggagtagggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggt
cttggtggtgctggtgtagggggagtagggtctccatatggaaaggaaggtcttccagct
ggagtaggtgttggtggtgatggtcttggtggtgctggtgtagggggagtgggatatccc
tatggaaaggatggtgtcccagttgggactggacttggtggtgctggtgcagggggagta
gggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggtcttggtggtgctggtgta
gggggagtagggtctccatatggaaaggaaggtcttccagctggagtaggtgttggtggt
gatggtcttggtggtgctggtgtagggggagtgggatatccctatggaaaggatggtgtc
ccagttgggactggacttggtggtgctggtgcagggggagtagggtctccctatggaaag
gatggtctcccagctggggctggtcttggtggtgctggtgtagggggagtagggtctcca
tatggaaaggaaggtcttccagctggagtaggtgttggtggtgatggtcttggtggtgct
gggggagtagggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggtcttggtggt
gctggtgtagggggagtaggaggtcttggttctttatatggaaaggatggtctctcagct
ggggctgtgtcaggagctgctcattttccttctggaggtgaagaagtactgggatctcgc
catggcagggatggtacgctgagcagatctaaaggatatataggtggaggaggagatggc
tttccctcagaaggtggtagtggcgctggctctgcaatacggagtgctgggtctccctat
ggcaaggacaatgggtcagctggagccggggctggtgtgggtggtgttggcaggttggga
ggcgatgaaagggtgttacgtggtaaagaaggtgtggtaggtgctgttgggcgaggtggt
gaatatgggctggattcacatcctggcaaatcttctatgggaggtgaaactggaaagggc
actgccagtaatttcagaggctcagggaacaaaggctcatctcaggagagagattcactt
tcaggtcaaggagatgccaggggtgagggcagagatttaggacatttcggctccctgtac
ggcaaaaattctgcctttggagggtcagggagtaaatcccataacagatctgttgatggg
aggaattcaggtggttttggtcaaggtttattggattatgggcagatgtcagatctttat
ggtggacctgcttcaataaaccagagaaaacaggaacccagccttgatattaaagcaaat
gatttcttgaagaatacagaaagtgtgggaagaagacgttattgcctagatgatctgaaa
gcaccacgctgtcatatcaacaaacagttacttgatgtcagagtcctgaaaggggaatca
gctgagctgtcgtgcaccgtcagtaaagatgaagtgacaggaacctggtttaaagatgga
ttaaagttaacaaacatggacggaatctattttgaaaaggaaggtctggtccacaaacta
attattaacaaagtggaagattttcatgctgggagatacaggtttgaaggtggagatacc
aaaactgaagcttcaatttttgttgaagatcctccacaggtcgacaaagttctcctcaaa
aacttaacaagtgttcctactgtggccaaggcagggcagaaagtaaagatcaagatccct
tttgagggccggctgccagtcagagcaacgtggctaaaggacagaatggagctcgtagat
gacacaaggattcgtgttgataaaacagagacttttaccatgctgtccatctccagcagt
gagagaaaggactgtggggattacaaagtcaggctgaagaatgacagtggggtcctggag
atcaacttaaagcttgtggtattagacaagccacagccacctgcaggacccatcaaaatt
gtagaaagctctgcaagtgacatcaccattcagtggaagcccccaaaggacgacgggggc
aaaccactgcaaagctacattgttgagagacagcaggtgggcaagaatgactgggtgact
ttgggagaaacccccaggagctgtactaccttcactactaacaaagtggaacaagacatg
agctactacttcagggtgagagctgtgaatgtcgagggcactagtgacgcactggaatcg
gaggaagtgaaggctgtcagtaaagcttcacctggtgccccagatccccctgagattgtc
agtgccagcagagacaccatcacaatatcctggaaagcacctcgtaaaactggcaattcc
cgaattgtgggatacatcattcaaaagcgcaagaagggtaccacaacctggctgccagtc
aacaatgtgcctatagcagacaagaagctgaaaatgaccaatctcaagaaaggtctgcag
tatgaatttcgtgtggcagctgtcaatgctgctggcataggagatgccagtgaaccatca
cggcctgtctttgcacgggattccacaaaatctccgggtcaagtgcaggaccttaaagtg
agcagcagtgacagcactagcatcaccttgacatggaagagacctgaagcagaagatggg
ggtgatgtgaaaggctatgaggtggagatgcggtcttctaacaacctcaactggaccaaa
tgcaatagtcttcccatagaggtgaccacttacacagttaaaggcctccaagccaaggag
atatacttcctgcgtgtgagagccctcaatgacagtggcccaggagaagccacagagctc
gaagcttgcatcgaagctgctctccctgtggtttctcccaggttactaatagatgacaca
gtgaaaaacttcctggttataaaagcaggaaataccatccgagtgaatattccctttgaa
gcatctccagatccagtggtgacctggttgaaggatgggcttcctcttccaaacagggct
acaataaacaccaaagatggtaccacccagctgctgattggagaagctgagtttgctgac
agcggcatctacaccgttgagctccagaatgccttagggaaaagtgaaaaattcagcttc
caagttcaagttacagatatcccgcaatcacctggaccgattcaattggaagagaaagtg
ccaaatacagtgacagtaacctgggagccttcagcatctgagaaatgggaaaataatctc
tactacacagtcctgaaacgggaatcacagaagggcttgtggcacgtggtgggtgacctg
atctacaccaacaagttcacattcaccaaactgatcccaggccgggactactactttagg
gtcgtggcaaaaaattacttgggagccagtggtccatctgaaactgcgcagccttggaga
attaaaaaaacaaaggctgaatttcaagtcaaaccacagaaataccggagtgttaatcaa
aatcagccccccagattccttgtcccgttgaagcctcatgtggtgactactgggagtgag
tgccaaatgagctgtgcagttggaggccatccagccccaaagatcacatggtacaaggat
ggtagagacctctccactgatcctaactatttttgcacaaacaactttggtgtctgctcc
ctggttgtcatgggtgtcacaaaacatgatgaaggagaatatatggtagaagccaccaat
gaatcgggccgtgcattcagcaaagccttcctcgctattaaaggtaacaaactataa
DBGET
integrated database retrieval system
