KEGG   Ehrlichia japonica: EHF_0445
Entry
EHF_0445          CDS       T03078                                 
Name
(GenBank) trbL/VirB6 plasmid conjugal transfer family protein
  KO
K03201  type IV secretion system protein VirB6
Organism
ehh  Ehrlichia japonica
Pathway
ehh03070  Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ehh00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   03070 Bacterial secretion system
    EHF_0445
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:ehh02044]
    EHF_0445
Secretion system [BR:ehh02044]
 Type IV secretion system
  Conjugal DNA-protein transfer (VirB/D) protein
   EHF_0445
SSDB
Motif
Pfam: TrbL
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHX04151
UniProt: X5GJ18
LinkDB
Position
485620..491448
AA seq 1942 aa
MCNFIKKNFIKLLLFLVITACESNYHPVPRCIPADVFSETKTASVSAYFDPNSEDFISDD
KSLGNLVKNDQVVRWKYTGYVTDGRPITLRVDGMWTAWVTNVDNDVALGDEESDRYDEIL
PVERICGPYNKIEKTFVPDGHAECKVSCELISGVKDDLERGAYGPPCWFKNGYGAYLLFK
RPNDPEPNETLNHMKYPVSPMMHIGYKPLELAGSDVYSTKNKPIMNSLCQKITLEPGWKI
YVKILDKHYYDNVGGYAITFIEGVKTETQFSVFEWVRKQVRGELDKAGEKLFKHIVGNPV
FRNFVFSLLTLFLVFGALAYIFGMVQSPFGDIIVRILKVSLIILLISPSSWEFFYNHLLS
LFIHGIDQIIAIINSHTSSYNPNEPLAFLDDMIVNKIFSPVIWKIKIRALIIADFSSIFA
VCVIIIAVFLYIALCVYGFVIYLTAFVGITFLIGLFPLLLLGILFSQFKHLFDGWLTQCI
SFAMQAILIFTLISLFGALIMNYYYRIFGFTTCYNEWLKVKICLLGKKTLCIFDRGVFGW
TPGQTYDPKIIGFPLSTDIFMDRKPSGNARYQFTGGGAYIDVPPDRKYKDFRYLDYPFLD
PDTKTDGNPFGVNVSENSPFRQLSYYINALLTSKKGYVAARLIKDIEDELDVLEKKKVIS
AVSKSKVLQIIQDRRNQDKLNNKSELDKYKDEDFKSQVINSIVNDVIAGAVQDPTPQGEL
NKQYDYNLILRIRAGYLILWTEVGSLFLAALLIWQMRAFIQSVAVSLAGGSMMSQTIASM
YEGGFIRIFSGIPVIGGVIEKIDQGIDSFKFVAGNYVTKAARMPLNALQGVPYLGKAVKF
TASSTNVLTSSYNEYDRNFSNNFKTLNYARAFIGAHLGFSPLDAMKYLGGHIAGKTLGNR
EGGLIHNAIEDRKAALDSLKAHILGPEKYKPSPYIPNKKGEDDDRNPFAKEESHSKYSST
LLDEHGNVCVNKENLEDALEAREQLKTMLGNTRDDTALQNIKYDLDKIDNALRQHLDDKF
DDVTQRYANSRDPINHPQDLLPENLSVLRTSSASETSSITGNTELYDIIQMYNDTETSTS
LDVVSPVGSARSEISEQGSEDDIKDRVKAFTDSNISQHGASLEEGIELKELGTASSETSG
ITGNTELGDMTQMYNDTETSTSLDIVSPVGSARSEISEQGSEDDIKDRVKAFTDSNISQY
GASLEEGIELKELGTASSETSGITGNTELGDMTQMYNDTEVGDALDVISPVSSARSEISE
QGSEDDIKDRVKAFTDSNISQYGASLEEGIELKELGTASSETSGITGNTELGDMTQMYND
TEVGDALDVISPVSSARSEISEQGSEDDIKDRVKAFTDSNISQYGASLEEGIELKELGTA
SSETSGITGNTELGDMTQMYNDTEVGDALDVISPVSSARSEISEQGSEDDIKDRVKAFTD
SNISQHGASLEEGIELKELGTASSETSGITGNTELGDMTQMYNDTETSTSFYDSDSLSSE
AASEESNSMLMKNLHDEQSVGLNPEEKSELSSGIEKHNEADSSVLMDNATEQGVEEDTSK
DASNLSLDYNVLDIGDLKRDLDSADIKSDETLQQFSMGSEEEGELAGKKEEVDDNSIFKQ
EEDDKERLQQPDIEGSSALLVEPYDSSVSEQIDDGKMCDDVSYDSELVDKDGVLTQEGSL
DQGIYDSADIKSDETADHAEETVSEDSKDLGEVSEVDDETDGVNDEELKIKETDDVSDQS
DSEGVYESGDGEFSSNDDVSNVEGLINVVTASEGNVIIEDLQQHVQPNIQPNAVSLKKDK
DVVVNKSISDKLDIKDIGVVKRKKKESGKSKADNSDKAKSAKTVVNPKSLKKSLNVILNQ
CTNDLSAKFWLSIDKIFEDSKSGKQKRKLSKQDILLMIKQLETIIASLKDRKRHLTDPGE
IKEIEASIKEAESTIKSLLIQG
NT seq 5829 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtgtaattttattaaaaagaattttataaaattattgttattcttagtaataactgca
tgtgaatctaattatcatccagttcctagatgtataccagctgatgtgttctctgaaact
aaaacagcttctgtttcagcatattttgatccaaattcggaagattttatttctgatgat
aaatcattaggaaatcttgtaaaaaatgatcaagtagtacgatggaaatatactggatat
gtgacagatggtcgtccaattacattaagagttgatggaatgtggactgcatgggtaact
aatgttgataatgatgtagctttgggtgatgaggaatcagatcgttatgatgagatatta
cctgttgaaagaatttgtggaccttacaataagatagaaaaaacctttgttcctgatggt
catgctgaatgtaaagtatcatgtgaattaatttctggagttaaagatgatttagaaaga
ggtgcgtatggacctccttgttggtttaagaatggatacggtgcatatttattgtttaag
agaccaaatgatcctgagccaaatgaaacgttaaatcatatgaaatatccagtttctcct
atgatgcacatagggtacaagccgttggaattagctggtagtgatgtttattctactaag
aataaaccgattatgaattccctttgtcaaaaaataacattggagccaggatggaaaata
tatgtaaaaatattagataaacattattatgataatgttgggggatatgcgataacattt
attgaaggtgtaaaaacagaaacgcagttttctgtttttgaatgggttcgcaaacaggta
agaggtgaattggataaagcaggtgagaagctttttaagcatatagttggaaatccagta
tttaggaattttgtttttagtttattgactttgtttttagtatttggggccttggcttat
atctttggtatggtgcagagtccatttggtgatattattgttagaatattaaaagtatca
ttaataatattattgatttctccaagtagttgggagttcttttataatcatttacttagt
ctatttattcatggtatagatcaaattattgcaataattaatagtcatacaagttcttat
aatcctaatgaacctttggcttttctggatgacatgatagtaaataaaatattttctcca
gttatttggaaaataaagattagagcattaatcattgctgatttttcttcaatatttgct
gtatgtgtaatcattattgccgtattcctttacattgctttatgtgtgtatgggtttgtt
atatatctaacagcatttgttggtattacatttttaattggattatttccattgttatta
ttaggtattcttttttctcagttcaagcacctatttgatgggtggttaacacaatgtata
agctttgcaatgcaggcaatattgatattcactctgatttccttatttggtgcgcttatt
atgaattattattaccgcatttttgggtttacaacgtgttataatgagtggctaaaggta
aaaatatgtttgttgggtaaaaaaactctatgtatatttgatcgtggtgtttttggatgg
actccagggcaaacttatgacccaaaaattattggttttccgctaagtactgacattttt
atggataggaagccttctggtaatgcgaggtatcaatttactggtggaggtgcatatatt
gatgttcctcctgatcgtaaatataaggattttagatatctagattatccttttcttgat
ccagatactaagactgatgggaatccatttggtgttaacgtgtctgaaaatagcccattt
agacaattatcttattatattaacgcattacttacttctaaaaaaggatatgtagctgct
agattgataaaagatatagaggatgagttagatgttttggagaaaaagaaagttataagt
gcagttagtaaaagtaaagttttacaaattatacaagatagaagaaatcaagataagctt
aataacaaaagtgagttagataaatataaagatgaggattttaaatctcaagtaattaat
agtattgttaatgatgttatagcaggtgctgttcaagatcctactcctcaaggagagtta
aataaacaatacgattataatttaattttaagaattagagctggatatttgatattatgg
acagaagttggttctttattcttagctgcattgttaatatggcaaatgcgtgcctttatt
caaagtgtagcagtatctctagctggcggtagcatgatgtctcaaactattgctagtatg
tatgaaggtggtttcataaggattttttctggaattccagtcataggtggtgtaattgaa
aaaattgatcaaggtatagatagctttaaatttgtagcaggtaattatgttactaaagct
gctcgtatgcctttgaatgcgttacagggtgttccttatttaggtaaagctgttaaattt
actgctagttctactaatgtattgacctcttcgtataatgagtatgatagaaattttagt
aataattttaagacattaaattatgctcgagcttttataggtgctcatttaggattttct
ccattagatgcgatgaaatacttaggcggtcatattgctggaaagacattagggaataga
gaaggtggattaattcataatgcaattgaggatcgtaaagctgctttagacagcttaaaa
gcacatatattaggacctgagaaatataaaccaagtccttatatacctaataagaaagga
gaagatgatgatagaaatccttttgctaaggaagaatcacatagcaaatatagtagtaca
ttattagatgagcatggaaatgtatgtgtaaataaagaaaatttagaagatgcacttgaa
gcaagagaacaacttaaaacaatgcttggtaatactagagatgatactgcattacagaat
attaagtatgatcttgataagattgataatgctttacgtcaacatttagatgataaattt
gatgatgtcacacaaaggtatgctaattctcgtgatcctataaatcatcctcaggattta
cttcctgaaaatttatctgtgctgcgtacttcttcagcaagtgaaacttcaagtattaca
ggtaatacagaattatacgatattatacaaatgtataatgatactgaaacaagtacttct
ttggatgttgtatctcctgtgggtagcgcaagatcagaaatctcagaacaaggttcagaa
gatgatatcaaagatagagttaaagcgtttacagattcaaatatatcacaacatggtgca
tcgttagaagaaggtatagagttaaaagagttaggaacggcatcgagtgaaacttcaggt
attacgggtaatacagaattaggtgatatgacacaaatgtataatgatactgaaacaagt
acttctttggatattgtatctcctgtgggtagcgcaagatcagaaatctcagaacaaggt
tcagaagatgatatcaaagatagagttaaagcgtttacagattcaaatatatcacaatat
ggtgcatcgttagaagaaggtatagagttaaaagagttaggaacggcatcgagtgaaact
tcaggtattacgggtaatacagaattaggtgatatgacacaaatgtataatgatactgaa
gtaggtgatgctttagatgttatatctcctgtgagtagcgcaagatcagaaatctcagaa
caaggttcagaagatgatatcaaagatagagttaaagcgtttacagattcaaatatatca
caatatggtgcatcgttagaagaaggtatagagttaaaagagttaggaacggcatcgagt
gaaacttcaggtattacgggtaatacagaattaggtgatatgacacaaatgtataatgat
actgaagtaggtgatgctttagatgttatatctcctgtgagtagcgcaagatcagaaatc
tcagaacaaggttcagaagatgatatcaaagatagagttaaagcgtttacagattcaaat
atatcacaatatggtgcatcgttagaagaaggtatagagttaaaagagttaggaacggca
tcgagtgaaacttcaggtattacgggtaatacagaattaggtgatatgacacaaatgtat
aatgatactgaagtaggtgatgctttagatgttatatctcctgtgagtagcgcaagatca
gaaatctcagaacaaggttcagaagatgatatcaaagatagagttaaagcgtttacagat
tcaaatatatcacaacatggtgcatcgttagaggaaggtatagagttaaaagagttagga
acggcatcgagtgaaacttcaggtattacgggtaatacagaattaggtgatatgacacaa
atgtataatgatactgaaacaagtacttcattttatgatagtgacagtttatcgtctgaa
gctgcttcagaggaaagtaattcaatgcttatgaagaatttacatgatgagcaaagtgta
ggcttgaatccggaagagaaaagtgagttaagttcaggaattgaaaagcataatgaagca
gattcgtcagtgttgatggataatgccactgaacaaggagtagaagaagatacttctaaa
gacgctagtaatttgagtttagactataatgttctagatataggtgatttaaaaagagat
ttggatagtgctgatattaaatctgatgagactctacaacaatttagtatgggaagtgaa
gaagaaggtgaattagctggtaagaaagaagaagtagatgataacagtatttttaaacaa
gaggaagatgataaagaaagattgcaacagccagatatagaagggtcatctgcattattg
gttgaaccgtatgatagttctgtttcagagcaaatcgatgatggaaaaatgtgtgatgat
gtatcttatgatagtgaattagtagataaagatggtgttctaacacaagaaggcagttta
gatcaaggtatttatgatagtgctgatattaaatctgatgagactgctgatcatgctgaa
gaaacagtttctgaggattctaaagacttaggagaagtaagtgaagttgatgatgagaca
gatggtgtaaatgatgaagagcttaaaattaaagaaactgatgatgtatctgatcaatct
gatagtgaaggagtttatgaaagtggtgatggtgaatttagcagtaatgatgatgtatcc
aatgttgaaggattgattaatgtagttactgctagtgaagggaatgttataattgaagat
ttacaacaacatgtacaacctaatatacaacctaatgctgtgtcattaaagaaagataaa
gatgttgtggtaaataaaagtatctcagataagttggatattaaagatataggtgttgtt
aaaagaaagaaaaaagaatctggcaaaagtaaagctgataattctgataaagcaaaatca
gctaaaacagttgttaatccaaaatctttaaagaaatctttgaatgtgatattaaatcaa
tgtacaaacgacttatcagcgaaattctggttatctattgataaaatatttgaagattct
aaaagtggtaaacaaaagcgtaaattatcaaaacaagatattttattaatgataaagcaa
cttgaaacaattatagcatcattgaaagatagaaaaagacatcttactgatcctggtgaa
ataaaagagattgaagcaagtattaaagaagcagaatctactattaagagcttattaatt
cagggataa

DBGET integrated database retrieval system