Entamoeba histolytica: EHI_013040
Help
Entry
EHI_013040 CDS
T00238
Name
(RefSeq) adaptor protein (AP) family protein
KO
K12392
AP-1 complex subunit beta-1
Organism
ehi
Entamoeba histolytica
Pathway
ehi04142
Lysosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ehi00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04142 Lysosome
EHI_013040
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ehi04131
]
EHI_013040
Membrane trafficking [BR:
ehi04131
]
Endosome - Golgi transport
Others
AP-1 complex
EHI_013040
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Adaptin_N
Cnd1
HEAT_2
HEAT
Alpha_adaptinC2
B2-adapt-app_C
INTS1_R4
HEAT_EZ
US29
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
6219475
NCBI-ProteinID:
XP_001913524
UniProt:
B1N2V8
LinkDB
All DBs
AA seq
1091 aa
AA seq
DB search
MSKYFVSSHRGEIQDLREKLNSSKDDVRTEAVKRIVAAMTEGKDVSMLFIDVLKCMQTNK
LELKKLVYLYLMNYSRSQPERAILVVNSFVKDSSDPNPLIRALAIRTMGCIRVQNVFEYF
IEPLGKCLKDKDPYVRKTAVLCVLKLYCMDPVNIEQHGFLNTLRDMLLDDNQMVVSNVIA
ALHEIGNNGGKEWIIEEKMVRPLLSALDGSNEWGQVYIMDAIATYIPKESKEAENICERV
INKLTHNNPSVVMAAAKIVLKHLEVISPQIANIYCKRLSAPLVSIVLSNSSKHDYEIQYI
TLRCINLIIQKYPHLFSNQLRTFYCSYDEPIYIKIEKLEIMLMLVNESNVMDILVELKEY
ALSADIEFVRKSVQAFGKCALKLEKVADRCVKQLVELIELGQNYIVQEACIVMKDLFRKY
PQKYLPVIAKLCDNLNTLDDPNAKAAMIWIIGEYNQLITNSFDLLNEFMNSFADEPLNVQ
LALLTASVKLFIQQPDSQDLVQKALSEASNSASFDIRDRAHIYWRILFDHPQQTHDIMLK
ERDVITFQTQQLHPQILNSLISELGELSAVYQKVPASFVVKLKKIGVSAKLDEEEGGSEM
SDLLCFDGGSSNLIGTASKNVLDFDEDTSKRNDSMKDIFSIGKQTVPINRLVALPKTPTD
MKVDASLIYEGGSLFLQLEITNNSPLTMTNFQMQFNKNVFGLVPGQLNIDAIPPNKRWGA
LLPVGLIPPEITTPVSSRLEVAIANSTQQIYFYVLEMPIGLLMKEQSQVDIANCANLWNS
LPNTMSKEYKGSGLELKLQKLSTFILVATKKANDKELLMYTIKFLNDIDVMVEITSTSKG
YKILAKCIDKQYLSFIXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXDASLIYEGGS
LFLQLEITNNSPLTMTNFQMQFNKNVFGLVPGQLNIDAIPPNKRWGALLPVGLIPPEITT
PVSSRLEVAIANSTQQIYFYVLEMPIGLLMKEQSQVDIANCANLWNSLPNTMSKEYKGSG
LELKLQKLSTFILVATKKANDKELLMYTIKFLNDIDVMVEITSTSKGYKILAKCIDKQYL
SFIFKFFDGLF
NT seq
3276 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaagtattttgtttcaagtcatagaggagaaattcaagatcttagagaaaaatta
aatagtagtaaagatgatgttagaacagaagcagttaaaagaattgttgcagcaatgaca
gaaggaaaagatgtttctatgcttttcattgatgttttaaagtgtatgcaaacaaataaa
ttagaactcaagaagttagtttatttgtatttaatgaattactctagaagtcaaccagaa
cgtgctattttagttgttaattcatttgttaaagattcaagtgatcctaatccactcatt
cgagcattagcaattagaactatgggatgtattagagtacaaaatgtatttgaatatttt
attgaaccacttggaaaatgtttaaaagataaagatccatatgttagaaaaacagcagta
ctttgtgttttaaaattatattgtatggatccagttaatattgaacaacatggatttctt
aatacattaagagatatgttattagatgataatcaaatggttgtttctaatgttattgca
gcattacatgaaattggaaataatggaggaaaagaatggattattgaagaaaagatggtt
agaccattattaagtgcattagatggaagtaatgaatggggacaagtttatattatggat
gctattgctacatatattccaaaagaatcaaaagaagcagaaaatatatgtgaaagagta
attaataaacttacacataataatccatcagttgttatggcagcagcaaaaattgtatta
aaacatttagaagtaatttcaccacaaattgctaatatttattgtaaaagattatctgca
ccattagttagtatagtattaagtaatagttctaaacatgattatgaaattcaatatatt
actcttcgatgtattaatttaataatacaaaaatatccacatttatttagtaatcaatta
agaacattttattgttcatatgatgaaccaatttatattaaaatagaaaaattagaaatt
atgttaatgttagttaatgaaagtaatgtaatggatattcttgtagaattaaaagaatat
gctctttcagctgatattgaatttgttagaaaatcagttcaagcatttggaaaatgtgca
ttaaaattagaaaaagttgcagatagatgtgttaaacaattagttgaattaattgaatta
ggtcaaaattatattgtacaagaagcatgtattgtaatgaaagacttatttagaaaatat
ccacaaaaatatcttccagtaattgcaaaattatgtgataatttaaatacattagatgat
ccaaatgctaaagctgctatgatttggattattggagaatataatcaacttattactaat
tcatttgatcttcttaatgaatttatgaattcatttgctgatgaaccacttaatgttcaa
ttagctcttcttactgcatcagttaaattatttattcaacaaccagactcacaagattta
gtacaaaaagcattaagtgaagcatctaattcagcatcatttgatattagagatcgtgca
catatttattggagaattttatttgatcatccacaacaaacacatgatattatgttaaaa
gaacgtgatgtcattacattccaaactcaacaacttcatccacaaattcttaattctctt
atttcagaattaggtgaattatctgctgtttatcaaaaagttccagcatcttttgtagta
aaattgaaaaaaattggagtaagtgctaaattagatgaagaagaaggtggaagtgaaatg
agtgatcttctttgcttcgatggaggaagttctaatcttattggaactgcttctaaaaat
gttttagactttgatgaagatacttcaaagagaaatgattcaatgaaagatattttctct
attggaaaacaaactgttccaattaatcgtttagttgcattaccaaaaacaccaactgat
atgaaagttgatgcttcattaatttatgaaggtggtagtttattcttacaattagaaatt
acaaataatagtccattaacaatgactaatttccaaatgcaatttaataaaaatgttttt
ggattagttcctggtcaattaaatattgatgccattcctccaaataaacgttggggtgct
ttacttccagttggacttattcctcctgaaattacaactcctgtttcttctcgtttagaa
gttgctattgctaattctacacaacaaatttatttctatgttcttgaaatgccaattggt
ttattaatgaaagaacagtctcaagttgatattgctaattgtgctaatttatggaactct
cttccaaatactatgtctaaagaatataaaggatctggacttgaacttaaacttcaaaaa
ttatctactttcattttagttgcaacaaaaaaggctaatgacaaagaactattaatgtac
acaattaaattccttaacgacatcgacgttatggttgaaattacttctacttctaaagga
tataaaatccttgctaaatgcatcgacaaacaatatttatcctttattnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgatgcttcattaatttatgaaggtggtagt
ttattcttacaattagaaattacaaataatagtccattaacaatgactaatttccaaatg
caatttaataaaaatgtttttggattagttcctggtcaattaaatattgatgccattcct
ccaaataaacgttggggtgctttacttccagttggacttattcctcctgaaattacaact
cctgtttcttctcgtttagaagttgctattgctaattctacacaacaaatttatttctat
gttcttgaaatgccaattggtttattaatgaaagaacagtctcaagttgatattgctaat
tgtgctaatttatggaactctcttccaaatactatgtctaaagaatataaaggatctgga
cttgaacttaaacttcaaaaattatctactttcattttagttgcaacaaaaaaggctaat
gacaaagaactattaatgtacacaattaaattccttaacgacatcgacgttatggttgaa
attacttctacttctaaaggatataaaatccttgctaaatgcatcgacaaacaatattta
tcctttattttcaaattctttgatggacttttttaa
DBGET
integrated database retrieval system