Entamoeba histolytica: EHI_060350 Help Entry EHI_060350        CDS       T00238                                  Symbol 89.t00016 Name (RefSeq) splicing factor Prp8   KO K12856   pre-mRNA-processing factor 8 Organism ehi  Entamoeba histolytica Pathway ehi03040   Spliceosome Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ehi00001]  09120 Genetic Information Processing   09121 Transcription    03040 Spliceosome     EHI_060350 (89.t00016)  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03041 Spliceosome [BR:ehi03041]     EHI_060350 (89.t00016) Spliceosome [BR:ehi03041]  Complex B   U4/U6.U5 tri-snRNP components    U5 snRNP specific factors     EHI_060350 (89.t00016)  Complex C    U5 SnRNP specific factors     EHI_060350 (89.t00016) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  PROCN PRP8_domainIV U6-snRNA_bdg PRO8NT U5_2-snRNA_bdg RRM_4 PROCT JAB YjiS-like Motif Other DBs NCBI-GeneID:  3407545 NCBI-ProteinID:  XP_653245 UniProt:  C4M6K0 LinkDB All DBs AA seq 2270 aa AA seqDB search MSVTMPPEHIRKIVKEHGDMSSRKFSKDKRVYLGALKFLPHAVYKLLENIPMPWEEIKMV DVMYHITGAITFVTEIPKVIEPIYFAQWGTMWIAMRNEKANRKNFRRMILPSFDDEEPPL DYGDNILDVDPIPSIRLELDGIEDKSVMEWFYDSKPLVHSHNVNGTSYKRWKLNIEQLST LHRLSERLLGDITDMNYYYLFNKESFFNAKALNCTLIGGPKFEPLFRDTNDDEDWSEFDD INKLIIRRIIRTEYKVAYPNLYANRPREVHIIPYHYPMQMIVKPDDPTLPSYYFDSLLNP IEWKNDWYETQEMEEDDDETIEFYDDVVAFGNTIELDNEKIKDGLNLINAQYPFNNKYGV TRRAQDVPLIKGWYLEHIQKNYPVKVRVSYQKLLKCYVINELQKKPPKSLCKRNFFAALD ETHFFYHTKLDWVEAGLQVIRQGYNILNLLIHRKNVDFLHLDYNFNIKPVRTLTTKERKK SRFGNSFHLIREILKMTKIVVDAHCQYRLGRVDSYTLADGIQYIFSHIGTLTGMYRYKYK VIQQIRMCKDLKHIIYYRFNTNSIEKGPGIGFWAPMWRVWIFLLRGLIPILERWLGNLLA RQFEGRKAKAIAKTITKQRVESGFDIELRAAVLHEINEIMPEGIKSNKAKTIMQHLSEAW RCWKANIPWKVPGLPEPIEAMILRYVKKKADWWTDVAHYTRERTKRGCTADKTVSKKNLG RLTRLWLKGEQERQFNYLKDGPYLTSEEGVAILTTTVQWLENQQFQPIPFPPSNYKYDTK LLVLALENLKESFSTKTRINQSQREELGLIEQAFDNPHEFLLRIKRQLLTQRTFKEVKIE FVDMYTHLIPNYDFDPMEKIADAYLDQYLWYEGDKRHLFPNWIKPSDTEPAPLLVYKFCN GMNNLTNIWNVENGECNVIVESNYDKMFKKVDLTLLNRLLRLIMDPLLADYITAKNNITL AYKDMMHVNSYGLIEGLAFSSFVIQYYGLILDILLLGPRRAFEIAGTANQPNDYLTFKTK EIEEHHPIRMYTRYIDKFYMVLRFTEEESKELIEKLLIEHPDPNNENSINYNNKKCWPKD CRMRLMRHDVNLGRAVFWELKNRLPRSLTTLNWEDSCVTVYSKDNPNVLFTMCGFEIRIL PKCRSQEEEFSIKEDAWALTNNETMEKTANAYLKVSKEEIMKFDNRIRQILMSSSATTFT RVVNKWNTALIGLMMYFREATIHTQELLDVLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPNRFPPVVFY TPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDFKWSRQTDVGIQAFRAGMSHDEDQLIPNLFRYILPWET EFKDSQRVWMEYAQKRKEAIEENRRLTLEDLEDSWDKGIPRINTLFQQDKHTLAYDKGWR IRTEFKRYQIQKLNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRSDMIQALGGVEGILEHTLFRATFFPT WEGLFWEKSSGFEESMKYKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRGSVYVGFETQLDL TGIFMQGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQESNELDVDRVQKETIHPR KSYKMNSSCADITLFGMNEWETGKPSMLTDNKNILNGIHTNKYWIDVQLRWGDFDQHNIE SYARQKYESYINDNNCLYPSQTGVIIAFDLAYNTYSAYGNWIPGMKDLLQKALAKILKCN IALFVLRERIRKALQLYSSEPTNPSLSITNYGELFTNQIIWFVDHSNIYRVTTHKTFEGN HITKPLNGCIFIFNPRTGGVHLKIIHSSEWEGQKRIGQLKHWKSAEEVVKLVRALPIEEQ PKQIIVSLRGMLDPLETHMIDFPNILLKGSEIALPFGEIMQMEKVKDAVNKATESMLLMF NMYDDWLETVSSYTAFHRAVLLLRGLGINPVKAKKILLPNPTISIKPQHQWPTYSDDEWK EIEIKIKDLIIGEYAKKNNISASSLTQNEVRDIILGMHIQTPSAERQQVLEIEGEKNIQQ GITVTTKTQNKLQETMTVTTSTPYEQKVFAATQNWRQRAIEASKLLDKMNNLFVENEGEG NPIVIPKNIIKGIIQIADTKIEIGGILFGQESTKNKGIMEVQCCVLVPQYATNKYIVFAQ HCPQHEELHNMKAIGWIHTCSGEPKLTVYDAVMNSLIQEHYNIDGQCICIGIGEGAIGIE GYSFNEIGREFGKQNSDSLITLQNNCTEELGVKQPLIVSEKINGFFLIPEKGSWNYSLST SKFTVNIEYTLKAGIPLEFYNEAHRITHFLCWVQSDEENNDVDMTEYSLF NT seq 6813 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgagtgttaccatgccacctgaacatatcaggaaaattgtaaaagagcatggggatatg tcaagtagaaaatttagtaaagataaaagagtgtatttgggtgcacttaaatttttacct catgctgtgtataaattattagagaatataccaatgccatgggaagaaattaaaatggtt gatgttatgtatcatatcactggagcaattacctttgtaactgaaatacctaaagttatc gaaccaatttattttgcacaatggggaactatgtggattgcgatgagaaatgaaaaggca aaccgaaagaattttagaagaatgatattaccatcatttgatgatgaagagccaccattg gactatggagataacattcttgatgtagacccaataccaagtattcgactagaattagat ggaatagaagataaatcagttatggaatggttttatgattcaaaaccattagttcatagc cataatgtaaatgggacaagttataaacgttggaaattaaatattgaacaattaagtaca ttacacagattgtcagaacgattacttggtgatattacagatatgaattattattattta tttaacaaagaatctttttttaatgcaaaggcattaaattgtacattaattggaggacca aaatttgaaccattatttagagatactaatgatgatgaagactggagtgaattcgatgat attaataaacttattatcagaagaattattcgtaccgaatataaagtggcttatcctaat ttatatgctaatcgtccaagagaagttcatattattccttatcattatccaatgcaaatg attgttaaaccagatgacccaacattaccctcttattattttgattcattacttaatcca atcgagtggaaaaatgattggtatgaaactcaagaaatggaagaagatgatgatgaaaca attgaattttatgatgatgttgttgcatttggtaatacaattgaacttgacaatgaaaaa ataaaagatggtttaaatttaattaatgcacaatatccatttaataataaatatggagta actagaagagcacaagatgttccattgattaaaggatggtatttagaacatattcaaaag aattatcctgttaaagtaagagtaagttatcaaaaattattaaaatgttatgttattaat gaattacaaaagaaaccaccaaaatctctctgtaaaagaaatttctttgcagcgttggat gagacacatttcttttatcacacgaaattagattgggttgaggcaggattacaagtaatt agacaaggatataatattcttaatcttcttattcatagaaagaatgtagattttcttcat ttagattataattttaatattaaacctgtaagaacattaacaacaaaagaaagaaaaaaa tcacgattcggtaattcatttcatttaataagagaaatattaaaaatgactaaaattgtt gttgatgctcattgccaatacagacttggaagagttgattcatatactcttgctgatgga attcaatatatatttagtcatattggaacacttacaggaatgtatcgttataaatataaa gttattcaacaaataagaatgtgtaaagatttaaaacatattatttattatcgatttaat acaaactctattgaaaaaggacctggaataggattttgggcaccaatgtggagagtatgg atctttttattaagagggttaattccaattttagaacgatggttaggaaatcttcttgct cgacaatttgaaggtagaaaagctaaagcaatagccaaaactattactaaacaaagggtt gaaagtggatttgatattgaattaagagctgctgtattacatgaaattaatgaaattatg cctgaaggaattaaaagtaataaagctaaaacaattatgcaacatcttagtgaagcatgg agatgttggaaagcaaatattccatggaaagttcctggattaccagaaccaattgaagct atgattctacgatatgtaaaaaagaaagccgattggtggacagatgttgcacattatact agagaaaggactaaaagaggatgtactgcagataagacagttagtaaaaaaaatcttgga agattaacaaggttatggttaaaaggagaacaagaaaggcaatttaattatttaaaagat ggaccttatttaacaagtgaagaaggagtagctatattaacaactacagttcaatggctt gaaaatcaacaatttcaaccaattccatttccaccaagtaattataaatatgatactaaa ttacttgttttagcattagaaaatttaaaagaatcatttagtactaaaacaagaattaat caaagtcaaagagaagaattaggattaattgaacaagcatttgataatccacatgaattt ttacttagaattaaaagacaattattaactcaaagaacatttaaagaagttaaaattgaa tttgttgatatgtacacccatttaattccaaattatgattttgatccaatggaaaaaatt gcagatgcatatcttgatcaatatttatggtatgaaggagataaaagacatttattccct aattggataaaaccatcagatactgaaccagcaccattattagtatataagttttgtaat ggaatgaataatttaacaaatatatggaatgttgaaaatggagaatgtaatgttattgta gaatcaaattatgataaaatgtttaagaaagttgatttaacattattaaatagattatta agattaattatggatcctttattagcagattatattactgcaaaaaataacataactttg gcttacaaagatatgatgcatgtaaattcttatgggttaatagaaggattagcatttagt agttttgttattcaatattatggattaatcttagatattttattacttggaccaagaaga gcattcgaaattgcaggtactgcaaatcagccaaatgattatttaacatttaaaacaaaa gaaattgaagaacatcatccaattagaatgtacacaagatatattgataaattttatatg gtattaagatttactgaagaagaaagtaaagaattaatagaaaaattattaatagaacat ccagatccaaataatgaaaattcaataaattataataataaaaagtgttggccaaaagat tgtagaatgagattaatgagacatgatgtaaatttaggacgtgccgtattttgggagtta aagaatagattgccacgttcattaactactcttaattgggaagattcatgtgttacagtt tattcaaaagataatccaaatgttttatttactatgtgtggatttgaaattcgtattctt ccaaaatgtagaagtcaagaagaagagtttagcattaaagaagatgcatgggcacttact aataatgaaacaatggaaaaaacagcaaatgcatatttaaaagtaagtaaagaagaaatt atgaaatttgataatagaattagacaaattttaatgtcatcaagtgctactacatttaca agagtagtaaataaatggaatactgcgttgattggattaatgatgtattttagagaagct actattcatacacaagaattacttgatgttttagttaaatgtgaaaataaaatacaaaca agaattaaaataggattaaattcaaaaatgcctaatagatttccaccagttgtattttat actccaaaagaacttggtggacttggaatgctttctatgggacatgttttaattccacaa tcagactttaaatggagtagacaaactgatgttggtattcaagcatttagagctggaatg agtcatgatgaagaccaattaattcctaatttatttagatatattcttccatgggaaaca gaatttaaagattctcaaagagtatggatggaatatgcacaaaaaagaaaagaagctatt gaagaaaatagaagactaacattagaagatttagaggattcttgggataaaggaattccc agaattaatacattgtttcaacaagataaacatacattagcatatgataaaggatggcgt attagaacagagtttaaacgataccaaattcaaaaattaaatccattttggtggacacat caaagacatgatggaaaattgtggaatcttaataattatagaagtgatatgattcaggct ttaggaggagtagaaggaattttagaacacacactatttagagctacattctttcctaca tgggaaggattattttgggagaaatcaagtgggtttgaagaatcaatgaaatataaaaaa ttaactaatgcacaaagaagtggattaaatcaaattccaaatagaagatttacattatgg tggtcaccaacaataaatagaggaagtgtatatgttggatttgaaacgcagttagattta acaggaatatttatgcaaggaaaaatcccaacattaaaaattagtttaattcaaatattt agagcacatttatggcaaaaaatacatgaaagtattgttatggatttatgtcaagtattt gatcaagaaagtaatgaattagatgttgatagagttcaaaaagaaacaattcatccaaga aagtcatataaaatgaattcttcttgtgcagatattacattatttggaatgaatgaatgg gaaactggaaaaccttcaatgctaactgataataaaaatatcttaaatggaattcataca aataaatattggattgatgtacaattacgttggggtgattttgatcaacataatattgaa agttatgcaagacaaaaatatgaaagttatataaatgataataattgtttatatccttct caaactggtgttattattgcttttgatttagcttataatacatattctgcatatggaaat tggattcctggaatgaaagatttattacaaaaagcattagctaaaatacttaaatgtaat attgcattatttgtattaagagaacgtattagaaaggcacttcaattatattctagtgaa ccaactaatccatcattatctataacaaattatggtgaattatttacaaatcaaattatt tggtttgttgatcatagtaatatctatcgagttacaactcataaaacatttgaaggaaat cacattactaaaccattaaatggatgtatctttatatttaatccaagaactggaggtgtt catttaaaaattattcattcatcagaatgggaaggacaaaaacgtattggtcaattaaaa cattggaaatctgcagaggaggttgttaaattagtacgagcattaccaattgaagaacaa cctaaacaaattattgtatcattaagaggaatgttagacccattagaaactcatatgatt gattttccaaatattttattaaaaggaagtgaaatagcattaccatttggtgaaattatg caaatggaaaaagttaaagatgctgttaacaaagctactgaatcaatgttattaatgttt aatatgtatgatgattggttagaaactgttagttcatatactgcatttcatagagctgta ttattattaagaggacttggaataaatcctgttaaagctaaaaaaattcttcttccaaat ccaactatttcaattaaaccacaacaccaatggccaacatatagtgatgatgaatggaaa gaaattgaaattaaaataaaagatttaattattggagaatatgccaaaaagaataatatc agtgcaagtagtttaactcaaaatgaagttagagatattattcttggaatgcatattcaa acaccttctgctgaaagacaacaagttttagaaattgaaggagaaaagaatattcaacaa ggaattactgtaacaacaaaaacacaaaataaattacaagaaactatgactgtaacaaca agtactccttatgaacaaaaagtatttgctgcaactcaaaattggagacaaagagctatt gaagcaagtaaattacttgataaaatgaataatttatttgttgaaaatgaaggagaagga aatcctattgttattcctaaaaatattattaaaggaattattcaaattgcagacaccaaa attgaaattggtggaattttatttggtcaagaaagtacaaaaaataaaggaattatggaa gttcaatgttgtgttttagttcctcaatatgccacaaataaatatattgtatttgctcaa cattgcccacaacatgaggaacttcataatatgaaagcaattggatggattcatacttgt tctggtgaacctaagttaacagtatatgatgctgtaatgaattcattaatacaagaacat tataatattgatggacaatgtatttgtattggtattggagaaggtgcaattggaattgaa ggatattcatttaatgaaattggaagagagtttggtaaacaaaatagtgatagtctaatt acattacaaaataattgtactgaagaattaggagtaaaacaaccacttattgtttcagaa aaaattaatggattctttttaattccagaaaaaggaagttggaattattcattatctact tctaaatttactgttaatattgaatatactcttaaagctggtattccattagaattttat aatgaagctcatagaattacacacttcctttgttgggtacaaagtgatgaagaaaacaat gatgttgatatgactgaatattcattattttaa

DBGET integrated database retrieval system